MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 101857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14502	NC_011080	A	6	6	679502	679507	100 %	0 %	0 %	0 %	194446791
14503	NC_011080	TGG	2	6	679527	679532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446791
14504	NC_011080	TTC	2	6	679547	679552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194446791
14505	NC_011080	TGC	2	6	679581	679586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446791
14506	NC_011080	ACC	2	6	679592	679597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446791
14507	NC_011080	CTT	2	6	679623	679628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194446791
14508	NC_011080	ACT	2	6	679635	679640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446791
14509	NC_011080	TAA	2	6	679726	679731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194446791
14510	NC_011080	GCTG	2	8	679779	679786	0 %	25 %	50 %	25 %	194446791
14511	NC_011080	ACG	2	6	679800	679805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446791
14512	NC_011080	CTG	2	6	679844	679849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446791
14513	NC_011080	A	6	6	679859	679864	100 %	0 %	0 %	0 %	194446791
14514	NC_011080	GCC	2	6	679883	679888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446791
14515	NC_011080	CGC	2	6	680022	680027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446791
14516	NC_011080	CTGGA	2	10	680063	680072	20 %	20 %	40 %	20 %	194446791
14517	NC_011080	CGTT	2	8	680094	680101	0 %	50 %	25 %	25 %	194446791
14518	NC_011080	ATCC	2	8	680105	680112	25 %	25 %	0 %	50 %	194446791
14519	NC_011080	TTC	2	6	680113	680118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194446791
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14522	NC_011080	CGT	2	6	680275	680280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446791
14523	NC_011080	CTG	2	6	680292	680297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446791
14524	NC_011080	TGA	2	6	680307	680312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446791
14525	NC_011080	GC	3	6	680319	680324	0 %	0 %	50 %	50 %	194446791
14526	NC_011080	CAGT	2	8	680341	680348	25 %	25 %	25 %	25 %	194446791
14527	NC_011080	CGC	2	6	680586	680591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444851
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14530	NC_011080	GCGT	2	8	680776	680783	0 %	25 %	50 %	25 %	194444851
14531	NC_011080	GC	3	6	680914	680919	0 %	0 %	50 %	50 %	194444851
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14535	NC_011080	TGTC	2	8	680995	681002	0 %	50 %	25 %	25 %	194446121
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14538	NC_011080	ATG	2	6	681142	681147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446121
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14543	NC_011080	T	6	6	681360	681365	0 %	100 %	0 %	0 %	194446121
14544	NC_011080	GCG	2	6	681390	681395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446121
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14546	NC_011080	TCG	2	6	681634	681639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446121
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14548	NC_011080	GAT	2	6	681715	681720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14549	NC_011080	GCC	2	6	681771	681776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14550	NC_011080	CAC	2	6	681817	681822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448967508
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14552	NC_011080	TTC	2	6	681901	681906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448967508
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14555	NC_011080	TTC	2	6	682030	682035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448967508
14556	NC_011080	CGG	2	6	682050	682055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448967508
14557	NC_011080	ATGA	2	8	682105	682112	50 %	25 %	25 %	0 %	448967508
14558	NC_011080	ATA	2	6	682253	682258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14559	NC_011080	TTTC	2	8	682262	682269	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14560	NC_011080	A	6	6	682314	682319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14561	NC_011080	GCC	2	6	682349	682354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14562	NC_011080	TC	3	6	682369	682374	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14563	NC_011080	AGC	2	6	682499	682504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444708
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14617	NC_011080	A	6	6	685254	685259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14618	NC_011080	CAT	2	6	685284	685289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14742	NC_011080	GC	3	6	690518	690523	0 %	0 %	50 %	50 %	194446423
14743	NC_011080	CGC	2	6	690608	690613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446423
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14984	NC_011080	GCA	2	6	700951	700956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442555
14985	NC_011080	AAT	2	6	700991	700996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442555
14986	NC_011080	GC	3	6	701008	701013	0 %	0 %	50 %	50 %	194442555
14987	NC_011080	CGT	2	6	701024	701029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442555
14988	NC_011080	CGT	2	6	701135	701140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442555
14989	NC_011080	ATT	2	6	701381	701386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194442555
14990	NC_011080	TCAC	2	8	701388	701395	25 %	25 %	0 %	50 %	194442555
14991	NC_011080	ATTC	2	8	701409	701416	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14992	NC_011080	TAT	2	6	701418	701423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14993	NC_011080	AAT	2	6	701425	701430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14994	NC_011080	ATAAG	2	10	701505	701514	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14995	NC_011080	TCA	2	6	701552	701557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14997	NC_011080	GGC	2	6	701584	701589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14998	NC_011080	CAG	2	6	701592	701597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14999	NC_011080	G	6	6	701622	701627	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15000	NC_011080	AT	3	6	701648	701653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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