MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 101857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
101501	NC_011080	ATG	2	6	4809208	4809213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101502	NC_011080	TCG	2	6	4809275	4809280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443158
101503	NC_011080	CTG	2	6	4809295	4809300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443158
101504	NC_011080	CG	3	6	4809315	4809320	0 %	0 %	50 %	50 %	194443158
101505	NC_011080	AGC	2	6	4809338	4809343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443158
101506	NC_011080	GATG	2	8	4809387	4809394	25 %	25 %	50 %	0 %	194443158
101507	NC_011080	GAT	2	6	4809405	4809410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443158
101508	NC_011080	CGA	2	6	4809465	4809470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443158
101509	NC_011080	TGA	2	6	4809473	4809478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443158
101510	NC_011080	GC	3	6	4809510	4809515	0 %	0 %	50 %	50 %	194443158
101511	NC_011080	CGT	2	6	4809574	4809579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443158
101512	NC_011080	CAC	2	6	4809624	4809629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443158
101513	NC_011080	TAC	2	6	4809649	4809654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443158
101514	NC_011080	GCAA	2	8	4809773	4809780	50 %	0 %	25 %	25 %	194443158
101515	NC_011080	CGG	2	6	4809866	4809871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443158
101516	NC_011080	TAA	2	6	4809918	4809923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194443158
101517	NC_011080	CGCA	2	8	4809936	4809943	25 %	0 %	25 %	50 %	194443158
101518	NC_011080	CGCC	2	8	4809999	4810006	0 %	0 %	25 %	75 %	194443158
101519	NC_011080	TGA	2	6	4810028	4810033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443158
101520	NC_011080	TCG	2	6	4810224	4810229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443158
101521	NC_011080	GAAAGA	2	12	4810269	4810280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443158
101522	NC_011080	GC	3	6	4810522	4810527	0 %	0 %	50 %	50 %	194443158
101523	NC_011080	GTA	2	6	4810556	4810561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443158
101524	NC_011080	GC	3	6	4810582	4810587	0 %	0 %	50 %	50 %	194443158
101525	NC_011080	TGG	2	6	4810606	4810611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443158
101526	NC_011080	CGA	2	6	4810628	4810633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443158
101527	NC_011080	ATC	2	6	4810652	4810657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443158
101528	NC_011080	GGA	2	6	4810659	4810664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194443158
101529	NC_011080	CTG	2	6	4810882	4810887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443158
101530	NC_011080	CAACAT	2	12	4810899	4810910	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	194443158
101531	NC_011080	CAG	2	6	4810939	4810944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443158
101532	NC_011080	TAA	2	6	4810950	4810955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194443158
101533	NC_011080	CGG	2	6	4810970	4810975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443158
101534	NC_011080	GCCGG	2	10	4810984	4810993	0 %	0 %	60 %	40 %	194443158
101535	NC_011080	CG	3	6	4811075	4811080	0 %	0 %	50 %	50 %	194443158
101536	NC_011080	GCA	2	6	4811166	4811171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443158
101537	NC_011080	GTTAT	2	10	4811191	4811200	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
101538	NC_011080	CGG	2	6	4811227	4811232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101539	NC_011080	AAC	2	6	4811276	4811281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194444790
101540	NC_011080	ATCTGC	2	12	4811336	4811347	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	194444790
101541	NC_011080	TTA	2	6	4811350	4811355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444790
101542	NC_011080	CG	3	6	4811396	4811401	0 %	0 %	50 %	50 %	194444790
101543	NC_011080	ATT	2	6	4811407	4811412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444790
101544	NC_011080	GAG	2	6	4811413	4811418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194444790
101545	NC_011080	TTG	2	6	4811419	4811424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444790
101546	NC_011080	GGGC	2	8	4811465	4811472	0 %	0 %	75 %	25 %	194444790
101547	NC_011080	CCA	2	6	4811477	4811482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444790
101548	NC_011080	CG	3	6	4811486	4811491	0 %	0 %	50 %	50 %	194444790
101549	NC_011080	CTG	2	6	4811548	4811553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444790
101550	NC_011080	CGC	2	6	4811610	4811615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101551	NC_011080	ACA	2	6	4811649	4811654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101552	NC_011080	AAT	2	6	4811662	4811667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194444478
101553	NC_011080	GTA	2	6	4811718	4811723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444478
101554	NC_011080	CGG	2	6	4811747	4811752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444478
101555	NC_011080	CGG	2	6	4811858	4811863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444478
101556	NC_011080	GCAGCG	2	12	4811864	4811875	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	194444478
101557	NC_011080	ATCA	2	8	4811910	4811917	50 %	25 %	0 %	25 %	194444478
101558	NC_011080	GCT	2	6	4812050	4812055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444478
101559	NC_011080	CGC	2	6	4812062	4812067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444478
101560	NC_011080	CGACGG	2	12	4812071	4812082	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	194444478
101561	NC_011080	TGG	2	6	4812155	4812160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444478
101562	NC_011080	A	8	8	4812222	4812229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101563	NC_011080	AGC	2	6	4812328	4812333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445147
101564	NC_011080	ATC	2	6	4812381	4812386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445147
101565	NC_011080	AGC	2	6	4812387	4812392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445147
101566	NC_011080	CGG	2	6	4812415	4812420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445147
101567	NC_011080	GAA	3	9	4812522	4812530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445147
101568	NC_011080	CGT	2	6	4812540	4812545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445147
101569	NC_011080	TGG	2	6	4812581	4812586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445147
101570	NC_011080	GTCA	2	8	4812672	4812679	25 %	25 %	25 %	25 %	194445147
101571	NC_011080	TGGC	2	8	4812795	4812802	0 %	25 %	50 %	25 %	194445147
101572	NC_011080	TGGG	2	8	4812806	4812813	0 %	25 %	75 %	0 %	194445147
101573	NC_011080	ACG	2	6	4812878	4812883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445147
101574	NC_011080	CGCAG	2	10	4812901	4812910	20 %	0 %	40 %	40 %	194446090
101575	NC_011080	TCT	2	6	4812939	4812944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194446090
101576	NC_011080	GTA	2	6	4812950	4812955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446090
101577	NC_011080	ACG	2	6	4812977	4812982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446090
101578	NC_011080	GGT	2	6	4813145	4813150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446090
101579	NC_011080	GCG	2	6	4813333	4813338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446090
101580	NC_011080	GGCG	2	8	4813395	4813402	0 %	0 %	75 %	25 %	194446090
101581	NC_011080	GAG	2	6	4813425	4813430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194446090
101582	NC_011080	CGA	2	6	4813431	4813436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446090
101583	NC_011080	GC	3	6	4813473	4813478	0 %	0 %	50 %	50 %	194446090
101584	NC_011080	CG	3	6	4813533	4813538	0 %	0 %	50 %	50 %	194446090
101585	NC_011080	CTG	2	6	4813555	4813560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446090
101586	NC_011080	ACG	2	6	4813571	4813576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446090
101587	NC_011080	GCC	2	6	4813659	4813664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446090
101588	NC_011080	CCAG	2	8	4813702	4813709	25 %	0 %	25 %	50 %	194446090
101589	NC_011080	CAA	2	6	4813763	4813768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101590	NC_011080	ATA	2	6	4813794	4813799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101591	NC_011080	T	6	6	4813803	4813808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101592	NC_011080	T	8	8	4813828	4813835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101593	NC_011080	T	7	7	4813848	4813854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101594	NC_011080	ATT	2	6	4813872	4813877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101595	NC_011080	ATTTT	2	10	4813899	4813908	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101596	NC_011080	TAA	2	6	4813917	4813922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101597	NC_011080	TGC	2	6	4813993	4813998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443788
101598	NC_011080	GTG	2	6	4814076	4814081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443788
101599	NC_011080	ACGTG	2	10	4814110	4814119	20 %	20 %	40 %	20 %	194443788
101600	NC_011080	GGC	2	6	4814142	4814147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443788
101601	NC_011080	CGC	2	6	4814186	4814191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443788
101602	NC_011080	CAG	2	6	4814202	4814207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443788
101603	NC_011080	GGT	2	6	4814261	4814266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443788
101604	NC_011080	A	6	6	4814271	4814276	100 %	0 %	0 %	0 %	194443788
101605	NC_011080	ATG	2	6	4814320	4814325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443788
101606	NC_011080	AGT	2	6	4814366	4814371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443788
101607	NC_011080	GAA	2	6	4814384	4814389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443788
101608	NC_011080	GCA	2	6	4814444	4814449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444693
101609	NC_011080	TCGC	2	8	4814539	4814546	0 %	25 %	25 %	50 %	194444693
101610	NC_011080	GAT	2	6	4814736	4814741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444693
101611	NC_011080	CGC	2	6	4814761	4814766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444693
101612	NC_011080	GCT	2	6	4814792	4814797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444693
101613	NC_011080	TGC	2	6	4814816	4814821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444693
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101615	NC_011080	CGG	2	6	4814866	4814871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444693
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101850	NC_011080	GGC	2	6	4827335	4827340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443042
101851	NC_011080	TGA	2	6	4827437	4827442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443042
101852	NC_011080	CG	4	8	4827462	4827469	0 %	0 %	50 %	50 %	194443042
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101855	NC_011080	CTG	2	6	4827546	4827551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443042
101856	NC_011080	A	8	8	4827598	4827605	100 %	0 %	0 %	0 %	194443042
101857	NC_011080	ATA	2	6	4827636	4827641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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