MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 101857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_011080	ATATTA	2	12	635868	635879	50 %	50 %	0 %	0 %	194442284
13502	NC_011080	GGC	2	6	635917	635922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442284
13503	NC_011080	GGCG	2	8	635980	635987	0 %	0 %	75 %	25 %	194442284
13504	NC_011080	TGGG	2	8	635993	636000	0 %	25 %	75 %	0 %	194442284
13505	NC_011080	GCT	2	6	636010	636015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442284
13506	NC_011080	TTA	2	6	636047	636052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194442284
13507	NC_011080	TTAA	2	8	636083	636090	50 %	50 %	0 %	0 %	194442284
13508	NC_011080	ATT	2	6	636182	636187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194442284
13509	NC_011080	TAA	3	9	636220	636228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442284
13510	NC_011080	ATT	2	6	636233	636238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194442284
13511	NC_011080	A	6	6	636482	636487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13512	NC_011080	AGA	2	6	636506	636511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13513	NC_011080	GCC	2	6	636574	636579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13514	NC_011080	CGG	2	6	636619	636624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442909
13515	NC_011080	CA	3	6	636678	636683	50 %	0 %	0 %	50 %	194442909
13516	NC_011080	GCA	2	6	636836	636841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442909
13517	NC_011080	TATG	2	8	636899	636906	25 %	50 %	25 %	0 %	194442909
13518	NC_011080	CAG	2	6	636933	636938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442909
13519	NC_011080	GCG	2	6	636961	636966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442909
13520	NC_011080	CAT	2	6	636987	636992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442909
13521	NC_011080	ACC	2	6	636997	637002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194442909
13522	NC_011080	CGG	2	6	637019	637024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442909
13523	NC_011080	TCT	2	6	637039	637044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194442909
13524	NC_011080	AAC	2	6	637068	637073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194442909
13525	NC_011080	GCCA	2	8	637150	637157	25 %	0 %	25 %	50 %	194442909
13526	NC_011080	TGT	2	6	637177	637182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194442909
13527	NC_011080	ATG	2	6	637225	637230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442909
13528	NC_011080	CGC	2	6	637284	637289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442909
13529	NC_011080	GGC	2	6	637311	637316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442909
13530	NC_011080	CCG	2	6	637328	637333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442909
13531	NC_011080	CTG	2	6	637341	637346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442909
13532	NC_011080	ACG	2	6	637360	637365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442909
13533	NC_011080	T	6	6	637369	637374	0 %	100 %	0 %	0 %	194442909
13534	NC_011080	CCG	2	6	637489	637494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442909
13535	NC_011080	TGTTT	2	10	637520	637529	0 %	80 %	20 %	0 %	194442909
13536	NC_011080	TAA	2	6	637544	637549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442909
13537	NC_011080	CGG	2	6	637552	637557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442909
13538	NC_011080	TCC	2	6	637606	637611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13539	NC_011080	ATA	2	6	637624	637629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13540	NC_011080	TAA	2	6	637638	637643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13541	NC_011080	AAATT	2	10	637644	637653	60 %	40 %	0 %	0 %	194446377
13542	NC_011080	T	6	6	637670	637675	0 %	100 %	0 %	0 %	194446377
13543	NC_011080	AT	3	6	637759	637764	50 %	50 %	0 %	0 %	194446377
13544	NC_011080	TCA	2	6	637783	637788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446377
13545	NC_011080	ATTCAG	2	12	637803	637814	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	194446377
13546	NC_011080	ATT	2	6	637818	637823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446377
13547	NC_011080	CACT	2	8	637861	637868	25 %	25 %	0 %	50 %	194446377
13548	NC_011080	CG	3	6	637894	637899	0 %	0 %	50 %	50 %	194446377
13549	NC_011080	CTC	2	6	637968	637973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194446377
13550	NC_011080	CCT	2	6	638027	638032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194446377
13551	NC_011080	GCCGG	2	10	638053	638062	0 %	0 %	60 %	40 %	194446377
13552	NC_011080	CAGCGC	2	12	638088	638099	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	194446377
13553	NC_011080	GGT	2	6	638144	638149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446377
13554	NC_011080	AGC	2	6	638170	638175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446377
13555	NC_011080	TGC	2	6	638209	638214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446377
13556	NC_011080	CGGCGA	2	12	638216	638227	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	194446377
13557	NC_011080	CAG	2	6	638232	638237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446377
13558	NC_011080	CGC	2	6	638294	638299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446377
13559	NC_011080	CCG	2	6	638321	638326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446377
13560	NC_011080	GCCA	2	8	638352	638359	25 %	0 %	25 %	50 %	194446377
13561	NC_011080	GC	3	6	638389	638394	0 %	0 %	50 %	50 %	194446377
13562	NC_011080	CGC	2	6	638400	638405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446377
13563	NC_011080	GCC	3	9	638421	638429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446377
13564	NC_011080	TCG	2	6	638476	638481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446377
13565	NC_011080	CAG	2	6	638497	638502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446377
13566	NC_011080	CG	3	6	638538	638543	0 %	0 %	50 %	50 %	194446377
13567	NC_011080	GC	3	6	638552	638557	0 %	0 %	50 %	50 %	194446377
13568	NC_011080	AAT	2	6	638586	638591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194446377
13569	NC_011080	CGC	2	6	638600	638605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446377
13570	NC_011080	CG	3	6	638625	638630	0 %	0 %	50 %	50 %	194446377
13571	NC_011080	CAG	2	6	638664	638669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446377
13572	NC_011080	TCT	2	6	638695	638700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194446377
13573	NC_011080	GC	3	6	638737	638742	0 %	0 %	50 %	50 %	194442991
13574	NC_011080	AAG	2	6	638747	638752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194442991
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13577	NC_011080	GGA	2	6	638851	638856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194442991
13578	NC_011080	CGG	2	6	638896	638901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442991
13579	NC_011080	CGA	2	6	638950	638955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442991
13580	NC_011080	CGA	2	6	638965	638970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442991
13581	NC_011080	GGT	2	6	639029	639034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442991
13582	NC_011080	CCCG	2	8	639036	639043	0 %	0 %	25 %	75 %	194442991
13583	NC_011080	TGC	2	6	639124	639129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442991
13584	NC_011080	CTG	2	6	639131	639136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442991
13585	NC_011080	CGG	2	6	639157	639162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442991
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13587	NC_011080	GCG	2	6	639325	639330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442991
13588	NC_011080	GC	3	6	639363	639368	0 %	0 %	50 %	50 %	194442991
13589	NC_011080	CGG	2	6	639376	639381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442991
13590	NC_011080	TGC	2	6	639435	639440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442991
13591	NC_011080	CGT	2	6	639544	639549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442991
13592	NC_011080	TCACT	2	10	639565	639574	20 %	40 %	0 %	40 %	194442991
13593	NC_011080	CCT	2	6	639585	639590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194442496
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13595	NC_011080	GCGATG	2	12	639647	639658	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	194442496
13596	NC_011080	GCG	2	6	639677	639682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442496
13597	NC_011080	AGCCC	2	10	639690	639699	20 %	0 %	20 %	60 %	194442496
13598	NC_011080	TGC	2	6	639717	639722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442496
13599	NC_011080	CAT	2	6	639727	639732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442496
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13601	NC_011080	CGG	2	6	639831	639836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442496
13602	NC_011080	AGC	2	6	639890	639895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442496
13603	NC_011080	ATA	2	6	640070	640075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442496
13604	NC_011080	GAC	2	6	640105	640110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442496
13605	NC_011080	CAGAC	2	10	640202	640211	40 %	0 %	20 %	40 %	194442496
13606	NC_011080	ATC	2	6	640244	640249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442496
13607	NC_011080	AGC	2	6	640301	640306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442496
13608	NC_011080	CGG	2	6	640361	640366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444410
13609	NC_011080	CTG	2	6	640467	640472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444410
13610	NC_011080	CCG	2	6	640495	640500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444410
13611	NC_011080	CGA	2	6	640532	640537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444410
13612	NC_011080	CGG	2	6	640550	640555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444410
13613	NC_011080	CAC	2	6	640566	640571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444410
13614	NC_011080	T	6	6	640578	640583	0 %	100 %	0 %	0 %	194444410
13615	NC_011080	CCG	2	6	640613	640618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444410
13616	NC_011080	CGG	2	6	640697	640702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444410
13617	NC_011080	CGA	2	6	640715	640720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444410
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13620	NC_011080	TTA	2	6	640842	640847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443911
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13744	NC_011080	CAT	2	6	646653	646658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444250
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13850	NC_011080	TACC	2	8	651312	651319	25 %	25 %	0 %	50 %	194446023
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13981	NC_011080	GCG	2	6	656382	656387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442251
13982	NC_011080	CGG	2	6	656445	656450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442251
13983	NC_011080	CG	3	6	656509	656514	0 %	0 %	50 %	50 %	194442251
13984	NC_011080	GAT	2	6	656527	656532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442251
13985	NC_011080	AGC	2	6	656570	656575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442251
13986	NC_011080	CAAT	2	8	656580	656587	50 %	25 %	0 %	25 %	194442251
13987	NC_011080	CCGC	2	8	656600	656607	0 %	0 %	25 %	75 %	194442251
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13990	NC_011080	CATCA	2	10	656695	656704	40 %	20 %	0 %	40 %	194442251
13991	NC_011080	AGCGC	2	10	656759	656768	20 %	0 %	40 %	40 %	194442251
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13994	NC_011080	CAG	2	6	656845	656850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442251
13995	NC_011080	AAT	2	6	656857	656862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442251
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13999	NC_011080	GAAA	2	8	656963	656970	75 %	0 %	25 %	0 %	194442251
14000	NC_011080	GCC	2	6	656979	656984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444009

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