MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 chromosome

Total Repeats: 102321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_011205	TCA	2	6	564378	564383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242253
12002	NC_011205	GC	3	6	564467	564472	0 %	0 %	50 %	50 %	198243760
12003	NC_011205	CCGT	2	8	564526	564533	0 %	25 %	25 %	50 %	198243760
12004	NC_011205	CGG	2	6	564560	564565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243760
12005	NC_011205	GTT	2	6	564573	564578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198243760
12006	NC_011205	GGC	2	6	564594	564599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243760
12007	NC_011205	GTCG	2	8	564601	564608	0 %	25 %	50 %	25 %	198243760
12008	NC_011205	ACGCG	2	10	564623	564632	20 %	0 %	40 %	40 %	198243760
12009	NC_011205	CCAG	2	8	564633	564640	25 %	0 %	25 %	50 %	198243760
12010	NC_011205	CCA	2	6	564643	564648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198243760
12011	NC_011205	GCC	2	6	564656	564661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198243760
12012	NC_011205	GCC	2	6	564743	564748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198243760
12013	NC_011205	CGC	2	6	564750	564755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198243760
12014	NC_011205	CAA	2	6	564796	564801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198243760
12015	NC_011205	GCC	2	6	564805	564810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198243760
12016	NC_011205	AGA	2	6	564822	564827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198243760
12017	NC_011205	ATC	2	6	564845	564850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198243760
12018	NC_011205	T	6	6	564861	564866	0 %	100 %	0 %	0 %	198243283
12019	NC_011205	CTG	2	6	564925	564930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243283
12020	NC_011205	CAT	2	6	564942	564947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198243283
12021	NC_011205	GCCGA	2	10	564967	564976	20 %	0 %	40 %	40 %	198243283
12022	NC_011205	AGT	2	6	565013	565018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198243283
12023	NC_011205	CGG	2	6	565037	565042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243283
12024	NC_011205	CGG	2	6	565085	565090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243283
12025	NC_011205	CG	3	6	565097	565102	0 %	0 %	50 %	50 %	198243283
12026	NC_011205	GAG	2	6	565261	565266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198243283
12027	NC_011205	CGGG	2	8	565277	565284	0 %	0 %	75 %	25 %	198243283
12028	NC_011205	TGG	2	6	565331	565336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198243283
12029	NC_011205	AGC	2	6	565354	565359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198243283
12030	NC_011205	TGGTCA	2	12	565430	565441	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	198243283
12031	NC_011205	GCG	2	6	565480	565485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243283
12032	NC_011205	CG	3	6	565484	565489	0 %	0 %	50 %	50 %	198243283
12033	NC_011205	CCT	2	6	565556	565561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198243283
12034	NC_011205	CAT	2	6	565587	565592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198243283
12035	NC_011205	ACA	2	6	565627	565632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198243283
12036	NC_011205	CGA	2	6	565724	565729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198243283
12037	NC_011205	CGA	2	6	565739	565744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198243283
12038	NC_011205	CCT	2	6	565780	565785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12039	NC_011205	C	6	6	565855	565860	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12040	NC_011205	TTA	2	6	565861	565866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12041	NC_011205	AAC	2	6	565900	565905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12042	NC_011205	CGA	2	6	565971	565976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198243437
12043	NC_011205	GTT	2	6	566062	566067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198243437
12044	NC_011205	TGG	2	6	566073	566078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198243437
12045	NC_011205	TAA	2	6	566085	566090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198243437
12046	NC_011205	TAC	2	6	566131	566136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198243437
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12049	NC_011205	CGA	2	6	566401	566406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198243437
12050	NC_011205	GC	3	6	566415	566420	0 %	0 %	50 %	50 %	198243437
12051	NC_011205	AACA	2	8	566432	566439	75 %	0 %	0 %	25 %	198243437
12052	NC_011205	ATT	2	6	566453	566458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198243437
12053	NC_011205	GA	3	6	566562	566567	50 %	0 %	50 %	0 %	198243437
12054	NC_011205	ATA	2	6	566593	566598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198243437
12055	NC_011205	TGC	2	6	566626	566631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241812
12056	NC_011205	TGG	3	9	566632	566640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198241812
12057	NC_011205	TCA	2	6	566650	566655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198241812
12058	NC_011205	ATT	2	6	566724	566729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198241812
12059	NC_011205	GCC	2	6	566769	566774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241812
12060	NC_011205	GCT	2	6	566780	566785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241812
12061	NC_011205	CGC	2	6	566810	566815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241812
12062	NC_011205	AT	3	6	566840	566845	50 %	50 %	0 %	0 %	198241812
12063	NC_011205	TC	3	6	566858	566863	0 %	50 %	0 %	50 %	198241812
12064	NC_011205	TGG	2	6	566986	566991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198241812
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12066	NC_011205	AGC	3	9	567037	567045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241812
12067	NC_011205	CGA	2	6	567133	567138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241812
12068	NC_011205	GAT	2	6	567179	567184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198241812
12069	NC_011205	GATC	2	8	567206	567213	25 %	25 %	25 %	25 %	198241812
12070	NC_011205	TGT	2	6	567256	567261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198241812
12071	NC_011205	CAGC	2	8	567265	567272	25 %	0 %	25 %	50 %	198241812
12072	NC_011205	CAT	2	6	567281	567286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198241812
12073	NC_011205	TCA	2	6	567326	567331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198241812
12074	NC_011205	GAT	2	6	567372	567377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12075	NC_011205	GAC	2	6	567404	567409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12076	NC_011205	GC	3	6	567425	567430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12077	NC_011205	AG	3	6	567440	567445	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12078	NC_011205	GGC	2	6	567471	567476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242491
12079	NC_011205	CGG	3	9	567552	567560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242491
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12082	NC_011205	GTTGC	2	10	567639	567648	0 %	40 %	40 %	20 %	198242491
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12087	NC_011205	CCT	2	6	567921	567926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198242491
12088	NC_011205	TTG	2	6	567943	567948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198242491
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12090	NC_011205	CAG	2	6	567985	567990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242491
12091	NC_011205	GC	3	6	568073	568078	0 %	0 %	50 %	50 %	198242491
12092	NC_011205	GCG	2	6	568091	568096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242491
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12096	NC_011205	GC	3	6	568350	568355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12097	NC_011205	CCGGC	2	10	568389	568398	0 %	0 %	40 %	60 %	198245234
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12103	NC_011205	TCA	2	6	568742	568747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198245234
12104	NC_011205	GC	3	6	568805	568810	0 %	0 %	50 %	50 %	198245234
12105	NC_011205	GAA	2	6	568812	568817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198245234
12106	NC_011205	TGG	2	6	568856	568861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198245234
12107	NC_011205	CGG	2	6	568940	568945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245234
12108	NC_011205	GATC	2	8	568973	568980	25 %	25 %	25 %	25 %	198245234
12109	NC_011205	CAT	2	6	569018	569023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198245234
12110	NC_011205	GC	3	6	569075	569080	0 %	0 %	50 %	50 %	198245234
12111	NC_011205	TTA	2	6	569111	569116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198245234
12112	NC_011205	CGTT	2	8	569208	569215	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12113	NC_011205	GCC	2	6	569262	569267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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12115	NC_011205	GA	3	6	569291	569296	50 %	0 %	50 %	0 %	198246046
12116	NC_011205	A	6	6	569407	569412	100 %	0 %	0 %	0 %	198246046
12117	NC_011205	CGG	2	6	569532	569537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198246046
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12119	NC_011205	CCA	2	6	569622	569627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198246046
12120	NC_011205	CTG	2	6	569680	569685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198246046
12121	NC_011205	CGAC	2	8	569715	569722	25 %	0 %	25 %	50 %	198246046
12122	NC_011205	GTTTT	2	10	569723	569732	0 %	80 %	20 %	0 %	198246046
12123	NC_011205	GGC	2	6	569770	569775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198246046
12124	NC_011205	TAA	2	6	569812	569817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198246046
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12126	NC_011205	GCT	2	6	570024	570029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244920
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12128	NC_011205	GTTTT	2	10	570143	570152	0 %	80 %	20 %	0 %	198244920
12129	NC_011205	GCT	2	6	570258	570263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244920
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12222	NC_011205	GCCT	2	8	574375	574382	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12223	NC_011205	AC	3	6	574396	574401	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12224	NC_011205	CAT	2	6	574409	574414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12225	NC_011205	AAT	2	6	574417	574422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12226	NC_011205	CAG	2	6	574431	574436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12227	NC_011205	GCA	2	6	574777	574782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242922
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12229	NC_011205	A	6	6	574923	574928	100 %	0 %	0 %	0 %	198242922
12230	NC_011205	ATT	2	6	574935	574940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198242922
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12232	NC_011205	GC	3	6	575131	575136	0 %	0 %	50 %	50 %	198242922
12233	NC_011205	GGC	2	6	575159	575164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242922
12234	NC_011205	TC	3	6	575174	575179	0 %	50 %	0 %	50 %	198242922
12235	NC_011205	CG	3	6	575301	575306	0 %	0 %	50 %	50 %	198242922
12236	NC_011205	CGA	2	6	575312	575317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242922
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12238	NC_011205	CG	4	8	575467	575474	0 %	0 %	50 %	50 %	198242263
12239	NC_011205	GAT	2	6	575478	575483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242263
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12241	NC_011205	GCG	2	6	575533	575538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242263
12242	NC_011205	CTG	2	6	575553	575558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242263
12243	NC_011205	CCAG	2	8	575584	575591	25 %	0 %	25 %	50 %	198242263
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12340	NC_011205	T	6	6	580843	580848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12341	NC_011205	ATGT	2	8	580930	580937	25 %	50 %	25 %	0 %	198245781
12342	NC_011205	AAG	2	6	580946	580951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198245781
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12431	NC_011205	ATTT	2	8	585795	585802	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12483	NC_011205	CAG	2	6	588572	588577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242835
12484	NC_011205	AGTC	2	8	588617	588624	25 %	25 %	25 %	25 %	198242835
12485	NC_011205	GC	3	6	588646	588651	0 %	0 %	50 %	50 %	198242835
12486	NC_011205	GCG	2	6	588673	588678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242835
12487	NC_011205	TTAT	2	8	588682	588689	25 %	75 %	0 %	0 %	198242835
12488	NC_011205	GCC	2	6	588713	588718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242835
12489	NC_011205	CAG	2	6	588744	588749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242835
12490	NC_011205	CGT	2	6	588772	588777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12491	NC_011205	ACG	2	6	588779	588784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12496	NC_011205	ACC	2	6	588964	588969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198242175
12497	NC_011205	GCCT	2	8	588976	588983	0 %	25 %	25 %	50 %	198242175
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