MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 101857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
91501	NC_011080	GCGCT	2	10	4329832	4329841	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
91502	NC_011080	TAC	2	6	4329921	4329926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442464
91503	NC_011080	TAA	2	6	4329953	4329958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442464
91504	NC_011080	CAGTA	2	10	4330055	4330064	40 %	20 %	20 %	20 %	194442464
91505	NC_011080	CAC	2	6	4330068	4330073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194442464
91506	NC_011080	CTA	2	6	4330100	4330105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442464
91507	NC_011080	TGG	2	6	4330117	4330122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442464
91508	NC_011080	CGG	2	6	4330149	4330154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442464
91509	NC_011080	CGGCC	2	10	4330177	4330186	0 %	0 %	40 %	60 %	194442464
91510	NC_011080	CGT	2	6	4330211	4330216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442464
91511	NC_011080	GCA	2	6	4330281	4330286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442464
91512	NC_011080	CGC	2	6	4330310	4330315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442464
91513	NC_011080	GC	3	6	4330517	4330522	0 %	0 %	50 %	50 %	194442464
91514	NC_011080	ACG	2	6	4330535	4330540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442464
91515	NC_011080	CGG	2	6	4330625	4330630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442464
91516	NC_011080	ACGTCA	2	12	4330666	4330677	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	194442464
91517	NC_011080	GAA	2	6	4330701	4330706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194442464
91518	NC_011080	CG	3	6	4330772	4330777	0 %	0 %	50 %	50 %	194442464
91519	NC_011080	CGTC	2	8	4330783	4330790	0 %	25 %	25 %	50 %	194442464
91520	NC_011080	CAG	2	6	4330821	4330826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442464
91521	NC_011080	CCGC	2	8	4330831	4330838	0 %	0 %	25 %	75 %	194442464
91522	NC_011080	GCAA	2	8	4330933	4330940	50 %	0 %	25 %	25 %	194442464
91523	NC_011080	TTC	2	6	4330974	4330979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194442464
91524	NC_011080	TTG	2	6	4331051	4331056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194442464
91525	NC_011080	AC	3	6	4331057	4331062	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91526	NC_011080	ATTA	2	8	4331093	4331100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91527	NC_011080	CCAC	2	8	4331208	4331215	25 %	0 %	0 %	75 %	194445279
91528	NC_011080	ATG	2	6	4331255	4331260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445279
91529	NC_011080	CGT	2	6	4331430	4331435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445279
91530	NC_011080	TAT	2	6	4331488	4331493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194445279
91531	NC_011080	TCA	2	6	4331502	4331507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445279
91532	NC_011080	GCT	2	6	4331517	4331522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445279
91533	NC_011080	CGCAG	2	10	4331610	4331619	20 %	0 %	40 %	40 %	194445279
91534	NC_011080	CGG	2	6	4331643	4331648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445279
91535	NC_011080	TAAT	2	8	4331675	4331682	50 %	50 %	0 %	0 %	194445279
91536	NC_011080	CCA	2	6	4331684	4331689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194445279
91537	NC_011080	GCG	2	6	4331699	4331704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445279
91538	NC_011080	TCA	2	6	4331778	4331783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445279
91539	NC_011080	CG	3	6	4331846	4331851	0 %	0 %	50 %	50 %	194445279
91540	NC_011080	GCC	2	6	4331873	4331878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445279
91541	NC_011080	CGT	2	6	4331985	4331990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445279
91542	NC_011080	TGG	2	6	4332044	4332049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445279
91543	NC_011080	TTG	2	6	4332064	4332069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445279
91544	NC_011080	GCG	2	6	4332079	4332084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445279
91545	NC_011080	ATG	2	6	4332152	4332157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444582
91546	NC_011080	ATTA	2	8	4332163	4332170	50 %	50 %	0 %	0 %	194444582
91547	NC_011080	GGC	2	6	4332278	4332283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444582
91548	NC_011080	GTG	2	6	4332290	4332295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444582
91549	NC_011080	TGA	2	6	4332303	4332308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444582
91550	NC_011080	AAAG	2	8	4332331	4332338	75 %	0 %	25 %	0 %	194444582
91551	NC_011080	CAT	2	6	4332373	4332378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444582
91552	NC_011080	GC	3	6	4332384	4332389	0 %	0 %	50 %	50 %	194444582
91553	NC_011080	CTG	2	6	4332413	4332418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444582
91554	NC_011080	GAA	2	6	4332427	4332432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444582
91555	NC_011080	TGC	2	6	4332555	4332560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444582
91556	NC_011080	GGT	2	6	4332580	4332585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444582
91557	NC_011080	GAC	2	6	4332605	4332610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444582
91558	NC_011080	TGA	2	6	4332618	4332623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444582
91559	NC_011080	GGC	2	6	4332640	4332645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444582
91560	NC_011080	GGC	2	6	4332655	4332660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444582
91561	NC_011080	AGC	2	6	4332756	4332761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444582
91562	NC_011080	ATT	2	6	4332776	4332781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444582
91563	NC_011080	GAT	2	6	4332790	4332795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444582
91564	NC_011080	TGC	2	6	4332820	4332825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444582
91565	NC_011080	CTGC	2	8	4332878	4332885	0 %	25 %	25 %	50 %	194444582
91566	NC_011080	GGC	2	6	4332946	4332951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91567	NC_011080	GAA	2	6	4333024	4333029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91568	NC_011080	TAT	2	6	4333041	4333046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443574
91569	NC_011080	GGC	2	6	4333074	4333079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443574
91570	NC_011080	ACTG	2	8	4333191	4333198	25 %	25 %	25 %	25 %	194443574
91571	NC_011080	GAA	2	6	4333219	4333224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443574
91572	NC_011080	CG	3	6	4333252	4333257	0 %	0 %	50 %	50 %	194443574
91573	NC_011080	GCA	2	6	4333263	4333268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443574
91574	NC_011080	GC	3	6	4333454	4333459	0 %	0 %	50 %	50 %	194443574
91575	NC_011080	TGG	2	6	4333460	4333465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443574
91576	NC_011080	CG	3	6	4333519	4333524	0 %	0 %	50 %	50 %	194443574
91577	NC_011080	GC	3	6	4333573	4333578	0 %	0 %	50 %	50 %	194443574
91578	NC_011080	GCC	2	6	4333586	4333591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443574
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91580	NC_011080	GGCT	2	8	4333684	4333691	0 %	25 %	50 %	25 %	194443574
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91582	NC_011080	ATG	3	9	4333960	4333968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443574
91583	NC_011080	AAG	2	6	4334018	4334023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443574
91584	NC_011080	CTGC	2	8	4334055	4334062	0 %	25 %	25 %	50 %	194443574
91585	NC_011080	GGC	2	6	4334067	4334072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443574
91586	NC_011080	TTG	2	6	4334204	4334209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443574
91587	NC_011080	GGT	2	6	4334217	4334222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443574
91588	NC_011080	CGA	2	6	4334298	4334303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443574
91589	NC_011080	GGC	2	6	4334346	4334351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443574
91590	NC_011080	GGC	2	6	4334356	4334361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443574
91591	NC_011080	GC	3	6	4334404	4334409	0 %	0 %	50 %	50 %	194443574
91592	NC_011080	T	6	6	4334482	4334487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91593	NC_011080	A	8	8	4334492	4334499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91594	NC_011080	GA	3	6	4334551	4334556	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91595	NC_011080	TAT	2	6	4334617	4334622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91596	NC_011080	TCGT	2	8	4334648	4334655	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91597	NC_011080	TGCTA	2	10	4334656	4334665	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
91598	NC_011080	GGA	2	6	4334693	4334698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91599	NC_011080	AAT	2	6	4334701	4334706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442679
91600	NC_011080	TGG	2	6	4334730	4334735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442679
91601	NC_011080	GCG	2	6	4334765	4334770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442679
91602	NC_011080	CAGC	2	8	4334785	4334792	25 %	0 %	25 %	50 %	194442679
91603	NC_011080	TGC	2	6	4334841	4334846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442679
91604	NC_011080	CTG	2	6	4334891	4334896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442679
91605	NC_011080	CGTAC	2	10	4334909	4334918	20 %	20 %	20 %	40 %	194442679
91606	NC_011080	CAA	2	6	4334954	4334959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194442679
91607	NC_011080	CAA	2	6	4335000	4335005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194442679
91608	NC_011080	TGC	2	6	4335018	4335023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442679
91609	NC_011080	AG	3	6	4335154	4335159	50 %	0 %	50 %	0 %	194442679
91610	NC_011080	TGA	2	6	4335187	4335192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442679
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91612	NC_011080	ATC	2	6	4335219	4335224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442679
91613	NC_011080	ATCGCG	2	12	4335234	4335245	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	194442679
91614	NC_011080	GGCG	2	8	4335262	4335269	0 %	0 %	75 %	25 %	194442679
91615	NC_011080	TGG	2	6	4335393	4335398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442679
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