MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 chromosome

Total Repeats: 103087

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_011083	GCA	2	6	474592	474597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448967585
10002	NC_011083	ACA	2	6	474689	474694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448967585
10003	NC_011083	TTG	2	6	474698	474703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448967585
10004	NC_011083	CAA	2	6	474729	474734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448967585
10005	NC_011083	ACG	2	6	475037	475042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448967585
10006	NC_011083	CAA	2	6	475047	475052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448967585
10007	NC_011083	GAA	2	6	475140	475145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448967585
10008	NC_011083	CGG	3	9	475176	475184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448967585
10009	NC_011083	TC	3	6	475243	475248	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10010	NC_011083	ATT	2	6	475303	475308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_011083	AAGC	2	8	475333	475340	50 %	0 %	25 %	25 %	513545519
10012	NC_011083	TGA	2	6	475432	475437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513545519
10013	NC_011083	GTT	2	6	475472	475477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513545519
10014	NC_011083	A	6	6	475556	475561	100 %	0 %	0 %	0 %	513545519
10015	NC_011083	AATT	2	8	475575	475582	50 %	50 %	0 %	0 %	513545519
10016	NC_011083	TCA	3	9	475613	475621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513545519
10017	NC_011083	CAT	2	6	475633	475638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513545519
10018	NC_011083	AGC	2	6	475713	475718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513545519
10019	NC_011083	TAA	2	6	475726	475731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513545519
10020	NC_011083	GAA	2	6	475781	475786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513545519
10021	NC_011083	TCA	2	6	475819	475824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513545519
10022	NC_011083	CG	3	6	475830	475835	0 %	0 %	50 %	50 %	513545519
10023	NC_011083	GGT	2	6	475846	475851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513545519
10024	NC_011083	CGA	2	6	475983	475988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10025	NC_011083	G	6	6	476079	476084	0 %	0 %	100 %	0 %	194448768
10026	NC_011083	ATATT	2	10	476111	476120	40 %	60 %	0 %	0 %	194448768
10027	NC_011083	ATC	2	6	476126	476131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194448768
10028	NC_011083	TAA	2	6	476142	476147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194448768
10029	NC_011083	CCG	3	9	476150	476158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194448768
10030	NC_011083	CCT	2	6	476159	476164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194448768
10031	NC_011083	CGTC	2	8	476186	476193	0 %	25 %	25 %	50 %	194448768
10032	NC_011083	CCCAG	2	10	476211	476220	20 %	0 %	20 %	60 %	194448768
10033	NC_011083	GAT	2	6	476257	476262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448768
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10035	NC_011083	GAC	2	6	476336	476341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448768
10036	NC_011083	CAT	2	6	476362	476367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194448768
10037	NC_011083	TAT	2	6	476415	476420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194448768
10038	NC_011083	CCA	2	6	476445	476450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194448768
10039	NC_011083	GTG	2	6	476486	476491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194448768
10040	NC_011083	GCGG	2	8	476505	476512	0 %	0 %	75 %	25 %	194448768
10041	NC_011083	TTC	2	6	476521	476526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194448768
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10043	NC_011083	GTT	2	6	476658	476663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194448768
10044	NC_011083	GCGCC	2	10	476694	476703	0 %	0 %	40 %	60 %	194448768
10045	NC_011083	GC	3	6	476724	476729	0 %	0 %	50 %	50 %	194448768
10046	NC_011083	CG	3	6	476786	476791	0 %	0 %	50 %	50 %	194448768
10047	NC_011083	GA	3	6	476884	476889	50 %	0 %	50 %	0 %	194448768
10048	NC_011083	ATT	2	6	476926	476931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194448768
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10051	NC_011083	AAGT	2	8	477096	477103	50 %	25 %	25 %	0 %	194448768
10052	NC_011083	GGT	2	6	477173	477178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_011083	TAC	2	6	477191	477196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10054	NC_011083	CGG	2	6	477198	477203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10055	NC_011083	A	6	6	477226	477231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_011083	A	6	6	477239	477244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_011083	CGG	2	6	477250	477255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10058	NC_011083	CTG	2	6	477324	477329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10059	NC_011083	TCG	2	6	477340	477345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10060	NC_011083	GCC	2	6	477443	477448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10061	NC_011083	CAG	2	6	477453	477458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10062	NC_011083	TAA	2	6	477462	477467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_011083	AAG	2	6	477472	477477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_011083	ATG	2	6	477491	477496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450542
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10070	NC_011083	TTA	2	6	477679	477684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194450542
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10082	NC_011083	GTC	2	6	478271	478276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450542
10083	NC_011083	CGC	2	6	478374	478379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450542
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10087	NC_011083	CTG	2	6	478502	478507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450542
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10092	NC_011083	TGG	2	6	478620	478625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194450542
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10095	NC_011083	GTA	2	6	478790	478795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194449289
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10097	NC_011083	GCTG	2	8	478965	478972	0 %	25 %	50 %	25 %	194449289
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10103	NC_011083	GC	3	6	479402	479407	0 %	0 %	50 %	50 %	194449289
10104	NC_011083	GGCAG	2	10	479574	479583	20 %	0 %	60 %	20 %	194449289
10105	NC_011083	TGAG	2	8	479591	479598	25 %	25 %	50 %	0 %	194449289
10106	NC_011083	A	6	6	479645	479650	100 %	0 %	0 %	0 %	194449289
10107	NC_011083	GAC	2	6	479763	479768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449289
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10109	NC_011083	GCG	2	6	479796	479801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449289
10110	NC_011083	GC	3	6	479849	479854	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10111	NC_011083	GGTGAC	2	12	479866	479877	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	194451847
10112	NC_011083	CAG	2	6	480035	480040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194451847
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10114	NC_011083	GA	3	6	480150	480155	50 %	0 %	50 %	0 %	194451847
10115	NC_011083	GAT	2	6	480182	480187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10117	NC_011083	TTG	2	6	480409	480414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_011083	TCG	2	6	480457	480462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194451331
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10120	NC_011083	CTGG	2	8	480592	480599	0 %	25 %	50 %	25 %	194451331
10121	NC_011083	TCA	2	6	480606	480611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194451331
10122	NC_011083	GAT	2	6	480626	480631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194451331
10123	NC_011083	CGC	2	6	480705	480710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194451264
10124	NC_011083	GGC	2	6	480737	480742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194451264
10125	NC_011083	ATAC	2	8	480789	480796	50 %	25 %	0 %	25 %	194451264
10126	NC_011083	AAG	2	6	480859	480864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194451264
10127	NC_011083	GATCGC	2	12	480912	480923	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	194451264
10128	NC_011083	GGAA	2	8	480945	480952	50 %	0 %	50 %	0 %	194451264
10129	NC_011083	ATC	2	6	480984	480989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194451264
10130	NC_011083	CGC	2	6	481037	481042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194451264
10131	NC_011083	CCA	3	9	481112	481120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194451264
10132	NC_011083	CTG	2	6	481155	481160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194451264
10133	NC_011083	CCGA	2	8	481192	481199	25 %	0 %	25 %	50 %	194451264
10134	NC_011083	TTCG	2	8	481279	481286	0 %	50 %	25 %	25 %	194451264
10135	NC_011083	TAA	2	6	481295	481300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194451264
10136	NC_011083	GCA	2	6	481412	481417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194451264
10137	NC_011083	TTGGTG	2	12	481515	481526	0 %	50 %	50 %	0 %	194451264
10138	NC_011083	AAT	2	6	481601	481606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194451264
10139	NC_011083	TATC	2	8	481640	481647	25 %	50 %	0 %	25 %	194451264
10140	NC_011083	CAC	2	6	481656	481661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194451264
10141	NC_011083	ATCG	2	8	481677	481684	25 %	25 %	25 %	25 %	194451264
10142	NC_011083	CCG	2	6	481727	481732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194451264
10143	NC_011083	ATT	2	6	481901	481906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194448511
10144	NC_011083	GGC	2	6	481916	481921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448511
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10151	NC_011083	CCT	2	6	482184	482189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194448511
10152	NC_011083	GCGCT	2	10	482198	482207	0 %	20 %	40 %	40 %	194448511
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10154	NC_011083	GCC	2	6	482262	482267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194448511
10155	NC_011083	TGCC	2	8	482296	482303	0 %	25 %	25 %	50 %	194448511
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10158	NC_011083	GCT	2	6	482507	482512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448511
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10160	NC_011083	TA	3	6	482589	482594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10161	NC_011083	ATG	2	6	482615	482620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10162	NC_011083	ACC	2	6	482666	482671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10163	NC_011083	GCTAA	2	10	482688	482697	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10164	NC_011083	GTTTG	2	10	482762	482771	0 %	60 %	40 %	0 %	194450714
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10166	NC_011083	GC	3	6	482971	482976	0 %	0 %	50 %	50 %	194450714
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10179	NC_011083	ATCAA	2	10	483446	483455	60 %	20 %	0 %	20 %	194450714
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10189	NC_011083	ATT	2	6	484058	484063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10190	NC_011083	T	6	6	484065	484070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10191	NC_011083	TAT	2	6	484078	484083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10201	NC_011083	ACA	2	6	484512	484517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10207	NC_011083	GTAA	2	8	484730	484737	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10208	NC_011083	GGT	2	6	484752	484757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10209	NC_011083	TA	3	6	484782	484787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10210	NC_011083	ACTTT	2	10	484873	484882	20 %	60 %	0 %	20 %	194450043
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10217	NC_011083	CAGT	2	8	485031	485038	25 %	25 %	25 %	25 %	194450043
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10221	NC_011083	A	6	6	485158	485163	100 %	0 %	0 %	0 %	194450043
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10223	NC_011083	TCC	2	6	485219	485224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10224	NC_011083	AATG	2	8	485278	485285	50 %	25 %	25 %	0 %	194451887
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10228	NC_011083	GCC	2	6	485429	485434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194451887
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10230	NC_011083	TGG	2	6	485465	485470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194451887
10231	NC_011083	TGGCA	2	10	485508	485517	20 %	20 %	40 %	20 %	194451887
10232	NC_011083	GCG	2	6	485522	485527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194451887
10233	NC_011083	TGCC	2	8	485622	485629	0 %	25 %	25 %	50 %	194451887
10234	NC_011083	ATG	3	9	485642	485650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194451887
10235	NC_011083	GGCG	2	8	485672	485679	0 %	0 %	75 %	25 %	194451887
10236	NC_011083	TCG	2	6	485768	485773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194451887
10237	NC_011083	CT	3	6	485786	485791	0 %	50 %	0 %	50 %	194451887
10238	NC_011083	TTA	2	6	485939	485944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194451887
10239	NC_011083	CCA	2	6	485971	485976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194451887
10240	NC_011083	TTG	2	6	485990	485995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194451887
10241	NC_011083	TATCGA	2	12	485998	486009	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	194451887
10242	NC_011083	ATG	2	6	486042	486047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194451887
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10244	NC_011083	GGC	2	6	486125	486130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194451887
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