MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 101857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_011080	ATT	2	6	565316	565321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443306
12002	NC_011080	GCT	2	6	565335	565340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443306
12003	NC_011080	TCA	2	6	565342	565347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443306
12004	NC_011080	GC	3	6	565431	565436	0 %	0 %	50 %	50 %	194442548
12005	NC_011080	TAAC	2	8	565498	565505	50 %	25 %	0 %	25 %	194442548
12006	NC_011080	CGG	2	6	565524	565529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442548
12007	NC_011080	GTT	2	6	565537	565542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194442548
12008	NC_011080	GGC	2	6	565558	565563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442548
12009	NC_011080	GTCG	2	8	565565	565572	0 %	25 %	50 %	25 %	194442548
12010	NC_011080	ACGCG	2	10	565587	565596	20 %	0 %	40 %	40 %	194442548
12011	NC_011080	CCAG	2	8	565597	565604	25 %	0 %	25 %	50 %	194442548
12012	NC_011080	CCA	2	6	565607	565612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194442548
12013	NC_011080	GCC	2	6	565620	565625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442548
12014	NC_011080	GCC	2	6	565707	565712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442548
12015	NC_011080	CGC	2	6	565714	565719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442548
12016	NC_011080	CCG	2	6	565740	565745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442548
12017	NC_011080	CAA	2	6	565760	565765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194442548
12018	NC_011080	GCC	2	6	565769	565774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442548
12019	NC_011080	AGA	2	6	565786	565791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194442548
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12022	NC_011080	CTG	2	6	565889	565894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446507
12023	NC_011080	CAT	2	6	565906	565911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446507
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12025	NC_011080	AGT	2	6	565977	565982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446507
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12029	NC_011080	GAG	2	6	566225	566230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194446507
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12032	NC_011080	TGG	2	6	566295	566300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446507
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12037	NC_011080	CCT	2	6	566520	566525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194446507
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12040	NC_011080	CGA	2	6	566688	566693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446507
12041	NC_011080	CGA	2	6	566703	566708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446507
12042	NC_011080	CCT	2	6	566744	566749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12043	NC_011080	C	6	6	566819	566824	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12044	NC_011080	TTA	2	6	566825	566830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12045	NC_011080	AAC	2	6	566864	566869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12046	NC_011080	CGA	2	6	566935	566940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445905
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12052	NC_011080	CGG	2	6	567299	567304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445905
12053	NC_011080	CGA	2	6	567365	567370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445905
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12055	NC_011080	ATT	2	6	567417	567422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194445905
12056	NC_011080	GA	3	6	567526	567531	50 %	0 %	50 %	0 %	194445905
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12062	NC_011080	ATT	2	6	567688	567693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446215
12063	NC_011080	GCC	2	6	567733	567738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446215
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12069	NC_011080	AGC	3	9	568001	568009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446215
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12072	NC_011080	GAT	2	6	568143	568148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446215
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12074	NC_011080	TGT	2	6	568220	568225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194446215
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12080	NC_011080	GC	3	6	568389	568394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12081	NC_011080	CAT	2	6	568395	568400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12094	NC_011080	CG	3	6	568930	568935	0 %	0 %	50 %	50 %	194443127
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12101	NC_011080	GC	3	6	569314	569319	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12102	NC_011080	CCGGC	2	10	569353	569362	0 %	0 %	40 %	60 %	194442377
12103	NC_011080	CTA	2	6	569457	569462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442377
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12105	NC_011080	TG	3	6	569596	569601	0 %	50 %	50 %	0 %	194442377
12106	NC_011080	GGC	2	6	569653	569658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442377
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12113	NC_011080	CAT	2	6	569982	569987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442377
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12115	NC_011080	TTA	2	6	570075	570080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194442377
12116	NC_011080	CGTT	2	8	570172	570179	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12117	NC_011080	GCC	2	6	570226	570231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12118	NC_011080	GA	3	6	570255	570260	50 %	0 %	50 %	0 %	194444315
12119	NC_011080	A	6	6	570371	570376	100 %	0 %	0 %	0 %	194444315
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12121	NC_011080	GCC	2	6	570575	570580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444315
12122	NC_011080	CCA	2	6	570586	570591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444315
12123	NC_011080	CTG	2	6	570644	570649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444315
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12125	NC_011080	GTTTT	2	10	570687	570696	0 %	80 %	20 %	0 %	194444315
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12132	NC_011080	GCT	2	6	571222	571227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443400
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12222	NC_011080	GCCT	2	8	575338	575345	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12223	NC_011080	AC	3	6	575359	575364	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12224	NC_011080	CAT	2	6	575372	575377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12225	NC_011080	AAT	2	6	575380	575385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12226	NC_011080	CAG	2	6	575394	575399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12229	NC_011080	CTG	2	6	575791	575796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445629
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12231	NC_011080	A	6	6	575886	575891	100 %	0 %	0 %	0 %	194445629
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12239	NC_011080	CG	3	6	576264	576269	0 %	0 %	50 %	50 %	194445629
12240	NC_011080	CGA	2	6	576275	576280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445629
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12242	NC_011080	CG	4	8	576430	576437	0 %	0 %	50 %	50 %	194446738
12243	NC_011080	GAT	2	6	576441	576446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446738
12244	NC_011080	CGC	2	6	576461	576466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446738
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12246	NC_011080	CTG	2	6	576516	576521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446738
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12250	NC_011080	GCA	2	6	576718	576723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446738
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12262	NC_011080	TGG	2	6	577291	577296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446738
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12274	NC_011080	CTA	2	6	577920	577925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445651
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12344	NC_011080	T	6	6	581806	581811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12345	NC_011080	ATGT	2	8	581893	581900	25 %	50 %	25 %	0 %	194442880
12346	NC_011080	AAG	2	6	581909	581914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194442880
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12350	NC_011080	CCGGC	2	10	582089	582098	0 %	0 %	40 %	60 %	194442880
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12363	NC_011080	CTG	2	6	582664	582669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442880
12364	NC_011080	ATC	2	6	582754	582759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442880
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12434	NC_011080	ATTT	2	8	586758	586765	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12435	NC_011080	AAC	2	6	586787	586792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12487	NC_011080	CAG	2	6	589535	589540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446659
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