MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 101857

< Previous12...2425262728293031323334...203204Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_011080	GC	3	6	657023	657028	0 %	0 %	50 %	50 %	194444009
14002	NC_011080	GAC	2	6	657042	657047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444009
14003	NC_011080	GAC	2	6	657077	657082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444009
14004	NC_011080	AAT	2	6	657084	657089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194444009
14005	NC_011080	AGC	2	6	657100	657105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444009
14006	NC_011080	GGT	2	6	657146	657151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444009
14007	NC_011080	CCA	2	6	657158	657163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444009
14008	NC_011080	CAT	2	6	657183	657188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444009
14009	NC_011080	GC	3	6	657273	657278	0 %	0 %	50 %	50 %	194444009
14010	NC_011080	GCGCGA	2	12	657377	657388	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	194444009
14011	NC_011080	GAAGC	2	10	657435	657444	40 %	0 %	40 %	20 %	194444009
14012	NC_011080	CGCC	2	8	657515	657522	0 %	0 %	25 %	75 %	194444009
14013	NC_011080	GCC	3	9	657549	657557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444009
14014	NC_011080	GCGAT	2	10	657584	657593	20 %	20 %	40 %	20 %	194444009
14015	NC_011080	GC	3	6	657596	657601	0 %	0 %	50 %	50 %	194444009
14016	NC_011080	GCG	2	6	657629	657634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444009
14017	NC_011080	GCGCC	2	10	657650	657659	0 %	0 %	40 %	60 %	194444009
14018	NC_011080	GTT	2	6	657684	657689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444009
14019	NC_011080	CGC	2	6	657764	657769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444009
14020	NC_011080	CGG	4	12	657863	657874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444009
14021	NC_011080	TAA	2	6	657924	657929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194444009
14022	NC_011080	CAA	2	6	657930	657935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194444009
14023	NC_011080	CG	4	8	657951	657958	0 %	0 %	50 %	50 %	194444009
14024	NC_011080	TATC	2	8	658014	658021	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14025	NC_011080	A	7	7	658065	658071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14026	NC_011080	GCT	2	6	658108	658113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444324
14027	NC_011080	GCT	2	6	658192	658197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444324
14028	NC_011080	TGGCG	2	10	658198	658207	0 %	20 %	60 %	20 %	194444324
14029	NC_011080	ATG	2	6	658226	658231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444324
14030	NC_011080	CGG	2	6	658273	658278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444324
14031	NC_011080	TGG	2	6	658299	658304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444324
14032	NC_011080	CTG	2	6	658346	658351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444324
14033	NC_011080	GC	3	6	658352	658357	0 %	0 %	50 %	50 %	194444324
14034	NC_011080	GCT	2	6	658399	658404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444324
14035	NC_011080	AT	3	6	658427	658432	50 %	50 %	0 %	0 %	194444324
14036	NC_011080	GGC	2	6	658486	658491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444324
14037	NC_011080	G	6	6	658585	658590	0 %	0 %	100 %	0 %	194444324
14038	NC_011080	TTGC	2	8	658595	658602	0 %	50 %	25 %	25 %	194444324
14039	NC_011080	GCG	3	9	658605	658613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444324
14040	NC_011080	GGC	2	6	658633	658638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444324
14041	NC_011080	TTA	2	6	658650	658655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444324
14042	NC_011080	TCC	2	6	658693	658698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194444324
14043	NC_011080	GGC	2	6	658732	658737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444324
14044	NC_011080	T	6	6	658744	658749	0 %	100 %	0 %	0 %	194444324
14045	NC_011080	CGG	2	6	658768	658773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444324
14046	NC_011080	GCT	2	6	658780	658785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444324
14047	NC_011080	CGG	2	6	658857	658862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444324
14048	NC_011080	GGC	2	6	658900	658905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444324
14049	NC_011080	GC	3	6	658911	658916	0 %	0 %	50 %	50 %	194444324
14050	NC_011080	CAT	2	6	659008	659013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444324
14051	NC_011080	TCTG	2	8	659037	659044	0 %	50 %	25 %	25 %	194444324
14052	NC_011080	TGGC	2	8	659053	659060	0 %	25 %	50 %	25 %	194444324
14053	NC_011080	TTA	2	6	659078	659083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444324
14054	NC_011080	CTG	2	6	659093	659098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444324
14055	NC_011080	CGGCG	2	10	659176	659185	0 %	0 %	60 %	40 %	194444324
14056	NC_011080	ATG	2	6	659207	659212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444324
14057	NC_011080	TGC	2	6	659268	659273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444324
14058	NC_011080	CGC	2	6	659310	659315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444324
14059	NC_011080	GCTG	2	8	659327	659334	0 %	25 %	50 %	25 %	194444324
14060	NC_011080	TCTG	2	8	659364	659371	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14061	NC_011080	GGC	2	6	659407	659412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446134
14062	NC_011080	CAA	2	6	659425	659430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446134
14063	NC_011080	TAA	2	6	659441	659446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194446134
14064	NC_011080	CAG	2	6	659512	659517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446134
14065	NC_011080	TGT	2	6	659547	659552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194446134
14066	NC_011080	CGG	2	6	659589	659594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446134
14067	NC_011080	GC	3	6	659766	659771	0 %	0 %	50 %	50 %	194446134
14068	NC_011080	GCG	2	6	659781	659786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446134
14069	NC_011080	CGT	2	6	659809	659814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446134
14070	NC_011080	CG	3	6	659840	659845	0 %	0 %	50 %	50 %	194446134
14071	NC_011080	TGA	2	6	659919	659924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446134
14072	NC_011080	CGC	2	6	659976	659981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446134
14073	NC_011080	GCG	2	6	660017	660022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446134
14074	NC_011080	TCG	2	6	660110	660115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446134
14075	NC_011080	CGA	2	6	660150	660155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446134
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14077	NC_011080	CG	3	6	660212	660217	0 %	0 %	50 %	50 %	194446134
14078	NC_011080	CGC	2	6	660240	660245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446134
14079	NC_011080	ACCA	2	8	660310	660317	50 %	0 %	0 %	50 %	194446134
14080	NC_011080	AGC	2	6	660323	660328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446134
14081	NC_011080	TTA	2	6	660367	660372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14082	NC_011080	CAG	3	9	660401	660409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14083	NC_011080	ATA	2	6	660497	660502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14084	NC_011080	ATT	2	6	660506	660511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14085	NC_011080	AAG	2	6	660528	660533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14086	NC_011080	GAA	2	6	660550	660555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14087	NC_011080	TG	3	6	660577	660582	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14088	NC_011080	CAA	2	6	660604	660609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14089	NC_011080	TA	3	6	660634	660639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14090	NC_011080	GGA	2	6	660653	660658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14091	NC_011080	GATATG	2	12	660660	660671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443319
14092	NC_011080	TTC	2	6	660726	660731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443319
14093	NC_011080	CAG	2	6	660822	660827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443319
14094	NC_011080	CAG	2	6	660837	660842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443319
14095	NC_011080	TGG	2	6	660883	660888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443319
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14098	NC_011080	TGACGG	2	12	661006	661017	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	194443319
14099	NC_011080	CG	3	6	661065	661070	0 %	0 %	50 %	50 %	194443319
14100	NC_011080	CGCCA	2	10	661082	661091	20 %	0 %	20 %	60 %	194443319
14101	NC_011080	GTG	2	6	661104	661109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443319
14102	NC_011080	GATA	2	8	661121	661128	50 %	25 %	25 %	0 %	194443319
14103	NC_011080	CAC	2	6	661130	661135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443319
14104	NC_011080	AGTT	2	8	661190	661197	25 %	50 %	25 %	0 %	194443319
14105	NC_011080	GGC	2	6	661224	661229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443319
14106	NC_011080	CTG	2	6	661233	661238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443319
14107	NC_011080	TGC	2	6	661255	661260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443319
14108	NC_011080	CTG	2	6	661356	661361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443319
14109	NC_011080	GCA	2	6	661429	661434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443319
14110	NC_011080	CAC	2	6	661469	661474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443319
14111	NC_011080	CTG	2	6	661551	661556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443319
14112	NC_011080	TCA	2	6	661586	661591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443319
14113	NC_011080	GGC	2	6	661644	661649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443319
14114	NC_011080	CT	3	6	661803	661808	0 %	50 %	0 %	50 %	194443319
14115	NC_011080	GAT	2	6	661844	661849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444600
14116	NC_011080	CCG	2	6	661886	661891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444600
14117	NC_011080	CGG	2	6	661966	661971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444600
14118	NC_011080	GC	3	6	661985	661990	0 %	0 %	50 %	50 %	194444600
14119	NC_011080	GGA	2	6	662252	662257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194444600
14120	NC_011080	GTG	2	6	662298	662303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444600
14121	NC_011080	ACG	3	9	662314	662322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444600
14122	NC_011080	GGC	2	6	662354	662359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444600
14123	NC_011080	CGCCA	2	10	662372	662381	20 %	0 %	20 %	60 %	194444600
14124	NC_011080	CTG	2	6	662386	662391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444600
14125	NC_011080	CGG	2	6	662417	662422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444600
14126	NC_011080	TAC	2	6	662423	662428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444600
14127	NC_011080	TAC	2	6	662469	662474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444600
14128	NC_011080	GCA	2	6	662485	662490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444600
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14130	NC_011080	CGC	2	6	662540	662545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444600
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14132	NC_011080	TCTT	2	8	662584	662591	0 %	75 %	0 %	25 %	194444600
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14139	NC_011080	GCC	2	6	662972	662977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444600
14140	NC_011080	GTC	2	6	662989	662994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444600
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14148	NC_011080	CGG	2	6	663211	663216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444600
14149	NC_011080	GCG	2	6	663225	663230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444600
14150	NC_011080	CTG	2	6	663252	663257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444600
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14153	NC_011080	TGCGT	2	10	663372	663381	0 %	40 %	40 %	20 %	194444600
14154	NC_011080	A	6	6	663414	663419	100 %	0 %	0 %	0 %	194444600
14155	NC_011080	AG	3	6	663466	663471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14156	NC_011080	CAA	2	6	663528	663533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446405
14157	NC_011080	GC	3	6	663558	663563	0 %	0 %	50 %	50 %	194446405
14158	NC_011080	GCT	2	6	663567	663572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446405
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14163	NC_011080	CAG	2	6	663784	663789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446405
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14208	NC_011080	A	6	6	665570	665575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14209	NC_011080	TGT	3	9	665599	665607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14210	NC_011080	GTT	2	6	665608	665613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14211	NC_011080	TC	3	6	665651	665656	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14212	NC_011080	ACA	2	6	665673	665678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14221	NC_011080	GAT	2	6	666218	666223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443275
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14231	NC_011080	TTG	2	6	666619	666624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443275
14232	NC_011080	ACCGG	2	10	666630	666639	20 %	0 %	40 %	40 %	194443275
14233	NC_011080	TTA	2	6	666670	666675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443275
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14237	NC_011080	CGG	2	6	666776	666781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443275
14238	NC_011080	TCG	2	6	666799	666804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443275
14239	NC_011080	TAT	2	6	666830	666835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443275
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14487	NC_011080	TGG	2	6	678945	678950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446791
14488	NC_011080	TGG	2	6	678960	678965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446791
14489	NC_011080	AAC	2	6	678980	678985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446791
14490	NC_011080	GGC	2	6	679045	679050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446791
14491	NC_011080	CGG	2	6	679104	679109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446791
14492	NC_011080	CGG	2	6	679159	679164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446791
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14500	NC_011080	CCG	2	6	679433	679438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446791

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