MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 101857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_011080	TTC	2	6	542510	542515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194442277
11502	NC_011080	TCA	2	6	542533	542538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442277
11503	NC_011080	GTT	2	6	542539	542544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194442277
11504	NC_011080	GCG	2	6	542554	542559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442277
11505	NC_011080	GCG	2	6	542598	542603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442277
11506	NC_011080	CGTC	2	8	542647	542654	0 %	25 %	25 %	50 %	194442277
11507	NC_011080	CCG	2	6	542750	542755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442277
11508	NC_011080	TGC	2	6	542757	542762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442277
11509	NC_011080	GTC	2	6	542784	542789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442277
11510	NC_011080	A	6	6	542899	542904	100 %	0 %	0 %	0 %	194442277
11511	NC_011080	ACC	2	6	542913	542918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194442277
11512	NC_011080	GGC	2	6	542960	542965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442277
11513	NC_011080	AG	3	6	543063	543068	50 %	0 %	50 %	0 %	194442277
11514	NC_011080	CAA	2	6	543106	543111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194442277
11515	NC_011080	TCT	2	6	543162	543167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194442277
11516	NC_011080	GCG	2	6	543238	543243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442277
11517	NC_011080	TGG	2	6	543244	543249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442277
11518	NC_011080	TTG	2	6	543273	543278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_011080	GTC	2	6	543347	543352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442921
11520	NC_011080	GC	3	6	543400	543405	0 %	0 %	50 %	50 %	194442921
11521	NC_011080	AGC	2	6	543441	543446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442921
11522	NC_011080	TCA	2	6	543474	543479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442921
11523	NC_011080	GC	3	6	543567	543572	0 %	0 %	50 %	50 %	194444206
11524	NC_011080	TGT	2	6	543613	543618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444206
11525	NC_011080	AGT	2	6	543673	543678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444206
11526	NC_011080	GCG	2	6	543736	543741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444206
11527	NC_011080	GGC	2	6	543765	543770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444206
11528	NC_011080	GCCA	2	8	543814	543821	25 %	0 %	25 %	50 %	194444206
11529	NC_011080	GC	4	8	543942	543949	0 %	0 %	50 %	50 %	194444206
11530	NC_011080	GCG	2	6	543971	543976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444206
11531	NC_011080	CT	3	6	544003	544008	0 %	50 %	0 %	50 %	194444206
11532	NC_011080	TTCAA	2	10	544036	544045	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11533	NC_011080	ATC	2	6	544127	544132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442567
11534	NC_011080	TGGC	3	12	544135	544146	0 %	25 %	50 %	25 %	194442567
11535	NC_011080	GTA	2	6	544148	544153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442567
11536	NC_011080	GGC	2	6	544210	544215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442567
11537	NC_011080	TCG	2	6	544232	544237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442567
11538	NC_011080	GTT	2	6	544255	544260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194442567
11539	NC_011080	GCC	2	6	544315	544320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442567
11540	NC_011080	ATG	2	6	544388	544393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442567
11541	NC_011080	GGGTGC	2	12	544395	544406	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	194442567
11542	NC_011080	CTG	2	6	544430	544435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442567
11543	NC_011080	TGAT	2	8	544458	544465	25 %	50 %	25 %	0 %	194442567
11544	NC_011080	CAA	2	6	544472	544477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194442567
11545	NC_011080	CAGGCG	2	12	544548	544559	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11546	NC_011080	CTGA	2	8	544585	544592	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11547	NC_011080	AT	3	6	544631	544636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_011080	CAG	2	6	544654	544659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443575
11549	NC_011080	GTTG	2	8	544779	544786	0 %	50 %	50 %	0 %	194443575
11550	NC_011080	GC	3	6	544850	544855	0 %	0 %	50 %	50 %	194443575
11551	NC_011080	TGGGC	2	10	544866	544875	0 %	20 %	60 %	20 %	194443575
11552	NC_011080	CTG	2	6	545020	545025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443575
11553	NC_011080	GGC	2	6	545032	545037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443575
11554	NC_011080	CGT	2	6	545065	545070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443575
11555	NC_011080	GCG	2	6	545092	545097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443575
11556	NC_011080	TCA	3	9	545099	545107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443575
11557	NC_011080	GCG	2	6	545123	545128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443575
11558	NC_011080	AGC	2	6	545129	545134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443575
11559	NC_011080	AG	3	6	545220	545225	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11560	NC_011080	CGT	2	6	545354	545359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442832
11561	NC_011080	TCA	2	6	545414	545419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442832
11562	NC_011080	T	6	6	545428	545433	0 %	100 %	0 %	0 %	194442832
11563	NC_011080	CG	3	6	545440	545445	0 %	0 %	50 %	50 %	194442832
11564	NC_011080	CTG	2	6	545472	545477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442832
11565	NC_011080	GCG	2	6	545521	545526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442832
11566	NC_011080	CGC	2	6	545585	545590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442832
11567	NC_011080	CTG	2	6	545622	545627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442832
11568	NC_011080	GC	3	6	545649	545654	0 %	0 %	50 %	50 %	194442832
11569	NC_011080	GCC	2	6	545738	545743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442832
11570	NC_011080	ACC	2	6	545769	545774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194442832
11571	NC_011080	CG	3	6	545904	545909	0 %	0 %	50 %	50 %	194442832
11572	NC_011080	GTT	2	6	545915	545920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194442832
11573	NC_011080	CTGA	2	8	545961	545968	25 %	25 %	25 %	25 %	194442832
11574	NC_011080	GCG	2	6	545983	545988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442832
11575	NC_011080	GAC	3	9	546036	546044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442832
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11578	NC_011080	GC	3	6	546120	546125	0 %	0 %	50 %	50 %	194442832
11579	NC_011080	GCT	2	6	546143	546148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442832
11580	NC_011080	CTG	2	6	546165	546170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442832
11581	NC_011080	GGC	2	6	546221	546226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442832
11582	NC_011080	TAT	2	6	546285	546290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194442832
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11585	NC_011080	TGCG	2	8	546364	546371	0 %	25 %	50 %	25 %	194442832
11586	NC_011080	CGC	2	6	546412	546417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442832
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11588	NC_011080	CGC	3	9	546457	546465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442832
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11592	NC_011080	GC	3	6	546543	546548	0 %	0 %	50 %	50 %	194442832
11593	NC_011080	GC	4	8	546560	546567	0 %	0 %	50 %	50 %	194442832
11594	NC_011080	CAAAA	2	10	546578	546587	80 %	0 %	0 %	20 %	194442832
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11596	NC_011080	CG	4	8	546612	546619	0 %	0 %	50 %	50 %	194442832
11597	NC_011080	GC	3	6	546675	546680	0 %	0 %	50 %	50 %	194442832
11598	NC_011080	AAAG	2	8	546713	546720	75 %	0 %	25 %	0 %	194442832
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11602	NC_011080	A	6	6	546811	546816	100 %	0 %	0 %	0 %	194442832
11603	NC_011080	GGC	2	6	546827	546832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442832
11604	NC_011080	GGC	2	6	546839	546844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442832
11605	NC_011080	GCG	2	6	546870	546875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442832
11606	NC_011080	CTTT	2	8	546888	546895	0 %	75 %	0 %	25 %	194442832
11607	NC_011080	TGG	2	6	546904	546909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442832
11608	NC_011080	GCG	2	6	546997	547002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442832
11609	NC_011080	GCA	2	6	547004	547009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442832
11610	NC_011080	ACG	2	6	547044	547049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442832
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11612	NC_011080	CGC	2	6	547093	547098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442832
11613	NC_011080	ATT	2	6	547152	547157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194442832
11614	NC_011080	ATA	2	6	547162	547167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442832
11615	NC_011080	TTC	2	6	547188	547193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194442832
11616	NC_011080	AG	3	6	547211	547216	50 %	0 %	50 %	0 %	194442832
11617	NC_011080	AG	4	8	547265	547272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11618	NC_011080	TGA	2	6	547306	547311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444967
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11621	NC_011080	GC	3	6	547420	547425	0 %	0 %	50 %	50 %	194444967
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11983	NC_011080	CAT	2	6	564217	564222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445285
11984	NC_011080	ATC	2	6	564233	564238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445285
11985	NC_011080	ACCG	2	8	564259	564266	25 %	0 %	25 %	50 %	194445285
11986	NC_011080	CGA	2	6	564273	564278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445285
11987	NC_011080	TGG	2	6	564303	564308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445285
11988	NC_011080	CTG	2	6	564322	564327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445285
11989	NC_011080	GCG	2	6	564404	564409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445285
11990	NC_011080	TGT	2	6	564491	564496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445285
11991	NC_011080	TTC	2	6	564550	564555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194445285
11992	NC_011080	TGA	2	6	564613	564618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445285
11993	NC_011080	GTT	2	6	564762	564767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445285
11994	NC_011080	CTTT	2	8	564773	564780	0 %	75 %	0 %	25 %	194445285
11995	NC_011080	TCA	2	6	564867	564872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11996	NC_011080	A	7	7	564974	564980	100 %	0 %	0 %	0 %	194443306
11997	NC_011080	CGC	2	6	565032	565037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443306
11998	NC_011080	TGC	2	6	565098	565103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443306
11999	NC_011080	CAAT	2	8	565247	565254	50 %	25 %	0 %	25 %	194443306
12000	NC_011080	CTG	2	6	565265	565270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443306

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