MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 101857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_011080	ACA	2	6	748401	748406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194442673
16002	NC_011080	TCA	2	6	748416	748421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442673
16003	NC_011080	GGCGG	2	10	748510	748519	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
16004	NC_011080	ACA	2	6	748522	748527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16005	NC_011080	GCAG	2	8	748641	748648	25 %	0 %	50 %	25 %	194446341
16006	NC_011080	CCG	2	6	748683	748688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446341
16007	NC_011080	ATC	2	6	748727	748732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446341
16008	NC_011080	CTT	2	6	748734	748739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194446341
16009	NC_011080	CAG	2	6	748747	748752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446341
16010	NC_011080	AAG	2	6	748808	748813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194446341
16011	NC_011080	TACGGG	2	12	748854	748865	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	194446341
16012	NC_011080	CGT	2	6	748905	748910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446341
16013	NC_011080	CGC	2	6	748917	748922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446341
16014	NC_011080	T	6	6	748956	748961	0 %	100 %	0 %	0 %	194446341
16015	NC_011080	CTG	2	6	749025	749030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446341
16016	NC_011080	GCG	2	6	749193	749198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446341
16017	NC_011080	GCC	2	6	749200	749205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446341
16018	NC_011080	CGG	2	6	749235	749240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446341
16019	NC_011080	TTC	2	6	749328	749333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194446341
16020	NC_011080	AAT	2	6	749339	749344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16021	NC_011080	T	6	6	749416	749421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16022	NC_011080	TGG	2	6	749458	749463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16023	NC_011080	A	6	6	749496	749501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16024	NC_011080	AATT	2	8	749524	749531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16025	NC_011080	CA	3	6	749535	749540	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16026	NC_011080	AGA	2	6	749547	749552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16027	NC_011080	GCA	2	6	749596	749601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16028	NC_011080	A	6	6	749606	749611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16029	NC_011080	AAG	2	6	749620	749625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16030	NC_011080	T	6	6	749669	749674	0 %	100 %	0 %	0 %	194444609
16031	NC_011080	GTT	2	6	749729	749734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444609
16032	NC_011080	GCGG	2	8	749784	749791	0 %	0 %	75 %	25 %	194444609
16033	NC_011080	ATT	2	6	749958	749963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444609
16034	NC_011080	CGG	2	6	749975	749980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444609
16035	NC_011080	TTC	2	6	750030	750035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194444609
16036	NC_011080	TCTG	2	8	750073	750080	0 %	50 %	25 %	25 %	194444609
16037	NC_011080	GCC	2	6	750110	750115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444609
16038	NC_011080	GCGG	2	8	750135	750142	0 %	0 %	75 %	25 %	194444609
16039	NC_011080	GC	3	6	750163	750168	0 %	0 %	50 %	50 %	194444609
16040	NC_011080	TCA	2	6	750190	750195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444609
16041	NC_011080	CTG	2	6	750201	750206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444609
16042	NC_011080	ACGGC	2	10	750322	750331	20 %	0 %	40 %	40 %	194444609
16043	NC_011080	CTT	2	6	750350	750355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194444609
16044	NC_011080	ATG	2	6	750363	750368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444609
16045	NC_011080	CGC	2	6	750404	750409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444609
16046	NC_011080	CGT	2	6	750420	750425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444609
16047	NC_011080	CGG	2	6	750434	750439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444609
16048	NC_011080	TGC	2	6	750442	750447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444609
16049	NC_011080	TGTC	2	8	750448	750455	0 %	50 %	25 %	25 %	194444609
16050	NC_011080	GCT	2	6	750521	750526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444609
16051	NC_011080	CCT	2	6	750530	750535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194444609
16052	NC_011080	TCG	2	6	750565	750570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444609
16053	NC_011080	ATC	2	6	750699	750704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444609
16054	NC_011080	CTG	2	6	750711	750716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444609
16055	NC_011080	TGA	2	6	750773	750778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444609
16056	NC_011080	GAA	2	6	750789	750794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444609
16057	NC_011080	GAA	2	6	750810	750815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444609
16058	NC_011080	TGC	2	6	750845	750850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444609
16059	NC_011080	CGAT	2	8	750877	750884	25 %	25 %	25 %	25 %	194444609
16060	NC_011080	GTG	2	6	750969	750974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444609
16061	NC_011080	AACA	2	8	750981	750988	75 %	0 %	0 %	25 %	194444609
16062	NC_011080	ATGAA	2	10	751033	751042	60 %	20 %	20 %	0 %	194444609
16063	NC_011080	GTG	2	6	751047	751052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444609
16064	NC_011080	CTG	2	6	751078	751083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444609
16065	NC_011080	CGG	2	6	751111	751116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444609
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16067	NC_011080	CGG	3	9	751279	751287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444609
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16069	NC_011080	CGG	2	6	751435	751440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444609
16070	NC_011080	CG	3	6	751484	751489	0 %	0 %	50 %	50 %	194444609
16071	NC_011080	GTT	2	6	751506	751511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444609
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16076	NC_011080	T	8	8	751690	751697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16077	NC_011080	GTT	2	6	751792	751797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16078	NC_011080	TGAG	2	8	751819	751826	25 %	25 %	50 %	0 %	194446155
16079	NC_011080	GCCC	2	8	751833	751840	0 %	0 %	25 %	75 %	194446155
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16089	NC_011080	A	6	6	752293	752298	100 %	0 %	0 %	0 %	194446155
16090	NC_011080	CGG	2	6	752306	752311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446155
16091	NC_011080	GC	3	6	752336	752341	0 %	0 %	50 %	50 %	194446155
16092	NC_011080	CAT	2	6	752412	752417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446155
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16100	NC_011080	CGCGC	2	10	752834	752843	0 %	0 %	40 %	60 %	194446155
16101	NC_011080	GATC	2	8	752981	752988	25 %	25 %	25 %	25 %	194446155
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16108	NC_011080	GGA	2	6	753275	753280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194446155
16109	NC_011080	CTGT	2	8	753285	753292	0 %	50 %	25 %	25 %	194446155
16110	NC_011080	GCG	2	6	753348	753353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446155
16111	NC_011080	CGC	2	6	753528	753533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16112	NC_011080	GCG	2	6	753539	753544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16113	NC_011080	T	6	6	753545	753550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16114	NC_011080	CGC	2	6	753643	753648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16115	NC_011080	GCG	2	6	753651	753656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16116	NC_011080	TAC	2	6	753692	753697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16117	NC_011080	GC	3	6	753716	753721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16118	NC_011080	TGG	2	6	753756	753761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16119	NC_011080	T	6	6	753784	753789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16120	NC_011080	AATT	2	8	753798	753805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16121	NC_011080	ATT	2	6	753817	753822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16123	NC_011080	ATT	2	6	753879	753884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16488	NC_011080	CGC	2	6	770871	770876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16491	NC_011080	AAT	2	6	770935	770940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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