MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 98603

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8002	NC_011274	GAT	2	6	377812	377817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351657
8003	NC_011274	CGC	3	9	378021	378029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351657
8004	NC_011274	CGG	2	6	378032	378037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351657
8005	NC_011274	GCG	2	6	378073	378078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351657
8006	NC_011274	TGG	2	6	378080	378085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351657
8007	NC_011274	CGG	2	6	378158	378163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351657
8008	NC_011274	CGC	2	6	378230	378235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351657
8009	NC_011274	TAT	2	6	378251	378256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351657
8010	NC_011274	GCCA	2	8	378287	378294	25 %	0 %	25 %	50 %	205351657
8011	NC_011274	TAA	2	6	378295	378300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351657
8012	NC_011274	AATATA	2	12	378480	378491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351657
8013	NC_011274	CAT	2	6	378602	378607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351657
8014	NC_011274	A	6	6	378633	378638	100 %	0 %	0 %	0 %	205351657
8015	NC_011274	CGG	2	6	378698	378703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351657
8016	NC_011274	GGC	2	6	378750	378755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351657
8017	NC_011274	CGC	2	6	378909	378914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351657
8018	NC_011274	AG	3	6	378918	378923	50 %	0 %	50 %	0 %	205351657
8019	NC_011274	GAC	2	6	378952	378957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351657
8020	NC_011274	GCC	2	6	379243	379248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8021	NC_011274	CG	3	6	379307	379312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8022	NC_011274	CTG	2	6	379336	379341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8023	NC_011274	TCC	2	6	379345	379350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8024	NC_011274	GC	3	6	379488	379493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8025	NC_011274	GAA	2	6	379557	379562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_011274	TGT	2	6	379649	379654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_011274	CGT	2	6	379669	379674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8028	NC_011274	GC	3	6	379677	379682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8029	NC_011274	GCTATT	2	12	379690	379701	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8030	NC_011274	GCC	2	6	379717	379722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8031	NC_011274	GACTG	2	10	379794	379803	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8032	NC_011274	GGT	2	6	379951	379956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_011274	GTA	2	6	380047	380052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_011274	GGCT	2	8	380099	380106	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8035	NC_011274	AGT	2	6	380148	380153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_011274	AATC	2	8	380154	380161	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8037	NC_011274	GTTG	2	8	380215	380222	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_011274	GCC	2	6	380234	380239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8039	NC_011274	GGT	2	6	380257	380262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_011274	CG	3	6	380287	380292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8041	NC_011274	GC	4	8	380321	380328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8042	NC_011274	CGC	2	6	380379	380384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8043	NC_011274	GCCA	2	8	380387	380394	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8044	NC_011274	TTA	2	6	380444	380449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_011274	GTA	2	6	380494	380499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8047	NC_011274	CGG	2	6	380674	380679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8048	NC_011274	GTT	2	6	380709	380714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_011274	TAC	2	6	380716	380721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8050	NC_011274	GC	3	6	380727	380732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8051	NC_011274	TCG	2	6	380795	380800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8052	NC_011274	AGAC	2	8	380824	380831	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8053	NC_011274	TAT	2	6	380922	380927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_011274	TGA	2	6	380978	380983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_011274	TG	3	6	381067	381072	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_011274	CAGCGC	2	12	381100	381111	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8057	NC_011274	CG	3	6	381144	381149	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8058	NC_011274	GTCG	2	8	381265	381272	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8059	NC_011274	TGC	2	6	381292	381297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8060	NC_011274	TCA	2	6	381300	381305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8061	NC_011274	GCAG	2	8	381315	381322	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8062	NC_011274	ATA	2	6	381496	381501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_011274	TGG	2	6	381573	381578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351658
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8068	NC_011274	ATTTT	2	10	381921	381930	20 %	80 %	0 %	0 %	205351658
8069	NC_011274	TGG	2	6	381956	381961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351658
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8098	NC_011274	TC	3	6	383098	383103	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8099	NC_011274	TC	3	6	383197	383202	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8100	NC_011274	ATAG	2	8	383212	383219	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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8102	NC_011274	T	6	6	383355	383360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8105	NC_011274	ATA	2	6	383545	383550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8109	NC_011274	CTT	2	6	383702	383707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8110	NC_011274	A	6	6	383729	383734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_011274	ATT	2	6	383741	383746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_011274	TTTG	2	8	383750	383757	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_011274	TAG	2	6	383827	383832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8115	NC_011274	A	7	7	383908	383914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_011274	GTGA	2	8	383929	383936	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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8118	NC_011274	TA	4	8	384054	384061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_011274	T	7	7	384090	384096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_011274	AGT	2	6	384165	384170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8122	NC_011274	AAAATT	2	12	384190	384201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_011274	TAT	2	6	384226	384231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_011274	ATCGG	2	10	384357	384366	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8125	NC_011274	AAT	2	6	384408	384413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_011274	ATGG	2	8	384465	384472	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_011274	TAC	2	6	384524	384529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8128	NC_011274	T	7	7	384550	384556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8352	NC_011274	GGC	2	6	396224	396229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351669
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8358	NC_011274	CGT	2	6	396609	396614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351670
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