MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601 chromosome

Total Repeats: 96599

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_011147	AGA	2	6	2509065	2509070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53002	NC_011147	ATCC	2	8	2509071	2509078	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53003	NC_011147	GGC	2	6	2509097	2509102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53004	NC_011147	CAG	2	6	2509158	2509163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197363458
53005	NC_011147	TCA	2	6	2509193	2509198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197363458
53006	NC_011147	TCC	2	6	2509202	2509207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197363459
53007	NC_011147	TCT	2	6	2509210	2509215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197363459
53008	NC_011147	CGG	2	6	2509239	2509244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197363459
53009	NC_011147	CAG	2	6	2509252	2509257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197363459
53010	NC_011147	TCA	2	6	2509371	2509376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197363459
53011	NC_011147	CCCAA	2	10	2509397	2509406	40 %	0 %	0 %	60 %	197363459
53012	NC_011147	CAA	2	6	2509510	2509515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197363459
53013	NC_011147	TTC	2	6	2509539	2509544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197363459
53014	NC_011147	GTC	2	6	2509703	2509708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197363459
53015	NC_011147	TCA	2	6	2509794	2509799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197363459
53016	NC_011147	A	6	6	2509822	2509827	100 %	0 %	0 %	0 %	197363459
53017	NC_011147	T	6	6	2509913	2509918	0 %	100 %	0 %	0 %	197363459
53018	NC_011147	CGT	2	6	2509958	2509963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197363459
53019	NC_011147	AG	3	6	2509998	2510003	50 %	0 %	50 %	0 %	197363459
53020	NC_011147	GTT	2	6	2510068	2510073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197363459
53021	NC_011147	TCC	2	6	2510115	2510120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197363459
53022	NC_011147	CGCGA	2	10	2510146	2510155	20 %	0 %	40 %	40 %	197363459
53023	NC_011147	TGCAT	2	10	2510307	2510316	20 %	40 %	20 %	20 %	197363459
53024	NC_011147	TGC	2	6	2510330	2510335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197363459
53025	NC_011147	TTC	2	6	2510468	2510473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197363459
53026	NC_011147	TG	3	6	2510485	2510490	0 %	50 %	50 %	0 %	197363459
53027	NC_011147	CTG	2	6	2510547	2510552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197363459
53028	NC_011147	TCA	2	6	2510553	2510558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197363459
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53030	NC_011147	GGC	2	6	2510607	2510612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197363459
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53032	NC_011147	AAATC	2	10	2510680	2510689	60 %	20 %	0 %	20 %	197363460
53033	NC_011147	CATC	2	8	2510739	2510746	25 %	25 %	0 %	50 %	197363460
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53035	NC_011147	T	6	6	2510952	2510957	0 %	100 %	0 %	0 %	197363460
53036	NC_011147	CTG	2	6	2510975	2510980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197363460
53037	NC_011147	CT	3	6	2510986	2510991	0 %	50 %	0 %	50 %	197363460
53038	NC_011147	ATT	2	6	2511012	2511017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197363460
53039	NC_011147	TAT	2	6	2511020	2511025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197363460
53040	NC_011147	ACA	2	6	2511057	2511062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197363460
53041	NC_011147	TGT	2	6	2511086	2511091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197363460
53042	NC_011147	ATC	2	6	2511141	2511146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197363460
53043	NC_011147	CATTC	2	10	2511201	2511210	20 %	40 %	0 %	40 %	197363460
53044	NC_011147	CAAC	2	8	2511305	2511312	50 %	0 %	0 %	50 %	197363460
53045	NC_011147	CT	3	6	2511486	2511491	0 %	50 %	0 %	50 %	197363460
53046	NC_011147	GCT	2	6	2511579	2511584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197363461
53047	NC_011147	GTA	2	6	2511609	2511614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197363461
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53051	NC_011147	CAT	2	6	2511812	2511817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197363462
53052	NC_011147	GA	3	6	2511826	2511831	50 %	0 %	50 %	0 %	197363462
53053	NC_011147	TTC	2	6	2511840	2511845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197363462
53054	NC_011147	CAT	2	6	2511902	2511907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197363462
53055	NC_011147	TTG	2	6	2511915	2511920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197363462
53056	NC_011147	GCC	2	6	2511942	2511947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197363462
53057	NC_011147	TTCA	2	8	2511972	2511979	25 %	50 %	0 %	25 %	197363462
53058	NC_011147	TAGA	2	8	2511997	2512004	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53059	NC_011147	CGG	2	6	2512055	2512060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53060	NC_011147	TGC	2	6	2512093	2512098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53061	NC_011147	TTC	2	6	2512140	2512145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53062	NC_011147	TGC	2	6	2512165	2512170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53063	NC_011147	GCC	2	6	2512189	2512194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53064	NC_011147	GCT	2	6	2512221	2512226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53065	NC_011147	CA	3	6	2512233	2512238	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53066	NC_011147	AC	3	6	2512323	2512328	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53067	NC_011147	ATA	2	6	2512334	2512339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53068	NC_011147	A	6	6	2512416	2512421	100 %	0 %	0 %	0 %	197363463
53069	NC_011147	CT	4	8	2512426	2512433	0 %	50 %	0 %	50 %	197363463
53070	NC_011147	CAA	2	6	2512442	2512447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197363463
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53072	NC_011147	CAA	2	6	2512549	2512554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197363463
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53074	NC_011147	A	6	6	2512623	2512628	100 %	0 %	0 %	0 %	197363463
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53081	NC_011147	ATGAA	2	10	2513029	2513038	60 %	20 %	20 %	0 %	197363463
53082	NC_011147	AGCC	2	8	2513101	2513108	25 %	0 %	25 %	50 %	197363463
53083	NC_011147	TGA	2	6	2513116	2513121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53084	NC_011147	TGA	2	6	2513132	2513137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53085	NC_011147	TG	3	6	2513167	2513172	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53086	NC_011147	TGGA	2	8	2513203	2513210	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53087	NC_011147	A	7	7	2513222	2513228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53088	NC_011147	TTG	2	6	2513250	2513255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53089	NC_011147	TTTA	2	8	2513261	2513268	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53090	NC_011147	CCG	2	6	2513283	2513288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53091	NC_011147	CAA	2	6	2513312	2513317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53092	NC_011147	GGC	2	6	2513333	2513338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53093	NC_011147	T	6	6	2513441	2513446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53094	NC_011147	AAGA	2	8	2513475	2513482	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53095	NC_011147	CT	3	6	2513507	2513512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53096	NC_011147	ACG	2	6	2513608	2513613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53097	NC_011147	ATTCT	2	10	2513614	2513623	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
53098	NC_011147	AG	3	6	2513636	2513641	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53099	NC_011147	TAAC	2	8	2513703	2513710	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53100	NC_011147	GTC	2	6	2513789	2513794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53101	NC_011147	CA	3	6	2513951	2513956	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53102	NC_011147	CTCG	2	8	2513962	2513969	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53103	NC_011147	T	6	6	2513970	2513975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53104	NC_011147	AAAT	2	8	2514008	2514015	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53105	NC_011147	CAA	2	6	2514028	2514033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53106	NC_011147	ATA	2	6	2514035	2514040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53107	NC_011147	ATTA	2	8	2514050	2514057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53108	NC_011147	AAT	2	6	2514079	2514084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53109	NC_011147	CAG	2	6	2514108	2514113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53110	NC_011147	GAT	2	6	2514155	2514160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53111	NC_011147	TGGGTT	2	12	2514195	2514206	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53112	NC_011147	CGG	2	6	2514228	2514233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53113	NC_011147	TTA	2	6	2514324	2514329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197363464
53114	NC_011147	GCG	2	6	2514379	2514384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197363464
53115	NC_011147	GAAG	2	8	2514529	2514536	50 %	0 %	50 %	0 %	197363464
53116	NC_011147	AGG	2	6	2514541	2514546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197363464
53117	NC_011147	CTT	2	6	2514554	2514559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197363464
53118	NC_011147	CAAA	2	8	2514598	2514605	75 %	0 %	0 %	25 %	197363464
53119	NC_011147	T	7	7	2514643	2514649	0 %	100 %	0 %	0 %	197363465
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53245	NC_011147	ATG	2	6	2521585	2521590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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53341	NC_011147	T	6	6	2525918	2525923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53470	NC_011147	A	6	6	2532958	2532963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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