MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 chromosome

Total Repeats: 103087

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_011083	GCG	2	6	611906	611911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194451771
13002	NC_011083	ATC	2	6	611912	611917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194451771
13003	NC_011083	CTG	2	6	612070	612075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194451771
13004	NC_011083	CT	3	6	612125	612130	0 %	50 %	0 %	50 %	194451771
13005	NC_011083	GC	3	6	612165	612170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13006	NC_011083	CCGGC	2	10	612204	612213	0 %	0 %	40 %	60 %	194451124
13007	NC_011083	CTA	2	6	612308	612313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194451124
13008	NC_011083	GCG	2	6	612340	612345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194451124
13009	NC_011083	TG	3	6	612447	612452	0 %	50 %	50 %	0 %	194451124
13010	NC_011083	GGC	2	6	612504	612509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194451124
13011	NC_011083	GCGCC	2	10	612514	612523	0 %	0 %	40 %	60 %	194451124
13012	NC_011083	TCA	2	6	612557	612562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194451124
13013	NC_011083	GC	3	6	612620	612625	0 %	0 %	50 %	50 %	194451124
13014	NC_011083	GAA	2	6	612627	612632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194451124
13015	NC_011083	TGG	2	6	612671	612676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194451124
13016	NC_011083	CGG	2	6	612755	612760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194451124
13017	NC_011083	GATC	2	8	612788	612795	25 %	25 %	25 %	25 %	194451124
13018	NC_011083	CAT	2	6	612833	612838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194451124
13019	NC_011083	GC	3	6	612890	612895	0 %	0 %	50 %	50 %	194451124
13020	NC_011083	TTA	2	6	612926	612931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194451124
13021	NC_011083	CGTT	2	8	613023	613030	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13022	NC_011083	GCC	2	6	613077	613082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13023	NC_011083	GA	3	6	613106	613111	50 %	0 %	50 %	0 %	194447520
13024	NC_011083	A	6	6	613222	613227	100 %	0 %	0 %	0 %	194447520
13025	NC_011083	CGG	2	6	613347	613352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194447520
13026	NC_011083	GCC	2	6	613426	613431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194447520
13027	NC_011083	CCA	2	6	613437	613442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194447520
13028	NC_011083	CTG	2	6	613495	613500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447520
13029	NC_011083	CGAC	2	8	613530	613537	25 %	0 %	25 %	50 %	194447520
13030	NC_011083	GTTTT	2	10	613538	613547	0 %	80 %	20 %	0 %	194447520
13031	NC_011083	GGC	2	6	613585	613590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194447520
13032	NC_011083	TAA	2	6	613627	613632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194447520
13033	NC_011083	GCG	3	9	613640	613648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194447520
13034	NC_011083	GCT	2	6	613839	613844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449524
13035	NC_011083	GTTTT	2	10	613958	613967	0 %	80 %	20 %	0 %	194449524
13036	NC_011083	AAC	2	6	614081	614086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194449524
13037	NC_011083	ACC	2	6	614108	614113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194449524
13038	NC_011083	CGG	2	6	614130	614135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449524
13039	NC_011083	CAG	2	6	614140	614145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449524
13040	NC_011083	GC	4	8	614158	614165	0 %	0 %	50 %	50 %	194449524
13041	NC_011083	CAC	2	6	614277	614282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194449524
13042	NC_011083	GGC	2	6	614313	614318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449524
13043	NC_011083	GC	3	6	614317	614322	0 %	0 %	50 %	50 %	194449524
13044	NC_011083	CGG	2	6	614329	614334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449524
13045	NC_011083	AGG	3	9	614360	614368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194449524
13046	NC_011083	ATT	2	6	614415	614420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194450241
13047	NC_011083	CTGG	2	8	614423	614430	0 %	25 %	50 %	25 %	194450241
13048	NC_011083	CGC	2	6	614647	614652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450241
13049	NC_011083	CTG	2	6	614748	614753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450241
13050	NC_011083	GCT	2	6	614771	614776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450241
13051	NC_011083	GTG	2	6	614838	614843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194450241
13052	NC_011083	TGA	3	9	614890	614898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450241
13053	NC_011083	A	6	6	614914	614919	100 %	0 %	0 %	0 %	194450241
13054	NC_011083	CGG	2	6	614966	614971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450241
13055	NC_011083	CGC	2	6	614974	614979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450241
13056	NC_011083	GCTG	2	8	615001	615008	0 %	25 %	50 %	25 %	194450241
13057	NC_011083	GGA	3	9	615047	615055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194450241
13058	NC_011083	GCA	2	6	615089	615094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450241
13059	NC_011083	TGC	2	6	615100	615105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450241
13060	NC_011083	TTA	2	6	615114	615119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194450241
13061	NC_011083	CTG	2	6	615126	615131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450241
13062	NC_011083	TGG	2	6	615187	615192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194450241
13063	NC_011083	CGGGC	2	10	615214	615223	0 %	0 %	60 %	40 %	194450241
13064	NC_011083	ATC	2	6	615240	615245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194450241
13065	NC_011083	CCG	2	6	615274	615279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450241
13066	NC_011083	TGC	2	6	615325	615330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450241
13067	NC_011083	CCG	2	6	615346	615351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450241
13068	NC_011083	GCC	2	6	615356	615361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450241
13069	NC_011083	TC	3	6	615409	615414	0 %	50 %	0 %	50 %	194450241
13070	NC_011083	TTG	2	6	615441	615446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194450241
13071	NC_011083	TGC	2	6	615469	615474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450241
13072	NC_011083	TGT	2	6	615482	615487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194450241
13073	NC_011083	ATTT	2	8	615510	615517	25 %	75 %	0 %	0 %	194450241
13074	NC_011083	CGT	2	6	615533	615538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450241
13075	NC_011083	GCT	2	6	615545	615550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450241
13076	NC_011083	TGT	2	6	615577	615582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194450241
13077	NC_011083	GGCG	2	8	615593	615600	0 %	0 %	75 %	25 %	194450241
13078	NC_011083	GCT	2	6	615614	615619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450241
13079	NC_011083	TGG	2	6	615628	615633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194450241
13080	NC_011083	TGC	2	6	615640	615645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450241
13081	NC_011083	TGC	2	6	615652	615657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450241
13082	NC_011083	TGACGT	2	12	615664	615675	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	194450241
13083	NC_011083	TGC	2	6	615763	615768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450241
13084	NC_011083	TGC	2	6	615784	615789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450241
13085	NC_011083	GCG	2	6	615790	615795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450241
13086	NC_011083	CCT	2	6	615797	615802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194450241
13087	NC_011083	CAG	2	6	615816	615821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450241
13088	NC_011083	CCG	2	6	615825	615830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450241
13089	NC_011083	CAG	2	6	615981	615986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450241
13090	NC_011083	GCC	2	6	616067	616072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450241
13091	NC_011083	TTC	2	6	616227	616232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194450241
13092	NC_011083	TTCC	2	8	616237	616244	0 %	50 %	0 %	50 %	194450241
13093	NC_011083	TGG	2	6	616501	616506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194450241
13094	NC_011083	GAAA	2	8	616528	616535	75 %	0 %	25 %	0 %	194450241
13095	NC_011083	CGC	2	6	616595	616600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450241
13096	NC_011083	GCG	2	6	616696	616701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450241
13097	NC_011083	GCT	3	9	616703	616711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450241
13098	NC_011083	GCG	2	6	616720	616725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450241
13099	NC_011083	CGTT	2	8	616736	616743	0 %	50 %	25 %	25 %	194450241
13100	NC_011083	GAT	2	6	616780	616785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450241
13101	NC_011083	ATG	2	6	616788	616793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_011083	AAT	2	6	616796	616801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13103	NC_011083	T	6	6	616831	616836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13104	NC_011083	TAG	2	6	616867	616872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13105	NC_011083	A	6	6	616884	616889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13106	NC_011083	ACA	2	6	616893	616898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13107	NC_011083	TTA	2	6	616917	616922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13108	NC_011083	CTAT	2	8	616949	616956	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13109	NC_011083	GGC	2	6	616993	616998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449790
13110	NC_011083	ATCG	2	8	616999	617006	25 %	25 %	25 %	25 %	194449790
13111	NC_011083	CGG	2	6	617110	617115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449790
13112	NC_011083	CGC	2	6	617209	617214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194449790
13113	NC_011083	ATT	2	6	617217	617222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194449790
13114	NC_011083	TGA	2	6	617230	617235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194449790
13115	NC_011083	AACAG	2	10	617388	617397	60 %	0 %	20 %	20 %	194449790
13116	NC_011083	TTA	2	6	617401	617406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194449790
13117	NC_011083	TGG	2	6	617412	617417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194449790
13118	NC_011083	CGA	2	6	617572	617577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449790
13119	NC_011083	GGC	2	6	617615	617620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449790
13120	NC_011083	CGA	2	6	617650	617655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449790
13121	NC_011083	CGGCAA	2	12	617701	617712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449790
13122	NC_011083	CGC	2	6	617776	617781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194449790
13123	NC_011083	GGC	2	6	617783	617788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449790
13124	NC_011083	GAC	2	6	617809	617814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449790
13125	NC_011083	A	6	6	617816	617821	100 %	0 %	0 %	0 %	194449790
13126	NC_011083	AC	3	6	618176	618181	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13127	NC_011083	GCCT	2	8	618190	618197	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13128	NC_011083	AC	3	6	618211	618216	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13129	NC_011083	CAT	2	6	618224	618229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13130	NC_011083	AAT	2	6	618232	618237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13131	NC_011083	CAG	2	6	618246	618251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13132	NC_011083	GTG	2	6	618540	618545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194451576
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13230	NC_011083	GAC	2	6	623825	623830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449111
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13237	NC_011083	GTC	2	6	624251	624256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449111
13238	NC_011083	GCT	2	6	624288	624293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449111
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13241	NC_011083	TCG	2	6	624326	624331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449111
13242	NC_011083	GCG	2	6	624345	624350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449111
13243	NC_011083	TGG	2	6	624368	624373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194449111
13244	NC_011083	GAA	2	6	624436	624441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194449111
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13249	NC_011083	CGCT	2	8	624640	624647	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13250	NC_011083	T	6	6	624658	624663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13341	NC_011083	ATTT	2	8	629610	629617	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13342	NC_011083	AAC	2	6	629639	629644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13364	NC_011083	ATT	2	6	630516	630521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194447489
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13372	NC_011083	TGA	2	6	630887	630892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447489
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13392	NC_011083	GC	3	6	632461	632466	0 %	0 %	50 %	50 %	194449356
13393	NC_011083	GCG	2	6	632488	632493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449356
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13475	NC_011083	TCCA	2	8	636236	636243	25 %	25 %	0 %	50 %	194450110
13476	NC_011083	ATCGAT	2	12	636247	636258	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	194450110
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13480	NC_011083	CGA	2	6	636500	636505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450110
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13482	NC_011083	GAC	2	6	636586	636591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450110
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13484	NC_011083	CG	3	6	636668	636673	0 %	0 %	50 %	50 %	194450110
13485	NC_011083	GCG	2	6	636683	636688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450110
13486	NC_011083	TGC	2	6	636792	636797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450110
13487	NC_011083	A	6	6	636801	636806	100 %	0 %	0 %	0 %	194450110
13488	NC_011083	CTT	2	6	636825	636830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194450110
13489	NC_011083	GCG	2	6	636864	636869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450110
13490	NC_011083	GCCA	2	8	636899	636906	25 %	0 %	25 %	50 %	194450110
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13492	NC_011083	GC	3	6	636915	636920	0 %	0 %	50 %	50 %	194450110
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13497	NC_011083	TCA	2	6	637034	637039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194450110
13498	NC_011083	CTG	3	9	637081	637089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450110
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13500	NC_011083	TCT	2	6	637175	637180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194450110

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