MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 101857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_011080	GTT	2	6	861771	861776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443847
18502	NC_011080	CTG	2	6	861784	861789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443847
18503	NC_011080	ATCAC	2	10	861813	861822	40 %	20 %	0 %	40 %	194443847
18504	NC_011080	CTG	2	6	861916	861921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443847
18505	NC_011080	CGG	2	6	861984	861989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443847
18506	NC_011080	GGC	2	6	862017	862022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443847
18507	NC_011080	CTGGCG	2	12	862030	862041	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	194443847
18508	NC_011080	GC	3	6	862055	862060	0 %	0 %	50 %	50 %	194443847
18509	NC_011080	GCG	2	6	862068	862073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443847
18510	NC_011080	TGA	2	6	862082	862087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443847
18511	NC_011080	CCG	2	6	862111	862116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443847
18512	NC_011080	GGC	2	6	862132	862137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443847
18513	NC_011080	CCG	2	6	862169	862174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443847
18514	NC_011080	CGG	2	6	862271	862276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443847
18515	NC_011080	GCG	2	6	862281	862286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443847
18516	NC_011080	GGC	2	6	862299	862304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443847
18517	NC_011080	CAT	2	6	862317	862322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443847
18518	NC_011080	TGGC	2	8	862333	862340	0 %	25 %	50 %	25 %	194443847
18519	NC_011080	T	6	6	862446	862451	0 %	100 %	0 %	0 %	194443847
18520	NC_011080	GCT	2	6	862479	862484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443847
18521	NC_011080	TGC	2	6	862529	862534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18522	NC_011080	GGCGC	2	10	862540	862549	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
18523	NC_011080	CGC	2	6	862591	862596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18524	NC_011080	GCGA	2	8	862643	862650	25 %	0 %	50 %	25 %	194442547
18525	NC_011080	CGC	2	6	862680	862685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442547
18526	NC_011080	TCA	2	6	862694	862699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442547
18527	NC_011080	GGC	2	6	862763	862768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442547
18528	NC_011080	GCCGC	2	10	862769	862778	0 %	0 %	40 %	60 %	194442547
18529	NC_011080	CCA	2	6	862833	862838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194442547
18530	NC_011080	CG	3	6	862866	862871	0 %	0 %	50 %	50 %	194442547
18531	NC_011080	CCG	2	6	862875	862880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442547
18532	NC_011080	CAC	3	9	862888	862896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194442547
18533	NC_011080	CCA	2	6	862903	862908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194442547
18534	NC_011080	CGT	2	6	862974	862979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442547
18535	NC_011080	GCG	2	6	862992	862997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442547
18536	NC_011080	CAT	2	6	863010	863015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442547
18537	NC_011080	AGC	2	6	863125	863130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18538	NC_011080	A	6	6	863155	863160	100 %	0 %	0 %	0 %	194443157
18539	NC_011080	AAT	2	6	863221	863226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194443157
18540	NC_011080	GGC	2	6	863231	863236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443157
18541	NC_011080	CGA	2	6	863283	863288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443157
18542	NC_011080	GCC	2	6	863303	863308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443157
18543	NC_011080	ACC	2	6	863333	863338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443157
18544	NC_011080	CTG	2	6	863431	863436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443157
18545	NC_011080	CGC	2	6	863445	863450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443157
18546	NC_011080	CAG	2	6	863455	863460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443157
18547	NC_011080	GCC	2	6	863599	863604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443157
18548	NC_011080	CAG	2	6	863710	863715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443157
18549	NC_011080	GAT	2	6	863763	863768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443157
18550	NC_011080	AT	3	6	863767	863772	50 %	50 %	0 %	0 %	194443157
18551	NC_011080	CCCG	2	8	863779	863786	0 %	0 %	25 %	75 %	194443157
18552	NC_011080	CGG	2	6	863814	863819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443157
18553	NC_011080	CCAT	2	8	863885	863892	25 %	25 %	0 %	50 %	194443157
18554	NC_011080	GCG	2	6	863901	863906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443157
18555	NC_011080	CGC	2	6	864042	864047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443157
18556	NC_011080	GC	3	6	864046	864051	0 %	0 %	50 %	50 %	194443157
18557	NC_011080	AC	3	6	864119	864124	50 %	0 %	0 %	50 %	194443157
18558	NC_011080	GCC	2	6	864190	864195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443157
18559	NC_011080	ACATG	2	10	864198	864207	40 %	20 %	20 %	20 %	194443157
18560	NC_011080	CGC	2	6	864235	864240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443157
18561	NC_011080	GGT	2	6	864252	864257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443157
18562	NC_011080	GCC	2	6	864272	864277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443157
18563	NC_011080	AGG	2	6	864282	864287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194443157
18564	NC_011080	GCG	2	6	864366	864371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443157
18565	NC_011080	ACAA	2	8	864495	864502	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18566	NC_011080	CCAC	2	8	864530	864537	25 %	0 %	0 %	75 %	194445747
18567	NC_011080	ATT	2	6	864563	864568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194445747
18568	NC_011080	CTG	2	6	864579	864584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445747
18569	NC_011080	GCA	2	6	864602	864607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445747
18570	NC_011080	GCA	2	6	864632	864637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445747
18571	NC_011080	GCT	2	6	864653	864658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445747
18572	NC_011080	GGA	2	6	864683	864688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194445747
18573	NC_011080	GGA	2	6	864826	864831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194445747
18574	NC_011080	TAC	2	6	864966	864971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445747
18575	NC_011080	ATC	2	6	865011	865016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445747
18576	NC_011080	CGG	2	6	865088	865093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445747
18577	NC_011080	TGT	2	6	865135	865140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445747
18578	NC_011080	CCG	2	6	865164	865169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445747
18579	NC_011080	CGC	2	6	865210	865215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445747
18580	NC_011080	GC	3	6	865269	865274	0 %	0 %	50 %	50 %	194445747
18581	NC_011080	ATG	2	6	865278	865283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445747
18582	NC_011080	GCA	2	6	865457	865462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445747
18583	NC_011080	GGCG	2	8	865475	865482	0 %	0 %	75 %	25 %	194445747
18584	NC_011080	AGC	3	9	865489	865497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445747
18585	NC_011080	TGA	2	6	865516	865521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445747
18586	NC_011080	GAT	2	6	865533	865538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445747
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18588	NC_011080	CGA	2	6	865579	865584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446519
18589	NC_011080	GCC	2	6	865620	865625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446519
18590	NC_011080	GCTG	2	8	865653	865660	0 %	25 %	50 %	25 %	194446519
18591	NC_011080	ATT	2	6	865730	865735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446519
18592	NC_011080	GCG	2	6	865776	865781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446519
18593	NC_011080	CG	3	6	865859	865864	0 %	0 %	50 %	50 %	194446519
18594	NC_011080	CTG	2	6	865865	865870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446519
18595	NC_011080	GCG	2	6	865886	865891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446519
18596	NC_011080	A	8	8	865919	865926	100 %	0 %	0 %	0 %	194446519
18597	NC_011080	CTG	2	6	865964	865969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446519
18598	NC_011080	GCC	2	6	865973	865978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446519
18599	NC_011080	CGC	2	6	866000	866005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446519
18600	NC_011080	GCA	2	6	866023	866028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446519
18601	NC_011080	TGG	2	6	866070	866075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446519
18602	NC_011080	GC	3	6	866109	866114	0 %	0 %	50 %	50 %	194446519
18603	NC_011080	CAT	2	6	866147	866152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446519
18604	NC_011080	GTTG	2	8	866161	866168	0 %	50 %	50 %	0 %	194446519
18605	NC_011080	ATG	2	6	866169	866174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446519
18606	NC_011080	GAGGG	2	10	866201	866210	20 %	0 %	80 %	0 %	194446519
18607	NC_011080	CTG	2	6	866215	866220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446519
18608	NC_011080	G	6	6	866226	866231	0 %	0 %	100 %	0 %	194446519
18609	NC_011080	TGG	2	6	866247	866252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446519
18610	NC_011080	GCG	2	6	866280	866285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446519
18611	NC_011080	TGCTC	2	10	866292	866301	0 %	40 %	20 %	40 %	194446519
18612	NC_011080	CTG	2	6	866321	866326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446519
18613	NC_011080	GCC	2	6	866362	866367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446519
18614	NC_011080	CAGGCG	2	12	866372	866383	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	194446519
18615	NC_011080	CGC	2	6	866443	866448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446519
18616	NC_011080	CAA	2	6	866576	866581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446519
18617	NC_011080	CGCC	2	8	866603	866610	0 %	0 %	25 %	75 %	194446519
18618	NC_011080	GC	3	6	866630	866635	0 %	0 %	50 %	50 %	194446519
18619	NC_011080	TTAACG	2	12	866642	866653	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	194446519
18620	NC_011080	CTG	2	6	866684	866689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446519
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