MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 101857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_011080	CGG	2	6	402233	402238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443154
8502	NC_011080	CGCCTG	2	12	402351	402362	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	194443154
8503	NC_011080	CGG	2	6	402398	402403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443154
8504	NC_011080	GATC	2	8	402431	402438	25 %	25 %	25 %	25 %	194443154
8505	NC_011080	CAG	2	6	402444	402449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443154
8506	NC_011080	TCC	2	6	402501	402506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194443154
8507	NC_011080	CG	3	6	402509	402514	0 %	0 %	50 %	50 %	194443154
8508	NC_011080	CCG	2	6	402560	402565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443154
8509	NC_011080	GGC	2	6	402616	402621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443154
8510	NC_011080	GC	3	6	402620	402625	0 %	0 %	50 %	50 %	194443154
8511	NC_011080	G	6	6	402631	402636	0 %	0 %	100 %	0 %	194443154
8512	NC_011080	GGC	2	6	402696	402701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443154
8513	NC_011080	CAT	2	6	402895	402900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8514	NC_011080	GTC	2	6	403014	403019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8515	NC_011080	AGTC	2	8	403023	403030	25 %	25 %	25 %	25 %	194442931
8516	NC_011080	CACGA	2	10	403041	403050	40 %	0 %	20 %	40 %	194442931
8517	NC_011080	GCTT	2	8	403054	403061	0 %	50 %	25 %	25 %	194442931
8518	NC_011080	CGT	2	6	403081	403086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442931
8519	NC_011080	TCGC	2	8	403090	403097	0 %	25 %	25 %	50 %	194442931
8520	NC_011080	GC	3	6	403160	403165	0 %	0 %	50 %	50 %	194442931
8521	NC_011080	CGG	2	6	403186	403191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442931
8522	NC_011080	A	6	6	403213	403218	100 %	0 %	0 %	0 %	194442931
8523	NC_011080	CGG	2	6	403246	403251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442931
8524	NC_011080	GAC	2	6	403263	403268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442931
8525	NC_011080	A	6	6	403278	403283	100 %	0 %	0 %	0 %	194442931
8526	NC_011080	CAA	2	6	403416	403421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194442931
8527	NC_011080	TGG	2	6	403573	403578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442931
8528	NC_011080	GCC	2	6	403632	403637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442931
8529	NC_011080	CTG	2	6	403659	403664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442931
8530	NC_011080	TGG	2	6	403720	403725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442931
8531	NC_011080	CGA	2	6	403784	403789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442931
8532	NC_011080	TG	3	6	403806	403811	0 %	50 %	50 %	0 %	194442931
8533	NC_011080	GAT	2	6	403883	403888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442931
8534	NC_011080	GGT	2	6	403931	403936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442931
8535	NC_011080	GC	3	6	403960	403965	0 %	0 %	50 %	50 %	194442931
8536	NC_011080	CCG	2	6	403981	403986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442931
8537	NC_011080	CGG	2	6	403988	403993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442931
8538	NC_011080	TGG	2	6	404023	404028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442931
8539	NC_011080	CGT	2	6	404063	404068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442931
8540	NC_011080	TGC	2	6	404111	404116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442931
8541	NC_011080	TGGC	2	8	404133	404140	0 %	25 %	50 %	25 %	194442931
8542	NC_011080	TGG	2	6	404245	404250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442931
8543	NC_011080	GGT	2	6	404324	404329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442931
8544	NC_011080	GCC	2	6	404362	404367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442931
8545	NC_011080	CGG	2	6	404431	404436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442931
8546	NC_011080	TGTCG	2	10	404474	404483	0 %	40 %	40 %	20 %	194442931
8547	NC_011080	AGA	2	6	404486	404491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194442931
8548	NC_011080	CCA	2	6	404632	404637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194442931
8549	NC_011080	CCG	2	6	404638	404643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442931
8550	NC_011080	CGC	2	6	404668	404673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442931
8551	NC_011080	GGC	2	6	404699	404704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442931
8552	NC_011080	CCGAT	2	10	404719	404728	20 %	20 %	20 %	40 %	194442931
8553	NC_011080	CGC	2	6	404744	404749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442931
8554	NC_011080	TGA	2	6	404843	404848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442931
8555	NC_011080	GCG	2	6	404904	404909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442931
8556	NC_011080	GGCACC	2	12	404988	404999	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	194442931
8557	NC_011080	CCG	2	6	405016	405021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442931
8558	NC_011080	CGT	2	6	405023	405028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442931
8559	NC_011080	CCA	2	6	405098	405103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194442931
8560	NC_011080	GC	3	6	405157	405162	0 %	0 %	50 %	50 %	194442931
8561	NC_011080	ATT	2	6	405182	405187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194442931
8562	NC_011080	CGC	2	6	405200	405205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442931
8563	NC_011080	GCGATG	2	12	405210	405221	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	194442931
8564	NC_011080	GAG	3	9	405307	405315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194442931
8565	NC_011080	AGC	2	6	405334	405339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442534
8566	NC_011080	CTA	2	6	405373	405378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442534
8567	NC_011080	CGGA	2	8	405410	405417	25 %	0 %	50 %	25 %	194442534
8568	NC_011080	CGC	2	6	405470	405475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442534
8569	NC_011080	GC	4	8	405474	405481	0 %	0 %	50 %	50 %	194442534
8570	NC_011080	TGA	2	6	405583	405588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442534
8571	NC_011080	GCA	2	6	405613	405618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442534
8572	NC_011080	CTG	2	6	405649	405654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442534
8573	NC_011080	TCG	2	6	405754	405759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442534
8574	NC_011080	CA	3	6	405843	405848	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8575	NC_011080	TGA	2	6	405876	405881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444943
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8578	NC_011080	GCG	2	6	405943	405948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444943
8579	NC_011080	GCC	3	9	406012	406020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444943
8580	NC_011080	CGC	2	6	406040	406045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444943
8581	NC_011080	A	6	6	406141	406146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8582	NC_011080	TAA	2	6	406177	406182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8583	NC_011080	TA	3	6	406223	406228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8584	NC_011080	GAC	2	6	406278	406283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8585	NC_011080	CGC	2	6	406302	406307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8586	NC_011080	T	6	6	406325	406330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8587	NC_011080	C	6	6	406355	406360	0 %	0 %	0 %	100 %	194443953
8588	NC_011080	GAC	3	9	406368	406376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443953
8589	NC_011080	GC	3	6	406538	406543	0 %	0 %	50 %	50 %	194443953
8590	NC_011080	TCA	2	6	406714	406719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443953
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8592	NC_011080	TGC	2	6	406883	406888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443953
8593	NC_011080	CTGG	2	8	406923	406930	0 %	25 %	50 %	25 %	194443953
8594	NC_011080	GCT	2	6	406959	406964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443953
8595	NC_011080	GCA	2	6	407076	407081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443953
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8597	NC_011080	CGG	2	6	407142	407147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443953
8598	NC_011080	A	6	6	407185	407190	100 %	0 %	0 %	0 %	194443953
8599	NC_011080	CGC	2	6	407202	407207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443953
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8601	NC_011080	TGC	2	6	407363	407368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443953
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8603	NC_011080	TGG	2	6	407445	407450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443953
8604	NC_011080	TGGC	2	8	407477	407484	0 %	25 %	50 %	25 %	194443953
8605	NC_011080	GTC	2	6	407539	407544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443953
8606	NC_011080	TCCT	2	8	407639	407646	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8607	NC_011080	AAC	2	6	407673	407678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8608	NC_011080	ATG	2	6	407687	407692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8609	NC_011080	ATC	2	6	407718	407723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8610	NC_011080	T	6	6	407730	407735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8611	NC_011080	ATTG	2	8	407747	407754	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8612	NC_011080	TCTG	2	8	407843	407850	0 %	50 %	25 %	25 %	194443439
8613	NC_011080	T	6	6	407874	407879	0 %	100 %	0 %	0 %	194443439
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8618	NC_011080	A	7	7	408023	408029	100 %	0 %	0 %	0 %	194443439
8619	NC_011080	CAGG	2	8	408030	408037	25 %	0 %	50 %	25 %	194443439
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8622	NC_011080	ATTT	2	8	408398	408405	25 %	75 %	0 %	0 %	194443439
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8624	NC_011080	ATG	2	6	408447	408452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443439
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8872	NC_011080	CGG	2	6	420444	420449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8873	NC_011080	TCA	2	6	420513	420518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8992	NC_011080	GCC	2	6	426258	426263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444712
8993	NC_011080	GCG	2	6	426285	426290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444712
8994	NC_011080	CAC	2	6	426292	426297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444712
8995	NC_011080	GGCGCT	2	12	426346	426357	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	194444712
8996	NC_011080	TCA	2	6	426368	426373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444712
8997	NC_011080	ATG	2	6	426414	426419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444712
8998	NC_011080	GCC	2	6	426434	426439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444712
8999	NC_011080	GAT	2	6	426493	426498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444712
9000	NC_011080	CTG	2	6	426518	426523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444712

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