MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 101857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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101002	NC_011080	AAG	2	6	4784083	4784088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101003	NC_011080	CGC	2	6	4784133	4784138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442414
101004	NC_011080	CAT	2	6	4784147	4784152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442414
101005	NC_011080	ACC	2	6	4784175	4784180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194442414
101006	NC_011080	CCG	2	6	4784221	4784226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442414
101007	NC_011080	TGGA	2	8	4784271	4784278	25 %	25 %	50 %	0 %	194442414
101008	NC_011080	CAC	2	6	4784306	4784311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194442414
101009	NC_011080	CTG	2	6	4784352	4784357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442414
101010	NC_011080	TACC	2	8	4784390	4784397	25 %	25 %	0 %	50 %	194442414
101011	NC_011080	CGG	2	6	4784407	4784412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442414
101012	NC_011080	TGT	2	6	4784418	4784423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194442414
101013	NC_011080	CGC	2	6	4784438	4784443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442414
101014	NC_011080	AGGAC	2	10	4784455	4784464	40 %	0 %	40 %	20 %	194442414
101015	NC_011080	GCT	2	6	4784555	4784560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442414
101016	NC_011080	GC	3	6	4784593	4784598	0 %	0 %	50 %	50 %	194442414
101017	NC_011080	CGC	2	6	4784744	4784749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442414
101018	NC_011080	GCA	2	6	4784768	4784773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442414
101019	NC_011080	CGA	2	6	4784780	4784785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442414
101020	NC_011080	TGA	2	6	4784819	4784824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442414
101021	NC_011080	ACCGCG	2	12	4785028	4785039	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	194442414
101022	NC_011080	GGCG	2	8	4785143	4785150	0 %	0 %	75 %	25 %	194442414
101023	NC_011080	GAA	2	6	4785165	4785170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194442414
101024	NC_011080	GAT	2	6	4785245	4785250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442414
101025	NC_011080	CGT	2	6	4785291	4785296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442414
101026	NC_011080	AAGCAG	2	12	4785318	4785329	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	194442414
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101030	NC_011080	GC	3	6	4785507	4785512	0 %	0 %	50 %	50 %	194442414
101031	NC_011080	GAA	2	6	4785533	4785538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194442414
101032	NC_011080	GGC	2	6	4785585	4785590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442414
101033	NC_011080	AACCTG	2	12	4785624	4785635	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	194442414
101034	NC_011080	CG	3	6	4785673	4785678	0 %	0 %	50 %	50 %	194442414
101035	NC_011080	CCG	2	6	4785707	4785712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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101037	NC_011080	T	6	6	4785790	4785795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101038	NC_011080	TGA	2	6	4785844	4785849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101039	NC_011080	TAA	2	6	4785927	4785932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101040	NC_011080	CGT	2	6	4785959	4785964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101041	NC_011080	CTG	2	6	4786121	4786126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444985
101042	NC_011080	CTG	2	6	4786143	4786148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444985
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101050	NC_011080	TCC	2	6	4786720	4786725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101051	NC_011080	CAC	2	6	4786752	4786757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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101053	NC_011080	TGG	2	6	4786893	4786898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445182
101054	NC_011080	CTGG	2	8	4786900	4786907	0 %	25 %	50 %	25 %	194445182
101055	NC_011080	CGGCG	2	10	4786917	4786926	0 %	0 %	60 %	40 %	194445182
101056	NC_011080	TCG	3	9	4786937	4786945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445182
101057	NC_011080	AT	3	6	4787011	4787016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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101059	NC_011080	G	6	6	4787212	4787217	0 %	0 %	100 %	0 %	194446042
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101101	NC_011080	CG	3	6	4788739	4788744	0 %	0 %	50 %	50 %	194446554
101102	NC_011080	GGC	2	6	4788860	4788865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446554
101103	NC_011080	GC	3	6	4788864	4788869	0 %	0 %	50 %	50 %	194446554
101104	NC_011080	GCC	2	6	4788973	4788978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101105	NC_011080	CG	4	8	4789035	4789042	0 %	0 %	50 %	50 %	194442357
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101107	NC_011080	TTCGC	2	10	4789095	4789104	0 %	40 %	20 %	40 %	194442357
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101499	NC_011080	CAGC	2	8	4809115	4809122	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
101500	NC_011080	A	6	6	4809145	4809150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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