MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 101857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
93501	NC_011080	A	6	6	4428661	4428666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93502	NC_011080	CAA	2	6	4428691	4428696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93503	NC_011080	AATA	2	8	4428704	4428711	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93504	NC_011080	TGC	2	6	4428787	4428792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93505	NC_011080	ATA	2	6	4428796	4428801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93506	NC_011080	A	7	7	4428892	4428898	100 %	0 %	0 %	0 %	194445870
93507	NC_011080	A	6	6	4428902	4428907	100 %	0 %	0 %	0 %	194445870
93508	NC_011080	ATG	2	6	4428939	4428944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93509	NC_011080	AAAT	2	8	4428973	4428980	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93510	NC_011080	AT	6	12	4429002	4429013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93511	NC_011080	T	7	7	4429013	4429019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93512	NC_011080	TA	4	8	4429053	4429060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93513	NC_011080	T	6	6	4429094	4429099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93514	NC_011080	GTC	2	6	4429117	4429122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93515	NC_011080	ATT	2	6	4429196	4429201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446521
93516	NC_011080	ATG	2	6	4429298	4429303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446521
93517	NC_011080	GGGC	2	8	4429312	4429319	0 %	0 %	75 %	25 %	194446521
93518	NC_011080	ATTT	2	8	4429325	4429332	25 %	75 %	0 %	0 %	194446521
93519	NC_011080	GCG	2	6	4429489	4429494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446521
93520	NC_011080	AGC	2	6	4429549	4429554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93521	NC_011080	ATT	2	6	4429634	4429639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444588
93522	NC_011080	CAC	2	6	4429665	4429670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444588
93523	NC_011080	CTT	2	6	4429769	4429774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194444588
93524	NC_011080	GTT	2	6	4429800	4429805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444588
93525	NC_011080	CTT	2	6	4429832	4429837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194444588
93526	NC_011080	GTGGAG	2	12	4429903	4429914	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	194444588
93527	NC_011080	GTA	2	6	4429918	4429923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444588
93528	NC_011080	GCA	2	6	4430027	4430032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444588
93529	NC_011080	GCG	2	6	4430067	4430072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444588
93530	NC_011080	CAGCGC	2	12	4430073	4430084	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	194444588
93531	NC_011080	GCG	2	6	4430093	4430098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444588
93532	NC_011080	CCGC	2	8	4430128	4430135	0 %	0 %	25 %	75 %	194444588
93533	NC_011080	CCG	2	6	4430237	4430242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444588
93534	NC_011080	CTT	2	6	4430243	4430248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194444588
93535	NC_011080	TCA	2	6	4430260	4430265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444588
93536	NC_011080	CG	3	6	4430288	4430293	0 %	0 %	50 %	50 %	194444588
93537	NC_011080	GGT	2	6	4430298	4430303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444588
93538	NC_011080	CG	3	6	4430338	4430343	0 %	0 %	50 %	50 %	194444588
93539	NC_011080	CAGC	2	8	4430357	4430364	25 %	0 %	25 %	50 %	194444588
93540	NC_011080	GCC	2	6	4430385	4430390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444588
93541	NC_011080	GTG	2	6	4430404	4430409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444588
93542	NC_011080	CTG	2	6	4430478	4430483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444588
93543	NC_011080	CAA	2	6	4430603	4430608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194444588
93544	NC_011080	GCC	2	6	4430680	4430685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444588
93545	NC_011080	CAG	2	6	4430709	4430714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444588
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93547	NC_011080	AAC	2	6	4430967	4430972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194444588
93548	NC_011080	CAGAA	2	10	4431031	4431040	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
93549	NC_011080	TAAA	2	8	4431075	4431082	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93550	NC_011080	T	6	6	4431121	4431126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93551	NC_011080	GCC	2	6	4431176	4431181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93552	NC_011080	ATT	2	6	4431196	4431201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93553	NC_011080	TA	3	6	4431207	4431212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93554	NC_011080	AGA	2	6	4431314	4431319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93555	NC_011080	ATGAA	2	10	4431387	4431396	60 %	20 %	20 %	0 %	194443805
93556	NC_011080	TGG	2	6	4431477	4431482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443805
93557	NC_011080	TGC	2	6	4431615	4431620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443805
93558	NC_011080	ATC	2	6	4431653	4431658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443805
93559	NC_011080	GTG	2	6	4431776	4431781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443805
93560	NC_011080	CGG	2	6	4431793	4431798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443805
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93563	NC_011080	CAC	2	6	4431958	4431963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443805
93564	NC_011080	GC	4	8	4431990	4431997	0 %	0 %	50 %	50 %	194443805
93565	NC_011080	TGC	2	6	4432048	4432053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443805
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93571	NC_011080	CCA	2	6	4432242	4432247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443805
93572	NC_011080	CGG	2	6	4432251	4432256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443805
93573	NC_011080	CTG	2	6	4432274	4432279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443805
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93582	NC_011080	CTG	2	6	4432745	4432750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443805
93583	NC_011080	GC	3	6	4432776	4432781	0 %	0 %	50 %	50 %	194443805
93584	NC_011080	GAT	2	6	4432904	4432909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443805
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93586	NC_011080	GC	3	6	4432969	4432974	0 %	0 %	50 %	50 %	194443805
93587	NC_011080	CGC	2	6	4433039	4433044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93588	NC_011080	ATA	2	6	4433067	4433072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93589	NC_011080	T	7	7	4433096	4433102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93590	NC_011080	ATT	2	6	4433240	4433245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93591	NC_011080	TTA	2	6	4433258	4433263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93592	NC_011080	TGT	2	6	4433279	4433284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93593	NC_011080	CATT	2	8	4433396	4433403	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93594	NC_011080	ATG	2	6	4433419	4433424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444457
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93604	NC_011080	AGT	2	6	4433660	4433665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444457
93605	NC_011080	TAACCA	2	12	4433677	4433688	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93606	NC_011080	CGT	2	6	4433724	4433729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442530
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93616	NC_011080	CCGTT	2	10	4434150	4434159	0 %	40 %	20 %	40 %	194442530
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