MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 101857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
88001	NC_011080	GGC	2	6	4166249	4166254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88002	NC_011080	ACC	2	6	4166293	4166298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444438
88003	NC_011080	CAT	2	6	4166326	4166331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444438
88004	NC_011080	TCA	2	6	4166394	4166399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444438
88005	NC_011080	AATT	2	8	4166402	4166409	50 %	50 %	0 %	0 %	194444438
88006	NC_011080	CATC	2	8	4166506	4166513	25 %	25 %	0 %	50 %	194444438
88007	NC_011080	CTT	2	6	4166542	4166547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194444438
88008	NC_011080	GCT	2	6	4166578	4166583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444438
88009	NC_011080	TGC	2	6	4166603	4166608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444438
88010	NC_011080	ATG	2	6	4166663	4166668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444438
88011	NC_011080	T	6	6	4166723	4166728	0 %	100 %	0 %	0 %	194444438
88012	NC_011080	CAG	2	6	4166729	4166734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444438
88013	NC_011080	TGT	2	6	4166735	4166740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444438
88014	NC_011080	TCC	2	6	4166810	4166815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194443884
88015	NC_011080	CCT	2	6	4166838	4166843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194443884
88016	NC_011080	CGC	2	6	4166900	4166905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443884
88017	NC_011080	GAT	2	6	4166970	4166975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443884
88018	NC_011080	CAT	2	6	4166985	4166990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443884
88019	NC_011080	CGCTG	2	10	4167017	4167026	0 %	20 %	40 %	40 %	194443884
88020	NC_011080	CTG	2	6	4167100	4167105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443884
88021	NC_011080	GAC	2	6	4167214	4167219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443884
88022	NC_011080	CCG	2	6	4167310	4167315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443884
88023	NC_011080	CAC	2	6	4167334	4167339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443884
88024	NC_011080	TTA	2	6	4167345	4167350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443884
88025	NC_011080	TGAA	2	8	4167452	4167459	50 %	25 %	25 %	0 %	194443159
88026	NC_011080	CTC	2	6	4167469	4167474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194443159
88027	NC_011080	CAGC	2	8	4167475	4167482	25 %	0 %	25 %	50 %	194443159
88028	NC_011080	TGA	2	6	4167573	4167578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443159
88029	NC_011080	CGC	2	6	4167621	4167626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443159
88030	NC_011080	TTA	2	6	4167692	4167697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443159
88031	NC_011080	GCG	2	6	4167716	4167721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88032	NC_011080	GTA	2	6	4167760	4167765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88033	NC_011080	GAT	2	6	4167773	4167778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88034	NC_011080	CAT	2	6	4167826	4167831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442549
88035	NC_011080	GAA	2	6	4167986	4167991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194442549
88036	NC_011080	TGC	2	6	4168033	4168038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442549
88037	NC_011080	GTC	2	6	4168113	4168118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442549
88038	NC_011080	ATA	2	6	4168131	4168136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442549
88039	NC_011080	GAT	2	6	4168436	4168441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442549
88040	NC_011080	TGC	2	6	4168476	4168481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442549
88041	NC_011080	ATT	2	6	4168523	4168528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194442549
88042	NC_011080	GAA	2	6	4168538	4168543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194442549
88043	NC_011080	GTTTA	2	10	4168599	4168608	20 %	60 %	20 %	0 %	194442549
88044	NC_011080	TCG	2	6	4168627	4168632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442549
88045	NC_011080	A	6	6	4168654	4168659	100 %	0 %	0 %	0 %	194442549
88046	NC_011080	GACA	2	8	4168695	4168702	50 %	0 %	25 %	25 %	194442549
88047	NC_011080	GA	3	6	4168772	4168777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88048	NC_011080	TGGC	2	8	4168797	4168804	0 %	25 %	50 %	25 %	194444754
88049	NC_011080	GCTG	2	8	4168805	4168812	0 %	25 %	50 %	25 %	194444754
88050	NC_011080	GCA	2	6	4168839	4168844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444754
88051	NC_011080	GAA	2	6	4168950	4168955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444754
88052	NC_011080	GAA	2	6	4168979	4168984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444754
88053	NC_011080	AGA	2	6	4169090	4169095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444754
88054	NC_011080	GTG	2	6	4169226	4169231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444754
88055	NC_011080	CAG	2	6	4169342	4169347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444754
88056	NC_011080	CAG	2	6	4169364	4169369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444754
88057	NC_011080	A	6	6	4169400	4169405	100 %	0 %	0 %	0 %	194444754
88058	NC_011080	TCT	2	6	4169455	4169460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194446325
88059	NC_011080	TCTT	2	8	4169470	4169477	0 %	75 %	0 %	25 %	194446325
88060	NC_011080	TTC	2	6	4169550	4169555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194446325
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88065	NC_011080	GGC	2	6	4169722	4169727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446325
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88068	NC_011080	CGA	2	6	4169818	4169823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446325
88069	NC_011080	CGA	2	6	4169839	4169844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446325
88070	NC_011080	GTT	2	6	4169845	4169850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194446325
88071	NC_011080	GAT	2	6	4170047	4170052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446325
88072	NC_011080	CAT	2	6	4170165	4170170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446325
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88076	NC_011080	ATT	2	6	4170335	4170340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88077	NC_011080	ATG	2	6	4170408	4170413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88078	NC_011080	AAC	2	6	4170440	4170445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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88080	NC_011080	AAT	2	6	4170512	4170517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88081	NC_011080	ATT	2	6	4170523	4170528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444416
88082	NC_011080	AC	3	6	4170576	4170581	50 %	0 %	0 %	50 %	194444416
88083	NC_011080	GTT	2	6	4170596	4170601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444416
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88085	NC_011080	GCG	2	6	4170643	4170648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444416
88086	NC_011080	TCC	2	6	4170663	4170668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88087	NC_011080	CCG	2	6	4170792	4170797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444061
88088	NC_011080	TGC	2	6	4170887	4170892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444061
88089	NC_011080	GGT	2	6	4170893	4170898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444061
88090	NC_011080	TGA	2	6	4170926	4170931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444061
88091	NC_011080	TCC	2	6	4170959	4170964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194444061
88092	NC_011080	GAT	2	6	4170972	4170977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444061
88093	NC_011080	TGCG	2	8	4170979	4170986	0 %	25 %	50 %	25 %	194444061
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88100	NC_011080	A	6	6	4171372	4171377	100 %	0 %	0 %	0 %	194444061
88101	NC_011080	CCA	2	6	4171465	4171470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444061
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88104	NC_011080	A	6	6	4171554	4171559	100 %	0 %	0 %	0 %	194444061
88105	NC_011080	CGG	2	6	4171579	4171584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444061
88106	NC_011080	CGG	2	6	4171627	4171632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444061
88107	NC_011080	TGA	2	6	4171658	4171663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444061
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88112	NC_011080	ATA	2	6	4171801	4171806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194444061
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88116	NC_011080	GCT	2	6	4171937	4171942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444061
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88236	NC_011080	GCC	2	6	4178257	4178262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445307
88237	NC_011080	GAA	2	6	4178371	4178376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445307
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88317	NC_011080	GGA	2	6	4181889	4181894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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88340	NC_011080	GATGCG	2	12	4183023	4183034	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	194443181
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88343	NC_011080	CATGAC	2	12	4183334	4183345	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	194443181
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88345	NC_011080	ACG	2	6	4183384	4183389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443181
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88347	NC_011080	TGCG	2	8	4183606	4183613	0 %	25 %	50 %	25 %	194443181
88348	NC_011080	TGA	2	6	4183685	4183690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443181
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