MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 98603

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_011274	TGGAGG	2	12	473914	473925	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	205351733
10002	NC_011274	CGA	2	6	474018	474023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351733
10003	NC_011274	AGTA	2	8	474174	474181	50 %	25 %	25 %	0 %	205351733
10004	NC_011274	GCG	2	6	474182	474187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351733
10005	NC_011274	TCG	2	6	474192	474197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351733
10006	NC_011274	CT	3	6	474213	474218	0 %	50 %	0 %	50 %	205351733
10007	NC_011274	AGGGT	2	10	474261	474270	20 %	20 %	60 %	0 %	205351733
10008	NC_011274	TTTA	2	8	474315	474322	25 %	75 %	0 %	0 %	205351734
10009	NC_011274	GGTA	2	8	474465	474472	25 %	25 %	50 %	0 %	205351734
10010	NC_011274	GCT	2	6	474483	474488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351734
10011	NC_011274	CAC	2	6	474529	474534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351734
10012	NC_011274	AAGGC	2	10	474560	474569	40 %	0 %	40 %	20 %	205351734
10013	NC_011274	CT	3	6	474575	474580	0 %	50 %	0 %	50 %	205351734
10014	NC_011274	CGG	2	6	474648	474653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351734
10015	NC_011274	GC	3	6	474663	474668	0 %	0 %	50 %	50 %	205351734
10016	NC_011274	GCC	2	6	474725	474730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351734
10017	NC_011274	CCG	2	6	474746	474751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351734
10018	NC_011274	ATC	2	6	474791	474796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351734
10019	NC_011274	CGATCG	2	12	474803	474814	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	205351734
10020	NC_011274	ATCGTC	2	12	474937	474948	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	205351734
10021	NC_011274	GTC	2	6	474961	474966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351734
10022	NC_011274	CCG	2	6	474999	475004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351734
10023	NC_011274	TAA	2	6	475090	475095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351734
10024	NC_011274	GCT	2	6	475197	475202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351734
10025	NC_011274	CTG	2	6	475294	475299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351735
10026	NC_011274	TGCC	2	8	475306	475313	0 %	25 %	25 %	50 %	205351735
10027	NC_011274	CGC	2	6	475332	475337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351735
10028	NC_011274	ATTC	2	8	475344	475351	25 %	50 %	0 %	25 %	205351735
10029	NC_011274	CGC	2	6	475374	475379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351735
10030	NC_011274	GCTC	2	8	475407	475414	0 %	25 %	25 %	50 %	205351735
10031	NC_011274	GGCG	2	8	475432	475439	0 %	0 %	75 %	25 %	205351735
10032	NC_011274	TTC	2	6	475448	475453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351735
10033	NC_011274	ATG	2	6	475457	475462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351735
10034	NC_011274	CT	3	6	475472	475477	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10035	NC_011274	GCA	2	6	475484	475489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10036	NC_011274	GTGATA	2	12	475563	475574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_011274	GCT	2	6	475608	475613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10038	NC_011274	GCC	2	6	475662	475667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10039	NC_011274	TGCG	2	8	475989	475996	0 %	25 %	50 %	25 %	205351736
10040	NC_011274	GGC	2	6	476052	476057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351736
10041	NC_011274	GC	3	6	476082	476087	0 %	0 %	50 %	50 %	205351736
10042	NC_011274	TGGAAG	2	12	476122	476133	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	205351736
10043	NC_011274	CTG	3	9	476142	476150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351736
10044	NC_011274	CGG	2	6	476222	476227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351736
10045	NC_011274	ACT	2	6	476281	476286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351736
10046	NC_011274	CTT	2	6	476288	476293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351736
10047	NC_011274	GGC	2	6	476301	476306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351736
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10049	NC_011274	GGT	2	6	476405	476410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351736
10050	NC_011274	GAC	2	6	476433	476438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351736
10051	NC_011274	GTG	2	6	476451	476456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351736
10052	NC_011274	ATG	2	6	476466	476471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351736
10053	NC_011274	GC	3	6	476474	476479	0 %	0 %	50 %	50 %	205351736
10054	NC_011274	CCAG	2	8	476548	476555	25 %	0 %	25 %	50 %	205351736
10055	NC_011274	GC	3	6	476649	476654	0 %	0 %	50 %	50 %	205351736
10056	NC_011274	GAA	3	9	476754	476762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351736
10057	NC_011274	GGT	2	6	476789	476794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351736
10058	NC_011274	AGA	2	6	476795	476800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351736
10059	NC_011274	AAC	2	6	476805	476810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351736
10060	NC_011274	CAG	2	6	476832	476837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351736
10061	NC_011274	CAG	2	6	476841	476846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351736
10062	NC_011274	GGT	2	6	476849	476854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351736
10063	NC_011274	ACG	2	6	476887	476892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351736
10064	NC_011274	CGT	2	6	476957	476962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351736
10065	NC_011274	GCT	2	6	477023	477028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351736
10066	NC_011274	GTG	2	6	477029	477034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351736
10067	NC_011274	GCC	2	6	477052	477057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351736
10068	NC_011274	GGC	2	6	477131	477136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10069	NC_011274	TCA	3	9	477198	477206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351737
10070	NC_011274	GCA	2	6	477207	477212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351737
10071	NC_011274	CCA	2	6	477222	477227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351737
10072	NC_011274	GCGCC	2	10	477240	477249	0 %	0 %	40 %	60 %	205351737
10073	NC_011274	CGGT	2	8	477266	477273	0 %	25 %	50 %	25 %	205351737
10074	NC_011274	CGT	2	6	477298	477303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351737
10075	NC_011274	CGG	2	6	477310	477315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351737
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10078	NC_011274	CGACG	2	10	477448	477457	20 %	0 %	40 %	40 %	205351737
10079	NC_011274	CGG	2	6	477468	477473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351737
10080	NC_011274	CAGCGC	2	12	477688	477699	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	205351737
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10082	NC_011274	AGC	2	6	477716	477721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351737
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10084	NC_011274	CGCC	2	8	477918	477925	0 %	0 %	25 %	75 %	205351737
10085	NC_011274	TGGC	2	8	477957	477964	0 %	25 %	50 %	25 %	205351737
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10087	NC_011274	GACAA	2	10	478018	478027	60 %	0 %	20 %	20 %	205351738
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10090	NC_011274	CCA	2	6	478177	478182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351738
10091	NC_011274	GCC	2	6	478201	478206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351738
10092	NC_011274	GCTG	2	8	478254	478261	0 %	25 %	50 %	25 %	205351738
10093	NC_011274	CGG	2	6	478380	478385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351738
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10100	NC_011274	CCAGCA	2	12	478739	478750	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	205351738
10101	NC_011274	AGC	3	9	478756	478764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351738
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10103	NC_011274	CAT	2	6	478843	478848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351739
10104	NC_011274	CG	3	6	478882	478887	0 %	0 %	50 %	50 %	205351739
10105	NC_011274	CA	3	6	478939	478944	50 %	0 %	0 %	50 %	205351739
10106	NC_011274	CAG	2	6	479051	479056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351739
10107	NC_011274	TGT	2	6	479059	479064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351739
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10109	NC_011274	CG	3	6	479090	479095	0 %	0 %	50 %	50 %	205351739
10110	NC_011274	CACCG	2	10	479099	479108	20 %	0 %	20 %	60 %	205351739
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10113	NC_011274	CGG	2	6	479191	479196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351739
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10117	NC_011274	CG	3	6	479428	479433	0 %	0 %	50 %	50 %	205351739
10118	NC_011274	CG	3	6	479447	479452	0 %	0 %	50 %	50 %	205351739
10119	NC_011274	TGC	2	6	479469	479474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351739
10120	NC_011274	GCC	2	6	479477	479482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351739
10121	NC_011274	GCG	2	6	479505	479510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351739
10122	NC_011274	ATTA	2	8	479555	479562	50 %	50 %	0 %	0 %	205351739
10123	NC_011274	GCT	2	6	479572	479577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351739
10124	NC_011274	CAC	2	6	479645	479650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351739
10125	NC_011274	CGCA	2	8	479744	479751	25 %	0 %	25 %	50 %	205351739
10126	NC_011274	CGT	2	6	479756	479761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351739
10127	NC_011274	AG	3	6	479819	479824	50 %	0 %	50 %	0 %	205351739
10128	NC_011274	CAC	2	6	479834	479839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351739
10129	NC_011274	TCA	2	6	479923	479928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351739
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10149	NC_011274	GGC	2	6	480692	480697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351740
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10152	NC_011274	AGAC	2	8	480918	480925	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10153	NC_011274	AAAT	2	8	481044	481051	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10154	NC_011274	GAT	2	6	481064	481069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10155	NC_011274	ACGAT	2	10	481096	481105	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10156	NC_011274	ATCCAG	2	12	481200	481211	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	205351741
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10161	NC_011274	CAG	2	6	481479	481484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351741
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10170	NC_011274	T	6	6	481918	481923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10222	NC_011274	CTGG	2	8	484196	484203	0 %	25 %	50 %	25 %	205351744
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10226	NC_011274	ATCTT	2	10	484263	484272	20 %	60 %	0 %	20 %	205351744
10227	NC_011274	GCG	2	6	484341	484346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351744
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10230	NC_011274	GAT	2	6	484454	484459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351744
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10232	NC_011274	CAG	2	6	484502	484507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351744
10233	NC_011274	CGC	2	6	484513	484518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351744
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10235	NC_011274	CAG	2	6	484589	484594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351744
10236	NC_011274	GTG	2	6	484602	484607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351744
10237	NC_011274	ACTC	2	8	484664	484671	25 %	25 %	0 %	50 %	205351745
10238	NC_011274	GGC	2	6	484697	484702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351745
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10483	NC_011274	TAAGG	2	10	496035	496044	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10484	NC_011274	TAT	2	6	496237	496242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10485	NC_011274	AAATTT	2	12	496267	496278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10486	NC_011274	AAT	2	6	496324	496329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10487	NC_011274	AT	3	6	496361	496366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10488	NC_011274	T	6	6	496366	496371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10489	NC_011274	TTA	2	6	496411	496416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10490	NC_011274	AAT	2	6	496425	496430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10491	NC_011274	CAG	2	6	496572	496577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351755
10492	NC_011274	TGCG	2	8	496651	496658	0 %	25 %	50 %	25 %	205351755
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