MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 101857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_011080	CAG	3	9	885606	885614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444906
19003	NC_011080	AGC	2	6	885640	885645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444906
19004	NC_011080	AAT	2	6	885738	885743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194444906
19005	NC_011080	CTGA	2	8	885750	885757	25 %	25 %	25 %	25 %	194444906
19006	NC_011080	CGC	2	6	885759	885764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444906
19007	NC_011080	CGC	2	6	885815	885820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444906
19008	NC_011080	CCGC	2	8	885827	885834	0 %	0 %	25 %	75 %	194444906
19009	NC_011080	GC	3	6	885926	885931	0 %	0 %	50 %	50 %	194444906
19010	NC_011080	CG	3	6	885941	885946	0 %	0 %	50 %	50 %	194444906
19011	NC_011080	TGC	2	6	885952	885957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444906
19012	NC_011080	CAC	2	6	885975	885980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444906
19013	NC_011080	T	6	6	886007	886012	0 %	100 %	0 %	0 %	194444906
19014	NC_011080	AATT	2	8	886014	886021	50 %	50 %	0 %	0 %	194444906
19015	NC_011080	CCT	2	6	886091	886096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194444906
19016	NC_011080	TGT	2	6	886102	886107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444906
19017	NC_011080	ACAGCA	2	12	886169	886180	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	194444906
19018	NC_011080	CAC	2	6	886188	886193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444906
19019	NC_011080	CAGC	2	8	886200	886207	25 %	0 %	25 %	50 %	194444906
19020	NC_011080	ACGC	3	12	886250	886261	25 %	0 %	25 %	50 %	194444906
19021	NC_011080	GA	4	8	886270	886277	50 %	0 %	50 %	0 %	194444906
19022	NC_011080	TGA	2	6	886311	886316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444576
19023	NC_011080	CGG	2	6	886362	886367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444576
19024	NC_011080	GTC	2	6	886466	886471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444576
19025	NC_011080	CCA	2	6	886494	886499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444576
19026	NC_011080	CGG	2	6	886526	886531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444576
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19028	NC_011080	T	6	6	886695	886700	0 %	100 %	0 %	0 %	194444576
19029	NC_011080	GC	3	6	886707	886712	0 %	0 %	50 %	50 %	194444576
19030	NC_011080	A	6	6	886739	886744	100 %	0 %	0 %	0 %	194444576
19031	NC_011080	CAG	2	6	886879	886884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444576
19032	NC_011080	CAT	2	6	886891	886896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444576
19033	NC_011080	GGT	2	6	886903	886908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444576
19034	NC_011080	CGC	2	6	886950	886955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444576
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19036	NC_011080	GCGCG	2	10	887131	887140	0 %	0 %	60 %	40 %	194444576
19037	NC_011080	CTG	2	6	887187	887192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444576
19038	NC_011080	T	6	6	887203	887208	0 %	100 %	0 %	0 %	194444576
19039	NC_011080	CT	3	6	887271	887276	0 %	50 %	0 %	50 %	194444576
19040	NC_011080	GTT	2	6	887290	887295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444576
19041	NC_011080	TCA	2	6	887310	887315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444576
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19044	NC_011080	CAG	2	6	887389	887394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444576
19045	NC_011080	TCG	2	6	887417	887422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444576
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19047	NC_011080	CGCC	2	8	887457	887464	0 %	0 %	25 %	75 %	194444576
19048	NC_011080	CAACGC	2	12	887508	887519	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	194444576
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19050	NC_011080	CCG	2	6	887591	887596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444576
19051	NC_011080	CAA	2	6	887647	887652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194444576
19052	NC_011080	GCC	2	6	887830	887835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444576
19053	NC_011080	GAAT	2	8	887921	887928	50 %	25 %	25 %	0 %	194444576
19054	NC_011080	GCG	2	6	887940	887945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444576
19055	NC_011080	CGG	2	6	887949	887954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444576
19056	NC_011080	TAA	2	6	887997	888002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194444576
19057	NC_011080	CTCA	2	8	888007	888014	25 %	25 %	0 %	50 %	194444576
19058	NC_011080	CGAAA	2	10	888164	888173	60 %	0 %	20 %	20 %	194445005
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19061	NC_011080	CTGA	2	8	888245	888252	25 %	25 %	25 %	25 %	194445005
19062	NC_011080	TCA	2	6	888261	888266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445005
19063	NC_011080	GC	3	6	888273	888278	0 %	0 %	50 %	50 %	194445005
19064	NC_011080	TGC	2	6	888316	888321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445005
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19066	NC_011080	GTG	2	6	888390	888395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445005
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19069	NC_011080	CGGTA	2	10	888484	888493	20 %	20 %	40 %	20 %	194445005
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19072	NC_011080	GGC	2	6	888638	888643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445005
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19086	NC_011080	AGTA	2	8	889527	889534	50 %	25 %	25 %	0 %	194446337
19087	NC_011080	GGC	2	6	889537	889542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446337
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19090	NC_011080	TGG	2	6	889578	889583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446337
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19092	NC_011080	TGG	2	6	889653	889658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446337
19093	NC_011080	GTG	2	6	889661	889666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446337
19094	NC_011080	TCA	2	6	889674	889679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446337
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19096	NC_011080	GATT	2	8	889703	889710	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19097	NC_011080	AGT	2	6	889900	889905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19099	NC_011080	CCG	2	6	890004	890009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442237
19100	NC_011080	CGG	2	6	890061	890066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442237
19101	NC_011080	TTG	2	6	890081	890086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194442237
19102	NC_011080	GTC	2	6	890121	890126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442237
19103	NC_011080	GC	3	6	890134	890139	0 %	0 %	50 %	50 %	194442237
19104	NC_011080	GGC	2	6	890167	890172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442237
19105	NC_011080	TCGC	2	8	890218	890225	0 %	25 %	25 %	50 %	194442237
19106	NC_011080	TGG	2	6	890226	890231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442237
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19108	NC_011080	GAT	2	6	890260	890265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442237
19109	NC_011080	GCG	3	9	890274	890282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442237
19110	NC_011080	TGG	2	6	890292	890297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442237
19111	NC_011080	TTCA	2	8	890402	890409	25 %	50 %	0 %	25 %	194442237
19112	NC_011080	TCG	2	6	890416	890421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442237
19113	NC_011080	CTG	2	6	890456	890461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442237
19114	NC_011080	CGA	2	6	890479	890484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442237
19115	NC_011080	GC	3	6	890537	890542	0 %	0 %	50 %	50 %	194442237
19116	NC_011080	GCA	2	6	890569	890574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442237
19117	NC_011080	A	6	6	890591	890596	100 %	0 %	0 %	0 %	194442237
19118	NC_011080	CTG	2	6	890609	890614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442237
19119	NC_011080	GAT	2	6	890620	890625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442237
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19121	NC_011080	TAA	2	6	890701	890706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442237
19122	NC_011080	GCG	2	6	890723	890728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442237
19123	NC_011080	TAA	2	6	890737	890742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442237
19124	NC_011080	CG	3	6	890762	890767	0 %	0 %	50 %	50 %	194442237
19125	NC_011080	GCG	2	6	890819	890824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442237
19126	NC_011080	CG	3	6	890918	890923	0 %	0 %	50 %	50 %	194442237
19127	NC_011080	A	6	6	890999	891004	100 %	0 %	0 %	0 %	194442237
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19137	NC_011080	CGCTG	2	10	891487	891496	0 %	20 %	40 %	40 %	194445323
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19232	NC_011080	AG	3	6	895697	895702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19233	NC_011080	CGAG	2	8	895712	895719	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19234	NC_011080	GGT	2	6	895733	895738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19235	NC_011080	CGC	2	6	895772	895777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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19238	NC_011080	CA	3	6	895993	895998	50 %	0 %	0 %	50 %	194442902
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19241	NC_011080	CGTGGG	2	12	896122	896133	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	194442902
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19243	NC_011080	GC	3	6	896220	896225	0 %	0 %	50 %	50 %	194442902
19244	NC_011080	CGG	2	6	896289	896294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442902
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19362	NC_011080	ATTT	2	8	902431	902438	25 %	75 %	0 %	0 %	194442761
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