MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 101857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_011080	AAACGA	2	12	496829	496840	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	194445524
10502	NC_011080	GA	3	6	496958	496963	50 %	0 %	50 %	0 %	194445524
10503	NC_011080	GGC	2	6	496986	496991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445524
10504	NC_011080	GCA	2	6	496992	496997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445524
10505	NC_011080	T	7	7	497082	497088	0 %	100 %	0 %	0 %	194445524
10506	NC_011080	A	6	6	497089	497094	100 %	0 %	0 %	0 %	194445524
10507	NC_011080	GGC	2	6	497115	497120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445524
10508	NC_011080	ATT	2	6	497126	497131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194445524
10509	NC_011080	CAA	2	6	497176	497181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194445524
10510	NC_011080	TA	3	6	497206	497211	50 %	50 %	0 %	0 %	194445524
10511	NC_011080	A	6	6	497211	497216	100 %	0 %	0 %	0 %	194445524
10512	NC_011080	ATT	2	6	497240	497245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194445524
10513	NC_011080	ATT	2	6	497319	497324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194445524
10514	NC_011080	ATA	2	6	497336	497341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194445524
10515	NC_011080	TGT	2	6	497364	497369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445524
10516	NC_011080	A	6	6	497421	497426	100 %	0 %	0 %	0 %	194445524
10517	NC_011080	TCC	2	6	497463	497468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194445524
10518	NC_011080	TGA	2	6	497537	497542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445524
10519	NC_011080	TG	3	6	497555	497560	0 %	50 %	50 %	0 %	194445524
10520	NC_011080	ACTT	2	8	497571	497578	25 %	50 %	0 %	25 %	194445524
10521	NC_011080	CAA	2	6	497600	497605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194445524
10522	NC_011080	A	6	6	497614	497619	100 %	0 %	0 %	0 %	194445524
10523	NC_011080	ATT	2	6	497650	497655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194445524
10524	NC_011080	TGA	2	6	497687	497692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10525	NC_011080	A	7	7	497700	497706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10526	NC_011080	CCG	2	6	497707	497712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10527	NC_011080	CGG	2	6	497722	497727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10528	NC_011080	T	6	6	497728	497733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10529	NC_011080	CAG	2	6	497764	497769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445009
10530	NC_011080	CAT	2	6	497803	497808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445009
10531	NC_011080	ATC	2	6	497869	497874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445009
10532	NC_011080	CCA	2	6	497908	497913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194445009
10533	NC_011080	CCG	2	6	497922	497927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445009
10534	NC_011080	ACC	2	6	497933	497938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194445009
10535	NC_011080	ATG	2	6	497999	498004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445009
10536	NC_011080	ACC	2	6	498044	498049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194445009
10537	NC_011080	GCC	2	6	498068	498073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445009
10538	NC_011080	ATGGCG	2	12	498095	498106	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	194445009
10539	NC_011080	CGC	2	6	498151	498156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445009
10540	NC_011080	CGG	2	6	498199	498204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445009
10541	NC_011080	GA	4	8	498215	498222	50 %	0 %	50 %	0 %	194445009
10542	NC_011080	CAGC	2	8	498304	498311	25 %	0 %	25 %	50 %	194445009
10543	NC_011080	CAG	2	6	498337	498342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445009
10544	NC_011080	CAG	2	6	498361	498366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445009
10545	NC_011080	GTT	2	6	498466	498471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445009
10546	NC_011080	TGC	2	6	498540	498545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445009
10547	NC_011080	CAG	2	6	498556	498561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445009
10548	NC_011080	GAT	2	6	498595	498600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445009
10549	NC_011080	CAT	2	6	498634	498639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445009
10550	NC_011080	CGC	2	6	498643	498648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10551	NC_011080	CAT	3	9	498657	498665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446490
10552	NC_011080	GAT	2	6	498717	498722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446490
10553	NC_011080	TCA	2	6	498760	498765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446490
10554	NC_011080	AC	3	6	498789	498794	50 %	0 %	0 %	50 %	194446490
10555	NC_011080	CAC	2	6	498813	498818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446490
10556	NC_011080	TCA	2	6	498869	498874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446490
10557	NC_011080	GCC	2	6	498954	498959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446490
10558	NC_011080	ACA	2	6	499002	499007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446076
10559	NC_011080	CAAATC	2	12	499017	499028	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	194446076
10560	NC_011080	ATG	2	6	499062	499067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446076
10561	NC_011080	CGTG	2	8	499156	499163	0 %	25 %	50 %	25 %	194446076
10562	NC_011080	GAA	2	6	499175	499180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194446076
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10564	NC_011080	GCCA	2	8	499287	499294	25 %	0 %	25 %	50 %	194446076
10565	NC_011080	TTG	2	6	499311	499316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194446076
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10568	NC_011080	GAAC	2	8	499387	499394	50 %	0 %	25 %	25 %	194446076
10569	NC_011080	GCC	2	6	499424	499429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446076
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10572	NC_011080	TCA	2	6	499681	499686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442831
10573	NC_011080	TGA	2	6	499706	499711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442831
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10575	NC_011080	GGC	2	6	499785	499790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442831
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10577	NC_011080	CGG	3	9	499932	499940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442831
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10580	NC_011080	GCTG	2	8	500120	500127	0 %	25 %	50 %	25 %	194442831
10581	NC_011080	GTAC	2	8	500156	500163	25 %	25 %	25 %	25 %	194442831
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10592	NC_011080	TGG	2	6	500519	500524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442831
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10598	NC_011080	CAT	3	9	500754	500762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442831
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10602	NC_011080	CGT	2	6	500970	500975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442831
10603	NC_011080	GCG	2	6	501050	501055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442831
10604	NC_011080	AGCC	2	8	501060	501067	25 %	0 %	25 %	50 %	194442831
10605	NC_011080	GTT	2	6	501147	501152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194442831
10606	NC_011080	GGAAAG	2	12	501155	501166	50 %	0 %	50 %	0 %	194442831
10607	NC_011080	CG	4	8	501173	501180	0 %	0 %	50 %	50 %	194442831
10608	NC_011080	ACC	2	6	501196	501201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194442831
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10617	NC_011080	TAGG	2	8	501444	501451	25 %	25 %	50 %	0 %	194442831
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10864	NC_011080	GGC	2	6	513293	513298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442454
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10982	NC_011080	TGC	2	6	518856	518861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444119
10983	NC_011080	GCG	2	6	519072	519077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444119
10984	NC_011080	GAA	2	6	519125	519130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444119
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10990	NC_011080	T	8	8	519482	519489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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