MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 101857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_011080	GCT	2	6	612753	612758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442998
13002	NC_011080	CG	3	6	612947	612952	0 %	0 %	50 %	50 %	194442998
13003	NC_011080	GGA	2	6	612977	612982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194442998
13004	NC_011080	TCCG	2	8	613024	613031	0 %	25 %	25 %	50 %	194442998
13005	NC_011080	AAT	2	6	613193	613198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442424
13006	NC_011080	GGT	2	6	613210	613215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442424
13007	NC_011080	CGG	2	6	613263	613268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442424
13008	NC_011080	TACC	2	8	613285	613292	25 %	25 %	0 %	50 %	194442424
13009	NC_011080	GCA	2	6	613456	613461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442424
13010	NC_011080	TTAAA	2	10	613497	613506	60 %	40 %	0 %	0 %	194442424
13011	NC_011080	TTA	2	6	613521	613526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194442424
13012	NC_011080	GAC	2	6	613570	613575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442424
13013	NC_011080	TA	3	6	613605	613610	50 %	50 %	0 %	0 %	194442424
13014	NC_011080	CGT	2	6	613701	613706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442424
13015	NC_011080	GGCGGG	2	12	613717	613728	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	194442424
13016	NC_011080	CGC	2	6	613749	613754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442424
13017	NC_011080	CGC	2	6	613899	613904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442424
13018	NC_011080	AAT	2	6	613913	613918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442424
13019	NC_011080	TGA	2	6	613945	613950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442424
13020	NC_011080	CGC	3	9	613954	613962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442424
13021	NC_011080	GC	3	6	614030	614035	0 %	0 %	50 %	50 %	194442424
13022	NC_011080	AGG	2	6	614062	614067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194442424
13023	NC_011080	GTG	2	6	614177	614182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446058
13024	NC_011080	CGC	2	6	614260	614265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446058
13025	NC_011080	CCG	2	6	614315	614320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446058
13026	NC_011080	CGGCA	2	10	614359	614368	20 %	0 %	40 %	40 %	194446058
13027	NC_011080	ACA	2	6	614478	614483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446058
13028	NC_011080	CAATTA	2	12	614578	614589	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	194446058
13029	NC_011080	TCG	2	6	614621	614626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13030	NC_011080	AAT	2	6	614640	614645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194445419
13031	NC_011080	AT	3	6	614704	614709	50 %	50 %	0 %	0 %	194445419
13032	NC_011080	GC	3	6	614719	614724	0 %	0 %	50 %	50 %	194445419
13033	NC_011080	GCA	2	6	614794	614799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445419
13034	NC_011080	G	6	6	614846	614851	0 %	0 %	100 %	0 %	194445419
13035	NC_011080	TGA	2	6	614863	614868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445419
13036	NC_011080	A	6	6	614889	614894	100 %	0 %	0 %	0 %	194445419
13037	NC_011080	TTAC	2	8	614952	614959	25 %	50 %	0 %	25 %	194445419
13038	NC_011080	CGA	2	6	615014	615019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445419
13039	NC_011080	A	7	7	615021	615027	100 %	0 %	0 %	0 %	194445419
13040	NC_011080	TAAG	2	8	615064	615071	50 %	25 %	25 %	0 %	194445419
13041	NC_011080	ATC	2	6	615158	615163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445419
13042	NC_011080	TCGA	2	8	615210	615217	25 %	25 %	25 %	25 %	194445419
13043	NC_011080	TTG	2	6	615268	615273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445419
13044	NC_011080	AC	3	6	615351	615356	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13045	NC_011080	CA	3	6	615357	615362	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13046	NC_011080	AAT	2	6	615370	615375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_011080	TAA	2	6	615419	615424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_011080	CAA	2	6	615449	615454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13049	NC_011080	A	6	6	615453	615458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_011080	GTG	2	6	615582	615587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13051	NC_011080	AGT	2	6	615615	615620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13052	NC_011080	TGT	2	6	615627	615632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_011080	ATA	2	6	615647	615652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_011080	TAA	2	6	615683	615688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13055	NC_011080	GAG	2	6	615723	615728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_011080	A	6	6	615748	615753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_011080	T	6	6	615754	615759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_011080	A	6	6	615841	615846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_011080	A	6	6	615874	615879	100 %	0 %	0 %	0 %	194443570
13060	NC_011080	GCT	2	6	615901	615906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443570
13061	NC_011080	AGC	2	6	615909	615914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443570
13062	NC_011080	GAA	2	6	615916	615921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443570
13063	NC_011080	AGG	2	6	615945	615950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194443570
13064	NC_011080	GTT	2	6	615958	615963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443570
13065	NC_011080	GAT	2	6	615982	615987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443570
13066	NC_011080	ATC	2	6	616047	616052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443570
13067	NC_011080	CAGT	2	8	616056	616063	25 %	25 %	25 %	25 %	194443570
13068	NC_011080	CGG	2	6	616093	616098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443570
13069	NC_011080	GTC	2	6	616135	616140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443570
13070	NC_011080	A	7	7	616151	616157	100 %	0 %	0 %	0 %	194443570
13071	NC_011080	CAG	2	6	616208	616213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443570
13072	NC_011080	TTG	2	6	616232	616237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443570
13073	NC_011080	GC	3	6	616246	616251	0 %	0 %	50 %	50 %	194443570
13074	NC_011080	TGC	2	6	616364	616369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443570
13075	NC_011080	AGT	2	6	616390	616395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443570
13076	NC_011080	ATT	2	6	616431	616436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443570
13077	NC_011080	GCG	2	6	616510	616515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443570
13078	NC_011080	CGG	2	6	616560	616565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443570
13079	NC_011080	AT	4	8	616616	616623	50 %	50 %	0 %	0 %	448967505
13080	NC_011080	TGGC	2	8	616633	616640	0 %	25 %	50 %	25 %	448967505
13081	NC_011080	ATAA	2	8	616642	616649	75 %	25 %	0 %	0 %	448967505
13082	NC_011080	CTG	2	6	616727	616732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448967505
13083	NC_011080	A	8	8	616733	616740	100 %	0 %	0 %	0 %	448967505
13084	NC_011080	GA	3	6	616803	616808	50 %	0 %	50 %	0 %	448967505
13085	NC_011080	ATGA	2	8	616849	616856	50 %	25 %	25 %	0 %	448967505
13086	NC_011080	TCCTT	2	10	616891	616900	0 %	60 %	0 %	40 %	448967505
13087	NC_011080	CCA	2	6	616918	616923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448967505
13088	NC_011080	CTC	2	6	616928	616933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13089	NC_011080	ATG	2	6	616943	616948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13090	NC_011080	AT	3	6	616954	616959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13091	NC_011080	CAT	2	6	616993	616998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13092	NC_011080	A	7	7	617011	617017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13093	NC_011080	ATT	2	6	617040	617045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13094	NC_011080	TACT	2	8	617087	617094	25 %	50 %	0 %	25 %	194442310
13095	NC_011080	AT	3	6	617120	617125	50 %	50 %	0 %	0 %	194442310
13096	NC_011080	CTG	2	6	617134	617139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442310
13097	NC_011080	CGG	2	6	617174	617179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442310
13098	NC_011080	GAAAGT	2	12	617201	617212	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	194442310
13099	NC_011080	AGT	2	6	617298	617303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442310
13100	NC_011080	CAT	2	6	617382	617387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442310
13101	NC_011080	GCA	2	6	617406	617411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442310
13102	NC_011080	TTA	2	6	617453	617458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194442310
13103	NC_011080	AAT	2	6	617461	617466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442310
13104	NC_011080	ATC	3	9	617524	617532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442310
13105	NC_011080	TATC	2	8	617559	617566	25 %	50 %	0 %	25 %	194442310
13106	NC_011080	TCT	2	6	617567	617572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194442310
13107	NC_011080	GGC	2	6	617573	617578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442310
13108	NC_011080	CTG	2	6	617593	617598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442310
13109	NC_011080	ATG	2	6	617621	617626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442310
13110	NC_011080	A	6	6	617683	617688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_011080	GGC	2	6	617752	617757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13112	NC_011080	CTTCA	2	10	617923	617932	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13113	NC_011080	GC	3	6	618006	618011	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13114	NC_011080	CAA	2	6	618023	618028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13115	NC_011080	TGAC	2	8	618140	618147	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13116	NC_011080	ATG	2	6	618164	618169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13117	NC_011080	ACAG	2	8	618173	618180	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13118	NC_011080	TG	3	6	618183	618188	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13119	NC_011080	TAG	2	6	618197	618202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13120	NC_011080	GAA	2	6	618221	618226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13121	NC_011080	CAT	2	6	618236	618241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13122	NC_011080	TG	3	6	618254	618259	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13123	NC_011080	GTT	2	6	618301	618306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13124	NC_011080	CTG	2	6	618436	618441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13125	NC_011080	CTG	2	6	618468	618473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13128	NC_011080	T	6	6	618649	618654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13251	NC_011080	CTG	2	6	624124	624129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446788
13252	NC_011080	GGC	2	6	624142	624147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446788
13253	NC_011080	GCG	3	9	624174	624182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446788
13254	NC_011080	CGT	2	6	624229	624234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446788
13255	NC_011080	CAC	2	6	624319	624324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446788
13256	NC_011080	GCG	2	6	624422	624427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446788
13257	NC_011080	CGC	2	6	624444	624449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446788
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13259	NC_011080	A	6	6	624645	624650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13260	NC_011080	T	6	6	624675	624680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13261	NC_011080	TTAT	2	8	624685	624692	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13262	NC_011080	AGA	2	6	624730	624735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445461
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13269	NC_011080	TTA	2	6	625105	625110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194445461
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13290	NC_011080	TCTCT	2	10	626039	626048	0 %	60 %	0 %	40 %	194445461
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13292	NC_011080	T	7	7	626093	626099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13293	NC_011080	GAAA	2	8	626147	626154	75 %	0 %	25 %	0 %	194443523
13294	NC_011080	TAT	2	6	626176	626181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443523
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13300	NC_011080	TA	3	6	626443	626448	50 %	50 %	0 %	0 %	194442914
13301	NC_011080	ACT	2	6	626558	626563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442272
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13311	NC_011080	CGTT	2	8	627000	627007	0 %	50 %	25 %	25 %	194442272
13312	NC_011080	TCG	2	6	627056	627061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13313	NC_011080	TGA	2	6	627091	627096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13314	NC_011080	ATG	2	6	627097	627102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13319	NC_011080	GCC	2	6	627394	627399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446127
13320	NC_011080	CAT	2	6	627435	627440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446127
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13323	NC_011080	GTC	2	6	627645	627650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446127
13324	NC_011080	CTG	3	9	627714	627722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446127
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13327	NC_011080	CTG	2	6	627777	627782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446127
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13329	NC_011080	GCAG	2	8	627824	627831	25 %	0 %	50 %	25 %	194446127
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13339	NC_011080	TGA	2	6	628265	628270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446127
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13341	NC_011080	GC	3	6	628452	628457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13342	NC_011080	CTTTT	2	10	628461	628470	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13343	NC_011080	T	7	7	628487	628493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13344	NC_011080	TAACGT	2	12	628500	628511	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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13351	NC_011080	GCT	2	6	629160	629165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444869
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13362	NC_011080	GTCGC	2	10	629521	629530	0 %	20 %	40 %	40 %	194444869
13363	NC_011080	GCG	2	6	629546	629551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444869
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13366	NC_011080	CGT	2	6	629806	629811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444869
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13369	NC_011080	T	6	6	630002	630007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13370	NC_011080	GC	3	6	630065	630070	0 %	0 %	50 %	50 %	194444678
13371	NC_011080	TGA	2	6	630094	630099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444678
13372	NC_011080	CCA	2	6	630119	630124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444678
13373	NC_011080	ACG	2	6	630178	630183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444678
13374	NC_011080	TGG	2	6	630277	630282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444678
13375	NC_011080	GCG	2	6	630330	630335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444678
13376	NC_011080	GTT	2	6	630365	630370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444678
13377	NC_011080	TGA	2	6	630391	630396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444678
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13380	NC_011080	CCG	2	6	630511	630516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444678
13381	NC_011080	TGG	2	6	630575	630580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444678
13382	NC_011080	TAT	2	6	630587	630592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444678
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13390	NC_011080	GTC	2	6	630988	630993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444678
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13402	NC_011080	CAG	2	6	631307	631312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13404	NC_011080	CTG	2	6	631323	631328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445353
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13408	NC_011080	CGT	2	6	631563	631568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13409	NC_011080	CAA	2	6	631575	631580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13410	NC_011080	CGCTGG	2	12	631640	631651	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	194443366
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13453	NC_011080	CGTT	2	8	633595	633602	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13454	NC_011080	AGTA	2	8	633646	633653	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13455	NC_011080	CGT	2	6	633682	633687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13473	NC_011080	GGC	2	6	634349	634354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442284
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13479	NC_011080	CTG	2	6	634814	634819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442284
13480	NC_011080	CGG	2	6	634848	634853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442284
13481	NC_011080	AG	3	6	635044	635049	50 %	0 %	50 %	0 %	194442284
13482	NC_011080	TGC	2	6	635220	635225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442284
13483	NC_011080	GCTG	2	8	635226	635233	0 %	25 %	50 %	25 %	194442284
13484	NC_011080	GAG	2	6	635234	635239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194442284
13485	NC_011080	CTG	2	6	635273	635278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442284
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13487	NC_011080	GGC	2	6	635335	635340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442284
13488	NC_011080	CCA	2	6	635364	635369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194442284
13489	NC_011080	GCG	2	6	635370	635375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442284
13490	NC_011080	ATC	2	6	635393	635398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442284
13491	NC_011080	CAG	2	6	635419	635424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442284
13492	NC_011080	TGG	3	9	635631	635639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442284
13493	NC_011080	ACG	2	6	635651	635656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442284
13494	NC_011080	A	7	7	635694	635700	100 %	0 %	0 %	0 %	194442284
13495	NC_011080	TCT	2	6	635754	635759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194442284
13496	NC_011080	A	6	6	635771	635776	100 %	0 %	0 %	0 %	194442284
13497	NC_011080	CG	3	6	635780	635785	0 %	0 %	50 %	50 %	194442284
13498	NC_011080	CTG	2	6	635786	635791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442284
13499	NC_011080	TTTAAA	2	12	635822	635833	50 %	50 %	0 %	0 %	194442284
13500	NC_011080	A	6	6	635844	635849	100 %	0 %	0 %	0 %	194442284

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