MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601 chromosome

Total Repeats: 96599

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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50002	NC_011147	CGG	2	6	2362029	2362034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197363314
50003	NC_011147	CCA	2	6	2362037	2362042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197363314
50004	NC_011147	TTTA	2	8	2362065	2362072	25 %	75 %	0 %	0 %	197363314
50005	NC_011147	T	6	6	2362170	2362175	0 %	100 %	0 %	0 %	197363314
50006	NC_011147	CAC	2	6	2362230	2362235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197363314
50007	NC_011147	CCG	2	6	2362244	2362249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197363314
50008	NC_011147	CAT	2	6	2362260	2362265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197363314
50009	NC_011147	TTCCGC	2	12	2362281	2362292	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	197363314
50010	NC_011147	CGC	2	6	2362320	2362325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197363314
50011	NC_011147	CGT	2	6	2362364	2362369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197363314
50012	NC_011147	TTCT	2	8	2362383	2362390	0 %	75 %	0 %	25 %	197363314
50013	NC_011147	GCA	2	6	2362481	2362486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197363314
50014	NC_011147	CAT	2	6	2362503	2362508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197363314
50015	NC_011147	CGTT	2	8	2362528	2362535	0 %	50 %	25 %	25 %	197363314
50016	NC_011147	GCG	2	6	2362591	2362596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197363314
50017	NC_011147	GTC	2	6	2362620	2362625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197363314
50018	NC_011147	CGG	2	6	2362653	2362658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197363314
50019	NC_011147	T	7	7	2362661	2362667	0 %	100 %	0 %	0 %	197363314
50020	NC_011147	CTT	2	6	2362718	2362723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197363314
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50024	NC_011147	CTTC	2	8	2362931	2362938	0 %	50 %	0 %	50 %	197363314
50025	NC_011147	T	7	7	2362955	2362961	0 %	100 %	0 %	0 %	197363314
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50028	NC_011147	ACC	2	6	2363161	2363166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50029	NC_011147	CA	3	6	2363201	2363206	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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50120	NC_011147	CTG	2	6	2367544	2367549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197363318
50121	NC_011147	TCT	2	6	2367618	2367623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197363318
50122	NC_011147	ATC	2	6	2367636	2367641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197363318
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50221	NC_011147	GGGCGC	2	12	2372477	2372488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197363322
50222	NC_011147	CTT	2	6	2372501	2372506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197363322
50223	NC_011147	CAC	2	6	2372513	2372518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197363322
50224	NC_011147	GTT	2	6	2372561	2372566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197363322
50225	NC_011147	ATG	2	6	2372604	2372609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197363322
50226	NC_011147	TCGG	2	8	2372637	2372644	0 %	25 %	50 %	25 %	197363322
50227	NC_011147	TGC	2	6	2372659	2372664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197363322
50228	NC_011147	ATC	2	6	2372733	2372738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197363322
50229	NC_011147	GGC	2	6	2372739	2372744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197363322
50230	NC_011147	GTG	2	6	2372745	2372750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197363322
50231	NC_011147	GCT	2	6	2372755	2372760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197363322
50232	NC_011147	TGG	2	6	2372778	2372783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197363322
50233	NC_011147	TTCTGG	2	12	2372832	2372843	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	197363322
50234	NC_011147	GTAC	2	8	2372876	2372883	25 %	25 %	25 %	25 %	197363322
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50354	NC_011147	TCT	2	6	2378378	2378383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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50356	NC_011147	GTT	2	6	2378433	2378438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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50472	NC_011147	CTT	2	6	2383592	2383597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197363334
50473	NC_011147	TG	3	6	2383639	2383644	0 %	50 %	50 %	0 %	197363334
50474	NC_011147	TCC	2	6	2383675	2383680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197363334
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50476	NC_011147	TGC	2	6	2383833	2383838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197363334
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50482	NC_011147	GC	3	6	2384028	2384033	0 %	0 %	50 %	50 %	197363334
50483	NC_011147	CGC	2	6	2384039	2384044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197363334
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50486	NC_011147	GCA	2	6	2384192	2384197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197363334
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50489	NC_011147	ATC	3	9	2384277	2384285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197363334
50490	NC_011147	AAC	2	6	2384302	2384307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197363334
50491	NC_011147	CTT	2	6	2384312	2384317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197363334
50492	NC_011147	GGT	2	6	2384331	2384336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197363334
50493	NC_011147	CAA	2	6	2384459	2384464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50494	NC_011147	A	6	6	2384463	2384468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50495	NC_011147	GGC	2	6	2384489	2384494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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50497	NC_011147	TCG	2	6	2384718	2384723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197363335
50498	NC_011147	GGTT	2	8	2384725	2384732	0 %	50 %	50 %	0 %	197363335
50499	NC_011147	GCG	2	6	2384831	2384836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197363335
50500	NC_011147	ACC	2	6	2384842	2384847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197363335

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