MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 101713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_011149	T	6	6	616472	616477	0 %	100 %	0 %	0 %	197247866
13002	NC_011149	TGC	2	6	616541	616546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247866
13003	NC_011149	CGG	2	6	616631	616636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247866
13004	NC_011149	TGA	2	6	616696	616701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197247866
13005	NC_011149	GCT	2	6	616731	616736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247866
13006	NC_011149	CGA	2	6	616748	616753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197247866
13007	NC_011149	AAGGG	2	10	616774	616783	40 %	0 %	60 %	0 %	197247866
13008	NC_011149	T	6	6	616805	616810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_011149	TCCC	2	8	616817	616824	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13010	NC_011149	GAGG	2	8	616830	616837	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_011149	ACGT	2	8	616878	616885	25 %	25 %	25 %	25 %	197249412
13012	NC_011149	CAA	2	6	617052	617057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197249412
13013	NC_011149	GCTT	2	8	617075	617082	0 %	50 %	25 %	25 %	197249412
13014	NC_011149	AAT	2	6	617218	617223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197249412
13015	NC_011149	GCA	2	6	617259	617264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249412
13016	NC_011149	GTT	2	6	617383	617388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197249412
13017	NC_011149	GCCA	3	12	617459	617470	25 %	0 %	25 %	50 %	197249412
13018	NC_011149	ATC	2	6	617524	617529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197249412
13019	NC_011149	CAT	2	6	617536	617541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197249412
13020	NC_011149	AGC	2	6	617544	617549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249412
13021	NC_011149	TGA	2	6	617735	617740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197249412
13022	NC_011149	TGT	2	6	617787	617792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197249412
13023	NC_011149	AG	3	6	617804	617809	50 %	0 %	50 %	0 %	197249412
13024	NC_011149	CTG	2	6	617846	617851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249412
13025	NC_011149	C	6	6	617867	617872	0 %	0 %	0 %	100 %	197249412
13026	NC_011149	CAG	2	6	617953	617958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249412
13027	NC_011149	AAGG	2	8	617964	617971	50 %	0 %	50 %	0 %	197249412
13028	NC_011149	ATCGGC	2	12	618004	618015	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	197249412
13029	NC_011149	GCC	2	6	618055	618060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249412
13030	NC_011149	TGG	2	6	618117	618122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197249412
13031	NC_011149	GCC	2	6	618139	618144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249412
13032	NC_011149	AG	3	6	618155	618160	50 %	0 %	50 %	0 %	197249412
13033	NC_011149	T	6	6	618583	618588	0 %	100 %	0 %	0 %	197249412
13034	NC_011149	CGC	2	6	618613	618618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249412
13035	NC_011149	GCG	2	6	618635	618640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249412
13036	NC_011149	GCA	2	6	618651	618656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249412
13037	NC_011149	ATC	2	6	618671	618676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197249412
13038	NC_011149	CGG	2	6	618679	618684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249412
13039	NC_011149	CGC	2	6	618699	618704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249412
13040	NC_011149	CGC	2	6	618717	618722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249412
13041	NC_011149	TGG	2	6	618840	618845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197249412
13042	NC_011149	GAT	2	6	618880	618885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197249412
13043	NC_011149	CG	4	8	618897	618904	0 %	0 %	50 %	50 %	197249412
13044	NC_011149	CGG	2	6	618927	618932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249412
13045	NC_011149	TGG	2	6	618936	618941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197249412
13046	NC_011149	CAC	2	6	618979	618984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197249412
13047	NC_011149	AGCGC	2	10	619004	619013	20 %	0 %	40 %	40 %	197249412
13048	NC_011149	GAAT	2	8	619085	619092	50 %	25 %	25 %	0 %	197249412
13049	NC_011149	CTT	2	6	619093	619098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197249412
13050	NC_011149	GTG	2	6	619165	619170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13051	NC_011149	CG	3	6	619181	619186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13052	NC_011149	TGCAAA	2	12	619211	619222	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13053	NC_011149	AAT	2	6	619231	619236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_011149	AT	3	6	619244	619249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13055	NC_011149	TA	3	6	619259	619264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_011149	ATA	2	6	619273	619278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_011149	TGG	2	6	619326	619331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197248927
13058	NC_011149	TGG	2	6	619392	619397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197248927
13059	NC_011149	GAAAC	2	10	619411	619420	60 %	0 %	20 %	20 %	197248927
13060	NC_011149	AC	3	6	619419	619424	50 %	0 %	0 %	50 %	197248927
13061	NC_011149	ATC	3	9	619468	619476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197248927
13062	NC_011149	GGA	2	6	619710	619715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197248927
13063	NC_011149	GGGAT	2	10	619766	619775	20 %	20 %	60 %	0 %	197248927
13064	NC_011149	CGC	2	6	619795	619800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248927
13065	NC_011149	TGA	2	6	619804	619809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248927
13066	NC_011149	CGC	2	6	619842	619847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248927
13067	NC_011149	GAC	2	6	619859	619864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248927
13068	NC_011149	GGA	2	6	619880	619885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197248927
13069	NC_011149	CTG	2	6	619902	619907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248927
13070	NC_011149	CTCGC	2	10	619950	619959	0 %	20 %	20 %	60 %	197248927
13071	NC_011149	TCA	2	6	619964	619969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197248927
13072	NC_011149	CTG	2	6	619995	620000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248927
13073	NC_011149	CTGG	2	8	620057	620064	0 %	25 %	50 %	25 %	197248927
13074	NC_011149	GCA	2	6	620069	620074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248927
13075	NC_011149	GAT	2	6	620115	620120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248927
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13080	NC_011149	GC	4	8	620299	620306	0 %	0 %	50 %	50 %	197248927
13081	NC_011149	GCGT	2	8	620332	620339	0 %	25 %	50 %	25 %	197248927
13082	NC_011149	GCA	2	6	620393	620398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248927
13083	NC_011149	CGG	2	6	620423	620428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248927
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13085	NC_011149	TGC	2	6	620473	620478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248927
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13087	NC_011149	GC	3	6	620629	620634	0 %	0 %	50 %	50 %	197249087
13088	NC_011149	CAG	2	6	620685	620690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249087
13089	NC_011149	ACA	2	6	620709	620714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197249087
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13091	NC_011149	CGC	2	6	620776	620781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197247426
13092	NC_011149	CT	3	6	620810	620815	0 %	50 %	0 %	50 %	197247426
13093	NC_011149	AGCGGT	2	12	620890	620901	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	197247426
13094	NC_011149	GC	3	6	621079	621084	0 %	0 %	50 %	50 %	197247426
13095	NC_011149	TGA	2	6	621127	621132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197247426
13096	NC_011149	TGGTAT	2	12	621140	621151	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	197247426
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13101	NC_011149	GC	3	6	621441	621446	0 %	0 %	50 %	50 %	197247426
13102	NC_011149	CGG	2	6	621447	621452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247426
13103	NC_011149	GGC	2	6	621469	621474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247426
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13105	NC_011149	GCG	2	6	621580	621585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247426
13106	NC_011149	GCG	2	6	621596	621601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247426
13107	NC_011149	GCG	2	6	621692	621697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247426
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13109	NC_011149	GCC	2	6	621714	621719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197247426
13110	NC_011149	ACG	2	6	621729	621734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197247426
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13118	NC_011149	AC	3	6	622079	622084	50 %	0 %	0 %	50 %	197247426
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13120	NC_011149	CGG	2	6	622095	622100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247426
13121	NC_011149	CGC	2	6	622111	622116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197247426
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13125	NC_011149	TACC	2	8	622195	622202	25 %	25 %	0 %	50 %	197247426
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13149	NC_011149	GTTGT	2	10	623561	623570	0 %	60 %	40 %	0 %	197247426
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13153	NC_011149	CTG	2	6	623711	623716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247426
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13180	NC_011149	ATA	2	6	624680	624685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13181	NC_011149	ATT	2	6	624693	624698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13182	NC_011149	T	7	7	624704	624710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13183	NC_011149	A	7	7	624913	624919	100 %	0 %	0 %	0 %	197248104
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13210	NC_011149	A	6	6	625878	625883	100 %	0 %	0 %	0 %	197248104
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13227	NC_011149	CCAG	2	8	626673	626680	25 %	0 %	25 %	50 %	197250909
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13362	NC_011149	AGC	2	6	631851	631856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248551
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13364	NC_011149	CG	3	6	631949	631954	0 %	0 %	50 %	50 %	197248551
13365	NC_011149	CGCCA	2	10	631966	631975	20 %	0 %	20 %	60 %	197248551
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13369	NC_011149	GGC	2	6	632108	632113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248551
13370	NC_011149	CTG	2	6	632117	632122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248551
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13374	NC_011149	CAC	2	6	632353	632358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197248551
13375	NC_011149	CTG	2	6	632435	632440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248551
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13377	NC_011149	GTA	2	6	632573	632578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248551
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13383	NC_011149	GTG	2	6	633182	633187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197247876
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13420	NC_011149	AG	3	6	634350	634355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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13474	NC_011149	TGTAA	2	10	636446	636455	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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13477	NC_011149	GTT	2	6	636492	636497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13478	NC_011149	TC	3	6	636535	636540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13479	NC_011149	ACA	2	6	636557	636562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13481	NC_011149	A	6	6	636737	636742	100 %	0 %	0 %	0 %	197248133
13482	NC_011149	ATG	2	6	636789	636794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248133
13483	NC_011149	A	6	6	636818	636823	100 %	0 %	0 %	0 %	197248133
13484	NC_011149	GGC	2	6	636886	636891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248133
13485	NC_011149	GAT	2	6	636913	636918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248133
13486	NC_011149	GCT	2	6	636922	636927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248133
13487	NC_011149	GGCG	2	8	636928	636935	0 %	0 %	75 %	25 %	197248133
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13490	NC_011149	GTG	2	6	637109	637114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197248133
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