MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 101857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_011080	TGAG	2	8	724389	724396	25 %	25 %	50 %	0 %	194446274
15502	NC_011080	TGT	2	6	724422	724427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194446274
15503	NC_011080	GAG	2	6	724457	724462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194446274
15504	NC_011080	GGGC	2	8	724553	724560	0 %	0 %	75 %	25 %	194446274
15505	NC_011080	GAC	2	6	724612	724617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446274
15506	NC_011080	GGA	2	6	724636	724641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194446274
15507	NC_011080	GGC	3	9	724646	724654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446274
15508	NC_011080	TATT	2	8	724686	724693	25 %	75 %	0 %	0 %	194446274
15509	NC_011080	GAA	2	6	724753	724758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194442720
15510	NC_011080	TA	3	6	724799	724804	50 %	50 %	0 %	0 %	194442720
15511	NC_011080	CTG	2	6	724853	724858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442720
15512	NC_011080	TC	3	6	724863	724868	0 %	50 %	0 %	50 %	194442720
15513	NC_011080	GACG	2	8	724923	724930	25 %	0 %	50 %	25 %	194442720
15514	NC_011080	TTG	2	6	725045	725050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194442720
15515	NC_011080	TGC	2	6	725065	725070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442720
15516	NC_011080	GGC	2	6	725077	725082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442720
15517	NC_011080	ACG	2	6	725207	725212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442720
15518	NC_011080	GCC	2	6	725230	725235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442720
15519	NC_011080	ACG	2	6	725306	725311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442720
15520	NC_011080	GC	3	6	725318	725323	0 %	0 %	50 %	50 %	194442720
15521	NC_011080	AG	3	6	725352	725357	50 %	0 %	50 %	0 %	194442720
15522	NC_011080	TTA	2	6	725358	725363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194442720
15523	NC_011080	AAC	2	6	725393	725398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194442720
15524	NC_011080	CAC	2	6	725471	725476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443222
15525	NC_011080	GAA	2	6	725574	725579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443222
15526	NC_011080	GCA	2	6	725582	725587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443222
15527	NC_011080	GCC	2	6	725592	725597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443222
15528	NC_011080	GGA	2	6	725606	725611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194443222
15529	NC_011080	CGA	2	6	725633	725638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443222
15530	NC_011080	TGG	2	6	725650	725655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443222
15531	NC_011080	GATA	2	8	725750	725757	50 %	25 %	25 %	0 %	194443222
15532	NC_011080	TTG	2	6	725823	725828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443222
15533	NC_011080	GAT	2	6	725865	725870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443222
15534	NC_011080	TTG	2	6	725956	725961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443222
15535	NC_011080	T	6	6	725985	725990	0 %	100 %	0 %	0 %	194443222
15536	NC_011080	GAT	2	6	726069	726074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443222
15537	NC_011080	TCG	2	6	726149	726154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443222
15538	NC_011080	GAC	2	6	726288	726293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443222
15539	NC_011080	GCTGG	2	10	726299	726308	0 %	20 %	60 %	20 %	194443222
15540	NC_011080	GCC	2	6	726310	726315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443222
15541	NC_011080	TTC	2	6	726330	726335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443222
15542	NC_011080	GC	3	6	726360	726365	0 %	0 %	50 %	50 %	194443222
15543	NC_011080	GC	4	8	726400	726407	0 %	0 %	50 %	50 %	194443222
15544	NC_011080	TTG	2	6	726469	726474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443222
15545	NC_011080	CGC	2	6	726547	726552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443222
15546	NC_011080	CGG	2	6	726571	726576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443222
15547	NC_011080	GGT	2	6	726581	726586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443222
15548	NC_011080	T	6	6	726615	726620	0 %	100 %	0 %	0 %	194443222
15549	NC_011080	CTG	2	6	726624	726629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443222
15550	NC_011080	GGA	2	6	726638	726643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194443222
15551	NC_011080	TCA	2	6	726687	726692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443222
15552	NC_011080	GGC	2	6	726755	726760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443222
15553	NC_011080	AGA	2	6	726767	726772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443222
15554	NC_011080	A	6	6	726774	726779	100 %	0 %	0 %	0 %	194443222
15555	NC_011080	TCT	2	6	726783	726788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443222
15556	NC_011080	TGA	2	6	726832	726837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443222
15557	NC_011080	TTC	2	6	726891	726896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443222
15558	NC_011080	T	6	6	726899	726904	0 %	100 %	0 %	0 %	194443222
15559	NC_011080	CAG	2	6	727011	727016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442969
15560	NC_011080	CGC	2	6	727017	727022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442969
15561	NC_011080	TAA	2	6	727034	727039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442969
15562	NC_011080	CG	3	6	727071	727076	0 %	0 %	50 %	50 %	194442969
15563	NC_011080	CTC	2	6	727086	727091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194442969
15564	NC_011080	TGC	2	6	727177	727182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442969
15565	NC_011080	GTC	2	6	727183	727188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442969
15566	NC_011080	TGA	2	6	727208	727213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442969
15567	NC_011080	CAG	2	6	727239	727244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442969
15568	NC_011080	CAG	2	6	727257	727262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442969
15569	NC_011080	ATT	2	6	727350	727355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194442969
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15571	NC_011080	GGT	2	6	727452	727457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442969
15572	NC_011080	ATG	2	6	727468	727473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442969
15573	NC_011080	CTT	2	6	727550	727555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194442969
15574	NC_011080	GGC	2	6	727581	727586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442969
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15578	NC_011080	CGC	2	6	728000	728005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442969
15579	NC_011080	GCGTA	2	10	728048	728057	20 %	20 %	40 %	20 %	194442969
15580	NC_011080	C	6	6	728086	728091	0 %	0 %	0 %	100 %	194442969
15581	NC_011080	TGC	2	6	728119	728124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442969
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15583	NC_011080	GCT	2	6	728222	728227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442969
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15585	NC_011080	GCT	2	6	728273	728278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442969
15586	NC_011080	TCT	2	6	728296	728301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194442969
15587	NC_011080	AGCG	2	8	728305	728312	25 %	0 %	50 %	25 %	194442969
15588	NC_011080	CCA	2	6	728450	728455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194442969
15589	NC_011080	ATGG	2	8	728485	728492	25 %	25 %	50 %	0 %	194442969
15590	NC_011080	TTA	2	6	728512	728517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194442969
15591	NC_011080	TGG	2	6	728564	728569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442969
15592	NC_011080	AG	3	6	728630	728635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15593	NC_011080	ACC	2	6	728653	728658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15594	NC_011080	GTG	2	6	728666	728671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15595	NC_011080	ATA	2	6	728710	728715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194443581
15596	NC_011080	TCA	2	6	728740	728745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443581
15597	NC_011080	A	6	6	728764	728769	100 %	0 %	0 %	0 %	194443581
15598	NC_011080	GCGT	2	8	728783	728790	0 %	25 %	50 %	25 %	194443581
15599	NC_011080	AAACG	2	10	728803	728812	60 %	0 %	20 %	20 %	194443581
15600	NC_011080	ATCA	2	8	728865	728872	50 %	25 %	0 %	25 %	194443581
15601	NC_011080	GC	3	6	728897	728902	0 %	0 %	50 %	50 %	194443581
15602	NC_011080	CGG	2	6	728912	728917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443581
15603	NC_011080	GGCC	2	8	728960	728967	0 %	0 %	50 %	50 %	194443581
15604	NC_011080	AAT	2	6	728988	728993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194443581
15605	NC_011080	GAGTA	2	10	729083	729092	40 %	20 %	40 %	0 %	194443581
15606	NC_011080	TCC	2	6	729094	729099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194443581
15607	NC_011080	GCG	2	6	729144	729149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443581
15608	NC_011080	CTT	2	6	729161	729166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443581
15609	NC_011080	GC	4	8	729171	729178	0 %	0 %	50 %	50 %	194443581
15610	NC_011080	GGCT	2	8	729232	729239	0 %	25 %	50 %	25 %	194443581
15611	NC_011080	GGCC	2	8	729259	729266	0 %	0 %	50 %	50 %	194443581
15612	NC_011080	GCG	3	9	729274	729282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443581
15613	NC_011080	TCAT	2	8	729325	729332	25 %	50 %	0 %	25 %	194443581
15614	NC_011080	CT	3	6	729352	729357	0 %	50 %	0 %	50 %	194443581
15615	NC_011080	CTGGC	2	10	729408	729417	0 %	20 %	40 %	40 %	194443581
15616	NC_011080	A	6	6	729421	729426	100 %	0 %	0 %	0 %	194443581
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15618	NC_011080	A	6	6	729520	729525	100 %	0 %	0 %	0 %	194443581
15619	NC_011080	TTC	2	6	729558	729563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443581
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15621	NC_011080	GCG	2	6	729676	729681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443581
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15742	NC_011080	CGAA	2	8	735259	735266	50 %	0 %	25 %	25 %	194442405
15743	NC_011080	GCT	2	6	735273	735278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442405
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15849	NC_011080	CAG	2	6	740231	740236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446753
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15851	NC_011080	TGAC	2	8	740383	740390	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15852	NC_011080	A	6	6	740407	740412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15853	NC_011080	ATGA	2	8	740442	740449	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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15857	NC_011080	CGCTGG	2	12	740507	740518	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	194446092
15858	NC_011080	GCA	2	6	740526	740531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446092
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15984	NC_011080	CTG	2	6	747106	747111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442984
15985	NC_011080	CTT	2	6	747117	747122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194442984
15986	NC_011080	GCA	2	6	747472	747477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442673
15987	NC_011080	CA	4	8	747569	747576	50 %	0 %	0 %	50 %	194442673
15988	NC_011080	GTA	2	6	747587	747592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442673
15989	NC_011080	CGGTG	2	10	747638	747647	0 %	20 %	60 %	20 %	194442673
15990	NC_011080	CGC	2	6	747736	747741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442673
15991	NC_011080	AATA	2	8	747742	747749	75 %	25 %	0 %	0 %	194442673
15992	NC_011080	GGCA	2	8	747935	747942	25 %	0 %	50 %	25 %	194442673
15993	NC_011080	TGA	2	6	747970	747975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442673
15994	NC_011080	CAGCG	2	10	748004	748013	20 %	0 %	40 %	40 %	194442673
15995	NC_011080	T	7	7	748049	748055	0 %	100 %	0 %	0 %	194442673
15996	NC_011080	TCA	2	6	748147	748152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442673
15997	NC_011080	CGC	3	9	748273	748281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442673
15998	NC_011080	GA	3	6	748314	748319	50 %	0 %	50 %	0 %	194442673
15999	NC_011080	GTT	2	6	748339	748344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194442673
16000	NC_011080	CGG	2	6	748352	748357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442673

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