MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 chromosome

Total Repeats: 103087

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_011083	A	6	6	521544	521549	100 %	0 %	0 %	0 %	194451413
11002	NC_011083	GCC	2	6	521556	521561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194451413
11003	NC_011083	GC	3	6	521569	521574	0 %	0 %	50 %	50 %	194451413
11004	NC_011083	TGA	2	6	521576	521581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194451413
11005	NC_011083	GCT	2	6	521589	521594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194451413
11006	NC_011083	CT	3	6	521593	521598	0 %	50 %	0 %	50 %	194451413
11007	NC_011083	GCCA	2	8	521769	521776	25 %	0 %	25 %	50 %	194451900
11008	NC_011083	GCG	2	6	521802	521807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194451900
11009	NC_011083	CG	3	6	521822	521827	0 %	0 %	50 %	50 %	194451900
11010	NC_011083	CTT	2	6	521830	521835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194451900
11011	NC_011083	CGC	2	6	521923	521928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194451900
11012	NC_011083	GCC	2	6	521936	521941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194451900
11013	NC_011083	TTC	2	6	521954	521959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194451900
11014	NC_011083	TGC	2	6	521979	521984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194451900
11015	NC_011083	GTC	2	6	522008	522013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194451900
11016	NC_011083	CGC	2	6	522071	522076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194451900
11017	NC_011083	CGT	2	6	522220	522225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194451900
11018	NC_011083	GTAA	2	8	522240	522247	50 %	25 %	25 %	0 %	194451900
11019	NC_011083	TCG	2	6	522267	522272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194451900
11020	NC_011083	GA	3	6	522315	522320	50 %	0 %	50 %	0 %	194451900
11021	NC_011083	GT	3	6	522335	522340	0 %	50 %	50 %	0 %	194451900
11022	NC_011083	CGAT	2	8	522369	522376	25 %	25 %	25 %	25 %	194451900
11023	NC_011083	AGTAG	2	10	522446	522455	40 %	20 %	40 %	0 %	194451900
11024	NC_011083	ACG	2	6	522462	522467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194451900
11025	NC_011083	GCC	2	6	522476	522481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194451900
11026	NC_011083	GCG	2	6	522495	522500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194451900
11027	NC_011083	TGC	2	6	522513	522518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194451900
11028	NC_011083	CCA	2	6	522568	522573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194451900
11029	NC_011083	GGC	2	6	522626	522631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194451900
11030	NC_011083	CA	3	6	522637	522642	50 %	0 %	0 %	50 %	194451900
11031	NC_011083	CCG	2	6	522678	522683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194451900
11032	NC_011083	TTC	2	6	522825	522830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194451900
11033	NC_011083	TTC	2	6	522935	522940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194451900
11034	NC_011083	T	6	6	522987	522992	0 %	100 %	0 %	0 %	194451900
11035	NC_011083	AGA	2	6	523007	523012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194451900
11036	NC_011083	GTT	2	6	523046	523051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194451900
11037	NC_011083	GC	3	6	523054	523059	0 %	0 %	50 %	50 %	194451900
11038	NC_011083	CGG	2	6	523156	523161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194451900
11039	NC_011083	CA	3	6	523181	523186	50 %	0 %	0 %	50 %	194451900
11040	NC_011083	GCG	2	6	523193	523198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194451900
11041	NC_011083	CTT	2	6	523207	523212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194451900
11042	NC_011083	CCG	2	6	523216	523221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194451900
11043	NC_011083	ATACCG	2	12	523230	523241	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	194451900
11044	NC_011083	GGA	2	6	523256	523261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194451900
11045	NC_011083	CGA	2	6	523353	523358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194451900
11046	NC_011083	AGTA	2	8	523509	523516	50 %	25 %	25 %	0 %	194451900
11047	NC_011083	GCG	2	6	523517	523522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194451900
11048	NC_011083	TCG	2	6	523527	523532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194451900
11049	NC_011083	CT	3	6	523548	523553	0 %	50 %	0 %	50 %	194451900
11050	NC_011083	AGGGT	2	10	523596	523605	20 %	20 %	60 %	0 %	194451900
11051	NC_011083	TTTA	2	8	523650	523657	25 %	75 %	0 %	0 %	194450485
11052	NC_011083	GGTA	2	8	523800	523807	25 %	25 %	50 %	0 %	194450485
11053	NC_011083	GCT	2	6	523818	523823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450485
11054	NC_011083	CAC	2	6	523864	523869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194450485
11055	NC_011083	AAGGC	2	10	523895	523904	40 %	0 %	40 %	20 %	194450485
11056	NC_011083	CT	3	6	523910	523915	0 %	50 %	0 %	50 %	194450485
11057	NC_011083	CGG	2	6	523983	523988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450485
11058	NC_011083	GC	3	6	523998	524003	0 %	0 %	50 %	50 %	194450485
11059	NC_011083	GCC	2	6	524060	524065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450485
11060	NC_011083	CCG	2	6	524081	524086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450485
11061	NC_011083	ATC	2	6	524126	524131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194450485
11062	NC_011083	CGATCG	2	12	524138	524149	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	194450485
11063	NC_011083	ATCGTC	2	12	524272	524283	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	194450485
11064	NC_011083	GTC	2	6	524296	524301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450485
11065	NC_011083	CCG	2	6	524334	524339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450485
11066	NC_011083	TAA	2	6	524425	524430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194450485
11067	NC_011083	GCT	2	6	524532	524537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450485
11068	NC_011083	CTG	2	6	524629	524634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449854
11069	NC_011083	TGCC	2	8	524641	524648	0 %	25 %	25 %	50 %	194449854
11070	NC_011083	CGC	2	6	524667	524672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194449854
11071	NC_011083	ATTC	2	8	524679	524686	25 %	50 %	0 %	25 %	194449854
11072	NC_011083	CGC	2	6	524709	524714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194449854
11073	NC_011083	GCTC	2	8	524742	524749	0 %	25 %	25 %	50 %	194449854
11074	NC_011083	GGCG	2	8	524767	524774	0 %	0 %	75 %	25 %	194449854
11075	NC_011083	TTC	2	6	524783	524788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194449854
11076	NC_011083	ATG	2	6	524792	524797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194449854
11077	NC_011083	CT	3	6	524807	524812	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11078	NC_011083	GCA	2	6	524819	524824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11079	NC_011083	GTGATA	2	12	524898	524909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11080	NC_011083	GCT	2	6	524943	524948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11081	NC_011083	GCC	2	6	524997	525002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11082	NC_011083	CCA	2	6	525221	525226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194448678
11083	NC_011083	AGC	2	6	525301	525306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448678
11084	NC_011083	TGCG	2	8	525324	525331	0 %	25 %	50 %	25 %	194448678
11085	NC_011083	CGG	3	9	525386	525394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448678
11086	NC_011083	GC	3	6	525417	525422	0 %	0 %	50 %	50 %	194448678
11087	NC_011083	TGGAAG	2	12	525457	525468	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	194448678
11088	NC_011083	CTG	3	9	525477	525485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448678
11089	NC_011083	CGG	2	6	525557	525562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448678
11090	NC_011083	ACT	2	6	525616	525621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194448678
11091	NC_011083	CTT	2	6	525623	525628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194448678
11092	NC_011083	GGC	2	6	525636	525641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448678
11093	NC_011083	GCG	2	6	525642	525647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448678
11094	NC_011083	CGA	2	6	525767	525772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448678
11095	NC_011083	GTG	2	6	525786	525791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194448678
11096	NC_011083	ATG	2	6	525801	525806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448678
11097	NC_011083	CG	3	6	525810	525815	0 %	0 %	50 %	50 %	194448678
11098	NC_011083	CCAG	2	8	525883	525890	25 %	0 %	25 %	50 %	194448678
11099	NC_011083	GC	3	6	525984	525989	0 %	0 %	50 %	50 %	194448678
11100	NC_011083	GAA	3	9	526089	526097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194448678
11101	NC_011083	GGT	2	6	526124	526129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194448678
11102	NC_011083	AGA	2	6	526130	526135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194448678
11103	NC_011083	AAC	2	6	526140	526145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194448678
11104	NC_011083	CAG	2	6	526167	526172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448678
11105	NC_011083	CAG	2	6	526176	526181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448678
11106	NC_011083	GGT	2	6	526184	526189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194448678
11107	NC_011083	ACG	2	6	526222	526227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448678
11108	NC_011083	CGT	2	6	526292	526297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448678
11109	NC_011083	GCT	2	6	526358	526363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448678
11110	NC_011083	GGC	2	6	526466	526471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11111	NC_011083	TCA	3	9	526533	526541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194448053
11112	NC_011083	GCA	2	6	526542	526547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448053
11113	NC_011083	CCA	2	6	526557	526562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194448053
11114	NC_011083	GCGCC	2	10	526575	526584	0 %	0 %	40 %	60 %	194448053
11115	NC_011083	CGGT	2	8	526601	526608	0 %	25 %	50 %	25 %	194448053
11116	NC_011083	CGT	2	6	526633	526638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448053
11117	NC_011083	CGG	2	6	526645	526650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448053
11118	NC_011083	ATC	3	9	526655	526663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194448053
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11120	NC_011083	CGACG	2	10	526783	526792	20 %	0 %	40 %	40 %	194448053
11121	NC_011083	CGG	2	6	526803	526808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448053
11122	NC_011083	CAGCGC	2	12	527023	527034	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	194448053
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11192	NC_011083	AAAT	2	8	530379	530386	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11193	NC_011083	GGA	2	6	530398	530403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11209	NC_011083	TGCC	2	8	531222	531229	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11210	NC_011083	T	6	6	531253	531258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11211	NC_011083	CAC	2	6	531384	531389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194448380
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11216	NC_011083	CAG	2	6	531475	531480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448380
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11221	NC_011083	CCGAC	2	10	531728	531737	20 %	0 %	20 %	60 %	194448380
11222	NC_011083	ACC	2	6	531772	531777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194448380
11223	NC_011083	TGA	2	6	531795	531800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448380
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11227	NC_011083	CGCT	2	8	532000	532007	0 %	25 %	25 %	50 %	194448380
11228	NC_011083	GGA	2	6	532041	532046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194448380
11229	NC_011083	CA	3	6	532077	532082	50 %	0 %	0 %	50 %	194448380
11230	NC_011083	GTGGC	2	10	532130	532139	0 %	20 %	60 %	20 %	194448380
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11232	NC_011083	TGG	2	6	532178	532183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194448380
11233	NC_011083	GCT	2	6	532212	532217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448380
11234	NC_011083	CGC	2	6	532297	532302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194448380
11235	NC_011083	TATC	2	8	532323	532330	25 %	50 %	0 %	25 %	194448380
11236	NC_011083	GCC	2	6	532387	532392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194448380
11237	NC_011083	CTG	2	6	532405	532410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448380
11238	NC_011083	ATG	2	6	532453	532458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447820
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11240	NC_011083	ACC	2	6	532495	532500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194447820
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11360	NC_011083	TATT	2	8	538110	538117	25 %	75 %	0 %	0 %	194448067
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11483	NC_011083	GTG	2	6	543302	543307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194448862
11484	NC_011083	CAGAAT	2	12	543428	543439	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	194448862
11485	NC_011083	CAT	3	9	543482	543490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194448862
11486	NC_011083	GCC	2	6	543494	543499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194448862
11487	NC_011083	GAT	2	6	543584	543589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448862
11488	NC_011083	GAA	2	6	543677	543682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194448862
11489	NC_011083	CGT	2	6	543698	543703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448862
11490	NC_011083	GCG	2	6	543778	543783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448862
11491	NC_011083	AGCC	2	8	543788	543795	25 %	0 %	25 %	50 %	194448862
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