MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 chromosome

Total Repeats: 102321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_011205	CG	3	6	541217	541222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11502	NC_011205	GC	3	6	541233	541238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11503	NC_011205	GC	4	8	541343	541350	0 %	0 %	50 %	50 %	198244801
11504	NC_011205	TTC	2	6	541429	541434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198244801
11505	NC_011205	TCA	2	6	541452	541457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198244801
11506	NC_011205	GTT	2	6	541458	541463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198244801
11507	NC_011205	GCG	2	6	541473	541478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244801
11508	NC_011205	GCG	2	6	541517	541522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244801
11509	NC_011205	AC	3	6	541551	541556	50 %	0 %	0 %	50 %	198244801
11510	NC_011205	CCG	2	6	541669	541674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244801
11511	NC_011205	TGC	2	6	541676	541681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244801
11512	NC_011205	GTC	2	6	541703	541708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244801
11513	NC_011205	ACC	2	6	541832	541837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198244801
11514	NC_011205	GGC	2	6	541879	541884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244801
11515	NC_011205	AG	3	6	541982	541987	50 %	0 %	50 %	0 %	198244801
11516	NC_011205	CAA	2	6	542025	542030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198244801
11517	NC_011205	GCG	2	6	542157	542162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244801
11518	NC_011205	TGG	2	6	542163	542168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198244801
11519	NC_011205	TTG	2	6	542192	542197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_011205	GTC	2	6	542266	542271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245151
11521	NC_011205	GC	3	6	542319	542324	0 %	0 %	50 %	50 %	198245151
11522	NC_011205	AGC	2	6	542360	542365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245151
11523	NC_011205	TCA	2	6	542393	542398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198245151
11524	NC_011205	TGT	2	6	542532	542537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198244419
11525	NC_011205	AGT	2	6	542592	542597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244419
11526	NC_011205	GCG	3	9	542655	542663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244419
11527	NC_011205	GGC	2	6	542684	542689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244419
11528	NC_011205	GCCA	2	8	542733	542740	25 %	0 %	25 %	50 %	198244419
11529	NC_011205	GC	4	8	542861	542868	0 %	0 %	50 %	50 %	198244419
11530	NC_011205	GCG	2	6	542890	542895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244419
11531	NC_011205	CT	3	6	542922	542927	0 %	50 %	0 %	50 %	198244419
11532	NC_011205	TTCAA	2	10	542955	542964	40 %	40 %	0 %	20 %	198244419
11533	NC_011205	ATC	2	6	543046	543051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198244769
11534	NC_011205	TGGC	3	12	543054	543065	0 %	25 %	50 %	25 %	198244769
11535	NC_011205	GTA	2	6	543067	543072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244769
11536	NC_011205	GGC	2	6	543129	543134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244769
11537	NC_011205	TCG	2	6	543151	543156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244769
11538	NC_011205	GTT	2	6	543174	543179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198244769
11539	NC_011205	GCC	2	6	543234	543239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244769
11540	NC_011205	ATG	2	6	543307	543312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244769
11541	NC_011205	GGGTGC	2	12	543314	543325	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	198244769
11542	NC_011205	CTG	2	6	543349	543354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244769
11543	NC_011205	TGAT	2	8	543377	543384	25 %	50 %	25 %	0 %	198244769
11544	NC_011205	CAA	2	6	543391	543396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198244769
11545	NC_011205	CAGGCG	2	12	543467	543478	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11546	NC_011205	AT	3	6	543550	543555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11547	NC_011205	CAG	2	6	543573	543578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198243180
11548	NC_011205	GTTG	2	8	543698	543705	0 %	50 %	50 %	0 %	198243180
11549	NC_011205	GC	3	6	543769	543774	0 %	0 %	50 %	50 %	198243180
11550	NC_011205	TGGGC	2	10	543785	543794	0 %	20 %	60 %	20 %	198243180
11551	NC_011205	CTG	2	6	543939	543944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243180
11552	NC_011205	GGC	2	6	543951	543956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243180
11553	NC_011205	CGT	2	6	543984	543989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243180
11554	NC_011205	GCG	2	6	544011	544016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243180
11555	NC_011205	TCA	3	9	544018	544026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198243180
11556	NC_011205	GCG	2	6	544042	544047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243180
11557	NC_011205	AGC	2	6	544048	544053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198243180
11558	NC_011205	AG	3	6	544139	544144	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_011205	CGT	2	6	544273	544278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243935
11560	NC_011205	TCA	2	6	544333	544338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198243935
11561	NC_011205	T	6	6	544347	544352	0 %	100 %	0 %	0 %	198243935
11562	NC_011205	CG	3	6	544359	544364	0 %	0 %	50 %	50 %	198243935
11563	NC_011205	CTG	2	6	544391	544396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243935
11564	NC_011205	GCG	2	6	544440	544445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243935
11565	NC_011205	CGC	2	6	544504	544509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198243935
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11567	NC_011205	GC	3	6	544568	544573	0 %	0 %	50 %	50 %	198243935
11568	NC_011205	GCC	2	6	544657	544662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198243935
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11572	NC_011205	CTGA	2	8	544880	544887	25 %	25 %	25 %	25 %	198243935
11573	NC_011205	GCG	2	6	544902	544907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243935
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11592	NC_011205	GC	4	8	545479	545486	0 %	0 %	50 %	50 %	198243935
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11595	NC_011205	CG	4	8	545531	545538	0 %	0 %	50 %	50 %	198243935
11596	NC_011205	GC	3	6	545594	545599	0 %	0 %	50 %	50 %	198243935
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11607	NC_011205	GGAA	2	8	545850	545857	50 %	0 %	50 %	0 %	198243935
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11617	NC_011205	AG	5	10	546184	546193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11618	NC_011205	TGA	2	6	546225	546230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242833
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11982	NC_011205	CAT	2	6	563253	563258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242788
11983	NC_011205	ATC	2	6	563269	563274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242788
11984	NC_011205	ACCG	2	8	563295	563302	25 %	0 %	25 %	50 %	198242788
11985	NC_011205	CGA	2	6	563309	563314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242788
11986	NC_011205	TGG	2	6	563339	563344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198242788
11987	NC_011205	CTG	2	6	563358	563363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242788
11988	NC_011205	GCG	2	6	563440	563445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242788
11989	NC_011205	TGT	2	6	563527	563532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198242788
11990	NC_011205	TTC	2	6	563586	563591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198242788
11991	NC_011205	TGA	2	6	563649	563654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242788
11992	NC_011205	GTT	2	6	563798	563803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198242788
11993	NC_011205	TCA	2	6	563903	563908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11994	NC_011205	A	7	7	564010	564016	100 %	0 %	0 %	0 %	198242253
11995	NC_011205	CGC	2	6	564068	564073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242253
11996	NC_011205	TGC	2	6	564134	564139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242253
11997	NC_011205	CAAT	2	8	564283	564290	50 %	25 %	0 %	25 %	198242253
11998	NC_011205	CTG	2	6	564301	564306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242253
11999	NC_011205	ATT	2	6	564352	564357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198242253
12000	NC_011205	GCT	2	6	564371	564376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242253

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