MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 chromosome

Total Repeats: 103087

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_011083	CAGGCG	2	12	910289	910300	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	194449590
19502	NC_011083	GGT	2	6	910337	910342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194449590
19503	NC_011083	CGC	2	6	910360	910365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194449590
19504	NC_011083	CAA	2	6	910493	910498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194449590
19505	NC_011083	CCG	2	6	910523	910528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194449590
19506	NC_011083	GC	3	6	910547	910552	0 %	0 %	50 %	50 %	194449590
19507	NC_011083	TTAACG	2	12	910559	910570	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	194449590
19508	NC_011083	CTG	2	6	910601	910606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449590
19509	NC_011083	GCG	3	9	910644	910652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449100
19510	NC_011083	GGCCG	2	10	910656	910665	0 %	0 %	60 %	40 %	194449100
19511	NC_011083	GCA	2	6	910694	910699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449100
19512	NC_011083	GCT	2	6	910715	910720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449100
19513	NC_011083	GCC	2	6	910735	910740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194449100
19514	NC_011083	GT	3	6	910750	910755	0 %	50 %	50 %	0 %	194449100
19515	NC_011083	TGC	2	6	910843	910848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449100
19516	NC_011083	GGC	2	6	910868	910873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449100
19517	NC_011083	CCTGG	2	10	910931	910940	0 %	20 %	40 %	40 %	194449100
19518	NC_011083	GTG	2	6	910958	910963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194449100
19519	NC_011083	CGG	2	6	911012	911017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449100
19520	NC_011083	GTG	2	6	911019	911024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194449100
19521	NC_011083	ACC	2	6	911031	911036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194449100
19522	NC_011083	GGCG	2	8	911149	911156	0 %	0 %	75 %	25 %	194449100
19523	NC_011083	ACC	2	6	911338	911343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194449100
19524	NC_011083	TACTGA	2	12	911391	911402	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	194449054
19525	NC_011083	CAG	2	6	911550	911555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449054
19526	NC_011083	CGA	2	6	911628	911633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449054
19527	NC_011083	CGG	2	6	911651	911656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449054
19528	NC_011083	GCAG	2	8	911688	911695	25 %	0 %	50 %	25 %	194449054
19529	NC_011083	GCGG	2	8	911716	911723	0 %	0 %	75 %	25 %	194449054
19530	NC_011083	CT	3	6	911737	911742	0 %	50 %	0 %	50 %	194449054
19531	NC_011083	AGC	2	6	911777	911782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449054
19532	NC_011083	GTT	2	6	911797	911802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194449054
19533	NC_011083	GGAT	2	8	911878	911885	25 %	25 %	50 %	0 %	194449054
19534	NC_011083	GCC	2	6	911901	911906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194449054
19535	NC_011083	GC	3	6	911909	911914	0 %	0 %	50 %	50 %	194449054
19536	NC_011083	CGC	2	6	911941	911946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194449054
19537	NC_011083	GGC	2	6	912003	912008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449054
19538	NC_011083	GACAG	2	10	912009	912018	40 %	0 %	40 %	20 %	194449054
19539	NC_011083	CTT	2	6	912069	912074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19540	NC_011083	CTG	2	6	912091	912096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19541	NC_011083	CCT	2	6	912111	912116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19542	NC_011083	AAT	2	6	912185	912190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19543	NC_011083	T	9	9	912210	912218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19544	NC_011083	GGC	2	6	912255	912260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19545	NC_011083	TA	3	6	912415	912420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19546	NC_011083	AAGG	2	8	912436	912443	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19547	NC_011083	TCA	2	6	912466	912471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19548	NC_011083	A	6	6	912490	912495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19549	NC_011083	CTG	2	6	912523	912528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19550	NC_011083	T	6	6	912614	912619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19551	NC_011083	T	6	6	912629	912634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19552	NC_011083	CGT	2	6	912765	912770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449193
19553	NC_011083	GGA	2	6	912785	912790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194449193
19554	NC_011083	GGC	2	6	912908	912913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449193
19555	NC_011083	CTA	2	6	912974	912979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194449193
19556	NC_011083	ACT	2	6	912982	912987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194449193
19557	NC_011083	GTG	3	9	913110	913118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194449193
19558	NC_011083	ATG	2	6	913170	913175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194449193
19559	NC_011083	GC	3	6	913208	913213	0 %	0 %	50 %	50 %	194449193
19560	NC_011083	GCG	2	6	913288	913293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449193
19561	NC_011083	GAC	2	6	913323	913328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449193
19562	NC_011083	TGA	2	6	913352	913357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194449193
19563	NC_011083	CTAT	2	8	913426	913433	25 %	50 %	0 %	25 %	194449193
19564	NC_011083	CGC	2	6	913453	913458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194449193
19565	NC_011083	ATA	2	6	913531	913536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194449193
19566	NC_011083	GCT	2	6	913538	913543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449193
19567	NC_011083	AGC	2	6	913549	913554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449193
19568	NC_011083	GAT	2	6	913586	913591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194449193
19569	NC_011083	CGGGC	2	10	913649	913658	0 %	0 %	60 %	40 %	194449193
19570	NC_011083	CCG	2	6	913662	913667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194449193
19571	NC_011083	CCG	2	6	913690	913695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194449193
19572	NC_011083	CTG	2	6	913701	913706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449193
19573	NC_011083	GTG	2	6	913707	913712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194449193
19574	NC_011083	GGC	2	6	913743	913748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449193
19575	NC_011083	GC	3	6	913767	913772	0 %	0 %	50 %	50 %	194449193
19576	NC_011083	GAG	2	6	913839	913844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194449193
19577	NC_011083	CTAT	2	8	913867	913874	25 %	50 %	0 %	25 %	194449193
19578	NC_011083	TGA	2	6	913916	913921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194449193
19579	NC_011083	GGT	2	6	913922	913927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194449193
19580	NC_011083	CGAC	2	8	913941	913948	25 %	0 %	25 %	50 %	194449193
19581	NC_011083	GCT	2	6	913952	913957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449193
19582	NC_011083	ATT	2	6	913965	913970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194449193
19583	NC_011083	CTG	2	6	914004	914009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449193
19584	NC_011083	GAA	2	6	914100	914105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194449193
19585	NC_011083	GCGT	2	8	914116	914123	0 %	25 %	50 %	25 %	194449193
19586	NC_011083	ATC	2	6	914163	914168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194449193
19587	NC_011083	TGG	2	6	914200	914205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194449193
19588	NC_011083	CTG	2	6	914214	914219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449193
19589	NC_011083	TGG	2	6	914251	914256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194449193
19590	NC_011083	GC	3	6	914321	914326	0 %	0 %	50 %	50 %	194449193
19591	NC_011083	GC	3	6	914328	914333	0 %	0 %	50 %	50 %	194449193
19592	NC_011083	AGC	2	6	914422	914427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449193
19593	NC_011083	A	6	6	914472	914477	100 %	0 %	0 %	0 %	194449193
19594	NC_011083	GCA	2	6	914597	914602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449193
19595	NC_011083	ATG	2	6	914628	914633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194449193
19596	NC_011083	GAA	2	6	914658	914663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194449193
19597	NC_011083	GTT	2	6	914702	914707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194449193
19598	NC_011083	AGTC	2	8	914798	914805	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19599	NC_011083	GAA	2	6	914892	914897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19600	NC_011083	CT	3	6	914934	914939	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19601	NC_011083	A	8	8	914951	914958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19602	NC_011083	TAT	2	6	914966	914971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19603	NC_011083	CAT	2	6	915046	915051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19604	NC_011083	A	6	6	915059	915064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19605	NC_011083	GAC	2	6	915133	915138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19606	NC_011083	AGA	2	6	915293	915298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194448645
19607	NC_011083	AATAA	2	10	915306	915315	80 %	20 %	0 %	0 %	194448645
19608	NC_011083	AGA	2	6	915398	915403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194448645
19609	NC_011083	ATA	2	6	915457	915462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194448645
19610	NC_011083	TAG	2	6	915470	915475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448645
19611	NC_011083	AGG	2	6	915476	915481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194448645
19612	NC_011083	GAGG	2	8	915561	915568	25 %	0 %	75 %	0 %	194448645
19613	NC_011083	AGTC	2	8	915574	915581	25 %	25 %	25 %	25 %	194448645
19614	NC_011083	GCA	2	6	915696	915701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448645
19615	NC_011083	GAA	2	6	915708	915713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194448645
19616	NC_011083	ATA	2	6	915745	915750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194448645
19617	NC_011083	CCTG	2	8	915792	915799	0 %	25 %	25 %	50 %	194448645
19618	NC_011083	ACT	2	6	915816	915821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194448645
19619	NC_011083	ATA	2	6	916024	916029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194448645
19620	NC_011083	GTT	2	6	916036	916041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194448645
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19622	NC_011083	ACC	2	6	916244	916249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194448645
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19986	NC_011083	CGAC	2	8	933844	933851	25 %	0 %	25 %	50 %	194447821
19987	NC_011083	TCA	2	6	933939	933944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194447821
19988	NC_011083	GCC	2	6	933965	933970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194447821
19989	NC_011083	ACC	2	6	934048	934053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194447821
19990	NC_011083	CGA	2	6	934075	934080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447821
19991	NC_011083	T	6	6	934112	934117	0 %	100 %	0 %	0 %	194447821
19992	NC_011083	TCA	2	6	934205	934210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194448368
19993	NC_011083	GA	3	6	934410	934415	50 %	0 %	50 %	0 %	194448368
19994	NC_011083	GCT	2	6	934416	934421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448368
19995	NC_011083	AAAT	2	8	934428	934435	75 %	25 %	0 %	0 %	194448368
19996	NC_011083	CAG	2	6	934465	934470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448368
19997	NC_011083	GGCT	2	8	934532	934539	0 %	25 %	50 %	25 %	194448368
19998	NC_011083	AGTA	2	8	934644	934651	50 %	25 %	25 %	0 %	194448368
19999	NC_011083	GGC	2	6	934654	934659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448368
20000	NC_011083	CAGCG	2	10	934675	934684	20 %	0 %	40 %	40 %	194448368

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