MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 chromosome

Total Repeats: 103087

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_011083	T	7	7	841849	841855	0 %	100 %	0 %	0 %	194447526
18002	NC_011083	CA	3	6	841906	841911	50 %	0 %	0 %	50 %	194447526
18003	NC_011083	AGAA	2	8	841936	841943	75 %	0 %	25 %	0 %	194447526
18004	NC_011083	AAG	2	6	842028	842033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194447526
18005	NC_011083	A	7	7	842053	842059	100 %	0 %	0 %	0 %	194447526
18006	NC_011083	ATT	2	6	842111	842116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18007	NC_011083	TGC	2	6	842193	842198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450395
18008	NC_011083	TTA	2	6	842206	842211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194450395
18009	NC_011083	ACC	2	6	842221	842226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194450395
18010	NC_011083	TCG	2	6	842354	842359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450919
18011	NC_011083	GCG	2	6	842361	842366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450919
18012	NC_011083	GGC	2	6	842378	842383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450919
18013	NC_011083	CAAC	2	8	842537	842544	50 %	0 %	0 %	50 %	194450919
18014	NC_011083	CGG	2	6	842620	842625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450919
18015	NC_011083	CAG	2	6	842671	842676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450919
18016	NC_011083	AGC	2	6	842677	842682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450919
18017	NC_011083	ACG	2	6	842685	842690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450919
18018	NC_011083	T	6	6	842696	842701	0 %	100 %	0 %	0 %	194450919
18019	NC_011083	CG	3	6	842729	842734	0 %	0 %	50 %	50 %	194450919
18020	NC_011083	CGC	2	6	842770	842775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450919
18021	NC_011083	CAT	2	6	842994	842999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194450919
18022	NC_011083	GGC	2	6	843057	843062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450919
18023	NC_011083	ATT	2	6	843063	843068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194450919
18024	NC_011083	ACA	2	6	843075	843080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194450919
18025	NC_011083	CTG	2	6	843224	843229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448354
18026	NC_011083	ATG	2	6	843274	843279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448354
18027	NC_011083	ACC	2	6	843330	843335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194448354
18028	NC_011083	TGG	2	6	843341	843346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194448354
18029	NC_011083	AATC	2	8	843365	843372	50 %	25 %	0 %	25 %	194448354
18030	NC_011083	GTA	2	6	843378	843383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448354
18031	NC_011083	A	6	6	843468	843473	100 %	0 %	0 %	0 %	194448354
18032	NC_011083	CTGT	2	8	843477	843484	0 %	50 %	25 %	25 %	194448354
18033	NC_011083	CAG	2	6	843531	843536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448354
18034	NC_011083	TTCAAT	2	12	843549	843560	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	194448354
18035	NC_011083	GC	3	6	843581	843586	0 %	0 %	50 %	50 %	194448354
18036	NC_011083	AGC	2	6	843601	843606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448354
18037	NC_011083	TAA	2	6	843660	843665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194448354
18038	NC_011083	CGT	2	6	843669	843674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448354
18039	NC_011083	GCG	2	6	843692	843697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448354
18040	NC_011083	CCG	2	6	843764	843769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194448354
18041	NC_011083	GCCA	2	8	843771	843778	25 %	0 %	25 %	50 %	194448354
18042	NC_011083	CCA	2	6	843809	843814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194448354
18043	NC_011083	GCC	2	6	843856	843861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194448354
18044	NC_011083	GCC	2	6	843864	843869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194448354
18045	NC_011083	CAG	2	6	843921	843926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448354
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18047	NC_011083	CAG	2	6	843985	843990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448354
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18049	NC_011083	GCG	2	6	844057	844062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448354
18050	NC_011083	AGC	2	6	844135	844140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448354
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18052	NC_011083	AGC	2	6	844183	844188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448354
18053	NC_011083	AAC	2	6	844198	844203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194448354
18054	NC_011083	TTAA	2	8	844259	844266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18055	NC_011083	AG	3	6	844271	844276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18056	NC_011083	AATAA	2	10	844289	844298	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18057	NC_011083	A	6	6	844309	844314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18058	NC_011083	ATG	2	6	844541	844546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448581
18059	NC_011083	TCT	2	6	844578	844583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194448581
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18063	NC_011083	TTC	2	6	844813	844818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194448581
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18065	NC_011083	CGG	2	6	844881	844886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448581
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18073	NC_011083	CGC	2	6	845215	845220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194448581
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18075	NC_011083	ATC	2	6	845306	845311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194448581
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18080	NC_011083	ATCA	2	8	845751	845758	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18081	NC_011083	CGC	2	6	845784	845789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18082	NC_011083	AGC	2	6	845863	845868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18083	NC_011083	TAA	2	6	845913	845918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18084	NC_011083	TTA	2	6	845963	845968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18085	NC_011083	GAT	2	6	846059	846064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18086	NC_011083	A	7	7	846073	846079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18087	NC_011083	TGT	2	6	846080	846085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18088	NC_011083	GCC	2	6	846171	846176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18089	NC_011083	CGCA	2	8	846291	846298	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18090	NC_011083	GGA	2	6	846303	846308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18091	NC_011083	CGT	2	6	846318	846323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18092	NC_011083	AAT	2	6	846371	846376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18093	NC_011083	A	6	6	846416	846421	100 %	0 %	0 %	0 %	194451536
18094	NC_011083	TAC	2	6	846528	846533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194451536
18095	NC_011083	CT	3	6	846554	846559	0 %	50 %	0 %	50 %	194451536
18096	NC_011083	CAG	2	6	846575	846580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194451536
18097	NC_011083	GCC	2	6	846581	846586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194451536
18098	NC_011083	CAT	2	6	846589	846594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194451536
18099	NC_011083	GAA	2	6	846698	846703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194451536
18100	NC_011083	CAT	2	6	846870	846875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194447545
18101	NC_011083	TGG	2	6	846881	846886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194447545
18102	NC_011083	T	6	6	846888	846893	0 %	100 %	0 %	0 %	194447545
18103	NC_011083	GCG	2	6	846902	846907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194447545
18104	NC_011083	TCT	2	6	846935	846940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194447545
18105	NC_011083	CTG	2	6	846967	846972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447545
18106	NC_011083	T	6	6	846977	846982	0 %	100 %	0 %	0 %	194447545
18107	NC_011083	GTT	2	6	847075	847080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194447545
18108	NC_011083	TGG	2	6	847085	847090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194447545
18109	NC_011083	TGT	2	6	847110	847115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194447545
18110	NC_011083	GT	3	6	847124	847129	0 %	50 %	50 %	0 %	194447545
18111	NC_011083	TGT	2	6	847160	847165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194451169
18112	NC_011083	GC	3	6	847190	847195	0 %	0 %	50 %	50 %	194451169
18113	NC_011083	GCT	2	6	847232	847237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194451169
18114	NC_011083	AT	3	6	847388	847393	50 %	50 %	0 %	0 %	194451169
18115	NC_011083	GACCG	2	10	847400	847409	20 %	0 %	40 %	40 %	194451169
18116	NC_011083	TGA	2	6	847457	847462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194451169
18117	NC_011083	TATC	2	8	847469	847476	25 %	50 %	0 %	25 %	194451169
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18120	NC_011083	GGC	2	6	847520	847525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194451169
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18122	NC_011083	AC	3	6	847568	847573	50 %	0 %	0 %	50 %	194451169
18123	NC_011083	ACCAC	2	10	847597	847606	40 %	0 %	0 %	60 %	194451169
18124	NC_011083	GGT	2	6	847658	847663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194451169
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18126	NC_011083	CG	3	6	847716	847721	0 %	0 %	50 %	50 %	194451169
18127	NC_011083	CGG	2	6	847736	847741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194451169
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18132	NC_011083	GTG	2	6	847992	847997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194451169
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18137	NC_011083	TGG	2	6	848353	848358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194451169
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18154	NC_011083	CTTA	2	8	849269	849276	25 %	50 %	0 %	25 %	194451818
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18242	NC_011083	ATC	2	6	854084	854089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194449786
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18356	NC_011083	TAC	2	6	859538	859543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194450450
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18484	NC_011083	CGG	2	6	864724	864729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450069
18485	NC_011083	GT	3	6	864750	864755	0 %	50 %	50 %	0 %	194450069
18486	NC_011083	GTG	2	6	864782	864787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194450069
18487	NC_011083	GC	3	6	864942	864947	0 %	0 %	50 %	50 %	194450069
18488	NC_011083	ACGG	2	8	865052	865059	25 %	0 %	50 %	25 %	194450069
18489	NC_011083	CAA	2	6	865066	865071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194450069
18490	NC_011083	CGG	2	6	865162	865167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450069
18491	NC_011083	GCG	2	6	865169	865174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450069
18492	NC_011083	CAG	2	6	865219	865224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450069
18493	NC_011083	ATGGTA	2	12	865238	865249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450069
18494	NC_011083	GCA	3	9	865264	865272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450069
18495	NC_011083	GTC	2	6	865315	865320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450069
18496	NC_011083	GGGAT	2	10	865388	865397	20 %	20 %	60 %	0 %	194450069
18497	NC_011083	GCCT	2	8	865471	865478	0 %	25 %	25 %	50 %	194450069
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18500	NC_011083	CCTG	2	8	865568	865575	0 %	25 %	25 %	50 %	194450609

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