MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601 chromosome

Total Repeats: 96599

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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48502	NC_011147	GCC	2	6	2291749	2291754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197363250
48503	NC_011147	CTT	2	6	2291756	2291761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197363250
48504	NC_011147	CGT	2	6	2291846	2291851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197363250
48505	NC_011147	AAG	2	6	2291928	2291933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48506	NC_011147	TAA	2	6	2292099	2292104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197363251
48507	NC_011147	GA	3	6	2292119	2292124	50 %	0 %	50 %	0 %	197363251
48508	NC_011147	ATC	2	6	2292133	2292138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197363251
48509	NC_011147	GTT	2	6	2292331	2292336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197363251
48510	NC_011147	A	6	6	2292343	2292348	100 %	0 %	0 %	0 %	197363251
48511	NC_011147	TCT	2	6	2292393	2292398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197363251
48512	NC_011147	TAT	2	6	2292579	2292584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48513	NC_011147	ACT	2	6	2292590	2292595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48514	NC_011147	AGG	2	6	2292638	2292643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48515	NC_011147	GCG	2	6	2292716	2292721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197363252
48516	NC_011147	CTG	2	6	2292767	2292772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197363252
48517	NC_011147	CGG	3	9	2292828	2292836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197363252
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48532	NC_011147	TGA	2	6	2293773	2293778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197363253
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48540	NC_011147	GAAA	2	8	2293981	2293988	75 %	0 %	25 %	0 %	197363253
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48545	NC_011147	CTC	2	6	2294176	2294181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197363253
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48553	NC_011147	A	6	6	2294675	2294680	100 %	0 %	0 %	0 %	197363253
48554	NC_011147	GCCA	2	8	2294813	2294820	25 %	0 %	25 %	50 %	197363254
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48602	NC_011147	GT	3	6	2297496	2297501	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48603	NC_011147	T	6	6	2297856	2297861	0 %	100 %	0 %	0 %	197363257
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48853	NC_011147	GTC	2	6	2309934	2309939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197363267
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48971	NC_011147	GCG	2	6	2315144	2315149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197363272
48972	NC_011147	TGG	2	6	2315151	2315156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197363272
48973	NC_011147	GC	3	6	2315198	2315203	0 %	0 %	50 %	50 %	197363272
48974	NC_011147	CGG	2	6	2315212	2315217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197363272
48975	NC_011147	CGG	2	6	2315251	2315256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197363272
48976	NC_011147	GCT	2	6	2315281	2315286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197363272
48977	NC_011147	GCC	2	6	2315288	2315293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197363272
48978	NC_011147	GCT	2	6	2315347	2315352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197363272
48979	NC_011147	GTG	2	6	2315360	2315365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197363272
48980	NC_011147	CTA	2	6	2315530	2315535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197363272
48981	NC_011147	TCTG	2	8	2315590	2315597	0 %	50 %	25 %	25 %	197363272
48982	NC_011147	CGG	2	6	2315632	2315637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197363272
48983	NC_011147	GCT	2	6	2315812	2315817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197363272
48984	NC_011147	CAT	2	6	2316056	2316061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48985	NC_011147	TCCGT	2	10	2316090	2316099	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
48986	NC_011147	T	6	6	2316144	2316149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48987	NC_011147	CAC	2	6	2316245	2316250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197363273
48988	NC_011147	CGG	2	6	2316257	2316262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197363273
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48990	NC_011147	TGG	2	6	2316319	2316324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197363273
48991	NC_011147	TTG	2	6	2316370	2316375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197363273
48992	NC_011147	GCT	2	6	2316521	2316526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197363273
48993	NC_011147	CCG	2	6	2316541	2316546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197363273
48994	NC_011147	CTGT	2	8	2316587	2316594	0 %	50 %	25 %	25 %	197363273
48995	NC_011147	CGT	2	6	2316608	2316613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197363273
48996	NC_011147	CTG	2	6	2316615	2316620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197363273
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48998	NC_011147	GAG	2	6	2316630	2316635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197363273
48999	NC_011147	GGCT	2	8	2316675	2316682	0 %	25 %	50 %	25 %	197363273
49000	NC_011147	TGC	2	6	2316721	2316726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197363273

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