MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 101857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
94001	NC_011080	CG	3	6	4452335	4452340	0 %	0 %	50 %	50 %	194446191
94002	NC_011080	CGC	2	6	4452369	4452374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446191
94003	NC_011080	GGA	2	6	4452376	4452381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194446191
94004	NC_011080	TGGC	2	8	4452430	4452437	0 %	25 %	50 %	25 %	194446191
94005	NC_011080	CGT	2	6	4452487	4452492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446191
94006	NC_011080	ATT	2	6	4452577	4452582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443290
94007	NC_011080	CAG	2	6	4452591	4452596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443290
94008	NC_011080	ATG	2	6	4452643	4452648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94009	NC_011080	GAT	2	6	4452656	4452661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442266
94010	NC_011080	CGG	2	6	4452677	4452682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442266
94011	NC_011080	GGTA	2	8	4452776	4452783	25 %	25 %	50 %	0 %	194442266
94012	NC_011080	GTT	2	6	4452831	4452836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194442266
94013	NC_011080	AAC	2	6	4452852	4452857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194442266
94014	NC_011080	CT	3	6	4452938	4452943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94015	NC_011080	GCC	2	6	4452947	4452952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94016	NC_011080	T	6	6	4452978	4452983	0 %	100 %	0 %	0 %	194444041
94017	NC_011080	CTTCTA	2	12	4453034	4453045	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	194444041
94018	NC_011080	CGCA	2	8	4453046	4453053	25 %	0 %	25 %	50 %	194444041
94019	NC_011080	GCC	2	6	4453108	4453113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444041
94020	NC_011080	ATG	2	6	4453123	4453128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444041
94021	NC_011080	CTTC	2	8	4453151	4453158	0 %	50 %	0 %	50 %	194444041
94022	NC_011080	CGC	2	6	4453163	4453168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444041
94023	NC_011080	TGG	2	6	4453238	4453243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444041
94024	NC_011080	A	6	6	4453276	4453281	100 %	0 %	0 %	0 %	194444041
94025	NC_011080	GC	3	6	4453286	4453291	0 %	0 %	50 %	50 %	194444041
94026	NC_011080	TGG	2	6	4453298	4453303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444041
94027	NC_011080	GCA	2	6	4453331	4453336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444041
94028	NC_011080	TCA	2	6	4453379	4453384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444041
94029	NC_011080	GCA	2	6	4453388	4453393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444041
94030	NC_011080	TGCGC	2	10	4453424	4453433	0 %	20 %	40 %	40 %	194444041
94031	NC_011080	GCT	2	6	4453532	4453537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94032	NC_011080	AT	3	6	4453564	4453569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94033	NC_011080	AAC	2	6	4453630	4453635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94034	NC_011080	ATA	2	6	4453712	4453717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94035	NC_011080	GCC	2	6	4453800	4453805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444774
94036	NC_011080	GCGTC	2	10	4453849	4453858	0 %	20 %	40 %	40 %	194444774
94037	NC_011080	TGT	2	6	4453931	4453936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444774
94038	NC_011080	TAC	2	6	4454016	4454021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444774
94039	NC_011080	GTC	2	6	4454028	4454033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444774
94040	NC_011080	CG	4	8	4454099	4454106	0 %	0 %	50 %	50 %	194444774
94041	NC_011080	CCGC	2	8	4454143	4454150	0 %	0 %	25 %	75 %	194444774
94042	NC_011080	ATG	2	6	4454290	4454295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444774
94043	NC_011080	GCT	2	6	4454325	4454330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444774
94044	NC_011080	TGG	2	6	4454431	4454436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444774
94045	NC_011080	A	6	6	4454476	4454481	100 %	0 %	0 %	0 %	194444774
94046	NC_011080	ACC	2	6	4454499	4454504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444774
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94048	NC_011080	TGC	2	6	4454588	4454593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444774
94049	NC_011080	ACC	2	6	4454697	4454702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444774
94050	NC_011080	ATAC	2	8	4454713	4454720	50 %	25 %	0 %	25 %	194444774
94051	NC_011080	TGGC	2	8	4454871	4454878	0 %	25 %	50 %	25 %	194444774
94052	NC_011080	GC	3	6	4454882	4454887	0 %	0 %	50 %	50 %	194444774
94053	NC_011080	CGG	2	6	4454933	4454938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444774
94054	NC_011080	G	6	6	4455007	4455012	0 %	0 %	100 %	0 %	194444774
94055	NC_011080	GC	3	6	4455016	4455021	0 %	0 %	50 %	50 %	194444774
94056	NC_011080	T	6	6	4455100	4455105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94057	NC_011080	TTAT	2	8	4455116	4455123	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94058	NC_011080	TCC	2	6	4455147	4455152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194446261
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94060	NC_011080	GCT	2	6	4455245	4455250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446261
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94064	NC_011080	GTC	2	6	4455522	4455527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446261
94065	NC_011080	CGGTAA	2	12	4455535	4455546	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	194446261
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94067	NC_011080	TAT	2	6	4455638	4455643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446261
94068	NC_011080	GC	3	6	4455648	4455653	0 %	0 %	50 %	50 %	194446261
94069	NC_011080	GAAA	2	8	4455680	4455687	75 %	0 %	25 %	0 %	194446261
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94071	NC_011080	CG	3	6	4455715	4455720	0 %	0 %	50 %	50 %	194446261
94072	NC_011080	CGG	2	6	4455767	4455772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446261
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94077	NC_011080	GTT	2	6	4456004	4456009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194446261
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94080	NC_011080	TA	3	6	4456189	4456194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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94082	NC_011080	ACT	2	6	4456303	4456308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94083	NC_011080	T	6	6	4456322	4456327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94084	NC_011080	TGA	2	6	4456422	4456427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94085	NC_011080	CTG	2	6	4456448	4456453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94086	NC_011080	TGTGG	2	10	4456462	4456471	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
94087	NC_011080	ATT	2	6	4456595	4456600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94088	NC_011080	TACA	2	8	4456647	4456654	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94089	NC_011080	A	6	6	4456662	4456667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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94091	NC_011080	TG	3	6	4456736	4456741	0 %	50 %	50 %	0 %	194443299
94092	NC_011080	GC	3	6	4456764	4456769	0 %	0 %	50 %	50 %	194443299
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94101	NC_011080	GC	3	6	4457169	4457174	0 %	0 %	50 %	50 %	194443299
94102	NC_011080	CGC	2	6	4457238	4457243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443299
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94104	NC_011080	A	6	6	4457307	4457312	100 %	0 %	0 %	0 %	194443299
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94107	NC_011080	ACG	2	6	4457526	4457531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443299
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94110	NC_011080	TCC	2	6	4457698	4457703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94111	NC_011080	CAA	2	6	4457779	4457784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194443549
94112	NC_011080	CCGCGA	2	12	4457800	4457811	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	194443549
94113	NC_011080	GCC	2	6	4457836	4457841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443549
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94115	NC_011080	CCCG	2	8	4457943	4457950	0 %	0 %	25 %	75 %	194443549
94116	NC_011080	CGG	2	6	4458058	4458063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443549
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94119	NC_011080	CTG	2	6	4458227	4458232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443549
94120	NC_011080	CG	3	6	4458246	4458251	0 %	0 %	50 %	50 %	194443549
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94132	NC_011080	GAT	2	6	4459163	4459168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443549
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