MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 101713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_011149	CAC	2	6	522161	522166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197250950
11002	NC_011149	AACT	2	8	522217	522224	50 %	25 %	0 %	25 %	197250950
11003	NC_011149	AAC	2	6	522249	522254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197250950
11004	NC_011149	GAA	2	6	522287	522292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197250950
11005	NC_011149	AGC	2	6	522350	522355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250950
11006	NC_011149	TGC	2	6	522375	522380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250950
11007	NC_011149	CTA	2	6	522572	522577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197250950
11008	NC_011149	CA	3	6	522592	522597	50 %	0 %	0 %	50 %	197250950
11009	NC_011149	TC	3	6	522628	522633	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11010	NC_011149	GGC	2	6	522685	522690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250395
11011	NC_011149	TCG	2	6	522707	522712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250395
11012	NC_011149	GTT	2	6	522730	522735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197250395
11013	NC_011149	GCC	2	6	522790	522795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250395
11014	NC_011149	ATG	2	6	522863	522868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197250395
11015	NC_011149	GGGTGC	2	12	522870	522881	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	197250395
11016	NC_011149	CTG	2	6	522905	522910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250395
11017	NC_011149	TGAT	2	8	522933	522940	25 %	50 %	25 %	0 %	197250395
11018	NC_011149	CAA	2	6	522947	522952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197250395
11019	NC_011149	CAGGCG	2	12	523023	523034	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11020	NC_011149	AT	3	6	523106	523111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11021	NC_011149	CAG	2	6	523129	523134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249895
11022	NC_011149	GTTG	2	8	523254	523261	0 %	50 %	50 %	0 %	197249895
11023	NC_011149	GC	3	6	523325	523330	0 %	0 %	50 %	50 %	197249895
11024	NC_011149	TGGGC	2	10	523341	523350	0 %	20 %	60 %	20 %	197249895
11025	NC_011149	CTG	2	6	523495	523500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249895
11026	NC_011149	GGC	2	6	523507	523512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249895
11027	NC_011149	CGT	2	6	523540	523545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249895
11028	NC_011149	GCG	2	6	523567	523572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249895
11029	NC_011149	TCA	2	6	523574	523579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197249895
11030	NC_011149	GCG	2	6	523598	523603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249895
11031	NC_011149	AGC	2	6	523604	523609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249895
11032	NC_011149	AG	3	6	523695	523700	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_011149	CGT	2	6	523829	523834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247588
11034	NC_011149	TCA	2	6	523889	523894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247588
11035	NC_011149	T	6	6	523903	523908	0 %	100 %	0 %	0 %	197247588
11036	NC_011149	CG	3	6	523915	523920	0 %	0 %	50 %	50 %	197247588
11037	NC_011149	GCT	2	6	523946	523951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247588
11038	NC_011149	GCG	2	6	523996	524001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247588
11039	NC_011149	CGC	2	6	524060	524065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197247588
11040	NC_011149	CTG	2	6	524097	524102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247588
11041	NC_011149	GC	3	6	524124	524129	0 %	0 %	50 %	50 %	197247588
11042	NC_011149	GCC	2	6	524213	524218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197247588
11043	NC_011149	ACC	2	6	524244	524249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197247588
11044	NC_011149	CG	3	6	524379	524384	0 %	0 %	50 %	50 %	197247588
11045	NC_011149	GTT	2	6	524390	524395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197247588
11046	NC_011149	CG	3	6	524400	524405	0 %	0 %	50 %	50 %	197247588
11047	NC_011149	CTGA	2	8	524436	524443	25 %	25 %	25 %	25 %	197247588
11048	NC_011149	GGC	3	9	524588	524596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247588
11049	NC_011149	GC	3	6	524595	524600	0 %	0 %	50 %	50 %	197247588
11050	NC_011149	GCT	2	6	524618	524623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247588
11051	NC_011149	CTG	2	6	524640	524645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247588
11052	NC_011149	GGC	2	6	524696	524701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247588
11053	NC_011149	TAT	2	6	524760	524765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197247588
11054	NC_011149	GTT	2	6	524771	524776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197247588
11055	NC_011149	CGG	2	6	524811	524816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247588
11056	NC_011149	TGCG	2	8	524839	524846	0 %	25 %	50 %	25 %	197247588
11057	NC_011149	CGC	2	6	524887	524892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197247588
11058	NC_011149	CGG	2	6	524920	524925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247588
11059	NC_011149	CGC	3	9	524932	524940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197247588
11060	NC_011149	GCA	3	9	524945	524953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197247588
11061	NC_011149	CGC	2	6	524965	524970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197247588
11062	NC_011149	GGC	2	6	525014	525019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247588
11063	NC_011149	GC	3	6	525018	525023	0 %	0 %	50 %	50 %	197247588
11064	NC_011149	CAAAA	2	10	525053	525062	80 %	0 %	0 %	20 %	197247588
11065	NC_011149	A	6	6	525059	525064	100 %	0 %	0 %	0 %	197247588
11066	NC_011149	CG	4	8	525087	525094	0 %	0 %	50 %	50 %	197247588
11067	NC_011149	GC	3	6	525150	525155	0 %	0 %	50 %	50 %	197247588
11068	NC_011149	AAAG	2	8	525188	525195	75 %	0 %	25 %	0 %	197247588
11069	NC_011149	CCA	2	6	525214	525219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197247588
11070	NC_011149	GTA	2	6	525225	525230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197247588
11071	NC_011149	GTG	2	6	525243	525248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197247588
11072	NC_011149	A	6	6	525286	525291	100 %	0 %	0 %	0 %	197247588
11073	NC_011149	GGC	2	6	525302	525307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247588
11074	NC_011149	GGC	2	6	525314	525319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247588
11075	NC_011149	GCG	2	6	525345	525350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247588
11076	NC_011149	CTTT	2	8	525363	525370	0 %	75 %	0 %	25 %	197247588
11077	NC_011149	TGG	2	6	525379	525384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197247588
11078	NC_011149	GCG	2	6	525472	525477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247588
11079	NC_011149	GCA	2	6	525479	525484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197247588
11080	NC_011149	ACG	2	6	525519	525524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197247588
11081	NC_011149	GAT	2	6	525546	525551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197247588
11082	NC_011149	CGC	2	6	525568	525573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197247588
11083	NC_011149	ATT	2	6	525627	525632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197247588
11084	NC_011149	ATA	2	6	525637	525642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197247588
11085	NC_011149	TTC	2	6	525663	525668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197247588
11086	NC_011149	AG	3	6	525686	525691	50 %	0 %	50 %	0 %	197247588
11087	NC_011149	AG	5	10	525740	525749	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11088	NC_011149	TGA	2	6	525781	525786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248840
11089	NC_011149	CAG	2	6	525795	525800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248840
11090	NC_011149	A	6	6	525808	525813	100 %	0 %	0 %	0 %	197248840
11091	NC_011149	GCC	2	6	525907	525912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248840
11092	NC_011149	CTG	2	6	525933	525938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248840
11093	NC_011149	GCG	2	6	525990	525995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248840
11094	NC_011149	CGC	2	6	525996	526001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248840
11095	NC_011149	GAG	2	6	526005	526010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197248840
11096	NC_011149	AGA	2	6	526021	526026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197248840
11097	NC_011149	GCC	2	6	526055	526060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248840
11098	NC_011149	GCG	2	6	526194	526199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248347
11099	NC_011149	GTG	2	6	526334	526339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197248347
11100	NC_011149	CGC	2	6	526419	526424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248347
11101	NC_011149	GAT	2	6	526442	526447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248347
11102	NC_011149	A	6	6	526485	526490	100 %	0 %	0 %	0 %	197248347
11103	NC_011149	GGC	2	6	526613	526618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248347
11104	NC_011149	ACG	2	6	526640	526645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248347
11105	NC_011149	ATT	2	6	526676	526681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197248347
11106	NC_011149	GGC	2	6	526697	526702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11107	NC_011149	TTG	2	6	526780	526785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_011149	TCAG	2	8	526824	526831	25 %	25 %	25 %	25 %	197247766
11109	NC_011149	TGA	2	6	526853	526858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197247766
11110	NC_011149	GCG	2	6	526921	526926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247766
11111	NC_011149	TGA	2	6	527058	527063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197247766
11112	NC_011149	CGTA	2	8	527211	527218	25 %	25 %	25 %	25 %	197247766
11113	NC_011149	AGGCGA	2	12	527268	527279	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	197247766
11114	NC_011149	GAA	2	6	527437	527442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197247766
11115	NC_011149	CAA	2	6	527478	527483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197247766
11116	NC_011149	GAC	2	6	527524	527529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197247766
11117	NC_011149	CTG	2	6	527626	527631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247766
11118	NC_011149	GTAC	2	8	527694	527701	25 %	25 %	25 %	25 %	197247766
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11120	NC_011149	GAC	2	6	527893	527898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197247766
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11484	NC_011149	GTT	2	6	544013	544018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197247478
11485	NC_011149	GGC	2	6	544034	544039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247478
11486	NC_011149	GTCG	2	8	544041	544048	0 %	25 %	50 %	25 %	197247478
11487	NC_011149	ACGCG	2	10	544063	544072	20 %	0 %	40 %	40 %	197247478
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