MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 101713

< Previous12...2425262728293031323334...203204Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_011149	CCG	2	6	660212	660217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249351
14002	NC_011149	CAGC	2	8	660240	660247	25 %	0 %	25 %	50 %	197249351
14003	NC_011149	TTC	2	6	660262	660267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197249351
14004	NC_011149	ACC	2	6	660308	660313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197249351
14005	NC_011149	GCG	2	6	660336	660341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249351
14006	NC_011149	CGC	3	9	660432	660440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249351
14007	NC_011149	GTG	2	6	660448	660453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197249351
14008	NC_011149	CGG	2	6	660488	660493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249351
14009	NC_011149	CG	3	6	660528	660533	0 %	0 %	50 %	50 %	197249351
14010	NC_011149	GGC	2	6	660607	660612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249351
14011	NC_011149	T	7	7	660651	660657	0 %	100 %	0 %	0 %	197249351
14012	NC_011149	TTC	2	6	660664	660669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197250270
14013	NC_011149	ACG	2	6	660755	660760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250270
14014	NC_011149	GCG	2	6	660776	660781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250270
14015	NC_011149	GCA	2	6	660849	660854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250270
14016	NC_011149	CTT	2	6	660918	660923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197250270
14017	NC_011149	GTT	2	6	660940	660945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197250270
14018	NC_011149	CGG	2	6	660981	660986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250270
14019	NC_011149	CG	3	6	660989	660994	0 %	0 %	50 %	50 %	197250270
14020	NC_011149	CAG	2	6	661021	661026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250270
14021	NC_011149	CG	3	6	661129	661134	0 %	0 %	50 %	50 %	197250270
14022	NC_011149	GCG	2	6	661146	661151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250270
14023	NC_011149	CGG	2	6	661158	661163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250270
14024	NC_011149	CAC	2	6	661270	661275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197250270
14025	NC_011149	CGC	3	9	661281	661289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250270
14026	NC_011149	GC	3	6	661402	661407	0 %	0 %	50 %	50 %	197250270
14027	NC_011149	CGC	2	6	661492	661497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250270
14028	NC_011149	GCG	2	6	661525	661530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250270
14029	NC_011149	GTT	2	6	661545	661550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197250270
14030	NC_011149	AG	3	6	661553	661558	50 %	0 %	50 %	0 %	197250270
14031	NC_011149	TCC	2	6	661576	661581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197250205
14032	NC_011149	GC	4	8	661606	661613	0 %	0 %	50 %	50 %	197250205
14033	NC_011149	GC	3	6	661633	661638	0 %	0 %	50 %	50 %	197250205
14034	NC_011149	ATC	2	6	661662	661667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197250205
14035	NC_011149	CGC	2	6	661682	661687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250205
14036	NC_011149	CGT	2	6	661691	661696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250205
14037	NC_011149	TGG	2	6	661718	661723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197250205
14038	NC_011149	GCG	2	6	661793	661798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250205
14039	NC_011149	ATC	2	6	661807	661812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197250205
14040	NC_011149	GCG	2	6	661966	661971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251721
14041	NC_011149	CAG	2	6	661997	662002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197251721
14042	NC_011149	AGG	2	6	662014	662019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197251721
14043	NC_011149	CCA	2	6	662059	662064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197251721
14044	NC_011149	TGGG	2	8	662071	662078	0 %	25 %	75 %	0 %	197251721
14045	NC_011149	CCAG	2	8	662098	662105	25 %	0 %	25 %	50 %	197251721
14046	NC_011149	GT	3	6	662168	662173	0 %	50 %	50 %	0 %	197251721
14047	NC_011149	GCTCT	2	10	662246	662255	0 %	40 %	20 %	40 %	197251721
14048	NC_011149	GA	3	6	662284	662289	50 %	0 %	50 %	0 %	197251721
14049	NC_011149	TCT	2	6	662388	662393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197251721
14050	NC_011149	GCC	3	9	662427	662435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197251721
14051	NC_011149	CGTG	2	8	662458	662465	0 %	25 %	50 %	25 %	197251721
14052	NC_011149	TCA	2	6	662479	662484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197251721
14053	NC_011149	TTTC	2	8	662498	662505	0 %	75 %	0 %	25 %	197251721
14054	NC_011149	TCG	2	6	662599	662604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197251721
14055	NC_011149	TAAA	2	8	662649	662656	75 %	25 %	0 %	0 %	197251721
14056	NC_011149	CGC	2	6	662725	662730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197251721
14057	NC_011149	CCG	2	6	662778	662783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197251721
14058	NC_011149	TCA	2	6	662799	662804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197251721
14059	NC_011149	TAA	2	6	662815	662820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197251721
14060	NC_011149	T	7	7	662884	662890	0 %	100 %	0 %	0 %	197251721
14061	NC_011149	ATT	2	6	662921	662926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197251721
14062	NC_011149	TTG	2	6	662961	662966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_011149	TCAG	2	8	663018	663025	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14064	NC_011149	TTAT	2	8	663049	663056	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14065	NC_011149	T	6	6	663056	663061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14066	NC_011149	TGG	2	6	663093	663098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14067	NC_011149	ATTT	2	8	663108	663115	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14068	NC_011149	T	6	6	663158	663163	0 %	100 %	0 %	0 %	197251089
14069	NC_011149	AATT	2	8	663164	663171	50 %	50 %	0 %	0 %	197251089
14070	NC_011149	CGG	2	6	663184	663189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251089
14071	NC_011149	GTT	2	6	663199	663204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197251089
14072	NC_011149	TTA	2	6	663272	663277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197251089
14073	NC_011149	T	7	7	663353	663359	0 %	100 %	0 %	0 %	197249438
14074	NC_011149	TGG	2	6	663400	663405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197249438
14075	NC_011149	ATT	2	6	663507	663512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197249438
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14077	NC_011149	A	6	6	663661	663666	100 %	0 %	0 %	0 %	197249438
14078	NC_011149	GC	3	6	663697	663702	0 %	0 %	50 %	50 %	197249438
14079	NC_011149	GC	3	6	663758	663763	0 %	0 %	50 %	50 %	197249438
14080	NC_011149	GTT	2	6	663804	663809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197249438
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14082	NC_011149	TGG	2	6	663892	663897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197249438
14083	NC_011149	TGC	2	6	663904	663909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249438
14084	NC_011149	CGC	2	6	663923	663928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249438
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14086	NC_011149	GC	3	6	663972	663977	0 %	0 %	50 %	50 %	197249438
14087	NC_011149	CAG	2	6	663987	663992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249438
14088	NC_011149	GTT	2	6	663998	664003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197249438
14089	NC_011149	GTC	2	6	664134	664139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249438
14090	NC_011149	T	6	6	664152	664157	0 %	100 %	0 %	0 %	197249438
14091	NC_011149	GAG	2	6	664248	664253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197249438
14092	NC_011149	CTG	2	6	664254	664259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249438
14093	NC_011149	TAT	2	6	664265	664270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197249438
14094	NC_011149	GCA	2	6	664279	664284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249438
14095	NC_011149	CTG	2	6	664395	664400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249438
14096	NC_011149	AG	3	6	664425	664430	50 %	0 %	50 %	0 %	197249438
14097	NC_011149	GCA	3	9	664454	664462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249438
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14099	NC_011149	CAGC	2	8	664574	664581	25 %	0 %	25 %	50 %	197249438
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14101	NC_011149	TCG	2	6	664627	664632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249438
14102	NC_011149	CTG	2	6	664638	664643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249438
14103	NC_011149	CGA	2	6	664709	664714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249438
14104	NC_011149	CGA	2	6	664718	664723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249438
14105	NC_011149	GGT	2	6	664724	664729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197249438
14106	NC_011149	GCG	2	6	664753	664758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249438
14107	NC_011149	A	6	6	664777	664782	100 %	0 %	0 %	0 %	197249438
14108	NC_011149	TTCC	2	8	664926	664933	0 %	50 %	0 %	50 %	197249438
14109	NC_011149	A	8	8	664941	664948	100 %	0 %	0 %	0 %	197249438
14110	NC_011149	GCT	2	6	664992	664997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247913
14111	NC_011149	AT	3	6	665016	665021	50 %	50 %	0 %	0 %	197247913
14112	NC_011149	TGGC	2	8	665050	665057	0 %	25 %	50 %	25 %	197247913
14113	NC_011149	ATG	2	6	665080	665085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197247913
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14119	NC_011149	AGAT	2	8	665363	665370	50 %	25 %	25 %	0 %	197247913
14120	NC_011149	GC	3	6	665389	665394	0 %	0 %	50 %	50 %	197247913
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14122	NC_011149	CAC	2	6	665523	665528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197247913
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14234	NC_011149	T	8	8	670120	670127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14488	NC_011149	ATA	2	6	682451	682456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197248165
14489	NC_011149	GCG	2	6	682464	682469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248165
14490	NC_011149	TTC	2	6	682483	682488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197248165
14491	NC_011149	AT	3	6	682592	682597	50 %	50 %	0 %	0 %	197248165
14492	NC_011149	GC	3	6	682605	682610	0 %	0 %	50 %	50 %	197248165
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