MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 chromosome

Total Repeats: 102321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_011205	AAG	2	6	228569	228574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198244279
5003	NC_011205	CGG	3	9	228645	228653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244279
5004	NC_011205	ACC	2	6	228686	228691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198244279
5005	NC_011205	GCG	3	9	228754	228762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244279
5006	NC_011205	CAG	2	6	228834	228839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198244279
5007	NC_011205	ATC	2	6	228878	228883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_011205	A	7	7	228918	228924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_011205	TA	3	6	228930	228935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_011205	A	6	6	228968	228973	100 %	0 %	0 %	0 %	198242771
5011	NC_011205	GTG	2	6	228998	229003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198242771
5012	NC_011205	GAT	2	6	229085	229090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242771
5013	NC_011205	TC	3	6	229102	229107	0 %	50 %	0 %	50 %	198242771
5014	NC_011205	ATC	2	6	229146	229151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242771
5015	NC_011205	TTA	2	6	229194	229199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198242771
5016	NC_011205	ATA	2	6	229212	229217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198242771
5017	NC_011205	GCT	2	6	229264	229269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242771
5018	NC_011205	ATT	2	6	229391	229396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198242771
5019	NC_011205	TAT	2	6	229470	229475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198242771
5020	NC_011205	ATG	2	6	229515	229520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242771
5021	NC_011205	GC	3	6	229585	229590	0 %	0 %	50 %	50 %	198242771
5022	NC_011205	GGCG	2	8	229692	229699	0 %	0 %	75 %	25 %	198242771
5023	NC_011205	GGC	2	6	229778	229783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242771
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5026	NC_011205	GC	3	6	229853	229858	0 %	0 %	50 %	50 %	198242771
5027	NC_011205	GCGG	2	8	229887	229894	0 %	0 %	75 %	25 %	198242771
5028	NC_011205	GAA	2	6	229982	229987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198242771
5029	NC_011205	GGC	2	6	230111	230116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242771
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5031	NC_011205	CGG	2	6	230170	230175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242771
5032	NC_011205	GCT	2	6	230233	230238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242771
5033	NC_011205	TGA	2	6	230353	230358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242771
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5035	NC_011205	TGA	2	6	230680	230685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242771
5036	NC_011205	CAA	2	6	230719	230724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198242771
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5038	NC_011205	CG	3	6	230831	230836	0 %	0 %	50 %	50 %	198242771
5039	NC_011205	CTA	2	6	230860	230865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242771
5040	NC_011205	TCA	2	6	230869	230874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242771
5041	NC_011205	CGG	2	6	230932	230937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242771
5042	NC_011205	GCG	2	6	230952	230957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242771
5043	NC_011205	GCACC	2	10	230986	230995	20 %	0 %	20 %	60 %	198242771
5044	NC_011205	CGG	2	6	231004	231009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242771
5045	NC_011205	GCT	2	6	231016	231021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242771
5046	NC_011205	TA	3	6	231075	231080	50 %	50 %	0 %	0 %	198242771
5047	NC_011205	ACT	2	6	231120	231125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242771
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5050	NC_011205	GGC	2	6	231284	231289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242771
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5053	NC_011205	TGC	2	6	231477	231482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242771
5054	NC_011205	TCA	2	6	231500	231505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242771
5055	NC_011205	GCG	2	6	231556	231561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242771
5056	NC_011205	CT	3	6	231587	231592	0 %	50 %	0 %	50 %	198242771
5057	NC_011205	ATG	2	6	231631	231636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245513
5058	NC_011205	TGC	2	6	231668	231673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245513
5059	NC_011205	GGC	2	6	231682	231687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245513
5060	NC_011205	GCC	2	6	231703	231708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245513
5061	NC_011205	TCG	2	6	231854	231859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245513
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5065	NC_011205	CCGC	2	8	232047	232054	0 %	0 %	25 %	75 %	198245513
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5069	NC_011205	CCAG	2	8	232195	232202	25 %	0 %	25 %	50 %	198245513
5070	NC_011205	GC	3	6	232307	232312	0 %	0 %	50 %	50 %	198245513
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5073	NC_011205	CGG	2	6	232545	232550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241827
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5113	NC_011205	GTT	2	6	234843	234848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5123	NC_011205	ACC	2	6	235102	235107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198244305
5124	NC_011205	CTT	2	6	235121	235126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198244305
5125	NC_011205	GTG	2	6	235159	235164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198244305
5126	NC_011205	TTCA	2	8	235203	235210	25 %	50 %	0 %	25 %	198244305
5127	NC_011205	GCC	2	6	235225	235230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244305
5128	NC_011205	CGA	2	6	235306	235311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198244305
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5130	NC_011205	GAT	2	6	235344	235349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244305
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5132	NC_011205	ACG	2	6	235375	235380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198244305
5133	NC_011205	GTA	2	6	235383	235388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244305
5134	NC_011205	TCA	2	6	235424	235429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198244305
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5141	NC_011205	GC	3	6	235673	235678	0 %	0 %	50 %	50 %	198244305
5142	NC_011205	CAG	2	6	235695	235700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198244305
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5145	NC_011205	GCC	2	6	236052	236057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244305
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5147	NC_011205	TCT	2	6	236307	236312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5148	NC_011205	CGC	2	6	236405	236410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198243476
5149	NC_011205	GGC	2	6	236427	236432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243476
5150	NC_011205	GC	3	6	236510	236515	0 %	0 %	50 %	50 %	198243476
5151	NC_011205	GGC	2	6	236626	236631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243476
5152	NC_011205	GC	3	6	236654	236659	0 %	0 %	50 %	50 %	198243476
5153	NC_011205	GGA	2	6	236661	236666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198243476
5154	NC_011205	TGG	2	6	236683	236688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198243476
5155	NC_011205	CGG	2	6	236712	236717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243476
5156	NC_011205	CGGCG	2	10	236853	236862	0 %	0 %	60 %	40 %	198243476
5157	NC_011205	CT	3	6	236869	236874	0 %	50 %	0 %	50 %	198243476
5158	NC_011205	GCG	2	6	236875	236880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243476
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5164	NC_011205	ATT	2	6	237091	237096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198243476
5165	NC_011205	TGC	2	6	237131	237136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243476
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5192	NC_011205	CTTC	2	8	238145	238152	0 %	50 %	0 %	50 %	198242974
5193	NC_011205	TTG	2	6	238162	238167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5220	NC_011205	GCT	2	6	239576	239581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243001
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5223	NC_011205	CG	3	6	239647	239652	0 %	0 %	50 %	50 %	198243001
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5231	NC_011205	CCGG	2	8	240061	240068	0 %	0 %	50 %	50 %	198242662
5232	NC_011205	CGT	2	6	240116	240121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242662
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5237	NC_011205	GCA	2	6	240365	240370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242662
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5239	NC_011205	ATG	2	6	240397	240402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242662
5240	NC_011205	ATCG	2	8	240503	240510	25 %	25 %	25 %	25 %	198242011
5241	NC_011205	TCG	2	6	240536	240541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242011
5242	NC_011205	GCA	2	6	240641	240646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242011
5243	NC_011205	A	6	6	240646	240651	100 %	0 %	0 %	0 %	198242011
5244	NC_011205	GCA	2	6	240716	240721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242011
5245	NC_011205	GCC	2	6	240754	240759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242011
5246	NC_011205	GGA	2	6	240779	240784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198242011
5247	NC_011205	GCCT	2	8	240834	240841	0 %	25 %	25 %	50 %	198242011
5248	NC_011205	CCG	2	6	240861	240866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242011
5249	NC_011205	GGC	2	6	240884	240889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242011
5250	NC_011205	TG	3	6	240960	240965	0 %	50 %	50 %	0 %	198242011
5251	NC_011205	GAA	2	6	240993	240998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198242011
5252	NC_011205	CGC	2	6	241014	241019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242011
5253	NC_011205	TGG	2	6	241146	241151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198242011
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5261	NC_011205	TAAA	2	8	241519	241526	75 %	25 %	0 %	0 %	198242011
5262	NC_011205	GCT	2	6	241598	241603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242011
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5265	NC_011205	TGG	2	6	241780	241785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198242011
5266	NC_011205	GTC	2	6	241869	241874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242011
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5270	NC_011205	A	7	7	242148	242154	100 %	0 %	0 %	0 %	198246202
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5302	NC_011205	CCA	2	6	243590	243595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5303	NC_011205	CTT	2	6	243641	243646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5304	NC_011205	TGCTC	2	10	243702	243711	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5305	NC_011205	AGG	2	6	243714	243719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5306	NC_011205	TGGC	3	12	243726	243737	0 %	25 %	50 %	25 %	198243155
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5322	NC_011205	TGG	2	6	244350	244355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198243155
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5361	NC_011205	CGC	2	6	246222	246227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198246109
5362	NC_011205	GCG	2	6	246279	246284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198246109
5363	NC_011205	TGC	2	6	246570	246575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198246109
5364	NC_011205	CCAG	2	8	246690	246697	25 %	0 %	25 %	50 %	198246109
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5491	NC_011205	GC	3	6	252066	252071	0 %	0 %	50 %	50 %	198245098
5492	NC_011205	CGC	3	9	252087	252095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245098
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