MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 101857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
96501	NC_011080	TAC	2	6	4570339	4570344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96502	NC_011080	TCA	2	6	4570367	4570372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444900
96503	NC_011080	CGA	2	6	4570509	4570514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444900
96504	NC_011080	TGG	2	6	4570526	4570531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444900
96505	NC_011080	CTT	2	6	4570593	4570598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194444900
96506	NC_011080	CAG	2	6	4570630	4570635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444900
96507	NC_011080	TGGA	2	8	4570661	4570668	25 %	25 %	50 %	0 %	194444900
96508	NC_011080	CAACTG	2	12	4570708	4570719	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	194444900
96509	NC_011080	CCG	2	6	4570728	4570733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444900
96510	NC_011080	GGT	2	6	4570744	4570749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444900
96511	NC_011080	TGGC	2	8	4570812	4570819	0 %	25 %	50 %	25 %	194444900
96512	NC_011080	ATG	2	6	4570820	4570825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444900
96513	NC_011080	AGA	2	6	4570882	4570887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444900
96514	NC_011080	GC	3	6	4570941	4570946	0 %	0 %	50 %	50 %	194444900
96515	NC_011080	T	6	6	4571035	4571040	0 %	100 %	0 %	0 %	194444900
96516	NC_011080	CAG	3	9	4571113	4571121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444900
96517	NC_011080	CAG	2	6	4571124	4571129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444900
96518	NC_011080	CTT	3	9	4571148	4571156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194444900
96519	NC_011080	CAG	2	6	4571158	4571163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444900
96520	NC_011080	TGA	2	6	4571417	4571422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444900
96521	NC_011080	CGC	2	6	4571487	4571492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444900
96522	NC_011080	GTT	2	6	4571533	4571538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444900
96523	NC_011080	TCA	2	6	4571546	4571551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444900
96524	NC_011080	ATG	2	6	4571561	4571566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444900
96525	NC_011080	TTG	2	6	4571603	4571608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444900
96526	NC_011080	GCC	2	6	4571615	4571620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444900
96527	NC_011080	T	7	7	4571623	4571629	0 %	100 %	0 %	0 %	194444900
96528	NC_011080	TAG	2	6	4571723	4571728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444900
96529	NC_011080	TCT	2	6	4571762	4571767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194444900
96530	NC_011080	TGT	2	6	4571778	4571783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444900
96531	NC_011080	CTT	2	6	4571797	4571802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96532	NC_011080	AC	3	6	4571833	4571838	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96533	NC_011080	AT	3	6	4571842	4571847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96534	NC_011080	CGA	2	6	4571870	4571875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96535	NC_011080	TTAT	2	8	4571968	4571975	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96536	NC_011080	TAC	2	6	4572007	4572012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96537	NC_011080	CAC	2	6	4572051	4572056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96538	NC_011080	ATCGA	2	10	4572060	4572069	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
96539	NC_011080	GTC	2	6	4572095	4572100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96540	NC_011080	TGA	2	6	4572219	4572224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443493
96541	NC_011080	CAA	2	6	4572305	4572310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194443493
96542	NC_011080	A	6	6	4572309	4572314	100 %	0 %	0 %	0 %	194443493
96543	NC_011080	GGC	2	6	4572316	4572321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443493
96544	NC_011080	CGG	2	6	4572333	4572338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443493
96545	NC_011080	ATC	2	6	4572365	4572370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443493
96546	NC_011080	TGC	2	6	4572465	4572470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443493
96547	NC_011080	GCG	2	6	4572498	4572503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443493
96548	NC_011080	CGATCG	2	12	4572565	4572576	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	194443493
96549	NC_011080	TCG	2	6	4572595	4572600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443493
96550	NC_011080	TGC	2	6	4572705	4572710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442613
96551	NC_011080	AGC	2	6	4572797	4572802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442613
96552	NC_011080	ATA	2	6	4572850	4572855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442613
96553	NC_011080	GAC	2	6	4572909	4572914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442613
96554	NC_011080	CAA	2	6	4572928	4572933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194442613
96555	NC_011080	GA	3	6	4572977	4572982	50 %	0 %	50 %	0 %	194442613
96556	NC_011080	AAT	2	6	4573086	4573091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442613
96557	NC_011080	AAT	2	6	4573131	4573136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442613
96558	NC_011080	GCA	2	6	4573187	4573192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442613
96559	NC_011080	CGG	2	6	4573196	4573201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442613
96560	NC_011080	GC	3	6	4573249	4573254	0 %	0 %	50 %	50 %	194442613
96561	NC_011080	GAC	2	6	4573285	4573290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442613
96562	NC_011080	GGC	2	6	4573425	4573430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442613
96563	NC_011080	TAAT	2	8	4573442	4573449	50 %	50 %	0 %	0 %	194442613
96564	NC_011080	CG	3	6	4573490	4573495	0 %	0 %	50 %	50 %	194442613
96565	NC_011080	GCCA	2	8	4573556	4573563	25 %	0 %	25 %	50 %	194442613
96566	NC_011080	CGC	2	6	4573694	4573699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442613
96567	NC_011080	CAGCA	2	10	4573722	4573731	40 %	0 %	20 %	40 %	194442613
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96569	NC_011080	GCC	2	6	4573798	4573803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442613
96570	NC_011080	CAGC	2	8	4573808	4573815	25 %	0 %	25 %	50 %	194442613
96571	NC_011080	TAA	2	6	4573842	4573847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442613
96572	NC_011080	AACC	2	8	4573875	4573882	50 %	0 %	0 %	50 %	194442613
96573	NC_011080	T	7	7	4573890	4573896	0 %	100 %	0 %	0 %	194442613
96574	NC_011080	TTCA	2	8	4573899	4573906	25 %	50 %	0 %	25 %	194442613
96575	NC_011080	CGG	2	6	4573920	4573925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442613
96576	NC_011080	GAC	2	6	4573942	4573947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96577	NC_011080	CA	3	6	4573966	4573971	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96578	NC_011080	T	6	6	4574038	4574043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96579	NC_011080	AGA	2	6	4574049	4574054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96580	NC_011080	T	8	8	4574056	4574063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96581	NC_011080	C	6	6	4574069	4574074	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
96582	NC_011080	CCCCAT	2	12	4574089	4574100	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96583	NC_011080	CT	3	6	4574101	4574106	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96584	NC_011080	AAG	2	6	4574226	4574231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443069
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96586	NC_011080	ATC	2	6	4574300	4574305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443069
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96589	NC_011080	ACG	2	6	4574548	4574553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443904
96590	NC_011080	TGC	2	6	4574566	4574571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443904
96591	NC_011080	GCG	2	6	4574572	4574577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443904
96592	NC_011080	GC	3	6	4574728	4574733	0 %	0 %	50 %	50 %	194443904
96593	NC_011080	AAG	2	6	4574743	4574748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443904
96594	NC_011080	ACG	2	6	4574764	4574769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443904
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96598	NC_011080	TGC	2	6	4574891	4574896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443904
96599	NC_011080	AGGT	2	8	4574956	4574963	25 %	25 %	50 %	0 %	194443904
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96602	NC_011080	TCA	2	6	4575040	4575045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443904
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96604	NC_011080	CTG	2	6	4575180	4575185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443904
96605	NC_011080	TGC	2	6	4575217	4575222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443904
96606	NC_011080	GCT	2	6	4575257	4575262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443904
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96609	NC_011080	TCG	2	6	4575368	4575373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443904
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96614	NC_011080	ATC	2	6	4575513	4575518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443904
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