MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 101713

< Previous12...2728293031323334353637...203204Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_011149	CAT	2	6	730781	730786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197251100
15503	NC_011149	CAA	2	6	730795	730800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197251100
15504	NC_011149	AGGT	2	8	730863	730870	25 %	25 %	50 %	0 %	197251100
15505	NC_011149	GTA	2	6	730901	730906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197251100
15506	NC_011149	GCG	2	6	730909	730914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251100
15507	NC_011149	GC	3	6	730925	730930	0 %	0 %	50 %	50 %	197251100
15508	NC_011149	TGG	2	6	730960	730965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197251100
15509	NC_011149	TCA	2	6	730971	730976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197251100
15510	NC_011149	CAGC	2	8	731077	731084	25 %	0 %	25 %	50 %	197251100
15511	NC_011149	GC	3	6	731095	731100	0 %	0 %	50 %	50 %	197251100
15512	NC_011149	CGG	2	6	731111	731116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251100
15513	NC_011149	AAT	2	6	731144	731149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197251100
15514	NC_011149	CCA	2	6	731179	731184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197251100
15515	NC_011149	GCC	2	6	731185	731190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197251100
15516	NC_011149	TCA	2	6	731229	731234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197251100
15517	NC_011149	CCG	2	6	731301	731306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197251100
15518	NC_011149	GCG	2	6	731314	731319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251100
15519	NC_011149	CATC	2	8	731380	731387	25 %	25 %	0 %	50 %	197251100
15520	NC_011149	CGC	2	6	731455	731460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197251100
15521	NC_011149	A	6	6	731687	731692	100 %	0 %	0 %	0 %	197251100
15522	NC_011149	GC	3	6	731702	731707	0 %	0 %	50 %	50 %	197251100
15523	NC_011149	GCG	2	6	731728	731733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251100
15524	NC_011149	GCG	2	6	731890	731895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251100
15525	NC_011149	CAT	2	6	731896	731901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197251100
15526	NC_011149	GT	3	6	731920	731925	0 %	50 %	50 %	0 %	197251100
15527	NC_011149	CCG	2	6	731937	731942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197251100
15528	NC_011149	CAG	3	9	731966	731974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197251100
15529	NC_011149	GCG	2	6	732006	732011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251100
15530	NC_011149	ATAA	2	8	732112	732119	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15531	NC_011149	GCG	2	6	732120	732125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15532	NC_011149	ACT	2	6	732223	732228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197251675
15533	NC_011149	GGC	2	6	732231	732236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251675
15534	NC_011149	CGG	2	6	732242	732247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251675
15535	NC_011149	TCA	2	6	732256	732261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197251675
15536	NC_011149	A	6	6	732277	732282	100 %	0 %	0 %	0 %	197251675
15537	NC_011149	GGC	2	6	732287	732292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251675
15538	NC_011149	CGT	2	6	732329	732334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197251675
15539	NC_011149	CGC	2	6	732351	732356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197251675
15540	NC_011149	GC	3	6	732394	732399	0 %	0 %	50 %	50 %	197251675
15541	NC_011149	CAA	2	6	732402	732407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197251675
15542	NC_011149	CGA	2	6	732428	732433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197251675
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15544	NC_011149	GTT	2	6	732527	732532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197251675
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15550	NC_011149	GC	3	6	732822	732827	0 %	0 %	50 %	50 %	197251675
15551	NC_011149	GGC	2	6	732834	732839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251675
15552	NC_011149	CGT	2	6	732848	732853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197251675
15553	NC_011149	GTTG	2	8	732903	732910	0 %	50 %	50 %	0 %	197251675
15554	NC_011149	CGC	2	6	732917	732922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197251675
15555	NC_011149	GCA	2	6	732935	732940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197251675
15556	NC_011149	GCG	2	6	733015	733020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251675
15557	NC_011149	AAT	2	6	733041	733046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197251675
15558	NC_011149	T	6	6	733106	733111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15559	NC_011149	AGG	2	6	733142	733147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15560	NC_011149	A	6	6	733152	733157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15561	NC_011149	CGC	2	6	733299	733304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197247548
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15570	NC_011149	TAA	2	6	733773	733778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15572	NC_011149	GCG	2	6	733896	733901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15573	NC_011149	GTC	2	6	733943	733948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449785025
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15591	NC_011149	CAT	2	6	734962	734967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15594	NC_011149	GC	3	6	735067	735072	0 %	0 %	50 %	50 %	197247545
15595	NC_011149	GC	5	10	735128	735137	0 %	0 %	50 %	50 %	197247545
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15601	NC_011149	GGC	2	6	735437	735442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247545
15602	NC_011149	CGAT	2	8	735484	735491	25 %	25 %	25 %	25 %	197247545
15603	NC_011149	CTG	2	6	735570	735575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247545
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15606	NC_011149	AAT	2	6	735669	735674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197247545
15607	NC_011149	CG	3	6	735695	735700	0 %	0 %	50 %	50 %	197247545
15608	NC_011149	GAACGA	2	12	735740	735751	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	197247545
15609	NC_011149	ATT	2	6	735759	735764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197247545
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15611	NC_011149	TAT	2	6	735842	735847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15612	NC_011149	T	7	7	735895	735901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15614	NC_011149	GCCA	2	8	736033	736040	25 %	0 %	25 %	50 %	197251198
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15622	NC_011149	GCT	2	6	736368	736373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197251198
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15986	NC_011149	GCT	2	6	751794	751799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250843
15987	NC_011149	GCG	2	6	751921	751926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250843
15988	NC_011149	A	6	6	751931	751936	100 %	0 %	0 %	0 %	197250843
15989	NC_011149	TGA	2	6	751997	752002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197250843
15990	NC_011149	GCG	2	6	752111	752116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250843
15991	NC_011149	CGC	2	6	752172	752177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250843
15992	NC_011149	GAA	2	6	752191	752196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197250843
15993	NC_011149	GC	3	6	752228	752233	0 %	0 %	50 %	50 %	197250843
15994	NC_011149	CGG	2	6	752257	752262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250843
15995	NC_011149	CGC	2	6	752324	752329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250843
15996	NC_011149	AGC	2	6	752357	752362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250843
15997	NC_011149	CGG	2	6	752376	752381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250843
15998	NC_011149	TGAA	2	8	752399	752406	50 %	25 %	25 %	0 %	197250843
15999	NC_011149	CGCGT	2	10	752491	752500	0 %	20 %	40 %	40 %	197250843
16000	NC_011149	GCG	2	6	752566	752571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250843

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