MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 chromosome

Total Repeats: 102321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_011205	CTT	2	6	663826	663831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14002	NC_011205	CGG	2	6	663857	663862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14003	NC_011205	AG	3	6	663881	663886	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14004	NC_011205	GCA	2	6	663907	663912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14005	NC_011205	CAG	2	6	663933	663938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14006	NC_011205	TGA	2	6	664104	664109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198241981
14007	NC_011205	TCA	2	6	664140	664145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198241981
14008	NC_011205	TCG	2	6	664183	664188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241981
14009	NC_011205	GCG	2	6	664218	664223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14010	NC_011205	GC	3	6	664263	664268	0 %	0 %	50 %	50 %	198244555
14011	NC_011205	AGA	2	6	664330	664335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198244555
14012	NC_011205	TCGC	2	8	664337	664344	0 %	25 %	25 %	50 %	198244555
14013	NC_011205	ATCACC	2	12	664364	664375	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	198244555
14014	NC_011205	GCA	2	6	664377	664382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198244555
14015	NC_011205	GCG	2	6	664403	664408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244555
14016	NC_011205	GTT	2	6	664424	664429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198244555
14017	NC_011205	TAA	2	6	664585	664590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198244555
14018	NC_011205	CTG	2	6	664663	664668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244555
14019	NC_011205	CTG	2	6	664711	664716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244555
14020	NC_011205	GGC	2	6	664729	664734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244555
14021	NC_011205	GCG	3	9	664761	664769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244555
14022	NC_011205	CGT	2	6	664816	664821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244555
14023	NC_011205	CAC	2	6	664906	664911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198244555
14024	NC_011205	GCG	2	6	665009	665014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244555
14025	NC_011205	CGC	2	6	665031	665036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244555
14026	NC_011205	A	6	6	665232	665237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14027	NC_011205	T	6	6	665262	665267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14028	NC_011205	TTAT	2	8	665272	665279	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14029	NC_011205	AGA	2	6	665317	665322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198245052
14030	NC_011205	ATT	2	6	665343	665348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198245052
14031	NC_011205	GGC	2	6	665375	665380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245052
14032	NC_011205	CGG	2	6	665438	665443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245052
14033	NC_011205	GCG	2	6	665535	665540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245052
14034	NC_011205	T	6	6	665549	665554	0 %	100 %	0 %	0 %	198245052
14035	NC_011205	G	6	6	665677	665682	0 %	0 %	100 %	0 %	198245052
14036	NC_011205	AAC	2	6	665738	665743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198245052
14037	NC_011205	GGT	2	6	665817	665822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198245052
14038	NC_011205	AGC	2	6	665885	665890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245052
14039	NC_011205	AGG	2	6	666004	666009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198245052
14040	NC_011205	GC	3	6	666037	666042	0 %	0 %	50 %	50 %	198245052
14041	NC_011205	CTG	2	6	666057	666062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245052
14042	NC_011205	GGCT	2	8	666089	666096	0 %	25 %	50 %	25 %	198245052
14043	NC_011205	GAAC	2	8	666125	666132	50 %	0 %	25 %	25 %	198245052
14044	NC_011205	ATC	2	6	666141	666146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198245052
14045	NC_011205	GAT	2	6	666150	666155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245052
14046	NC_011205	CGG	2	6	666169	666174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245052
14047	NC_011205	GAT	2	6	666234	666239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245052
14048	NC_011205	CT	3	6	666333	666338	0 %	50 %	0 %	50 %	198245052
14049	NC_011205	GAA	2	6	666354	666359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198245052
14050	NC_011205	GCG	2	6	666373	666378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245052
14051	NC_011205	GGT	2	6	666389	666394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198245052
14052	NC_011205	GGC	2	6	666407	666412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245052
14053	NC_011205	TGAG	2	8	666607	666614	25 %	25 %	50 %	0 %	198245052
14054	NC_011205	TCTCT	2	10	666626	666635	0 %	60 %	0 %	40 %	198245052
14055	NC_011205	ATAA	2	8	666651	666658	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_011205	T	8	8	666680	666687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14057	NC_011205	GAAA	2	8	666734	666741	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14058	NC_011205	TAT	2	6	666763	666768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_011205	ATT	2	6	666833	666838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198242981
14060	NC_011205	AT	3	6	666890	666895	50 %	50 %	0 %	0 %	198242981
14061	NC_011205	CGT	2	6	666970	666975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242981
14062	NC_011205	ATA	2	6	667003	667008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198242981
14063	NC_011205	TA	3	6	667030	667035	50 %	50 %	0 %	0 %	198242981
14064	NC_011205	ACT	2	6	667145	667150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198243469
14065	NC_011205	T	6	6	667214	667219	0 %	100 %	0 %	0 %	198243469
14066	NC_011205	GAA	2	6	667233	667238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198243469
14067	NC_011205	GGA	2	6	667277	667282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198243469
14068	NC_011205	AAT	2	6	667302	667307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198243469
14069	NC_011205	GTG	2	6	667335	667340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198243469
14070	NC_011205	GGCG	2	8	667397	667404	0 %	0 %	75 %	25 %	198243469
14071	NC_011205	CAC	2	6	667451	667456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198243469
14072	NC_011205	GGC	2	6	667522	667527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243469
14073	NC_011205	TGA	2	6	667564	667569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198243469
14074	NC_011205	CGTT	2	8	667587	667594	0 %	50 %	25 %	25 %	198243469
14075	NC_011205	TCG	2	6	667651	667656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14076	NC_011205	TGA	2	6	667686	667691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14077	NC_011205	ATG	2	6	667692	667697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14078	NC_011205	GCC	2	6	667822	667827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198243015
14079	NC_011205	TGCG	2	8	667878	667885	0 %	25 %	50 %	25 %	198243015
14080	NC_011205	CAT	2	6	667940	667945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198243015
14081	NC_011205	CG	3	6	667979	667984	0 %	0 %	50 %	50 %	198243015
14082	NC_011205	GCC	2	6	667989	667994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198243015
14083	NC_011205	CAT	2	6	668030	668035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198243015
14084	NC_011205	GGC	2	6	668086	668091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243015
14085	NC_011205	CTG	3	9	668174	668182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243015
14086	NC_011205	GTC	2	6	668240	668245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243015
14087	NC_011205	TAAT	2	8	668296	668303	50 %	50 %	0 %	0 %	198243015
14088	NC_011205	CTG	3	9	668309	668317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243015
14089	NC_011205	CG	3	6	668344	668349	0 %	0 %	50 %	50 %	198243015
14090	NC_011205	GGC	2	6	668351	668356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243015
14091	NC_011205	CTG	2	6	668372	668377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243015
14092	NC_011205	AAAT	2	8	668410	668417	75 %	25 %	0 %	0 %	198243015
14093	NC_011205	GCAG	2	8	668419	668426	25 %	0 %	50 %	25 %	198243015
14094	NC_011205	CTT	2	6	668461	668466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198243015
14095	NC_011205	TCA	2	6	668518	668523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198243015
14096	NC_011205	GAT	2	6	668539	668544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198243015
14097	NC_011205	TCG	2	6	668559	668564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243015
14098	NC_011205	GGC	2	6	668642	668647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243015
14099	NC_011205	GGC	2	6	668696	668701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243015
14100	NC_011205	CGA	2	6	668727	668732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198243015
14101	NC_011205	GCT	2	6	668797	668802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243015
14102	NC_011205	TGA	2	6	668842	668847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198243015
14103	NC_011205	TGA	2	6	668860	668865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198243015
14104	NC_011205	A	6	6	668948	668953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14105	NC_011205	GC	3	6	669047	669052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14106	NC_011205	CTTTT	2	10	669056	669065	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14107	NC_011205	T	7	7	669082	669088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14108	NC_011205	TAACGT	2	12	669095	669106	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14109	NC_011205	GAA	2	6	669251	669256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198243499
14110	NC_011205	GCG	2	6	669313	669318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243499
14111	NC_011205	TTG	2	6	669381	669386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198243499
14112	NC_011205	CGG	2	6	669574	669579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243499
14113	NC_011205	GCG	3	9	669627	669635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243499
14114	NC_011205	T	6	6	669636	669641	0 %	100 %	0 %	0 %	198243499
14115	NC_011205	GCT	2	6	669755	669760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243499
14116	NC_011205	CGG	2	6	669773	669778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243499
14117	NC_011205	TTC	2	6	669819	669824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198243499
14118	NC_011205	GCG	2	6	669906	669911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243499
14119	NC_011205	GC	3	6	669915	669920	0 %	0 %	50 %	50 %	198243499
14120	NC_011205	A	6	6	669928	669933	100 %	0 %	0 %	0 %	198243499
14121	NC_011205	GGT	2	6	669956	669961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198243499
14122	NC_011205	TGG	2	6	669994	669999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198243499
14123	NC_011205	AGC	2	6	670041	670046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198243499
14124	NC_011205	TGA	2	6	670054	670059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198243499
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14127	NC_011205	TA	3	6	670132	670137	50 %	50 %	0 %	0 %	198243499
14128	NC_011205	GCG	2	6	670141	670146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243499
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14131	NC_011205	CGT	2	6	670401	670406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243499
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14135	NC_011205	TGA	2	6	670689	670694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198241993
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14220	NC_011205	A	6	6	674411	674416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14221	NC_011205	ATG	2	6	674519	674524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245168
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14231	NC_011205	CG	3	6	674923	674928	0 %	0 %	50 %	50 %	198245168
14232	NC_011205	CTT	2	6	674935	674940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198245168
14233	NC_011205	CTGTA	2	10	674991	675000	20 %	40 %	20 %	20 %	198245168
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14237	NC_011205	TGGT	2	8	675110	675117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14238	NC_011205	CAG	2	6	675135	675140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14239	NC_011205	GGA	2	6	675169	675174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14240	NC_011205	CT	3	6	675221	675226	0 %	50 %	0 %	50 %	198242876
14241	NC_011205	TTG	2	6	675368	675373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198242876
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14243	NC_011205	CAG	2	6	675495	675500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242876
14244	NC_011205	ATT	2	6	675564	675569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198242876
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14246	NC_011205	GC	4	8	675585	675592	0 %	0 %	50 %	50 %	198242200
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14357	NC_011205	GAAT	2	8	681214	681221	50 %	25 %	25 %	0 %	198245596
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14360	NC_011205	CG	3	6	681310	681315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14361	NC_011205	TGCAAA	2	12	681340	681351	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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14364	NC_011205	AT	3	6	681373	681378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14365	NC_011205	TA	3	6	681388	681393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14366	NC_011205	ATA	2	6	681402	681407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14368	NC_011205	TGG	2	6	681521	681526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198245274
14369	NC_011205	GAAAC	2	10	681540	681549	60 %	0 %	20 %	20 %	198245274
14370	NC_011205	AC	3	6	681548	681553	50 %	0 %	0 %	50 %	198245274
14371	NC_011205	ATC	3	9	681597	681605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198245274
14372	NC_011205	GGA	2	6	681839	681844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198245274
14373	NC_011205	GGGAT	2	10	681895	681904	20 %	20 %	60 %	0 %	198245274
14374	NC_011205	CGC	2	6	681924	681929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245274
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14377	NC_011205	GAC	2	6	681988	681993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245274
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14381	NC_011205	CTG	2	6	682124	682129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245274
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14391	NC_011205	GCGT	2	8	682461	682468	0 %	25 %	50 %	25 %	198245274
14392	NC_011205	GCA	2	6	682522	682527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245274
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14443	NC_011205	TGG	2	6	684722	684727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198242266
14444	NC_011205	GCT	2	6	684750	684755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242266
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14452	NC_011205	GCG	2	6	685046	685051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242266
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14462	NC_011205	GTTGT	2	10	685690	685699	0 %	60 %	40 %	0 %	198242266
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14479	NC_011205	TTA	2	6	686284	686289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198242266
14480	NC_011205	CGC	2	6	686325	686330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242266
14481	NC_011205	GC	5	10	686337	686346	0 %	0 %	50 %	50 %	198242266
14482	NC_011205	GCC	2	6	686385	686390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242266
14483	NC_011205	TGAACG	2	12	686454	686465	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	198242266
14484	NC_011205	CGC	2	6	686478	686483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242266
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14486	NC_011205	CCGT	2	8	686543	686550	0 %	25 %	25 %	50 %	198242266
14487	NC_011205	GAC	2	6	686556	686561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242266
14488	NC_011205	CGT	2	6	686663	686668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242266
14489	NC_011205	GC	3	6	686690	686695	0 %	0 %	50 %	50 %	198242266
14490	NC_011205	ATT	2	6	686704	686709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198242266
14491	NC_011205	CAT	2	6	686739	686744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242266
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14493	NC_011205	ATAA	2	8	686759	686766	75 %	25 %	0 %	0 %	198242266
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14497	NC_011205	T	6	6	686833	686838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14498	NC_011205	GC	3	6	686921	686926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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