MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 101713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_011149	CTG	2	6	752647	752652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250843
16002	NC_011149	GCC	2	6	752710	752715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250843
16003	NC_011149	AAT	2	6	752716	752721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197250843
16004	NC_011149	GGC	2	6	752722	752727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250843
16005	NC_011149	GA	3	6	752798	752803	50 %	0 %	50 %	0 %	197250843
16006	NC_011149	GGC	2	6	752979	752984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250843
16007	NC_011149	GC	3	6	753056	753061	0 %	0 %	50 %	50 %	197248503
16008	NC_011149	TTTGAA	2	12	753066	753077	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	197248503
16009	NC_011149	CAG	2	6	753096	753101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248503
16010	NC_011149	CGC	2	6	753182	753187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248503
16011	NC_011149	CAG	2	6	753258	753263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248503
16012	NC_011149	GCG	2	6	753409	753414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248503
16013	NC_011149	TCA	2	6	753455	753460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197248503
16014	NC_011149	CT	3	6	753517	753522	0 %	50 %	0 %	50 %	197248503
16015	NC_011149	CCAG	2	8	753527	753534	25 %	0 %	25 %	50 %	197248503
16016	NC_011149	GAC	2	6	753540	753545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248503
16017	NC_011149	CA	3	6	753548	753553	50 %	0 %	0 %	50 %	197248503
16018	NC_011149	GCC	2	6	753657	753662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248503
16019	NC_011149	CTG	2	6	753663	753668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248503
16020	NC_011149	CAGGGT	2	12	753696	753707	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	197248503
16021	NC_011149	CAGAA	2	10	753826	753835	60 %	0 %	20 %	20 %	197248503
16022	NC_011149	CAGC	2	8	753873	753880	25 %	0 %	25 %	50 %	197248503
16023	NC_011149	GCA	2	6	753890	753895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248503
16024	NC_011149	ACA	2	6	753911	753916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197248503
16025	NC_011149	GGT	2	6	753933	753938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197248503
16026	NC_011149	CA	3	6	753959	753964	50 %	0 %	0 %	50 %	197248503
16027	NC_011149	AGCG	2	8	753999	754006	25 %	0 %	50 %	25 %	197248503
16028	NC_011149	CTC	2	6	754029	754034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197248503
16029	NC_011149	AGC	2	6	754093	754098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248503
16030	NC_011149	CGCGG	2	10	754112	754121	0 %	0 %	60 %	40 %	197248503
16031	NC_011149	CAG	2	6	754146	754151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248503
16032	NC_011149	GCC	2	6	754323	754328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248503
16033	NC_011149	TCG	2	6	754390	754395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248503
16034	NC_011149	GC	3	6	754432	754437	0 %	0 %	50 %	50 %	197248503
16035	NC_011149	GTA	2	6	754482	754487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248503
16036	NC_011149	CTTT	2	8	754575	754582	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16037	NC_011149	TTA	2	6	754589	754594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16038	NC_011149	T	6	6	754648	754653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16039	NC_011149	ATCG	2	8	754691	754698	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16040	NC_011149	CAAA	2	8	754752	754759	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16041	NC_011149	CGA	2	6	754767	754772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16042	NC_011149	GAT	2	6	754845	754850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197247814
16043	NC_011149	AAC	2	6	754868	754873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197247814
16044	NC_011149	GCT	2	6	754989	754994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247814
16045	NC_011149	TCA	2	6	755034	755039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247814
16046	NC_011149	CAA	2	6	755169	755174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197247814
16047	NC_011149	TGCCGG	2	12	755252	755263	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	197247814
16048	NC_011149	GCG	2	6	755318	755323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247814
16049	NC_011149	CGG	3	9	755364	755372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247814
16050	NC_011149	GCC	2	6	755392	755397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197247814
16051	NC_011149	TTA	2	6	755417	755422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197247814
16052	NC_011149	CATT	2	8	755445	755452	25 %	50 %	0 %	25 %	197247814
16053	NC_011149	CG	4	8	755454	755461	0 %	0 %	50 %	50 %	197247814
16054	NC_011149	GCC	2	6	755482	755487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197247814
16055	NC_011149	CGG	2	6	755508	755513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247814
16056	NC_011149	TAA	2	6	755601	755606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16057	NC_011149	AGCG	2	8	755612	755619	25 %	0 %	50 %	25 %	197249512
16058	NC_011149	GTT	2	6	755621	755626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197249512
16059	NC_011149	GTC	2	6	755647	755652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249512
16060	NC_011149	CCG	2	6	755665	755670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249512
16061	NC_011149	GTG	2	6	755734	755739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197249512
16062	NC_011149	TGG	2	6	755827	755832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197249512
16063	NC_011149	AG	3	6	755835	755840	50 %	0 %	50 %	0 %	197249512
16064	NC_011149	GGC	2	6	755890	755895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249512
16065	NC_011149	GGC	2	6	755913	755918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249512
16066	NC_011149	GGCAC	2	10	755922	755931	20 %	0 %	40 %	40 %	197249512
16067	NC_011149	GTC	2	6	755983	755988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249512
16068	NC_011149	CCGG	2	8	756082	756089	0 %	0 %	50 %	50 %	197249512
16069	NC_011149	CGG	2	6	756102	756107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249512
16070	NC_011149	GGC	2	6	756142	756147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249512
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16073	NC_011149	CG	3	6	756273	756278	0 %	0 %	50 %	50 %	197250468
16074	NC_011149	GAT	2	6	756501	756506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197250468
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16079	NC_011149	CTG	2	6	756927	756932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250468
16080	NC_011149	TGC	2	6	756943	756948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250468
16081	NC_011149	AATG	2	8	756992	756999	50 %	25 %	25 %	0 %	197250468
16082	NC_011149	GGC	2	6	757014	757019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250468
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16091	NC_011149	GC	3	6	757343	757348	0 %	0 %	50 %	50 %	197249866
16092	NC_011149	GCC	2	6	757398	757403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249866
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16094	NC_011149	GGC	2	6	757468	757473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249866
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16098	NC_011149	GC	3	6	757712	757717	0 %	0 %	50 %	50 %	197249866
16099	NC_011149	ACG	2	6	757724	757729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249866
16100	NC_011149	GAC	2	6	757800	757805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249866
16101	NC_011149	TCGC	2	8	757859	757866	0 %	25 %	25 %	50 %	197249866
16102	NC_011149	CGC	2	6	757875	757880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249866
16103	NC_011149	TAT	2	6	757933	757938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16104	NC_011149	TCG	2	6	758056	758061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197251492
16105	NC_011149	GCG	2	6	758063	758068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251492
16106	NC_011149	GGC	2	6	758080	758085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251492
16107	NC_011149	CAAC	2	8	758239	758246	50 %	0 %	0 %	50 %	197251492
16108	NC_011149	CGG	2	6	758322	758327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251492
16109	NC_011149	CAG	2	6	758373	758378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197251492
16110	NC_011149	AGC	2	6	758379	758384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197251492
16111	NC_011149	ACG	2	6	758387	758392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197251492
16112	NC_011149	CG	3	6	758431	758436	0 %	0 %	50 %	50 %	197251492
16113	NC_011149	CGC	2	6	758472	758477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197251492
16114	NC_011149	CAT	2	6	758696	758701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197251492
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16116	NC_011149	ATT	2	6	758765	758770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197251492
16117	NC_011149	ACA	2	6	758777	758782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197251492
16118	NC_011149	CTG	2	6	758926	758931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197251271
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