MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 101713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_011149	GCCGA	2	10	544407	544416	20 %	0 %	40 %	40 %	197251816
11502	NC_011149	AGT	2	6	544453	544458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197251816
11503	NC_011149	CGG	2	6	544477	544482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251816
11504	NC_011149	CGG	2	6	544525	544530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251816
11505	NC_011149	CG	3	6	544537	544542	0 %	0 %	50 %	50 %	197251816
11506	NC_011149	CGGG	2	8	544717	544724	0 %	0 %	75 %	25 %	197251816
11507	NC_011149	TGG	2	6	544771	544776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197251816
11508	NC_011149	GCA	2	6	544792	544797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197251816
11509	NC_011149	TGGTCA	2	12	544870	544881	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	197251816
11510	NC_011149	GCG	2	6	544920	544925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251816
11511	NC_011149	CG	3	6	544924	544929	0 %	0 %	50 %	50 %	197251816
11512	NC_011149	CCT	2	6	544996	545001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197251816
11513	NC_011149	CAT	2	6	545027	545032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197251816
11514	NC_011149	ACA	2	6	545067	545072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197251816
11515	NC_011149	CGA	2	6	545164	545169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197251816
11516	NC_011149	CGA	2	6	545179	545184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197251816
11517	NC_011149	CCT	2	6	545220	545225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11518	NC_011149	C	6	6	545295	545300	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11519	NC_011149	TTA	2	6	545301	545306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_011149	AAC	2	6	545340	545345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11521	NC_011149	CGA	2	6	545411	545416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197251341
11522	NC_011149	GTT	2	6	545502	545507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197251341
11523	NC_011149	TGG	2	6	545513	545518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197251341
11524	NC_011149	TAA	2	6	545525	545530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197251341
11525	NC_011149	TAC	2	6	545571	545576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197251341
11526	NC_011149	CAG	2	6	545599	545604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197251341
11527	NC_011149	CGG	2	6	545775	545780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251341
11528	NC_011149	CGA	2	6	545841	545846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197251341
11529	NC_011149	GC	3	6	545855	545860	0 %	0 %	50 %	50 %	197251341
11530	NC_011149	ATT	2	6	545893	545898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197251341
11531	NC_011149	GA	3	6	546002	546007	50 %	0 %	50 %	0 %	197251341
11532	NC_011149	AGG	2	6	546011	546016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197251341
11533	NC_011149	ATA	2	6	546033	546038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197251341
11534	NC_011149	TGC	2	6	546066	546071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250215
11535	NC_011149	TGG	3	9	546072	546080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197250215
11536	NC_011149	TCA	2	6	546090	546095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197250215
11537	NC_011149	ATT	2	6	546164	546169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197250215
11538	NC_011149	GCC	2	6	546209	546214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250215
11539	NC_011149	GCT	2	6	546220	546225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250215
11540	NC_011149	CGC	2	6	546250	546255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250215
11541	NC_011149	AT	3	6	546280	546285	50 %	50 %	0 %	0 %	197250215
11542	NC_011149	TC	3	6	546298	546303	0 %	50 %	0 %	50 %	197250215
11543	NC_011149	TGG	2	6	546426	546431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197250215
11544	NC_011149	CAAC	2	8	546448	546455	50 %	0 %	0 %	50 %	197250215
11545	NC_011149	AGC	3	9	546477	546485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250215
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11547	NC_011149	CGA	2	6	546573	546578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250215
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11549	NC_011149	GATC	2	8	546646	546653	25 %	25 %	25 %	25 %	197250215
11550	NC_011149	TGT	2	6	546696	546701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197250215
11551	NC_011149	CAGC	2	8	546705	546712	25 %	0 %	25 %	50 %	197250215
11552	NC_011149	CAT	2	6	546721	546726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197250215
11553	NC_011149	TCA	2	6	546766	546771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197250215
11554	NC_011149	GAT	2	6	546812	546817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_011149	GAC	2	6	546844	546849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11556	NC_011149	GC	3	6	546865	546870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11557	NC_011149	AG	3	6	546880	546885	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_011149	GGC	2	6	546911	546916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251684
11559	NC_011149	CGG	3	9	546992	547000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251684
11560	NC_011149	CTT	2	6	547040	547045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197251684
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11562	NC_011149	GTTGC	2	10	547079	547088	0 %	40 %	40 %	20 %	197251684
11563	NC_011149	TGC	2	6	547120	547125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197251684
11564	NC_011149	CCG	2	6	547151	547156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197251684
11565	NC_011149	ATCCTG	2	12	547203	547214	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	197251684
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11572	NC_011149	GCG	2	6	547531	547536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251684
11573	NC_011149	ATC	2	6	547537	547542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197251684
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11576	NC_011149	GC	3	6	547790	547795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11577	NC_011149	CCGGC	2	10	547829	547838	0 %	0 %	40 %	60 %	197249276
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11582	NC_011149	GCGCC	2	10	548139	548148	0 %	0 %	40 %	60 %	197249276
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11585	NC_011149	A	6	6	548253	548258	100 %	0 %	0 %	0 %	197249276
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11590	NC_011149	TTA	2	6	548551	548556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197249276
11591	NC_011149	CGTT	2	8	548648	548655	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11592	NC_011149	GCC	2	6	548702	548707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11595	NC_011149	A	6	6	548847	548852	100 %	0 %	0 %	0 %	197248751
11596	NC_011149	CGG	2	6	548972	548977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248751
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11600	NC_011149	CGAC	2	8	549155	549162	25 %	0 %	25 %	50 %	197248751
11601	NC_011149	GTTTT	2	10	549163	549172	0 %	80 %	20 %	0 %	197248751
11602	NC_011149	GGC	2	6	549210	549215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248751
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11608	NC_011149	GTTTT	2	10	549583	549592	0 %	80 %	20 %	0 %	197250697
11609	NC_011149	GCT	2	6	549698	549703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250697
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11611	NC_011149	ACC	2	6	549733	549738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197250697
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11985	NC_011149	CGG	2	6	568632	568637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251842
11986	NC_011149	T	7	7	568644	568650	0 %	100 %	0 %	0 %	197251842
11987	NC_011149	TGC	2	6	568653	568658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197251842
11988	NC_011149	GC	3	6	568665	568670	0 %	0 %	50 %	50 %	197251842
11989	NC_011149	T	6	6	568685	568690	0 %	100 %	0 %	0 %	197251842
11990	NC_011149	GAT	2	6	568792	568797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197251842
11991	NC_011149	TCA	2	6	568883	568888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197251842
11992	NC_011149	CCG	2	6	568895	568900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197251842
11993	NC_011149	TAT	2	6	568957	568962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197251842
11994	NC_011149	CGG	2	6	568968	568973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251842
11995	NC_011149	TGA	2	6	568974	568979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197251842
11996	NC_011149	TGA	2	6	569094	569099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197251842
11997	NC_011149	TTA	2	6	569159	569164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197251842
11998	NC_011149	CTG	2	6	569219	569224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197251842
11999	NC_011149	CAG	2	6	569278	569283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197251842
12000	NC_011149	CTTTA	2	10	569310	569319	20 %	60 %	0 %	20 %	197251842

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