MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 101857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_011080	CGC	2	6	589969	589974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443872
12502	NC_011080	TGG	2	6	590002	590007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443872
12503	NC_011080	GTCG	2	8	590079	590086	0 %	25 %	50 %	25 %	194443872
12504	NC_011080	CGG	2	6	590165	590170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443872
12505	NC_011080	T	7	7	590177	590183	0 %	100 %	0 %	0 %	194443872
12506	NC_011080	TGC	2	6	590186	590191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443872
12507	NC_011080	GC	3	6	590198	590203	0 %	0 %	50 %	50 %	194443872
12508	NC_011080	T	6	6	590218	590223	0 %	100 %	0 %	0 %	194443872
12509	NC_011080	GAT	2	6	590325	590330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443872
12510	NC_011080	ACA	2	6	590340	590345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194443872
12511	NC_011080	TCA	2	6	590416	590421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443872
12512	NC_011080	CCG	2	6	590428	590433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443872
12513	NC_011080	TAT	2	6	590490	590495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443872
12514	NC_011080	CGG	2	6	590501	590506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443872
12515	NC_011080	TGA	2	6	590507	590512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443872
12516	NC_011080	TGA	2	6	590627	590632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443872
12517	NC_011080	TTA	2	6	590692	590697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443872
12518	NC_011080	GC	3	6	590741	590746	0 %	0 %	50 %	50 %	194443872
12519	NC_011080	CTG	2	6	590752	590757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443872
12520	NC_011080	CAG	2	6	590811	590816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443872
12521	NC_011080	CTTTA	2	10	590843	590852	20 %	60 %	0 %	20 %	194443872
12522	NC_011080	GGTTT	2	10	590857	590866	0 %	60 %	40 %	0 %	194443872
12523	NC_011080	CG	3	6	590889	590894	0 %	0 %	50 %	50 %	194443872
12524	NC_011080	T	7	7	590933	590939	0 %	100 %	0 %	0 %	194443872
12525	NC_011080	TCC	2	6	590949	590954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194443872
12526	NC_011080	TGA	2	6	590978	590983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443872
12527	NC_011080	TGG	2	6	591011	591016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443872
12528	NC_011080	ATG	2	6	591092	591097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445092
12529	NC_011080	AG	3	6	591127	591132	50 %	0 %	50 %	0 %	194445092
12530	NC_011080	GC	3	6	591194	591199	0 %	0 %	50 %	50 %	194445092
12531	NC_011080	TGG	2	6	591223	591228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445092
12532	NC_011080	AGC	2	6	591253	591258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445092
12533	NC_011080	CGG	2	6	591262	591267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445092
12534	NC_011080	ATT	2	6	591353	591358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194445092
12535	NC_011080	GGC	3	9	591364	591372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445092
12536	NC_011080	TGG	2	6	591387	591392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445092
12537	NC_011080	GCT	2	6	591412	591417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445092
12538	NC_011080	ATT	2	6	591479	591484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194445092
12539	NC_011080	CGG	2	6	591493	591498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445092
12540	NC_011080	CGC	2	6	591570	591575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445092
12541	NC_011080	TGG	2	6	591687	591692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445092
12542	NC_011080	CGCGG	2	10	591698	591707	0 %	0 %	60 %	40 %	194445092
12543	NC_011080	CGG	3	9	591705	591713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445092
12544	NC_011080	GGA	2	6	591845	591850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194445092
12545	NC_011080	TGC	2	6	591859	591864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445092
12546	NC_011080	GGA	2	6	591928	591933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194445092
12547	NC_011080	CGG	2	6	591990	591995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445092
12548	NC_011080	GCGTC	2	10	592014	592023	0 %	20 %	40 %	40 %	194445092
12549	NC_011080	CAT	2	6	592037	592042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445092
12550	NC_011080	TCA	2	6	592209	592214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445092
12551	NC_011080	A	7	7	592248	592254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_011080	AGG	2	6	592306	592311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12553	NC_011080	CCG	2	6	592317	592322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12554	NC_011080	T	6	6	592437	592442	0 %	100 %	0 %	0 %	194445251
12555	NC_011080	GTT	2	6	592455	592460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445251
12556	NC_011080	TGGC	2	8	592534	592541	0 %	25 %	50 %	25 %	194445251
12557	NC_011080	CAG	2	6	592605	592610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445251
12558	NC_011080	GCTG	2	8	592649	592656	0 %	25 %	50 %	25 %	194445251
12559	NC_011080	ACCA	2	8	592669	592676	50 %	0 %	0 %	50 %	194445251
12560	NC_011080	GCG	2	6	592704	592709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445251
12561	NC_011080	TA	3	6	592712	592717	50 %	50 %	0 %	0 %	194445251
12562	NC_011080	GCTG	2	8	592724	592731	0 %	25 %	50 %	25 %	194445251
12563	NC_011080	TCA	2	6	592757	592762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445251
12564	NC_011080	CGC	2	6	592874	592879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445251
12565	NC_011080	CTG	2	6	592887	592892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445251
12566	NC_011080	GCC	2	6	592896	592901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445251
12567	NC_011080	CGA	2	6	592928	592933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445251
12568	NC_011080	AAG	2	6	592934	592939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445251
12569	NC_011080	AAT	2	6	592992	592997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194445251
12570	NC_011080	ATC	2	6	593070	593075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445251
12571	NC_011080	GCA	2	6	593142	593147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443732
12572	NC_011080	CCG	2	6	593199	593204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443732
12573	NC_011080	CG	3	6	593256	593261	0 %	0 %	50 %	50 %	194443732
12574	NC_011080	GTT	2	6	593316	593321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443732
12575	NC_011080	CA	3	6	593328	593333	50 %	0 %	0 %	50 %	194443732
12576	NC_011080	TCCA	2	8	593384	593391	25 %	25 %	0 %	50 %	194443732
12577	NC_011080	ATCGAT	2	12	593395	593406	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	194443732
12578	NC_011080	GC	3	6	593432	593437	0 %	0 %	50 %	50 %	194443732
12579	NC_011080	ACA	2	6	593525	593530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194443732
12580	NC_011080	GACT	2	8	593609	593616	25 %	25 %	25 %	25 %	194443732
12581	NC_011080	CGA	2	6	593648	593653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443732
12582	NC_011080	CGA	2	6	593721	593726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443732
12583	NC_011080	GAC	2	6	593734	593739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443732
12584	NC_011080	CAA	2	6	593793	593798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194443732
12585	NC_011080	AGCG	2	8	593821	593828	25 %	0 %	50 %	25 %	194443732
12586	NC_011080	GCG	2	6	593831	593836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443732
12587	NC_011080	TGC	2	6	593940	593945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443732
12588	NC_011080	A	6	6	593949	593954	100 %	0 %	0 %	0 %	194443732
12589	NC_011080	CTT	2	6	593973	593978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443732
12590	NC_011080	ACT	2	6	593993	593998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443732
12591	NC_011080	GCG	2	6	594012	594017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443732
12592	NC_011080	GCCA	2	8	594047	594054	25 %	0 %	25 %	50 %	194443732
12593	NC_011080	GGC	2	6	594055	594060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443732
12594	NC_011080	GC	3	6	594063	594068	0 %	0 %	50 %	50 %	194443732
12595	NC_011080	GTCC	2	8	594075	594082	0 %	25 %	25 %	50 %	194443732
12596	NC_011080	GCC	2	6	594088	594093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443732
12597	NC_011080	GAC	2	6	594097	594102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443732
12598	NC_011080	TG	3	6	594146	594151	0 %	50 %	50 %	0 %	194443732
12599	NC_011080	GGC	2	6	594159	594164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443732
12600	NC_011080	TCA	2	6	594182	594187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443732
12601	NC_011080	TGC	2	6	594230	594235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443732
12602	NC_011080	AG	3	6	594304	594309	50 %	0 %	50 %	0 %	194443732
12603	NC_011080	TCT	2	6	594323	594328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443732
12604	NC_011080	AAT	2	6	594371	594376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194444226
12605	NC_011080	T	6	6	594392	594397	0 %	100 %	0 %	0 %	194444226
12606	NC_011080	ATC	2	6	594448	594453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444226
12607	NC_011080	ATCCTG	2	12	594496	594507	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	194444226
12608	NC_011080	ATA	2	6	594514	594519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194444226
12609	NC_011080	GGGC	2	8	594537	594544	0 %	0 %	75 %	25 %	194444226
12610	NC_011080	AAT	2	6	594590	594595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194444226
12611	NC_011080	GAA	2	6	594602	594607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444226
12612	NC_011080	GGC	2	6	594687	594692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444226
12613	NC_011080	CAG	2	6	594706	594711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444226
12614	NC_011080	ATC	4	12	594731	594742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444226
12615	NC_011080	GCG	2	6	594764	594769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444226
12616	NC_011080	TAA	2	6	594772	594777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194444226
12617	NC_011080	GC	3	6	594807	594812	0 %	0 %	50 %	50 %	194444226
12618	NC_011080	GGT	2	6	594892	594897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444226
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12620	NC_011080	CCGCC	2	10	594975	594984	0 %	0 %	20 %	80 %	194444226
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12742	NC_011080	CAG	2	6	600201	600206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446464
12743	NC_011080	TCTG	2	8	600382	600389	0 %	50 %	25 %	25 %	194446464
12744	NC_011080	GCG	2	6	600402	600407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12745	NC_011080	GCC	2	6	600419	600424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12746	NC_011080	TTTA	2	8	600432	600439	25 %	75 %	0 %	0 %	194442231
12747	NC_011080	GA	3	6	600492	600497	50 %	0 %	50 %	0 %	194442231
12748	NC_011080	GACGT	2	10	600519	600528	20 %	20 %	40 %	20 %	194442231
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12750	NC_011080	ATC	2	6	600653	600658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442231
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12752	NC_011080	ACTG	2	8	600726	600733	25 %	25 %	25 %	25 %	194442231
12753	NC_011080	CG	3	6	600774	600779	0 %	0 %	50 %	50 %	194442231
12754	NC_011080	CCTGCT	2	12	600885	600896	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	194442231
12755	NC_011080	TGC	2	6	600981	600986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442231
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12782	NC_011080	CGA	2	6	602114	602119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12812	NC_011080	GT	3	6	603594	603599	0 %	50 %	50 %	0 %	194442819
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12821	NC_011080	CGAGC	2	10	604085	604094	20 %	0 %	40 %	40 %	194442819
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12860	NC_011080	T	6	6	605876	605881	0 %	100 %	0 %	0 %	194444131
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12986	NC_011080	GAT	2	6	611862	611867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442998
12987	NC_011080	GACG	2	8	611913	611920	25 %	0 %	50 %	25 %	194442998
12988	NC_011080	A	6	6	611970	611975	100 %	0 %	0 %	0 %	194442998
12989	NC_011080	CAA	2	6	612042	612047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194442998
12990	NC_011080	TCCGT	2	10	612192	612201	0 %	40 %	20 %	40 %	194442998
12991	NC_011080	GC	3	6	612228	612233	0 %	0 %	50 %	50 %	194442998
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12998	NC_011080	CAG	2	6	612716	612721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442998
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