MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 101857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_011080	AT	3	6	701707	701712	50 %	50 %	0 %	0 %	194443733
15003	NC_011080	ATT	2	6	701724	701729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443733
15004	NC_011080	CTTC	2	8	701786	701793	0 %	50 %	0 %	50 %	194443733
15005	NC_011080	AGC	2	6	701897	701902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443733
15006	NC_011080	TTTTC	2	10	701933	701942	0 %	80 %	0 %	20 %	194443733
15007	NC_011080	GC	3	6	701968	701973	0 %	0 %	50 %	50 %	194443733
15008	NC_011080	CAGC	2	8	701996	702003	25 %	0 %	25 %	50 %	194443733
15009	NC_011080	CAC	2	6	702009	702014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443733
15010	NC_011080	CACG	2	8	702041	702048	25 %	0 %	25 %	50 %	194443733
15011	NC_011080	CGT	2	6	702058	702063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443733
15012	NC_011080	TCC	2	6	702120	702125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194443733
15013	NC_011080	AT	3	6	702164	702169	50 %	50 %	0 %	0 %	194443733
15014	NC_011080	CAAC	2	8	702215	702222	50 %	0 %	0 %	50 %	194443733
15015	NC_011080	TCA	2	6	702229	702234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443733
15016	NC_011080	GA	3	6	702278	702283	50 %	0 %	50 %	0 %	194443733
15017	NC_011080	A	6	6	702361	702366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15018	NC_011080	TTC	2	6	702474	702479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194444385
15019	NC_011080	TGC	2	6	702548	702553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444385
15020	NC_011080	ACC	2	6	702607	702612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444385
15021	NC_011080	GTAA	2	8	702651	702658	50 %	25 %	25 %	0 %	194444385
15022	NC_011080	A	8	8	702721	702728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15023	NC_011080	AAC	2	6	702730	702735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15024	NC_011080	TTAAT	2	10	702833	702842	40 %	60 %	0 %	0 %	194442745
15025	NC_011080	GAA	2	6	702861	702866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194442745
15026	NC_011080	GCT	2	6	702905	702910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442745
15027	NC_011080	GCG	2	6	702968	702973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442745
15028	NC_011080	CAG	2	6	703167	703172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442745
15029	NC_011080	T	6	6	703173	703178	0 %	100 %	0 %	0 %	194442745
15030	NC_011080	CGG	2	6	703220	703225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442745
15031	NC_011080	CAG	2	6	703329	703334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442745
15032	NC_011080	TCA	2	6	703535	703540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442745
15033	NC_011080	CGA	2	6	703544	703549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442745
15034	NC_011080	CGG	2	6	703565	703570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442745
15035	NC_011080	CA	3	6	703587	703592	50 %	0 %	0 %	50 %	194442745
15036	NC_011080	GA	3	6	703634	703639	50 %	0 %	50 %	0 %	194442745
15037	NC_011080	TCA	2	6	703787	703792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442745
15038	NC_011080	TCG	2	6	703822	703827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442745
15039	NC_011080	GTG	2	6	703972	703977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442745
15040	NC_011080	ACG	2	6	704032	704037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15041	NC_011080	TGA	2	6	704042	704047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15042	NC_011080	A	7	7	704052	704058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15043	NC_011080	CTA	2	6	704064	704069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15044	NC_011080	GGCA	2	8	704086	704093	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15045	NC_011080	GC	3	6	704166	704171	0 %	0 %	50 %	50 %	194442270
15046	NC_011080	CTG	2	6	704308	704313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442270
15047	NC_011080	CTG	2	6	704332	704337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442270
15048	NC_011080	CG	4	8	704338	704345	0 %	0 %	50 %	50 %	194442270
15049	NC_011080	GAC	2	6	704371	704376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442270
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15051	NC_011080	GC	3	6	704403	704408	0 %	0 %	50 %	50 %	194442270
15052	NC_011080	CGG	2	6	704433	704438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442270
15053	NC_011080	GC	3	6	704442	704447	0 %	0 %	50 %	50 %	194442270
15054	NC_011080	GCC	2	6	704471	704476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442270
15055	NC_011080	GCTG	2	8	704495	704502	0 %	25 %	50 %	25 %	194442270
15056	NC_011080	GC	3	6	704556	704561	0 %	0 %	50 %	50 %	194442270
15057	NC_011080	GCT	3	9	704572	704580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442270
15058	NC_011080	GC	3	6	704586	704591	0 %	0 %	50 %	50 %	194442270
15059	NC_011080	GGT	2	6	704593	704598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442270
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15063	NC_011080	CGT	2	6	704731	704736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442270
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15065	NC_011080	TAT	2	6	704805	704810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194442270
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15074	NC_011080	GCG	2	6	705195	705200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442270
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15081	NC_011080	GCCA	2	8	705494	705501	25 %	0 %	25 %	50 %	194445742
15082	NC_011080	GGC	2	6	705530	705535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445742
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15094	NC_011080	GC	3	6	706120	706125	0 %	0 %	50 %	50 %	194445742
15095	NC_011080	CAG	2	6	706160	706165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445742
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15111	NC_011080	GCCGT	2	10	706733	706742	0 %	20 %	40 %	40 %	194445890
15112	NC_011080	CGG	2	6	706813	706818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445890
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15364	NC_011080	GCT	2	6	718721	718726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444287
15365	NC_011080	CGG	3	9	718756	718764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444287
15366	NC_011080	GGC	2	6	718772	718777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444287
15367	NC_011080	CGA	2	6	718780	718785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444287
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15370	NC_011080	GCC	2	6	718857	718862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444287
15371	NC_011080	CGG	2	6	718880	718885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15372	NC_011080	ACG	2	6	718896	718901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15413	NC_011080	TGA	2	6	720961	720966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444738
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15453	NC_011080	TAT	2	6	722591	722596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15472	NC_011080	GGT	2	6	723475	723480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446274
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15483	NC_011080	ATG	2	6	723855	723860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446274
15484	NC_011080	ACA	2	6	723867	723872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446274
15485	NC_011080	CT	3	6	723888	723893	0 %	50 %	0 %	50 %	194446274
15486	NC_011080	ACG	2	6	723955	723960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446274
15487	NC_011080	GCT	2	6	724003	724008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446274
15488	NC_011080	TGGCA	2	10	724020	724029	20 %	20 %	40 %	20 %	194446274
15489	NC_011080	AACGC	2	10	724046	724055	40 %	0 %	20 %	40 %	194446274
15490	NC_011080	TTA	2	6	724060	724065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446274
15491	NC_011080	CTG	2	6	724106	724111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446274
15492	NC_011080	GTG	2	6	724129	724134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446274
15493	NC_011080	TGC	2	6	724167	724172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446274
15494	NC_011080	GCT	2	6	724207	724212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446274
15495	NC_011080	GCT	2	6	724261	724266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446274
15496	NC_011080	TGCT	2	8	724295	724302	0 %	50 %	25 %	25 %	194446274
15497	NC_011080	GCG	2	6	724323	724328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446274
15498	NC_011080	CGC	2	6	724335	724340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446274
15499	NC_011080	GCG	2	6	724360	724365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446274
15500	NC_011080	GC	3	6	724377	724382	0 %	0 %	50 %	50 %	194446274

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