MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 chromosome

Total Repeats: 103087

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_011083	TAA	2	6	660952	660957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_011083	CCA	2	6	660969	660974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14003	NC_011083	CTC	2	6	660979	660984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14004	NC_011083	ATG	2	6	660994	660999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_011083	AT	3	6	661005	661010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14006	NC_011083	CAT	2	6	661044	661049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14007	NC_011083	A	7	7	661062	661068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_011083	ATT	2	6	661091	661096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14009	NC_011083	TACT	2	8	661138	661145	25 %	50 %	0 %	25 %	194450853
14010	NC_011083	CTG	2	6	661185	661190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450853
14011	NC_011083	CGG	2	6	661225	661230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450853
14012	NC_011083	GAAAGT	2	12	661252	661263	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	194450853
14013	NC_011083	AGT	2	6	661349	661354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450853
14014	NC_011083	CAT	2	6	661433	661438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194450853
14015	NC_011083	GCA	2	6	661457	661462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450853
14016	NC_011083	TTA	2	6	661504	661509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194450853
14017	NC_011083	AAT	2	6	661512	661517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194450853
14018	NC_011083	ATC	3	9	661575	661583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194450853
14019	NC_011083	TATC	2	8	661610	661617	25 %	50 %	0 %	25 %	194450853
14020	NC_011083	TCT	2	6	661618	661623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194450853
14021	NC_011083	GGC	2	6	661624	661629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450853
14022	NC_011083	CTG	2	6	661644	661649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450853
14023	NC_011083	ATG	2	6	661672	661677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450853
14024	NC_011083	A	6	6	661734	661739	100 %	0 %	0 %	0 %	194448469
14025	NC_011083	GGC	2	6	661803	661808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448469
14026	NC_011083	CTTCA	2	10	661974	661983	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
14027	NC_011083	GC	3	6	662057	662062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14028	NC_011083	CTT	2	6	662086	662091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14029	NC_011083	TCC	2	6	662096	662101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14030	NC_011083	CAT	2	6	662130	662135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14031	NC_011083	GTC	2	6	662146	662151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14032	NC_011083	CAC	2	6	662209	662214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14033	NC_011083	TGA	2	6	662241	662246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14034	NC_011083	GCTC	2	8	662278	662285	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14035	NC_011083	TC	3	6	662352	662357	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14036	NC_011083	ACG	2	6	662441	662446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14037	NC_011083	TCAT	2	8	662555	662562	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14038	NC_011083	T	8	8	662594	662601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14039	NC_011083	CGG	2	6	662646	662651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14040	NC_011083	ATC	2	6	662663	662668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14041	NC_011083	TGG	2	6	662691	662696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14042	NC_011083	CTT	2	6	662713	662718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14043	NC_011083	GTA	2	6	662741	662746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14044	NC_011083	GCG	2	6	662762	662767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14045	NC_011083	CT	3	6	662854	662859	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14046	NC_011083	TGG	2	6	663002	663007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14047	NC_011083	T	6	6	663103	663108	0 %	100 %	0 %	0 %	194449491
14048	NC_011083	CTT	2	6	663130	663135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194449491
14049	NC_011083	CGC	2	6	663185	663190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14050	NC_011083	TGG	2	6	663202	663207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14051	NC_011083	ATTA	2	8	663216	663223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14052	NC_011083	ATT	2	6	663241	663246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194450472
14053	NC_011083	CGCC	2	8	663339	663346	0 %	0 %	25 %	75 %	194450472
14054	NC_011083	TCT	2	6	663377	663382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194450472
14055	NC_011083	TCA	2	6	663448	663453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194450472
14056	NC_011083	CAG	2	6	663461	663466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450472
14057	NC_011083	TTA	2	6	663472	663477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194450472
14058	NC_011083	TA	3	6	663518	663523	50 %	50 %	0 %	0 %	194450472
14059	NC_011083	TA	3	6	663537	663542	50 %	50 %	0 %	0 %	194450472
14060	NC_011083	GTT	2	6	663546	663551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194450472
14061	NC_011083	GTA	2	6	663642	663647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450472
14062	NC_011083	TGCA	2	8	663690	663697	25 %	25 %	25 %	25 %	194450472
14063	NC_011083	TAA	2	6	663712	663717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194450472
14064	NC_011083	TTGT	2	8	663738	663745	0 %	75 %	25 %	0 %	194450472
14065	NC_011083	TAT	2	6	663762	663767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194450472
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14067	NC_011083	GTTT	2	8	663784	663791	0 %	75 %	25 %	0 %	194450472
14068	NC_011083	TGA	2	6	663807	663812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450472
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14071	NC_011083	GTA	2	6	663862	663867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450472
14072	NC_011083	ATAA	2	8	663872	663879	75 %	25 %	0 %	0 %	194450472
14073	NC_011083	CAA	2	6	663917	663922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194450472
14074	NC_011083	CTG	2	6	663967	663972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450472
14075	NC_011083	GCA	2	6	664006	664011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450472
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14077	NC_011083	TAG	2	6	664086	664091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450472
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14082	NC_011083	GAT	2	6	664375	664380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450472
14083	NC_011083	T	6	6	664410	664415	0 %	100 %	0 %	0 %	194450472
14084	NC_011083	AT	3	6	664428	664433	50 %	50 %	0 %	0 %	194450472
14085	NC_011083	TA	3	6	664443	664448	50 %	50 %	0 %	0 %	194450472
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14089	NC_011083	GAC	2	6	664576	664581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450472
14090	NC_011083	GCT	2	6	664633	664638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450472
14091	NC_011083	GAAAGC	2	12	664747	664758	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	194450472
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14094	NC_011083	T	8	8	664908	664915	0 %	100 %	0 %	0 %	194449865
14095	NC_011083	AT	3	6	664937	664942	50 %	50 %	0 %	0 %	194449865
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14099	NC_011083	GCGGA	2	10	665113	665122	20 %	0 %	60 %	20 %	194449865
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14101	NC_011083	TTCC	2	8	665142	665149	0 %	50 %	0 %	50 %	194449865
14102	NC_011083	GCC	2	6	665236	665241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194449865
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14107	NC_011083	GGC	2	6	665878	665883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194451519
14108	NC_011083	CAA	2	6	665909	665914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194451519
14109	NC_011083	CAT	2	6	665946	665951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194451519
14110	NC_011083	GTG	3	9	665962	665970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194451519
14111	NC_011083	GC	3	6	665988	665993	0 %	0 %	50 %	50 %	194451519
14112	NC_011083	AC	3	6	666071	666076	50 %	0 %	0 %	50 %	194451519
14113	NC_011083	CGAT	2	8	666119	666126	25 %	25 %	25 %	25 %	194451519
14114	NC_011083	AAT	2	6	666224	666229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14115	NC_011083	TTA	2	6	666262	666267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14116	NC_011083	GTT	2	6	666275	666280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14117	NC_011083	AGT	2	6	666309	666314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14118	NC_011083	AC	3	6	666331	666336	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14119	NC_011083	GTA	2	6	666398	666403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14120	NC_011083	TTG	2	6	666414	666419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14121	NC_011083	GC	3	6	666479	666484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14122	NC_011083	GCG	3	9	666524	666532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14123	NC_011083	CTC	2	6	666602	666607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14124	NC_011083	ATT	2	6	666638	666643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14125	NC_011083	GTC	2	6	666677	666682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14126	NC_011083	TCA	2	6	666778	666783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14128	NC_011083	TAA	2	6	666909	666914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14129	NC_011083	ATA	2	6	666920	666925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14238	NC_011083	CGA	2	6	672155	672160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450457
14239	NC_011083	GCT	2	6	672225	672230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450457
14240	NC_011083	TGA	2	6	672270	672275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450457
14241	NC_011083	TGA	2	6	672288	672293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450457
14242	NC_011083	A	6	6	672376	672381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14243	NC_011083	GC	3	6	672475	672480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14244	NC_011083	CTTTT	2	10	672484	672493	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14245	NC_011083	T	7	7	672510	672516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14246	NC_011083	TAACGT	2	12	672523	672534	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14247	NC_011083	GAA	2	6	672679	672684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194449805
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14249	NC_011083	TTG	2	6	672809	672814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194449805
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14272	NC_011083	GC	3	6	674088	674093	0 %	0 %	50 %	50 %	194451844
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14355	NC_011083	CGTT	2	8	677618	677625	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14356	NC_011083	AGTA	2	8	677669	677676	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14357	NC_011083	CGT	2	6	677705	677710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14367	NC_011083	GGC	2	6	678110	678115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448967586
14368	NC_011083	TGC	3	9	678145	678153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448967586
14369	NC_011083	T	6	6	678179	678184	0 %	100 %	0 %	0 %	448967586
14370	NC_011083	TAA	2	6	678272	678277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448967586
14371	NC_011083	ATT	2	6	678299	678304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448967586
14372	NC_011083	CAGA	2	8	678334	678341	50 %	0 %	25 %	25 %	448967586
14373	NC_011083	GGC	2	6	678372	678377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448967586
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14375	NC_011083	AGC	2	6	678474	678479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448967586
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14377	NC_011083	TCA	2	6	678662	678667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448967586
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14379	NC_011083	CTG	2	6	678837	678842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448967586
14380	NC_011083	CGG	2	6	678871	678876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448967586
14381	NC_011083	CAT	2	6	678881	678886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448967586
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14383	NC_011083	TTACC	2	10	679184	679193	20 %	40 %	0 %	40 %	448967586
14384	NC_011083	TGC	2	6	679243	679248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448967586
14385	NC_011083	GCTG	2	8	679249	679256	0 %	25 %	50 %	25 %	448967586
14386	NC_011083	GAG	2	6	679257	679262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	448967586
14387	NC_011083	CTG	2	6	679296	679301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448967586
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14398	NC_011083	A	6	6	679794	679799	100 %	0 %	0 %	0 %	448967586
14399	NC_011083	GC	5	10	679800	679809	0 %	0 %	50 %	50 %	448967586
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14401	NC_011083	A	6	6	679867	679872	100 %	0 %	0 %	0 %	448967586
14402	NC_011083	ATATTA	2	12	679891	679902	50 %	50 %	0 %	0 %	448967586
14403	NC_011083	GGC	2	6	679940	679945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448967586
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14405	NC_011083	TGGG	2	8	680016	680023	0 %	25 %	75 %	0 %	448967586
14406	NC_011083	GCT	2	6	680033	680038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448967586
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14408	NC_011083	TTAA	2	8	680106	680113	50 %	50 %	0 %	0 %	448967586
14409	NC_011083	ATT	2	6	680205	680210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448967586
14410	NC_011083	TAA	3	9	680243	680251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448967586
14411	NC_011083	ATT	2	6	680256	680261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448967586
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14414	NC_011083	GCC	2	6	680597	680602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14415	NC_011083	CGG	2	6	680642	680647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448504
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14441	NC_011083	TAA	2	6	681661	681666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14442	NC_011083	AAATT	2	10	681667	681676	60 %	40 %	0 %	0 %	194447765
14443	NC_011083	T	6	6	681693	681698	0 %	100 %	0 %	0 %	194447765
14444	NC_011083	AT	3	6	681782	681787	50 %	50 %	0 %	0 %	194447765
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14455	NC_011083	TGC	2	6	682232	682237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447765
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14485	NC_011083	CGG	2	6	683180	683185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194447521
14486	NC_011083	AGA	2	6	683207	683212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194447521
14487	NC_011083	TCC	3	9	683302	683310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194447521
14488	NC_011083	GCG	2	6	683348	683353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194447521
14489	NC_011083	GC	3	6	683386	683391	0 %	0 %	50 %	50 %	194447521
14490	NC_011083	CGG	2	6	683399	683404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194447521
14491	NC_011083	TGC	2	6	683458	683463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447521
14492	NC_011083	CGT	2	6	683567	683572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447521
14493	NC_011083	TCACT	2	10	683588	683597	20 %	40 %	0 %	40 %	194447521
14494	NC_011083	CCT	2	6	683608	683613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194448062
14495	NC_011083	CAC	2	6	683654	683659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194448062
14496	NC_011083	GCGATG	2	12	683670	683681	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	194448062
14497	NC_011083	GCG	2	6	683700	683705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448062
14498	NC_011083	AGCCC	2	10	683713	683722	20 %	0 %	20 %	60 %	194448062
14499	NC_011083	TGC	2	6	683740	683745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448062
14500	NC_011083	CAT	2	6	683750	683755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194448062

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