MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 101857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
95001	NC_011080	CGT	2	6	4500971	4500976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446196
95002	NC_011080	CGCT	2	8	4500982	4500989	0 %	25 %	25 %	50 %	194446196
95003	NC_011080	CATT	2	8	4501030	4501037	25 %	50 %	0 %	25 %	194446196
95004	NC_011080	CTG	2	6	4501043	4501048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446196
95005	NC_011080	GCC	2	6	4501058	4501063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446196
95006	NC_011080	AAAC	2	8	4501106	4501113	75 %	0 %	0 %	25 %	194446196
95007	NC_011080	GCA	2	6	4501162	4501167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446196
95008	NC_011080	CGTC	2	8	4501284	4501291	0 %	25 %	25 %	50 %	194446196
95009	NC_011080	TGG	2	6	4501348	4501353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446196
95010	NC_011080	CAC	2	6	4501403	4501408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446196
95011	NC_011080	ATT	2	6	4501443	4501448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95012	NC_011080	TAT	2	6	4501521	4501526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95013	NC_011080	T	6	6	4501633	4501638	0 %	100 %	0 %	0 %	194446698
95014	NC_011080	ATT	2	6	4501725	4501730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446698
95015	NC_011080	GCTG	2	8	4501759	4501766	0 %	25 %	50 %	25 %	194446698
95016	NC_011080	CGT	2	6	4501799	4501804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446698
95017	NC_011080	TGG	2	6	4501834	4501839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446698
95018	NC_011080	GTGG	2	8	4501901	4501908	0 %	25 %	75 %	0 %	194446698
95019	NC_011080	ATGAG	2	10	4501927	4501936	40 %	20 %	40 %	0 %	194446698
95020	NC_011080	CTG	2	6	4502071	4502076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445202
95021	NC_011080	GCT	2	6	4502145	4502150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445202
95022	NC_011080	GGT	2	6	4502250	4502255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445202
95023	NC_011080	TGGC	2	8	4502275	4502282	0 %	25 %	50 %	25 %	194445202
95024	NC_011080	GGC	3	9	4502355	4502363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445202
95025	NC_011080	GGGC	2	8	4502373	4502380	0 %	0 %	75 %	25 %	194445202
95026	NC_011080	TGG	2	6	4502390	4502395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445202
95027	NC_011080	GTC	2	6	4502407	4502412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445202
95028	NC_011080	TC	3	6	4502457	4502462	0 %	50 %	0 %	50 %	194445202
95029	NC_011080	CGGCG	2	10	4502496	4502505	0 %	0 %	60 %	40 %	194445202
95030	NC_011080	GGGC	2	8	4502513	4502520	0 %	0 %	75 %	25 %	194445202
95031	NC_011080	CAG	2	6	4502545	4502550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445202
95032	NC_011080	CGT	2	6	4502556	4502561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445202
95033	NC_011080	ATG	2	6	4502575	4502580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445202
95034	NC_011080	GTG	2	6	4502590	4502595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445202
95035	NC_011080	TGG	2	6	4502615	4502620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445202
95036	NC_011080	TCC	2	6	4502641	4502646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95037	NC_011080	GGA	2	6	4502660	4502665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95038	NC_011080	TTG	2	6	4502691	4502696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444560
95039	NC_011080	GAA	2	6	4502784	4502789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444560
95040	NC_011080	ATC	2	6	4502896	4502901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444560
95041	NC_011080	CAC	2	6	4502904	4502909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444560
95042	NC_011080	GCC	2	6	4502931	4502936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444560
95043	NC_011080	CG	3	6	4502948	4502953	0 %	0 %	50 %	50 %	194444560
95044	NC_011080	ATG	2	6	4502986	4502991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444560
95045	NC_011080	CCA	2	6	4503029	4503034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444560
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95048	NC_011080	TGG	2	6	4503224	4503229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444560
95049	NC_011080	CCG	2	6	4503293	4503298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444560
95050	NC_011080	GCC	2	6	4503309	4503314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444560
95051	NC_011080	GC	3	6	4503320	4503325	0 %	0 %	50 %	50 %	194444560
95052	NC_011080	CCA	2	6	4503356	4503361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444560
95053	NC_011080	ATA	2	6	4503382	4503387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194444560
95054	NC_011080	GC	3	6	4503441	4503446	0 %	0 %	50 %	50 %	194444560
95055	NC_011080	CGG	2	6	4503497	4503502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444560
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95080	NC_011080	CG	3	6	4504696	4504701	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95081	NC_011080	TGAACT	2	12	4504716	4504727	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95082	NC_011080	TGC	2	6	4504729	4504734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95083	NC_011080	GCC	2	6	4504752	4504757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95084	NC_011080	T	6	6	4504789	4504794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95085	NC_011080	GA	3	6	4504815	4504820	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95086	NC_011080	CGCGTT	2	12	4504852	4504863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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95089	NC_011080	GCG	2	6	4505002	4505007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442988
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95098	NC_011080	GC	3	6	4505416	4505421	0 %	0 %	50 %	50 %	194442988
95099	NC_011080	TGA	2	6	4505442	4505447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442988
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95102	NC_011080	AAAG	2	8	4505515	4505522	75 %	0 %	25 %	0 %	194442988
95103	NC_011080	GCG	2	6	4505565	4505570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442988
95104	NC_011080	CCA	2	6	4505599	4505604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194442988
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95108	NC_011080	CGGT	2	8	4505711	4505718	0 %	25 %	50 %	25 %	194442988
95109	NC_011080	GC	3	6	4505751	4505756	0 %	0 %	50 %	50 %	194442988
95110	NC_011080	ACC	2	6	4505804	4505809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194442988
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95115	NC_011080	CGG	2	6	4505925	4505930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442988
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