MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 chromosome

Total Repeats: 103087

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_011083	CGA	2	6	544111	544116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448862
11502	NC_011083	ATG	2	6	544125	544130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448862
11503	NC_011083	TAGG	2	8	544172	544179	25 %	25 %	50 %	0 %	194448862
11504	NC_011083	AAGT	2	8	544191	544198	50 %	25 %	25 %	0 %	194448862
11505	NC_011083	CGA	2	6	544225	544230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448862
11506	NC_011083	ATCTT	2	10	544302	544311	20 %	60 %	0 %	20 %	194448862
11507	NC_011083	TAA	2	6	544436	544441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194448516
11508	NC_011083	TTG	2	6	544486	544491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194448516
11509	NC_011083	CGC	2	6	544521	544526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194448516
11510	NC_011083	TCAT	2	8	544531	544538	25 %	50 %	0 %	25 %	194448516
11511	NC_011083	TGG	2	6	544595	544600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194448516
11512	NC_011083	AAG	2	6	544747	544752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194448516
11513	NC_011083	TCA	2	6	544757	544762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194448516
11514	NC_011083	GAA	2	6	544851	544856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194448516
11515	NC_011083	GCTT	2	8	544916	544923	0 %	50 %	25 %	25 %	194448516
11516	NC_011083	GCGT	2	8	544933	544940	0 %	25 %	50 %	25 %	194448516
11517	NC_011083	ATG	2	6	544969	544974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448516
11518	NC_011083	TTA	2	6	545050	545055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194448516
11519	NC_011083	ACG	2	6	545107	545112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448516
11520	NC_011083	CAG	2	6	545181	545186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448516
11521	NC_011083	TGG	2	6	545296	545301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11522	NC_011083	TAT	2	6	545526	545531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194447830
11523	NC_011083	AAATTT	2	12	545556	545567	50 %	50 %	0 %	0 %	194447830
11524	NC_011083	AAT	2	6	545613	545618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194447830
11525	NC_011083	AT	3	6	545650	545655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11526	NC_011083	T	6	6	545655	545660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11527	NC_011083	TTA	2	6	545700	545705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11528	NC_011083	AAT	2	6	545714	545719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11529	NC_011083	CAG	2	6	545726	545731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450446
11530	NC_011083	CAG	2	6	545861	545866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450446
11531	NC_011083	TGCG	2	8	545940	545947	0 %	25 %	50 %	25 %	194450446
11532	NC_011083	CGCT	2	8	545958	545965	0 %	25 %	25 %	50 %	194450446
11533	NC_011083	CGG	2	6	546022	546027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450446
11534	NC_011083	TTA	2	6	546159	546164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194450446
11535	NC_011083	TAA	2	6	546176	546181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194450446
11536	NC_011083	GGC	2	6	546191	546196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450446
11537	NC_011083	CGC	2	6	546208	546213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450446
11538	NC_011083	CCG	2	6	546232	546237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450446
11539	NC_011083	CAG	2	6	546320	546325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450446
11540	NC_011083	CG	3	6	546326	546331	0 %	0 %	50 %	50 %	194450446
11541	NC_011083	GCC	2	6	546359	546364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450446
11542	NC_011083	CGA	2	6	546376	546381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450446
11543	NC_011083	CGC	2	6	546442	546447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450446
11544	NC_011083	GGT	3	9	546458	546466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194450446
11545	NC_011083	TTA	2	6	546531	546536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194450446
11546	NC_011083	GCG	2	6	546556	546561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450446
11547	NC_011083	CGA	2	6	546562	546567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450446
11548	NC_011083	TCGG	2	8	546603	546610	0 %	25 %	50 %	25 %	194450446
11549	NC_011083	CAA	2	6	546647	546652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194450446
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11551	NC_011083	GCCA	2	8	546699	546706	25 %	0 %	25 %	50 %	194450446
11552	NC_011083	CCG	2	6	546717	546722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450446
11553	NC_011083	TTC	2	6	546779	546784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194450446
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11555	NC_011083	GCC	2	6	546864	546869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450446
11556	NC_011083	CGC	2	6	546908	546913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450446
11557	NC_011083	CGC	2	6	546917	546922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450446
11558	NC_011083	AAC	2	6	546927	546932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194450446
11559	NC_011083	AACC	2	8	546948	546955	50 %	0 %	0 %	50 %	194450446
11560	NC_011083	CGA	3	9	546957	546965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450446
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11562	NC_011083	GGC	2	6	546975	546980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450446
11563	NC_011083	ACCA	2	8	547031	547038	50 %	0 %	0 %	50 %	194450446
11564	NC_011083	GAA	2	6	547043	547048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194450446
11565	NC_011083	CAG	2	6	547145	547150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450446
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11567	NC_011083	TTG	3	9	547230	547238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_011083	AGT	2	6	547373	547378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513545520
11569	NC_011083	TGC	2	6	547403	547408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513545520
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11571	NC_011083	TGT	2	6	547454	547459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513545520
11572	NC_011083	CTT	2	6	547574	547579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513545520
11573	NC_011083	GTT	2	6	547626	547631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513545520
11574	NC_011083	CTG	2	6	547713	547718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513545520
11575	NC_011083	GTC	2	6	547750	547755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513545520
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11577	NC_011083	CAT	2	6	547869	547874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513545520
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11579	NC_011083	AAT	2	6	548014	548019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11580	NC_011083	TGT	2	6	548039	548044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11581	NC_011083	GGA	2	6	548111	548116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11582	NC_011083	ATG	2	6	548124	548129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447317
11583	NC_011083	AGA	2	6	548144	548149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194447317
11584	NC_011083	CAG	2	6	548218	548223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447317
11585	NC_011083	GAT	2	6	548297	548302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447317
11586	NC_011083	CGG	2	6	548317	548322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194447317
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11588	NC_011083	CGCGG	2	10	548418	548427	0 %	0 %	60 %	40 %	194447317
11589	NC_011083	GTTTT	2	10	548515	548524	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11590	NC_011083	CCG	2	6	548585	548590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11591	NC_011083	TA	3	6	548651	548656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11592	NC_011083	GAT	2	6	548670	548675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11593	NC_011083	GAC	2	6	548679	548684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11594	NC_011083	TGAT	2	8	548693	548700	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11595	NC_011083	T	6	6	548771	548776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11596	NC_011083	GCC	2	6	548822	548827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194448096
11597	NC_011083	GCT	2	6	548845	548850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448096
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11599	NC_011083	TCG	2	6	548945	548950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448096
11600	NC_011083	TGA	2	6	548996	549001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448096
11601	NC_011083	ATC	2	6	549022	549027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194448096
11602	NC_011083	A	6	6	549032	549037	100 %	0 %	0 %	0 %	194448096
11603	NC_011083	GC	3	6	549050	549055	0 %	0 %	50 %	50 %	194448096
11604	NC_011083	GTT	2	6	549172	549177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194448096
11605	NC_011083	TGATG	2	10	549198	549207	20 %	40 %	40 %	0 %	194448096
11606	NC_011083	AGC	2	6	549224	549229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448096
11607	NC_011083	GAAA	2	8	549240	549247	75 %	0 %	25 %	0 %	194448096
11608	NC_011083	GCT	2	6	549256	549261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448096
11609	NC_011083	GGC	2	6	549322	549327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448096
11610	NC_011083	GAA	2	6	549498	549503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194448096
11611	NC_011083	GAA	2	6	549508	549513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194448096
11612	NC_011083	GAA	2	6	549535	549540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194448096
11613	NC_011083	TCA	2	6	549542	549547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194448096
11614	NC_011083	GC	3	6	549585	549590	0 %	0 %	50 %	50 %	194448096
11615	NC_011083	CGT	2	6	549730	549735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448096
11616	NC_011083	TGG	2	6	549753	549758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194448096
11617	NC_011083	CG	3	6	549785	549790	0 %	0 %	50 %	50 %	194448096
11618	NC_011083	GAA	2	6	549799	549804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194448096
11619	NC_011083	CGT	2	6	549814	549819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448096
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11982	NC_011083	ACC	2	6	566557	566562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194449052
11983	NC_011083	CAG	2	6	566578	566583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449052
11984	NC_011083	CGA	2	6	566646	566651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449052
11985	NC_011083	ATTGAT	2	12	566674	566685	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	194449052
11986	NC_011083	CGA	2	6	566706	566711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449052
11987	NC_011083	TGG	2	6	566768	566773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194449052
11988	NC_011083	TTA	2	6	566809	566814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194449052
11989	NC_011083	CT	3	6	566871	566876	0 %	50 %	0 %	50 %	194449052
11990	NC_011083	ATC	2	6	566879	566884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194449052
11991	NC_011083	GC	3	6	567028	567033	0 %	0 %	50 %	50 %	194449052
11992	NC_011083	TGGCGC	2	12	567107	567118	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	194449052
11993	NC_011083	TGA	2	6	567153	567158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194449052
11994	NC_011083	CAG	2	6	567199	567204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449052
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11998	NC_011083	CAA	2	6	567328	567333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194449052
11999	NC_011083	GGC	2	6	567339	567344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449052
12000	NC_011083	AGTT	2	8	567377	567384	25 %	50 %	25 %	0 %	194449052

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