MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601 chromosome

Total Repeats: 96599

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_011147	TCG	2	6	2601381	2601386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197363545
55002	NC_011147	GAA	2	6	2601478	2601483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197363545
55003	NC_011147	A	6	6	2601517	2601522	100 %	0 %	0 %	0 %	197363545
55004	NC_011147	TGC	2	6	2601547	2601552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197363545
55005	NC_011147	ATGGGT	2	12	2601574	2601585	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	197363545
55006	NC_011147	TGA	2	6	2601622	2601627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197363545
55007	NC_011147	GC	4	8	2601632	2601639	0 %	0 %	50 %	50 %	197363545
55008	NC_011147	TAT	2	6	2601753	2601758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197363546
55009	NC_011147	TAAGCG	2	12	2601771	2601782	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	197363546
55010	NC_011147	GCC	2	6	2601849	2601854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197363546
55011	NC_011147	C	7	7	2601853	2601859	0 %	0 %	0 %	100 %	197363546
55012	NC_011147	CCAGT	2	10	2601925	2601934	20 %	20 %	20 %	40 %	197363546
55013	NC_011147	TAT	2	6	2601960	2601965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197363546
55014	NC_011147	TGA	2	6	2602035	2602040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197363546
55015	NC_011147	TCA	2	6	2602052	2602057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197363546
55016	NC_011147	CAG	2	6	2602123	2602128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197363546
55017	NC_011147	AAGG	2	8	2602155	2602162	50 %	0 %	50 %	0 %	197363546
55018	NC_011147	GCT	2	6	2602314	2602319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197363546
55019	NC_011147	GTA	2	6	2602336	2602341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197363546
55020	NC_011147	GA	3	6	2602389	2602394	50 %	0 %	50 %	0 %	197363546
55021	NC_011147	ATT	2	6	2602426	2602431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55022	NC_011147	AT	3	6	2602441	2602446	50 %	50 %	0 %	0 %	197363547
55023	NC_011147	ATG	2	6	2602500	2602505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197363547
55024	NC_011147	TG	3	6	2602514	2602519	0 %	50 %	50 %	0 %	197363547
55025	NC_011147	TTG	2	6	2602521	2602526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197363547
55026	NC_011147	CATCAC	2	12	2602601	2602612	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	197363547
55027	NC_011147	CGG	2	6	2602674	2602679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197363547
55028	NC_011147	TTG	2	6	2602707	2602712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197363547
55029	NC_011147	CTTA	2	8	2602806	2602813	25 %	50 %	0 %	25 %	197363547
55030	NC_011147	GCG	2	6	2602818	2602823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197363547
55031	NC_011147	GGC	2	6	2602838	2602843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197363547
55032	NC_011147	CT	3	6	2602903	2602908	0 %	50 %	0 %	50 %	197363547
55033	NC_011147	GAC	2	6	2602913	2602918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197363547
55034	NC_011147	TGC	2	6	2602928	2602933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197363547
55035	NC_011147	A	7	7	2603035	2603041	100 %	0 %	0 %	0 %	197363547
55036	NC_011147	T	7	7	2603088	2603094	0 %	100 %	0 %	0 %	197363547
55037	NC_011147	TTAA	2	8	2603114	2603121	50 %	50 %	0 %	0 %	197363547
55038	NC_011147	CAA	2	6	2603147	2603152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197363547
55039	NC_011147	AAAG	2	8	2603182	2603189	75 %	0 %	25 %	0 %	197363547
55040	NC_011147	GTC	2	6	2603242	2603247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55041	NC_011147	AC	4	8	2603264	2603271	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55042	NC_011147	GCAC	2	8	2603352	2603359	25 %	0 %	25 %	50 %	197363548
55043	NC_011147	GATG	2	8	2603414	2603421	25 %	25 %	50 %	0 %	197363548
55044	NC_011147	GAC	2	6	2603422	2603427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197363548
55045	NC_011147	CGA	2	6	2603472	2603477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197363548
55046	NC_011147	AACAGA	2	12	2603516	2603527	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	197363548
55047	NC_011147	TAC	3	9	2603636	2603644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197363548
55048	NC_011147	CG	3	6	2603763	2603768	0 %	0 %	50 %	50 %	197363548
55049	NC_011147	TGT	2	6	2603775	2603780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197363548
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55051	NC_011147	ATG	2	6	2603806	2603811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197363548
55052	NC_011147	GCG	2	6	2603870	2603875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197363548
55053	NC_011147	CAAA	2	8	2603903	2603910	75 %	0 %	0 %	25 %	197363548
55054	NC_011147	CTTT	2	8	2603941	2603948	0 %	75 %	0 %	25 %	197363548
55055	NC_011147	CAA	2	6	2604035	2604040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197363548
55056	NC_011147	GCA	2	6	2604375	2604380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197363548
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55058	NC_011147	GCA	2	6	2604440	2604445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197363548
55059	NC_011147	GTT	2	6	2604603	2604608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197363548
55060	NC_011147	CGA	2	6	2604647	2604652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55061	NC_011147	GCT	2	6	2604731	2604736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197363549
55062	NC_011147	AATCG	2	10	2604801	2604810	40 %	20 %	20 %	20 %	197363549
55063	NC_011147	CAAC	2	8	2604814	2604821	50 %	0 %	0 %	50 %	197363549
55064	NC_011147	GACAT	2	10	2605017	2605026	40 %	20 %	20 %	20 %	197363549
55065	NC_011147	CGC	2	6	2605042	2605047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197363549
55066	NC_011147	CGT	2	6	2605090	2605095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197363549
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55069	NC_011147	CCG	2	6	2605207	2605212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197363549
55070	NC_011147	TGG	2	6	2605446	2605451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197363549
55071	NC_011147	GCA	2	6	2605499	2605504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55072	NC_011147	GC	3	6	2605598	2605603	0 %	0 %	50 %	50 %	197363550
55073	NC_011147	TTCA	2	8	2605621	2605628	25 %	50 %	0 %	25 %	197363550
55074	NC_011147	A	6	6	2605644	2605649	100 %	0 %	0 %	0 %	197363550
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55088	NC_011147	CGG	2	6	2606241	2606246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197363550
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55091	NC_011147	T	6	6	2606333	2606338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55092	NC_011147	TTC	2	6	2606393	2606398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55093	NC_011147	CACT	2	8	2606416	2606423	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55094	NC_011147	GTTT	2	8	2606441	2606448	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55095	NC_011147	AAT	2	6	2606469	2606474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55099	NC_011147	AACA	2	8	2606817	2606824	75 %	0 %	0 %	25 %	197363551
55100	NC_011147	GCG	2	6	2606827	2606832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197363551
55101	NC_011147	CGGCA	2	10	2606850	2606859	20 %	0 %	40 %	40 %	197363551
55102	NC_011147	CTG	2	6	2606939	2606944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197363551
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55106	NC_011147	CAG	2	6	2607120	2607125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197363551
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55109	NC_011147	GCCA	2	8	2607182	2607189	25 %	0 %	25 %	50 %	197363551
55110	NC_011147	ACC	2	6	2607246	2607251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197363551
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