MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601 chromosome

Total Repeats: 96599

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51001	NC_011147	ATT	2	6	2409902	2409907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51002	NC_011147	GCG	2	6	2409947	2409952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197363364
51003	NC_011147	TTG	2	6	2409972	2409977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197363364
51004	NC_011147	GTTCT	2	10	2410019	2410028	0 %	60 %	20 %	20 %	197363364
51005	NC_011147	TTTG	2	8	2410049	2410056	0 %	75 %	25 %	0 %	197363364
51006	NC_011147	GAA	2	6	2410091	2410096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197363364
51007	NC_011147	GCG	2	6	2410107	2410112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197363364
51008	NC_011147	TTTC	2	8	2410128	2410135	0 %	75 %	0 %	25 %	197363364
51009	NC_011147	TGCGC	2	10	2410276	2410285	0 %	20 %	40 %	40 %	197363364
51010	NC_011147	TGAT	2	8	2410296	2410303	25 %	50 %	25 %	0 %	197363364
51011	NC_011147	CCA	2	6	2410321	2410326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197363364
51012	NC_011147	CGA	2	6	2410360	2410365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197363364
51013	NC_011147	TGC	2	6	2410368	2410373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197363364
51014	NC_011147	AAG	2	6	2410443	2410448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197363364
51015	NC_011147	T	6	6	2410547	2410552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51016	NC_011147	ACC	2	6	2410571	2410576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51017	NC_011147	GCAACG	2	12	2410683	2410694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197363365
51018	NC_011147	CCA	2	6	2410734	2410739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197363365
51019	NC_011147	GCT	3	9	2410746	2410754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197363365
51020	NC_011147	ACG	2	6	2410813	2410818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197363365
51021	NC_011147	TAA	2	6	2410958	2410963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197363365
51022	NC_011147	ACC	2	6	2410997	2411002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197363365
51023	NC_011147	GC	3	6	2411014	2411019	0 %	0 %	50 %	50 %	197363365
51024	NC_011147	CAG	2	6	2411032	2411037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197363365
51025	NC_011147	GC	3	6	2411047	2411052	0 %	0 %	50 %	50 %	197363365
51026	NC_011147	GTT	2	6	2411088	2411093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197363365
51027	NC_011147	ATCC	2	8	2411122	2411129	25 %	25 %	0 %	50 %	197363365
51028	NC_011147	GGC	2	6	2411230	2411235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197363365
51029	NC_011147	GCC	2	6	2411318	2411323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197363365
51030	NC_011147	TGC	2	6	2411342	2411347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197363365
51031	NC_011147	GC	3	6	2411356	2411361	0 %	0 %	50 %	50 %	197363365
51032	NC_011147	CCCG	2	8	2411362	2411369	0 %	0 %	25 %	75 %	197363365
51033	NC_011147	GCC	2	6	2411397	2411402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197363365
51034	NC_011147	ACGA	2	8	2411437	2411444	50 %	0 %	25 %	25 %	197363365
51035	NC_011147	CCA	2	6	2411472	2411477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197363365
51036	NC_011147	TGAT	2	8	2411485	2411492	25 %	50 %	25 %	0 %	197363365
51037	NC_011147	CCAG	2	8	2411520	2411527	25 %	0 %	25 %	50 %	197363365
51038	NC_011147	CGC	2	6	2411595	2411600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197363365
51039	NC_011147	TGC	2	6	2411604	2411609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197363365
51040	NC_011147	CGC	2	6	2411640	2411645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197363365
51041	NC_011147	CGC	2	6	2411699	2411704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197363365
51042	NC_011147	GCA	2	6	2411709	2411714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197363365
51043	NC_011147	CGC	2	6	2411724	2411729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197363365
51044	NC_011147	GCC	2	6	2411869	2411874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197363365
51045	NC_011147	CCGC	2	8	2411888	2411895	0 %	0 %	25 %	75 %	197363365
51046	NC_011147	G	6	6	2411898	2411903	0 %	0 %	100 %	0 %	197363365
51047	NC_011147	GCA	2	6	2411925	2411930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197363365
51048	NC_011147	ATG	2	6	2411950	2411955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197363365
51049	NC_011147	A	6	6	2412024	2412029	100 %	0 %	0 %	0 %	197363365
51050	NC_011147	GCG	2	6	2412117	2412122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197363365
51051	NC_011147	TCGC	2	8	2412201	2412208	0 %	25 %	25 %	50 %	197363365
51052	NC_011147	CGGCTG	2	12	2412223	2412234	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	197363365
51053	NC_011147	GCG	2	6	2412235	2412240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197363365
51054	NC_011147	TTC	2	6	2412265	2412270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197363365
51055	NC_011147	CGG	2	6	2412304	2412309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197363365
51056	NC_011147	TCA	2	6	2412457	2412462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51057	NC_011147	TTA	2	6	2412472	2412477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51058	NC_011147	GAG	2	6	2412481	2412486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51059	NC_011147	AGG	2	6	2412492	2412497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51060	NC_011147	CAG	2	6	2412615	2412620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197363366
51061	NC_011147	AAT	2	6	2412684	2412689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197363366
51062	NC_011147	TCG	2	6	2412716	2412721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197363366
51063	NC_011147	CGG	2	6	2412768	2412773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197363366
51064	NC_011147	ACG	2	6	2412777	2412782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197363366
51065	NC_011147	CAG	2	6	2412801	2412806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197363366
51066	NC_011147	CCATAC	2	12	2412816	2412827	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	197363366
51067	NC_011147	ATG	2	6	2412877	2412882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197363366
51068	NC_011147	CAG	2	6	2412903	2412908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197363366
51069	NC_011147	TCA	2	6	2412917	2412922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197363366
51070	NC_011147	GC	3	6	2412977	2412982	0 %	0 %	50 %	50 %	197363366
51071	NC_011147	GCA	2	6	2413004	2413009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197363366
51072	NC_011147	GGC	2	6	2413083	2413088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197363366
51073	NC_011147	GATA	2	8	2413157	2413164	50 %	25 %	25 %	0 %	197363366
51074	NC_011147	GC	3	6	2413228	2413233	0 %	0 %	50 %	50 %	197363366
51075	NC_011147	CGG	2	6	2413265	2413270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197363366
51076	NC_011147	CAGC	2	8	2413335	2413342	25 %	0 %	25 %	50 %	197363366
51077	NC_011147	GAA	2	6	2413350	2413355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197363366
51078	NC_011147	GCC	2	6	2413356	2413361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197363366
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51080	NC_011147	CA	3	6	2413414	2413419	50 %	0 %	0 %	50 %	197363366
51081	NC_011147	ATG	2	6	2413420	2413425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197363366
51082	NC_011147	ATA	2	6	2413447	2413452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197363366
51083	NC_011147	TGG	2	6	2413454	2413459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197363366
51084	NC_011147	GAA	2	6	2413467	2413472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197363366
51085	NC_011147	TCA	2	6	2413511	2413516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197363366
51086	NC_011147	CAC	2	6	2413539	2413544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197363366
51087	NC_011147	CGG	2	6	2413571	2413576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197363366
51088	NC_011147	CGA	2	6	2413625	2413630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197363366
51089	NC_011147	GC	3	6	2413750	2413755	0 %	0 %	50 %	50 %	197363366
51090	NC_011147	AT	3	6	2413762	2413767	50 %	50 %	0 %	0 %	197363366
51091	NC_011147	AAT	2	6	2413782	2413787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197363366
51092	NC_011147	CCG	2	6	2413829	2413834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197363366
51093	NC_011147	TTA	2	6	2413915	2413920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197363366
51094	NC_011147	A	6	6	2413956	2413961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51095	NC_011147	GTG	2	6	2413981	2413986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51096	NC_011147	CGC	2	6	2414036	2414041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197363367
51097	NC_011147	ATCACC	2	12	2414064	2414075	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	197363367
51098	NC_011147	GCA	2	6	2414137	2414142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197363367
51099	NC_011147	GAT	2	6	2414213	2414218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197363367
51100	NC_011147	CCA	2	6	2414234	2414239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197363367
51101	NC_011147	CGG	2	6	2414276	2414281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197363367
51102	NC_011147	ATAG	2	8	2414282	2414289	50 %	25 %	25 %	0 %	197363367
51103	NC_011147	ACC	2	6	2414343	2414348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197363367
51104	NC_011147	GCC	2	6	2414357	2414362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197363367
51105	NC_011147	GCGCAG	2	12	2414418	2414429	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	197363367
51106	NC_011147	CCG	2	6	2414440	2414445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197363367
51107	NC_011147	GCC	2	6	2414472	2414477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197363367
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51109	NC_011147	GAA	2	6	2414524	2414529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197363367
51110	NC_011147	CGC	2	6	2414531	2414536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197363367
51111	NC_011147	CTGA	2	8	2414545	2414552	25 %	25 %	25 %	25 %	197363367
51112	NC_011147	CAAGG	2	10	2414588	2414597	40 %	0 %	40 %	20 %	197363367
51113	NC_011147	AGC	2	6	2414601	2414606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197363367
51114	NC_011147	CGCC	2	8	2414617	2414624	0 %	0 %	25 %	75 %	197363367
51115	NC_011147	GGCC	2	8	2414629	2414636	0 %	0 %	50 %	50 %	197363367
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51354	NC_011147	GGC	2	6	2425631	2425636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449784964
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51468	NC_011147	GTC	2	6	2430765	2430770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197363382
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