MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 chromosome

Total Repeats: 103087

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_011083	CAC	2	6	887166	887171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194451386
19002	NC_011083	CAAT	2	8	887218	887225	50 %	25 %	0 %	25 %	194451386
19003	NC_011083	T	6	6	887241	887246	0 %	100 %	0 %	0 %	194451386
19004	NC_011083	GC	3	6	887333	887338	0 %	0 %	50 %	50 %	194451386
19005	NC_011083	GCT	2	6	887360	887365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194451386
19006	NC_011083	GGA	2	6	887400	887405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194451386
19007	NC_011083	TGA	2	6	887438	887443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194451386
19008	NC_011083	CGC	2	6	887453	887458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194451386
19009	NC_011083	GTT	2	6	887466	887471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194451386
19010	NC_011083	CGC	2	6	887495	887500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194451386
19011	NC_011083	CTG	2	6	887517	887522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194451386
19012	NC_011083	CGG	2	6	887582	887587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194451386
19013	NC_011083	GTACG	2	10	887597	887606	20 %	20 %	40 %	20 %	194451386
19014	NC_011083	TCG	2	6	887608	887613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194451386
19015	NC_011083	CG	3	6	887612	887617	0 %	0 %	50 %	50 %	194451386
19016	NC_011083	CAT	2	6	887669	887674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194451386
19017	NC_011083	GTGG	2	8	887727	887734	0 %	25 %	75 %	0 %	194451386
19018	NC_011083	GC	4	8	887762	887769	0 %	0 %	50 %	50 %	194451386
19019	NC_011083	CG	3	6	887828	887833	0 %	0 %	50 %	50 %	194448824
19020	NC_011083	ACGG	2	8	887909	887916	25 %	0 %	50 %	25 %	194448824
19021	NC_011083	GCA	2	6	887926	887931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448824
19022	NC_011083	GCG	2	6	887932	887937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448824
19023	NC_011083	GTGC	2	8	887947	887954	0 %	25 %	50 %	25 %	194448824
19024	NC_011083	TTC	2	6	887972	887977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194448824
19025	NC_011083	GC	3	6	887989	887994	0 %	0 %	50 %	50 %	194448824
19026	NC_011083	GGAA	2	8	888016	888023	50 %	0 %	50 %	0 %	194448824
19027	NC_011083	CGCCAG	2	12	888065	888076	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	194448824
19028	NC_011083	AG	3	6	888075	888080	50 %	0 %	50 %	0 %	194448824
19029	NC_011083	GCT	2	6	888085	888090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448824
19030	NC_011083	CGC	2	6	888155	888160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194448824
19031	NC_011083	CAC	2	6	888170	888175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194448824
19032	NC_011083	GCCA	2	8	888177	888184	25 %	0 %	25 %	50 %	194448824
19033	NC_011083	CCA	2	6	888241	888246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194448824
19034	NC_011083	GCT	2	6	888259	888264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448824
19035	NC_011083	ATGCGG	2	12	888341	888352	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	194448824
19036	NC_011083	CGC	2	6	888368	888373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194448824
19037	NC_011083	CGG	2	6	888421	888426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448824
19038	NC_011083	CG	4	8	888529	888536	0 %	0 %	50 %	50 %	194448824
19039	NC_011083	CA	3	6	888673	888678	50 %	0 %	0 %	50 %	194448824
19040	NC_011083	GCA	2	6	888703	888708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448824
19041	NC_011083	GCG	2	6	888760	888765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448824
19042	NC_011083	GAT	2	6	888811	888816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448824
19043	NC_011083	AAC	2	6	888839	888844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19044	NC_011083	TGCCAG	2	12	888880	888891	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	194448268
19045	NC_011083	TAAT	2	8	889009	889016	50 %	50 %	0 %	0 %	194448268
19046	NC_011083	ACG	2	6	889132	889137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448268
19047	NC_011083	TCGG	2	8	889192	889199	0 %	25 %	50 %	25 %	194448268
19048	NC_011083	GCGA	2	8	889219	889226	25 %	0 %	50 %	25 %	194448268
19049	NC_011083	CGA	2	6	889231	889236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448268
19050	NC_011083	TCT	2	6	889291	889296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194448268
19051	NC_011083	GC	3	6	889316	889321	0 %	0 %	50 %	50 %	194448268
19052	NC_011083	GCA	2	6	889340	889345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448268
19053	NC_011083	ACTCC	2	10	889353	889362	20 %	20 %	0 %	60 %	194448268
19054	NC_011083	GCG	2	6	889430	889435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448268
19055	NC_011083	CGCA	2	8	889527	889534	25 %	0 %	25 %	50 %	194448268
19056	NC_011083	GTT	2	6	889566	889571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194448268
19057	NC_011083	GCA	2	6	889742	889747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448268
19058	NC_011083	GAC	2	6	889782	889787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448268
19059	NC_011083	GCA	2	6	889802	889807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448268
19060	NC_011083	ACC	2	6	889842	889847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194448268
19061	NC_011083	TATGG	2	10	889884	889893	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
19062	NC_011083	TAA	2	6	889934	889939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19063	NC_011083	AC	3	6	889956	889961	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19064	NC_011083	ATC	2	6	890001	890006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19065	NC_011083	A	7	7	890037	890043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19066	NC_011083	ACGG	2	8	890069	890076	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19067	NC_011083	T	6	6	890094	890099	0 %	100 %	0 %	0 %	194450425
19068	NC_011083	ACG	2	6	890137	890142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450425
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19070	NC_011083	GCG	2	6	890233	890238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450425
19071	NC_011083	AGCGT	2	10	890280	890289	20 %	20 %	40 %	20 %	194450425
19072	NC_011083	CAG	2	6	890400	890405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450425
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19074	NC_011083	GGC	2	6	890466	890471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450425
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19080	NC_011083	CAT	3	9	890630	890638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194450425
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19083	NC_011083	CATT	2	8	890681	890688	25 %	50 %	0 %	25 %	194450425
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19087	NC_011083	CGG	2	6	890882	890887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450425
19088	NC_011083	TAT	2	6	890970	890975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194450425
19089	NC_011083	CAT	2	6	891023	891028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19090	NC_011083	ATT	2	6	891045	891050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19091	NC_011083	TTA	3	9	891100	891108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19092	NC_011083	TAA	2	6	891113	891118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19093	NC_011083	GC	3	6	891140	891145	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19094	NC_011083	ATA	2	6	891158	891163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19095	NC_011083	ATT	2	6	891170	891175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194450565
19096	NC_011083	CAGG	2	8	891240	891247	25 %	0 %	50 %	25 %	194450565
19097	NC_011083	ATG	2	6	891260	891265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450565
19098	NC_011083	CAG	2	6	891275	891280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450565
19099	NC_011083	TC	3	6	891286	891291	0 %	50 %	0 %	50 %	194450565
19100	NC_011083	GC	4	8	891397	891404	0 %	0 %	50 %	50 %	194450565
19101	NC_011083	GCT	2	6	891421	891426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450565
19102	NC_011083	GA	3	6	891435	891440	50 %	0 %	50 %	0 %	194450565
19103	NC_011083	CCG	2	6	891457	891462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450565
19104	NC_011083	GA	3	6	891561	891566	50 %	0 %	50 %	0 %	194450565
19105	NC_011083	CTG	3	9	891612	891620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450565
19106	NC_011083	T	6	6	891635	891640	0 %	100 %	0 %	0 %	194450565
19107	NC_011083	CGC	2	6	891658	891663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450565
19108	NC_011083	CGC	3	9	891669	891677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450565
19109	NC_011083	GAT	2	6	891712	891717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450565
19110	NC_011083	TAA	2	6	891724	891729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194450565
19111	NC_011083	CGA	2	6	891766	891771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450565
19112	NC_011083	GGT	2	6	891808	891813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194450565
19113	NC_011083	GGA	2	6	891814	891819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194450565
19114	NC_011083	GGCG	2	8	891889	891896	0 %	0 %	75 %	25 %	194450565
19115	NC_011083	CGCT	2	8	891936	891943	0 %	25 %	25 %	50 %	194450565
19116	NC_011083	CAAC	2	8	891958	891965	50 %	0 %	0 %	50 %	194450565
19117	NC_011083	GTC	2	6	891984	891989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450565
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19119	NC_011083	GTT	2	6	892123	892128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194450565
19120	NC_011083	TCA	2	6	892161	892166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194450565
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19122	NC_011083	CTG	2	6	892277	892282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450565
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19244	NC_011083	CAT	2	6	898337	898342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194447708
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19246	NC_011083	GCG	2	6	898463	898468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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19485	NC_011083	CTG	2	6	909881	909886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449590
19486	NC_011083	CGC	2	6	909917	909922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194449590
19487	NC_011083	GCA	2	6	909940	909945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449590
19488	NC_011083	TGG	2	6	909987	909992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194449590
19489	NC_011083	GC	3	6	910026	910031	0 %	0 %	50 %	50 %	194449590
19490	NC_011083	CAT	2	6	910064	910069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194449590
19491	NC_011083	GTTG	2	8	910078	910085	0 %	50 %	50 %	0 %	194449590
19492	NC_011083	ATG	2	6	910086	910091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194449590
19493	NC_011083	GGGGC	2	10	910120	910129	0 %	0 %	80 %	20 %	194449590
19494	NC_011083	CTG	2	6	910132	910137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449590
19495	NC_011083	G	6	6	910143	910148	0 %	0 %	100 %	0 %	194449590
19496	NC_011083	TGG	2	6	910164	910169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194449590
19497	NC_011083	GCG	2	6	910197	910202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449590
19498	NC_011083	TGCTC	2	10	910209	910218	0 %	40 %	20 %	40 %	194449590
19499	NC_011083	CTG	2	6	910238	910243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449590
19500	NC_011083	GCC	2	6	910279	910284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194449590

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