MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 101713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_011149	TGGC	2	8	821639	821646	0 %	25 %	50 %	25 %	197251912
17502	NC_011149	T	6	6	821752	821757	0 %	100 %	0 %	0 %	197251912
17503	NC_011149	GCT	2	6	821785	821790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197251912
17504	NC_011149	TGC	2	6	821835	821840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17505	NC_011149	GGCGC	2	10	821846	821855	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
17506	NC_011149	CGC	2	6	821897	821902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17507	NC_011149	GCGA	2	8	821949	821956	25 %	0 %	50 %	25 %	197251204
17508	NC_011149	CGC	2	6	821986	821991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197251204
17509	NC_011149	TCA	2	6	822000	822005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197251204
17510	NC_011149	GGC	2	6	822069	822074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251204
17511	NC_011149	GCCGC	2	10	822075	822084	0 %	0 %	40 %	60 %	197251204
17512	NC_011149	CCA	2	6	822139	822144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197251204
17513	NC_011149	CG	3	6	822172	822177	0 %	0 %	50 %	50 %	197251204
17514	NC_011149	CCG	2	6	822181	822186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197251204
17515	NC_011149	CAC	3	9	822194	822202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197251204
17516	NC_011149	CCA	2	6	822209	822214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197251204
17517	NC_011149	CGT	2	6	822280	822285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197251204
17518	NC_011149	GCG	2	6	822298	822303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251204
17519	NC_011149	CAT	2	6	822316	822321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197251204
17520	NC_011149	AGC	2	6	822431	822436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17521	NC_011149	A	6	6	822461	822466	100 %	0 %	0 %	0 %	197249182
17522	NC_011149	AAT	2	6	822527	822532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197249182
17523	NC_011149	GGC	2	6	822537	822542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249182
17524	NC_011149	CGA	2	6	822589	822594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249182
17525	NC_011149	GCC	2	6	822609	822614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249182
17526	NC_011149	ACC	2	6	822639	822644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197249182
17527	NC_011149	CTG	2	6	822737	822742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249182
17528	NC_011149	CGC	2	6	822751	822756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249182
17529	NC_011149	CAG	2	6	822761	822766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249182
17530	NC_011149	GCC	2	6	822905	822910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249182
17531	NC_011149	CAG	2	6	823016	823021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249182
17532	NC_011149	GAT	2	6	823069	823074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197249182
17533	NC_011149	AT	3	6	823073	823078	50 %	50 %	0 %	0 %	197249182
17534	NC_011149	CCCG	2	8	823085	823092	0 %	0 %	25 %	75 %	197249182
17535	NC_011149	CGG	2	6	823120	823125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249182
17536	NC_011149	CCAT	2	8	823191	823198	25 %	25 %	0 %	50 %	197249182
17537	NC_011149	GCG	2	6	823207	823212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249182
17538	NC_011149	CACCGA	2	12	823394	823405	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	197249182
17539	NC_011149	AC	3	6	823425	823430	50 %	0 %	0 %	50 %	197249182
17540	NC_011149	GCC	2	6	823496	823501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249182
17541	NC_011149	ACATG	2	10	823504	823513	40 %	20 %	20 %	20 %	197249182
17542	NC_011149	CGC	2	6	823541	823546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249182
17543	NC_011149	GGT	2	6	823558	823563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197249182
17544	NC_011149	GCC	2	6	823578	823583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249182
17545	NC_011149	AGG	2	6	823588	823593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197249182
17546	NC_011149	GCG	2	6	823672	823677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249182
17547	NC_011149	ACAA	2	8	823801	823808	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17548	NC_011149	CCAC	2	8	823836	823843	25 %	0 %	0 %	75 %	197250225
17549	NC_011149	ATT	2	6	823869	823874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197250225
17550	NC_011149	CTG	2	6	823885	823890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250225
17551	NC_011149	GCA	2	6	823908	823913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250225
17552	NC_011149	GCA	2	6	823938	823943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250225
17553	NC_011149	GCT	2	6	823959	823964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250225
17554	NC_011149	GGA	2	6	823989	823994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197250225
17555	NC_011149	GGC	2	6	824124	824129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250225
17556	NC_011149	GAA	2	6	824133	824138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197250225
17557	NC_011149	TAC	2	6	824272	824277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197250225
17558	NC_011149	ATC	2	6	824317	824322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197250225
17559	NC_011149	CGG	2	6	824394	824399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250225
17560	NC_011149	TGT	2	6	824441	824446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197250225
17561	NC_011149	CGC	2	6	824468	824473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250225
17562	NC_011149	GGTGAA	2	12	824499	824510	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	197250225
17563	NC_011149	CGC	2	6	824516	824521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250225
17564	NC_011149	GC	3	6	824575	824580	0 %	0 %	50 %	50 %	197250225
17565	NC_011149	ATG	2	6	824584	824589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197250225
17566	NC_011149	GCA	2	6	824763	824768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250225
17567	NC_011149	GGCG	2	8	824781	824788	0 %	0 %	75 %	25 %	197250225
17568	NC_011149	AGC	3	9	824795	824803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250225
17569	NC_011149	TGA	2	6	824822	824827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197250225
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17572	NC_011149	CGA	2	6	824885	824890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248135
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17574	NC_011149	GCTG	2	8	824959	824966	0 %	25 %	50 %	25 %	197248135
17575	NC_011149	ATT	2	6	825036	825041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197248135
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17579	NC_011149	CTG	2	6	825171	825176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248135
17580	NC_011149	GCG	2	6	825192	825197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248135
17581	NC_011149	A	8	8	825225	825232	100 %	0 %	0 %	0 %	197248135
17582	NC_011149	CTG	2	6	825270	825275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248135
17583	NC_011149	GCC	2	6	825279	825284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248135
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17585	NC_011149	GCA	2	6	825329	825334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248135
17586	NC_011149	TGG	2	6	825376	825381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197248135
17587	NC_011149	GC	3	6	825415	825420	0 %	0 %	50 %	50 %	197248135
17588	NC_011149	CAT	2	6	825453	825458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197248135
17589	NC_011149	GTTG	2	8	825467	825474	0 %	50 %	50 %	0 %	197248135
17590	NC_011149	ATG	2	6	825475	825480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248135
17591	NC_011149	GGGGC	2	10	825509	825518	0 %	0 %	80 %	20 %	197248135
17592	NC_011149	CTG	2	6	825521	825526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248135
17593	NC_011149	G	6	6	825532	825537	0 %	0 %	100 %	0 %	197248135
17594	NC_011149	TGG	2	6	825553	825558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197248135
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17596	NC_011149	TGCTC	2	10	825598	825607	0 %	40 %	20 %	40 %	197248135
17597	NC_011149	CTG	2	6	825627	825632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248135
17598	NC_011149	GCC	2	6	825668	825673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248135
17599	NC_011149	CAGGCG	2	12	825678	825689	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	197248135
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17602	NC_011149	CAA	2	6	825882	825887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197248135
17603	NC_011149	CCG	2	6	825912	825917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248135
17604	NC_011149	GC	3	6	825936	825941	0 %	0 %	50 %	50 %	197248135
17605	NC_011149	TTAACG	2	12	825948	825959	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	197248135
17606	NC_011149	CTG	2	6	825990	825995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248135
17607	NC_011149	TGC	2	6	826000	826005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248135
17608	NC_011149	GCG	3	9	826033	826041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248514
17609	NC_011149	GGCCG	2	10	826045	826054	0 %	0 %	60 %	40 %	197248514
17610	NC_011149	AAC	2	6	826067	826072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197248514
17611	NC_011149	GCA	2	6	826083	826088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248514
17612	NC_011149	GCT	2	6	826104	826109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248514
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17614	NC_011149	GT	3	6	826139	826144	0 %	50 %	50 %	0 %	197248514
17615	NC_011149	TGC	2	6	826232	826237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248514
17616	NC_011149	GC	3	6	826243	826248	0 %	0 %	50 %	50 %	197248514
17617	NC_011149	GGC	2	6	826257	826262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248514
17618	NC_011149	CCTGG	2	10	826320	826329	0 %	20 %	40 %	40 %	197248514
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17985	NC_011149	CCG	2	6	844069	844074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249266
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17988	NC_011149	CG	4	8	844307	844314	0 %	0 %	50 %	50 %	197249266
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