MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 101713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_011149	CAT	3	9	475806	475814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197250726
10002	NC_011149	GAT	2	6	475866	475871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197250726
10003	NC_011149	TCA	2	6	475909	475914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197250726
10004	NC_011149	AC	3	6	475938	475943	50 %	0 %	0 %	50 %	197250726
10005	NC_011149	CAC	2	6	475962	475967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197250726
10006	NC_011149	TCA	2	6	476018	476023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197250726
10007	NC_011149	GCC	2	6	476103	476108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250726
10008	NC_011149	ACA	2	6	476151	476156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197251191
10009	NC_011149	CAAATC	2	12	476166	476177	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	197251191
10010	NC_011149	ATG	2	6	476211	476216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197251191
10011	NC_011149	CGTG	2	8	476305	476312	0 %	25 %	50 %	25 %	197251191
10012	NC_011149	GAA	2	6	476324	476329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197251191
10013	NC_011149	AAG	2	6	476424	476429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197251191
10014	NC_011149	GCCA	2	8	476436	476443	25 %	0 %	25 %	50 %	197251191
10015	NC_011149	TTG	2	6	476460	476465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197251191
10016	NC_011149	CGC	2	6	476483	476488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197251191
10017	NC_011149	CAG	2	6	476516	476521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197251191
10018	NC_011149	GAAC	2	8	476536	476543	50 %	0 %	25 %	25 %	197251191
10019	NC_011149	GCC	2	6	476573	476578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197251191
10020	NC_011149	TCA	2	6	476641	476646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197251191
10021	NC_011149	GTA	2	6	476814	476819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197250137
10022	NC_011149	TCA	2	6	476830	476835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197250137
10023	NC_011149	TGA	2	6	476855	476860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197250137
10024	NC_011149	GCCA	2	8	476884	476891	25 %	0 %	25 %	50 %	197250137
10025	NC_011149	GGC	2	6	476934	476939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250137
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10027	NC_011149	CGG	3	9	477081	477089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250137
10028	NC_011149	GCG	2	6	477217	477222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250137
10029	NC_011149	CGG	3	9	477224	477232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250137
10030	NC_011149	GCTG	2	8	477269	477276	0 %	25 %	50 %	25 %	197250137
10031	NC_011149	GTAC	2	8	477305	477312	25 %	25 %	25 %	25 %	197250137
10032	NC_011149	CCAGAA	2	12	477345	477356	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	197250137
10033	NC_011149	CCA	2	6	477405	477410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197250137
10034	NC_011149	AGC	2	6	477428	477433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250137
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10038	NC_011149	CAG	2	6	477522	477527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250137
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10040	NC_011149	CAT	2	6	477579	477584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197250137
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10046	NC_011149	CAGAAT	2	12	477849	477860	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	197250137
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10052	NC_011149	GCG	2	6	478199	478204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250137
10053	NC_011149	AGCC	2	8	478209	478216	25 %	0 %	25 %	50 %	197250137
10054	NC_011149	GTT	2	6	478296	478301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197250137
10055	NC_011149	CG	4	8	478322	478329	0 %	0 %	50 %	50 %	197250137
10056	NC_011149	ACC	2	6	478345	478350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197250137
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10060	NC_011149	CGG	2	6	478437	478442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250137
10061	NC_011149	CGG	2	6	478460	478465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250137
10062	NC_011149	CTG	2	6	478476	478481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250137
10063	NC_011149	CAT	2	6	478488	478493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197250137
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10068	NC_011149	CGA	2	6	478646	478651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250137
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10079	NC_011149	GCGT	2	8	479354	479361	0 %	25 %	50 %	25 %	197250769
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10089	NC_011149	T	6	6	480076	480081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_011149	TTA	2	6	480121	480126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_011149	AAT	2	6	480135	480140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10119	NC_011149	GCC	2	6	481285	481290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197251780
10120	NC_011149	CGC	2	6	481329	481334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197251780
10121	NC_011149	CGC	2	6	481338	481343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197251780
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10123	NC_011149	AACC	2	8	481369	481376	50 %	0 %	0 %	50 %	197251780
10124	NC_011149	CGA	3	9	481378	481386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197251780
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10132	NC_011149	AGT	2	6	481794	481799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10133	NC_011149	TGC	2	6	481824	481829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10134	NC_011149	AAT	2	6	481846	481851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10135	NC_011149	TGT	2	6	481875	481880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10136	NC_011149	AAT	2	6	481924	481929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10137	NC_011149	CTT	2	6	481995	482000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10139	NC_011149	CTG	2	6	482134	482139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10140	NC_011149	GTC	2	6	482171	482176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10145	NC_011149	TGT	2	6	482460	482465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10146	NC_011149	GGA	2	6	482532	482537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10147	NC_011149	ATG	2	6	482545	482550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248768
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10156	NC_011149	GAT	2	6	483091	483096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10159	NC_011149	T	6	6	483192	483197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10233	NC_011149	GCT	2	6	486765	486770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250772
10234	NC_011149	GTG	2	6	486814	486819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197250772
10235	NC_011149	CGA	2	6	486822	486827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250772
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10237	NC_011149	A	6	6	486927	486932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10238	NC_011149	G	6	6	486933	486938	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10239	NC_011149	TG	3	6	486982	486987	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10240	NC_011149	GGT	2	6	487022	487027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10242	NC_011149	GA	3	6	487075	487080	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10484	NC_011149	ATT	2	6	498593	498598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197251122
10485	NC_011149	GTC	2	6	498611	498616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197251122
10486	NC_011149	CG	3	6	498660	498665	0 %	0 %	50 %	50 %	197251122
10487	NC_011149	CGA	2	6	498668	498673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197251122
10488	NC_011149	ATG	2	6	498674	498679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197251122
10489	NC_011149	CGT	2	6	498687	498692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197251122
10490	NC_011149	TGCCGA	2	12	498806	498817	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	197251122
10491	NC_011149	TGA	2	6	498827	498832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197251122
10492	NC_011149	ATT	2	6	498860	498865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197251122
10493	NC_011149	GCC	2	6	498880	498885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197251122
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10499	NC_011149	TGG	2	6	499106	499111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197251122
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