MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 101857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
90001	NC_011080	GCAAAA	2	12	4261373	4261384	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	194442964
90002	NC_011080	GC	3	6	4261421	4261426	0 %	0 %	50 %	50 %	194442964
90003	NC_011080	AAAGC	2	10	4261440	4261449	60 %	0 %	20 %	20 %	194442964
90004	NC_011080	A	6	6	4261473	4261478	100 %	0 %	0 %	0 %	194442964
90005	NC_011080	GAC	2	6	4261538	4261543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442964
90006	NC_011080	GC	3	6	4261571	4261576	0 %	0 %	50 %	50 %	194442964
90007	NC_011080	GT	3	6	4261675	4261680	0 %	50 %	50 %	0 %	194442964
90008	NC_011080	AAT	2	6	4261743	4261748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442964
90009	NC_011080	ACG	2	6	4261758	4261763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442964
90010	NC_011080	CT	3	6	4261785	4261790	0 %	50 %	0 %	50 %	194442964
90011	NC_011080	GAT	3	9	4261812	4261820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442964
90012	NC_011080	TA	3	6	4261846	4261851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90013	NC_011080	GCC	2	6	4261931	4261936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90014	NC_011080	CACG	2	8	4261937	4261944	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90015	NC_011080	CAA	2	6	4262102	4262107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90016	NC_011080	A	7	7	4262127	4262133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90017	NC_011080	CAT	2	6	4262199	4262204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90018	NC_011080	GTT	2	6	4262314	4262319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90019	NC_011080	CAT	2	6	4262384	4262389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90020	NC_011080	ATT	2	6	4262436	4262441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90021	NC_011080	CTTT	2	8	4262443	4262450	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90022	NC_011080	TGGGCG	2	12	4262509	4262520	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
90023	NC_011080	AGA	2	6	4262530	4262535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90024	NC_011080	TTA	2	6	4262583	4262588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90025	NC_011080	GTT	2	6	4262604	4262609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90026	NC_011080	A	6	6	4262628	4262633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90027	NC_011080	GAT	2	6	4262690	4262695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90028	NC_011080	GGT	2	6	4262722	4262727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90029	NC_011080	ATG	2	6	4262759	4262764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90030	NC_011080	T	8	8	4262771	4262778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90031	NC_011080	TTA	2	6	4262799	4262804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90032	NC_011080	TAC	2	6	4262830	4262835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90033	NC_011080	AGA	2	6	4262840	4262845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90034	NC_011080	GGC	2	6	4262892	4262897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442416
90035	NC_011080	GTG	2	6	4262949	4262954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442416
90036	NC_011080	GGC	2	6	4262979	4262984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442416
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90038	NC_011080	TGG	2	6	4262999	4263004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442416
90039	NC_011080	TTG	2	6	4263028	4263033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194442416
90040	NC_011080	GAT	2	6	4263061	4263066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442416
90041	NC_011080	GGC	2	6	4263102	4263107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442416
90042	NC_011080	GTT	2	6	4263141	4263146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194442416
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90048	NC_011080	ATT	2	6	4263511	4263516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194442416
90049	NC_011080	GCG	2	6	4263545	4263550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442416
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90051	NC_011080	GTC	2	6	4263724	4263729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442416
90052	NC_011080	ATTG	2	8	4263762	4263769	25 %	50 %	25 %	0 %	194442416
90053	NC_011080	GCCAG	2	10	4263781	4263790	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
90054	NC_011080	CCTGA	2	10	4263820	4263829	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
90055	NC_011080	CAG	2	6	4263837	4263842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90056	NC_011080	GT	3	6	4263963	4263968	0 %	50 %	50 %	0 %	194442637
90057	NC_011080	GCG	2	6	4263975	4263980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442637
90058	NC_011080	GC	3	6	4264021	4264026	0 %	0 %	50 %	50 %	194442637
90059	NC_011080	A	6	6	4264217	4264222	100 %	0 %	0 %	0 %	194442637
90060	NC_011080	GGC	2	6	4264250	4264255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442637
90061	NC_011080	CTGA	2	8	4264283	4264290	25 %	25 %	25 %	25 %	194442637
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90063	NC_011080	GCG	2	6	4264467	4264472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442637
90064	NC_011080	GGC	3	9	4264483	4264491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442637
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90071	NC_011080	CTG	3	9	4264769	4264777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442637
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90091	NC_011080	CGG	2	6	4265559	4265564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442753
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90094	NC_011080	GC	4	8	4265684	4265691	0 %	0 %	50 %	50 %	194442753
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90101	NC_011080	A	6	6	4265974	4265979	100 %	0 %	0 %	0 %	194442753
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90107	NC_011080	T	6	6	4266140	4266145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90108	NC_011080	A	7	7	4266206	4266212	100 %	0 %	0 %	0 %	513538141
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90229	NC_011080	AT	3	6	4271079	4271084	50 %	50 %	0 %	0 %	194444714
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90235	NC_011080	CCTG	2	8	4271406	4271413	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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